More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_0002 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_0002  DNA-directed DNA polymerase  100 
 
 		 379 aa  752    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000640008  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0002  DNA polymerase III subunit beta  84.17 
 
 		 378 aa  613  9.999999999999999e-175  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0259305  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0002  DNA polymerase III, beta subunit  69.58 
 
 		 375 aa  515  1.0000000000000001e-145  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000684448  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0002  DNA polymerase III, beta subunit  68.07 
 
 		 379 aa  485  1e-136  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.000269969  hitchhiker  0.00612818 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0002  DNA polymerase III subunit beta  65.18 
 
 		 380 aa  475  1e-133  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.000000143991  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0086  DNA polymerase III subunit beta  57.07 
 
 		 379 aa  435  1e-121  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00020  DNA polymerase III, beta subunit  56.46 
 
 		 376 aa  427  1e-118  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0002  DNA polymerase III, beta subunit  56.73 
 
 		 376 aa  421  1e-116  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0002  DNA polymerase III, beta subunit  55.29 
 
 		 377 aa  414  1e-114  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0002  DNA polymerase III subunit beta  53.57 
 
 		 396 aa  411  1e-113  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0135269  normal  0.401999 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0002  DNA polymerase III, beta subunit  54.35 
 
 		 376 aa  410  1e-113  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.000000849521  normal  0.168185 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0002  DNA polymerase III, beta subunit  54.33 
 
 		 378 aa  407  1.0000000000000001e-112  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0002  DNA polymerase III subunit beta  56.96 
 
 		 408 aa  407  1.0000000000000001e-112  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0003  DNA polymerase III, beta subunit  52.85 
 
 		 402 aa  400  9.999999999999999e-111  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.0000138278  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0002  DNA polymerase III, beta subunit  54.12 
 
 		 387 aa  401  9.999999999999999e-111  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0002  DNA polymerase III, beta subunit  57.88 
 
 		 386 aa  395  1e-109  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0002  DNA polymerase III, beta subunit  57.18 
 
 		 383 aa  393  1e-108  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00435185 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00020  DNA polymerase III, beta subunit  52.24 
 
 		 374 aa  390  1e-107  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.218776  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0002  DNA polymerase III, beta subunit  56.43 
 
 		 377 aa  387  1e-106  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  hitchhiker  0.00244113  unclonable  0.0000000186271 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0003  DNA polymerase III, beta subunit  56.99 
 
 		 377 aa  387  1e-106  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.000000000316606  hitchhiker  0.00386911 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0002  DNA polymerase III subunit beta  53.61 
 
 		 398 aa  386  1e-106  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.298765  normal  0.252015 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0002  DNA polymerase III subunit beta  53.11 
 
 		 398 aa  384  1e-105  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.042032 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9328  DNA-directed DNA polymerase  52.12 
 
 		 365 aa  384  1e-105  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.608924  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0002  DNA polymerase III subunit beta  53.11 
 
 		 398 aa  384  1e-105  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0010  DNA polymerase III subunit beta  53.11 
 
 		 398 aa  384  1e-105  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.716793  normal  0.123554 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0826  DNA polymerase III subunit beta  53.23 
 
 		 398 aa  377  1e-103  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00020  DNA polymerase III, beta subunit  51.99 
 
 		 378 aa  376  1e-103  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0003  DNA polymerase III, beta subunit  53.75 
 
 		 386 aa  377  1e-103  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.301808 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5295  DNA polymerase III, beta subunit  52.85 
 
 		 384 aa  377  1e-103  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0002  DNA polymerase III, beta subunit  51.19 
 
 		 374 aa  370  1e-101  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000000025514 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00020  DNA polymerase III, beta subunit  50.8 
 
 		 374 aa  369  1e-101  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0002  DNA polymerase III subunit beta  54.05 
 
 		 378 aa  368  1e-101  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.065739  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10002  DNA polymerase III subunit beta  51.03 
 
 		 402 aa  369  1e-101  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0002  DNA polymerase III, beta subunit  51.19 
 
 		 374 aa  370  1e-101  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0002  DNA polymerase III, beta subunit  50.64 
 
 		 388 aa  367  1e-100  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0002  DNA polymerase III, beta subunit  51.21 
 
 		 408 aa  365  1e-100  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0002  DNA polymerase III subunit beta  51.71 
 
 		 380 aa  367  1e-100  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.000348637  normal  0.134322 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00020  DNA polymerase III subunit beta  55.47 
 
 		 379 aa  364  1e-99  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00000000251098  normal  0.535088 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0003  DNA polymerase III, beta subunit  49.35 
 
 		 396 aa  355  1e-96  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3544  DNA polymerase III subunit beta  49.2 
 
 		 364 aa  331  2e-89  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.908435  normal  0.835762 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1435  DNA polymerase III subunit beta  42.22 
 
 		 374 aa  312  4.999999999999999e-84  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.674698  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0044  DNA polymerase III, beta subunit  37.47 
 
 		 374 aa  296  3e-79  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5871  DNA polymerase III, beta subunit  42.89 
 
 		 404 aa  261  1e-68  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.24159  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0738  DNA polymerase III beta subunit family protein  39.17 
 
 		 433 aa  244  1.9999999999999999e-63  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.911699 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0003  DNA polymerase III, beta subunit  30.75 
 
 		 366 aa  177  2e-43  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000553224  hitchhiker  0.000000389013 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0002  DNA polymerase III subunit beta  27.56 
 
 		 366 aa  174  1.9999999999999998e-42  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.279408  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0002  DNA polymerase III subunit beta  27.56 
 
 		 366 aa  174  1.9999999999999998e-42  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.316057  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00020  DNA polymerase III, beta subunit  28.08 
 
 		 365 aa  166  8e-40  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.443906  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00001  DNA polymerase III subunit beta  28.57 
 
