More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_0002 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_0002  DNA polymerase III subunit beta  100 
 
 		 380 aa  753    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.000348637  normal  0.134322 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0002  DNA polymerase III, beta subunit  61.21 
 
 		 377 aa  426  1e-118  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  hitchhiker  0.00244113  unclonable  0.0000000186271 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0003  DNA polymerase III, beta subunit  60.16 
 
 		 377 aa  421  1e-117  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.000000000316606  hitchhiker  0.00386911 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0002  DNA-directed DNA polymerase  51.71 
 
 		 379 aa  387  1e-106  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000640008  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0002  DNA polymerase III, beta subunit  50.4 
 
 		 375 aa  366  1e-100  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000684448  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0002  DNA polymerase III subunit beta  50.92 
 
 		 380 aa  364  1e-99  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.000000143991  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0002  DNA polymerase III, beta subunit  50.4 
 
 		 376 aa  364  1e-99  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0002  DNA polymerase III, beta subunit  50.39 
 
 		 378 aa  359  4e-98  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0002  DNA polymerase III subunit beta  50.39 
 
 		 408 aa  359  4e-98  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0002  DNA polymerase III, beta subunit  51.71 
 
 		 379 aa  356  3.9999999999999996e-97  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.000269969  hitchhiker  0.00612818 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0002  DNA polymerase III subunit beta  47.56 
 
 		 398 aa  353  2e-96  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.298765  normal  0.252015 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0002  DNA polymerase III subunit beta  50.13 
 
 		 378 aa  352  5.9999999999999994e-96  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0259305  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0002  DNA polymerase III, beta subunit  47.93 
 
 		 388 aa  350  2e-95  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00020  DNA polymerase III, beta subunit  48.56 
 
 		 376 aa  348  1e-94  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0002  DNA polymerase III, beta subunit  48.55 
 
 		 377 aa  348  1e-94  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0826  DNA polymerase III subunit beta  46.13 
 
 		 398 aa  347  3e-94  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0002  DNA polymerase III subunit beta  49.35 
 
 		 378 aa  345  8e-94  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.065739  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0086  DNA polymerase III subunit beta  46.34 
 
 		 379 aa  343  2.9999999999999997e-93  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00020  DNA polymerase III, beta subunit  47.89 
 
 		 378 aa  341  1e-92  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0002  DNA polymerase III, beta subunit  51.23 
 
 		 408 aa  340  2e-92  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0002  DNA polymerase III subunit beta  46.61 
 
 		 398 aa  340  2e-92  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0010  DNA polymerase III subunit beta  46.61 
 
 		 398 aa  340  2e-92  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.716793  normal  0.123554 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0002  DNA polymerase III subunit beta  46.61 
 
 		 398 aa  340  2e-92  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.042032 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0002  DNA polymerase III, beta subunit  46.32 
 
 		 376 aa  340  2.9999999999999998e-92  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.000000849521  normal  0.168185 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0003  DNA polymerase III, beta subunit  46.89 
 
 		 396 aa  335  5.999999999999999e-91  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0002  DNA polymerase III subunit beta  46.19 
 
 		 396 aa  334  1e-90  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0135269  normal  0.401999 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0002  DNA polymerase III, beta subunit  47.93 
 
 		 387 aa  333  2e-90  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0002  DNA polymerase III, beta subunit  47.53 
 
 		 386 aa  330  2e-89  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10002  DNA polymerase III subunit beta  45.24 
 
 		 402 aa  329  5.0000000000000004e-89  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5295  DNA polymerase III, beta subunit  47.41 
 
 		 384 aa  327  2.0000000000000001e-88  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0002  DNA polymerase III, beta subunit  47.88 
 
 		 383 aa  323  2e-87  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00435185 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0003  DNA polymerase III, beta subunit  45.19 
 
 		 402 aa  323  3e-87  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.0000138278  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0002  DNA polymerase III, beta subunit  45.77 
 
 		 374 aa  322  5e-87  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000000025514 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0002  DNA polymerase III, beta subunit  44.97 
 
 		 374 aa  322  5e-87  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00020  DNA polymerase III, beta subunit  44.33 
 
 		 374 aa  320  3e-86  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.218776  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00020  DNA polymerase III, beta subunit  44.56 
 
 		 374 aa  319  5e-86  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00020  DNA polymerase III subunit beta  48.44 
 
 		 379 aa  317  3e-85  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00000000251098  normal  0.535088 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0003  DNA polymerase III, beta subunit  45.38 
 
 		 386 aa  308  1.0000000000000001e-82  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.301808 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9328  DNA-directed DNA polymerase  39.52 
 
 		 365 aa  290  4e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.608924  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1435  DNA polymerase III subunit beta  38.58 
 
 		 374 aa  278  2e-73  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.674698  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0044  DNA polymerase III, beta subunit  35.7 
 
 		 374 aa  266  5e-70  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3544  DNA polymerase III subunit beta  36.34 
 
 		 364 aa  234  3e-60  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.908435  normal  0.835762 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0738  DNA polymerase III beta subunit family protein  36.47 
 
 		 433 aa  231  1e-59  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.911699 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5871  DNA polymerase III, beta subunit  38.59 
 
 		 404 aa  224  3e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.24159  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0003  DNA polymerase III, beta subunit  29.4 
 
 		 366 aa  169  7e-41  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000553224  hitchhiker  0.000000389013 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0002  DNA polymerase III, beta subunit  27.3 
 
 		 365 aa  165  1.0000000000000001e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.610199  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0002  DNA polymerase III, beta subunit  27.08 
 
 		 369 aa  164  3e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00001  DNA polymerase III subunit beta  28.24 
 
 		 385 aa  155  1e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.354313  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00001  DNA polymerase III subunit beta  28.21 
 
