More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_0002 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_0002  DNA polymerase III, beta subunit  100 
 
 		 377 aa  749    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  hitchhiker  0.00244113  unclonable  0.0000000186271 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0003  DNA polymerase III, beta subunit  95.49 
 
 		 377 aa  690    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.000000000316606  hitchhiker  0.00386911 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0002  DNA polymerase III subunit beta  61.21 
 
 		 380 aa  431  1e-119  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.000348637  normal  0.134322 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0002  DNA-directed DNA polymerase  56.46 
 
 		 379 aa  411  1e-113  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000640008  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0002  DNA polymerase III, beta subunit  55.7 
 
 		 375 aa  407  1.0000000000000001e-112  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000684448  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0002  DNA polymerase III subunit beta  55.94 
 
 		 408 aa  405  1.0000000000000001e-112  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0002  DNA polymerase III, beta subunit  57.94 
 
 		 379 aa  403  1e-111  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.000269969  hitchhiker  0.00612818 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0002  DNA polymerase III subunit beta  55.64 
 
 		 380 aa  392  1e-108  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.000000143991  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0002  DNA polymerase III subunit beta  56.32 
 
 		 378 aa  390  1e-107  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0259305  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0086  DNA polymerase III subunit beta  52.6 
 
 		 379 aa  383  1e-105  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0002  DNA polymerase III, beta subunit  53.44 
 
 		 378 aa  379  1e-104  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0002  DNA polymerase III subunit beta  54.21 
 
 		 378 aa  381  1e-104  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.065739  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00020  DNA polymerase III, beta subunit  54.79 
 
 		 376 aa  378  1e-104  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0002  DNA polymerase III, beta subunit  54.66 
 
 		 386 aa  372  1e-102  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0002  DNA polymerase III, beta subunit  53.97 
 
 		 376 aa  372  1e-102  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0003  DNA polymerase III, beta subunit  50.12 
 
 		 402 aa  372  1e-102  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.0000138278  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00020  DNA polymerase III, beta subunit  53.05 
 
 		 378 aa  372  1e-102  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0002  DNA polymerase III, beta subunit  50.48 
 
 		 408 aa  370  1e-101  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0002  DNA polymerase III, beta subunit  52.51 
 
 		 377 aa  369  1e-101  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0002  DNA polymerase III subunit beta  48.99 
 
 		 396 aa  370  1e-101  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0135269  normal  0.401999 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0002  DNA polymerase III, beta subunit  52.12 
 
 		 376 aa  365  1e-100  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.000000849521  normal  0.168185 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00020  DNA polymerase III, beta subunit  51.32 
 
 		 374 aa  364  2e-99  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.218776  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0002  DNA polymerase III, beta subunit  49.48 
 
 		 388 aa  363  3e-99  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0826  DNA polymerase III subunit beta  49.35 
 
 		 398 aa  362  6e-99  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5295  DNA polymerase III, beta subunit  52.97 
 
 		 384 aa  360  2e-98  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0002  DNA polymerase III subunit beta  48.96 
 
 		 398 aa  360  3e-98  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.042032 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0002  DNA polymerase III subunit beta  48.96 
 
 		 398 aa  359  5e-98  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0003  DNA polymerase III, beta subunit  49.1 
 
 		 396 aa  359  5e-98  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0010  DNA polymerase III subunit beta  48.96 
 
 		 398 aa  359  5e-98  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.716793  normal  0.123554 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0002  DNA polymerase III subunit beta  49.1 
 
 		 398 aa  358  6e-98  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.298765  normal  0.252015 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0002  DNA polymerase III, beta subunit  49.73 
 
 		 374 aa  354  1e-96  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0003  DNA polymerase III, beta subunit  51.55 
 
 		 386 aa  353  2.9999999999999997e-96  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.301808 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10002  DNA polymerase III subunit beta  46.79 
 
 		 402 aa  352  7e-96  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0002  DNA polymerase III, beta subunit  48.94 
 
 		 374 aa  351  1e-95  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000000025514 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0002  DNA polymerase III, beta subunit  51.85 
 
 		 383 aa  343  2e-93  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00435185 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00020  DNA polymerase III, beta subunit  47.07 
 