 		 397 aa  165  1.0000000000000001e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.284448  normal  0.0167825 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2720  DNA polymerase III, beta subunit  29.87 
 
 		 372 aa  163  4.0000000000000004e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.737243  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00020  DNA polymerase III, beta subunit  27.56 
 
 		 365 aa  160  4e-38  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000592113  decreased coverage  0.0000599685 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0002  DNA polymerase III, beta subunit  29.92 
 
 		 375 aa  159  1e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.000000418991  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2552  DNA polymerase III subunit beta  28.21 
 
 		 377 aa  158  2e-37  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0587336  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0002  DNA polymerase III, beta subunit  28.61 
 
 		 365 aa  157  3e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.610199  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0002  DNA polymerase III, beta subunit  29.1 
 
 		 369 aa  156  5.0000000000000005e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00001  DNA polymerase III subunit beta  26.63 
 
 		 385 aa  155  8e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.354313  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0003  DNA polymerase III, beta subunit  28.39 
 
 		 366 aa  155  1e-36  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1016  DNA polymerase III subunit beta  28.54 
 
 		 393 aa  155  2e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0002  DNA polymerase III subunit beta  25.39 
 
 		 370 aa  155  2e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1045  DNA polymerase III subunit beta  28.54 
 
 		 393 aa  155  2e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000409555  unclonable  0.00000000281863 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0001  DNA polymerase III subunit beta  26.77 
 
 		 385 aa  154  2.9999999999999998e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0002  DNA polymerase III subunit beta  28.39 
 
 		 377 aa  153  5e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0177596  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0002  DNA polymerase III subunit beta  28.39 
 
 		 377 aa  153  5e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.00213885  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00001  DNA polymerase III subunit beta  26.33 
 
 		 385 aa  152  7e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0002  DNA polymerase III subunit beta  26.06 
 
 		 366 aa  152  8e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.039801  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00001  DNA polymerase III subunit beta  26.08 
 
 		 385 aa  152  8.999999999999999e-36  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.280893  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2082  DNA polymerase IF1 subunit beta  27.56 
 
 		 382 aa  151  2e-35  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0161872  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1513  DNA polymerase III, beta subunit  28.68 
 
 		 381 aa  150  3e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000166783  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0002  DNA polymerase III subunit beta  26.72 
 
 		 379 aa  150  5e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00656712  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0002  DNA polymerase III subunit beta  26.72 
 
 		 379 aa  150  5e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.478099 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0002  DNA polymerase III subunit beta  26.72 
 
 		 379 aa  149  6e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0872061  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0002  DNA polymerase III subunit beta  26.72 
 
 		 379 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0173994  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2372  DNA polymerase III subunit beta  24.74 
 
 		 366 aa  148  2.0000000000000003e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0002  DNA polymerase III subunit beta  26.72 
 
 		 379 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.341639  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0002  DNA polymerase III subunit beta  26.72 
 
 		 379 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0132884  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0002  DNA polymerase III subunit beta  26.72 
 
 		 379 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000820509  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0002  DNA polymerase III subunit beta  25.77 
 
 		 381 aa  145  1e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000678483  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00020  DNA polymerase III, beta subunit  25 
 
 		 367 aa  145  1e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0993  DNA polymerase III, beta subunit  28.42 
 
 		 376 aa  144  2e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0002  DNA polymerase III subunit beta  25.26 
 
 		 381 aa  145  2e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0001  DNA polymerase III subunit beta  25.91 
 
 		 390 aa  143  4e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.174171  normal  0.105878 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0199  DNA polymerase III subunit beta  27.49 
 
 		 374 aa  143  5e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.0000579402  normal  0.0770055 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5318  DNA polymerase III subunit beta  26.58 
 
 		 381 aa  143  6e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.00172021  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0002  DNA polymerase III subunit beta  26.58 
 
 		 381 aa  143  6e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000341772  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0002  DNA polymerase III subunit beta  25.58 
 
 		 378 aa  142  7e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000167002  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0002  DNA polymerase III subunit beta  27.3 
 
 		 378 aa  142  7e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0002  DNA polymerase III, beta subunit  26.04 
 
 		 367 aa  142  9.999999999999999e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.870835  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0010  DNA polymerase III subunit beta  27.91 
 
 		 369 aa  140  3e-32  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.000914164  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00443  DNA polymerase III subunit beta  29.79 
 
 		 366 aa  140  3.9999999999999997e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1328  DNA polymerase III subunit beta  25.95 
 
 		 386 aa  140  4.999999999999999e-32  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12563  DNA polymerase III, beta chain  27.35 
 
 		 362 aa  140  4.999999999999999e-32  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.152259  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0002  DNA polymerase III subunit beta  27.89 
 
 		 361 aa  140  4.999999999999999e-32  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00000320383  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0002  DNA polymerase III, beta subunit  25.38 
 
 		 378 aa  139  6e-32  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.000189832  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00001  DNA polymerase III subunit beta  27.25 
 
 		 388 aa  139  1e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.652632 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00001  DNA polymerase III subunit beta  25.45 
 
 		 386 aa  138  2e-31  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0002  DNA polymerase III, beta subunit  28.65 
 
 		 366 aa  138  2e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00540998  normal  0.944506 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0002  DNA polymerase III subunit beta  27.44 
 
 		 378 aa  137  3.0000000000000003e-31  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0002  DNA polymerase sliding clamp subunit  25.26 
 
 		 376 aa  137  3.0000000000000003e-31  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000188302  unclonable  1.4129e-28 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1752  DNA polymerase III, beta subunit  27.01 
 
 		 374 aa  137  4e-31  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.236146  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0002  DNA polymerase III subunit beta  27.27 
 
 		 387 aa  136  5e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.273248  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>