 		 385 aa  154  2.9999999999999998e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0002  DNA polymerase sliding clamp subunit  25.82 
 
 		 376 aa  152  1e-35  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000188302  unclonable  1.4129e-28 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0002  DNA polymerase III subunit beta  25.7 
 
 		 366 aa  152  1e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.039801  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00020  DNA polymerase III, beta subunit  26.32 
 
 		 365 aa  150  3e-35  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.443906  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0001  DNA polymerase III subunit beta  28.61 
 
 		 385 aa  150  4e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00020  DNA polymerase III, beta subunit  27.63 
 
 		 365 aa  150  5e-35  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000592113  decreased coverage  0.0000599685 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00001  DNA polymerase III subunit beta  27.68 
 
 		 385 aa  147  3e-34  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.280893  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00001  DNA polymerase III subunit beta  28.61 
 
 		 388 aa  146  7.0000000000000006e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.652632 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2552  DNA polymerase III subunit beta  27.37 
 
 		 377 aa  145  9e-34  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0587336  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1328  DNA polymerase III subunit beta  28.28 
 
 		 386 aa  145  1e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0002  DNA polymerase III subunit beta  27.54 
 
 		 378 aa  145  1e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2720  DNA polymerase III, beta subunit  28.81 
 
 		 372 aa  145  1e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.737243  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0002  DNA polymerase III subunit beta  27.25 
 
 		 378 aa  145  1e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000167002  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0002  DNA polymerase III subunit beta  26.63 
 
 		 379 aa  145  2e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.341639  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0002  DNA polymerase III subunit beta  26.63 
 
 		 379 aa  145  2e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0872061  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0002  DNA polymerase III subunit beta  26.63 
 
 		 379 aa  145  2e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0132884  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00001  DNA polymerase III subunit beta  27.32 
 
 		 397 aa  144  2e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.284448  normal  0.0167825 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0002  DNA polymerase III subunit beta  27.11 
 
 		 377 aa  144  2e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0177596  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0002  DNA polymerase III subunit beta  27.11 
 
 		 377 aa  144  2e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.00213885  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0002  DNA polymerase III subunit beta  26.63 
 
 		 379 aa  144  3e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00656712  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0002  DNA polymerase III subunit beta  25.98 
 
 		 366 aa  144  3e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.279408  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0002  DNA polymerase III subunit beta  25.98 
 
 		 366 aa  144  3e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.316057  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0002  DNA polymerase III subunit beta  26.63 
 
 		 379 aa  144  3e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.478099 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1016  DNA polymerase III subunit beta  29.82 
 
 		 393 aa  144  4e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1045  DNA polymerase III subunit beta  29.82 
 
 		 393 aa  144  4e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000409555  unclonable  0.00000000281863 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0002  DNA polymerase III subunit beta  26.33 
 
 		 381 aa  142  7e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000678483  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2372  DNA polymerase III subunit beta  25.7 
 
 		 366 aa  142  8e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00001  DNA polymerase III subunit beta  27.78 
 
 		 386 aa  142  9.999999999999999e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0002  DNA polymerase III subunit beta  26.36 
 
 		 379 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000820509  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5318  DNA polymerase III subunit beta  25.95 
 
 		 381 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.00172021  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0002  DNA polymerase III subunit beta  25.95 
 
 		 381 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000341772  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0002  DNA polymerase III subunit beta  26.36 
 
 		 379 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0173994  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0002  DNA polymerase III subunit beta  25.95 
 
 		 381 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0002  DNA polymerase III, beta subunit  26.17 
 
 		 375 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.000000418991  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0002  DNA polymerase III, beta subunit  24.59 
 
 		 378 aa  140  3e-32  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.000189832  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0001  DNA polymerase III subunit beta  28.89 
 
 		 385 aa  138  2e-31  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.392011  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0001  DNA polymerase III subunit beta  28.64 
 
 		 385 aa  137  3.0000000000000003e-31  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1752  DNA polymerase III, beta subunit  27.78 
 
 		 374 aa  136  5e-31  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.236146  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0231  DNA polymerase III, beta subunit  26.68 
 
 		 367 aa  136  6.0000000000000005e-31  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000000874025  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0002  DNA polymerase III subunit beta  24.17 
 
 		 370 aa  136  6.0000000000000005e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0002  DNA polymerase III subunit beta  26.61 
 
 		 372 aa  136  7.000000000000001e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0002  DNA-directed DNA polymerase  25.07 
 
 		 367 aa  135  9.999999999999999e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0002  DNA polymerase III subunit beta  28.08 
 
 		 361 aa  134  1.9999999999999998e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00000320383  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0002  DNA polymerase III subunit beta  28.06 
 
 		 366 aa  134  1.9999999999999998e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.161415  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0002  DNA polymerase III, beta subunit  23.53 
 
 		 380 aa  134  3e-30  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0002  DNA polymerase III, beta subunit  24.79 
 
 		 372 aa  134  3e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0002  DNA polymerase III subunit beta  26.1 
 
 		 372 aa  134  3.9999999999999996e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.120269  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0002  DNA polymerase III subunit beta  26.76 
 
 		 387 aa  133  6e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.273248  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0002  DNA polymerase III, beta subunit  26.99 
 
 		 375 aa  133  6.999999999999999e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0002  DNA polymerase III subunit beta  26.28 
 
 		 380 aa  132  6.999999999999999e-30  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.376275  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0002  DNA polymerase III, beta subunit  25.06 
 
 		 374 aa  132  7.999999999999999e-30  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.00000374529  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0199  DNA polymerase III subunit beta  26.46 
 
 		 374 aa  132  9e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.0000579402  normal  0.0770055 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>