 		 374 aa  341  1e-92  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00020  DNA polymerase III subunit beta  52.76 
 
 		 379 aa  339  4e-92  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00000000251098  normal  0.535088 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0002  DNA polymerase III, beta subunit  48.84 
 
 		 387 aa  338  7e-92  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9328  DNA-directed DNA polymerase  47.07 
 
 		 365 aa  328  1.0000000000000001e-88  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.608924  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3544  DNA polymerase III subunit beta  42.51 
 
 		 364 aa  272  7e-72  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.908435  normal  0.835762 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1435  DNA polymerase III subunit beta  38.36 
 
 		 374 aa  265  1e-69  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.674698  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0044  DNA polymerase III, beta subunit  35.19 
 
 		 374 aa  256  7e-67  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5871  DNA polymerase III, beta subunit  40.29 
 
 		 404 aa  227  2e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.24159  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0738  DNA polymerase III beta subunit family protein  38.62 
 
 		 433 aa  223  6e-57  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.911699 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0002  DNA polymerase III, beta subunit  31.76 
 
 		 369 aa  184  2.0000000000000003e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0002  DNA polymerase III, beta subunit  28.35 
 
 		 365 aa  168  2e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.610199  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0003  DNA polymerase III, beta subunit  29.02 
 
 		 366 aa  164  2.0000000000000002e-39  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000553224  hitchhiker  0.000000389013 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0002  DNA polymerase III subunit beta  25.79 
 
 		 366 aa  162  6e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.279408  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0002  DNA polymerase III subunit beta  25.79 
 
 		 366 aa  162  6e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.316057  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0002  DNA polymerase III, beta subunit  30.77 
 
 		 375 aa  159  7e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.000000418991  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00020  DNA polymerase III, beta subunit  27.97 
 
 		 365 aa  159  9e-38  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.443906  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00020  DNA polymerase III, beta subunit  28.95 
 
 		 365 aa  152  1e-35  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000592113  decreased coverage  0.0000599685 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0002  DNA polymerase III, beta subunit  25.32 
 
 		 380 aa  150  2e-35  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00001  DNA polymerase III subunit beta  29.65 
 
 		 388 aa  147  4.0000000000000006e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.652632 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0002  DNA polymerase III, beta subunit  25.77 
 
 		 378 aa  145  8.000000000000001e-34  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.000189832  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0002  DNA polymerase III, beta subunit  25.59 
 
 		 367 aa  145  1e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.150547  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2372  DNA polymerase III subunit beta  24.67 
 
 		 366 aa  144  3e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0002  DNA polymerase sliding clamp subunit  24.42 
 
 		 376 aa  143  6e-33  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000188302  unclonable  1.4129e-28 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0001  DNA polymerase III subunit beta  26.34 
 
 		 385 aa  142  9.999999999999999e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0002  DNA polymerase III subunit beta  26.4 
 
 		 378 aa  142  9.999999999999999e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000167002  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0002  DNA polymerase III, beta subunit  26.12 
 
 		 366 aa  140  4.999999999999999e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.00000000544098  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0002  DNA polymerase III subunit beta  24.81 
 
 		 378 aa  139  1e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0815  DNA polymerase III, beta subunit  23.56 
 
 		 375 aa  139  1e-31  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  unclonable  0.000000015774  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00001  DNA polymerase III subunit beta  26.09 
 
 		 385 aa  137  2e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.354313  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1016  DNA polymerase III subunit beta  29.31 
 
 		 393 aa  137  3.0000000000000003e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1045  DNA polymerase III subunit beta  29.31 
 
 		 393 aa  137  3.0000000000000003e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000409555  unclonable  0.00000000281863 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0002  DNA polymerase III subunit beta  23.48 
 
 		 366 aa  137  3.0000000000000003e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.039801  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0001  DNA polymerase III, beta subunit  24.28 
 
 		 372 aa  137  4e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0872728  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0199  DNA polymerase III subunit beta  28.39 
 
 		 374 aa  136  5e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.0000579402  normal  0.0770055 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0002  DNA polymerase III, beta subunit  26.65 
 
 		 365 aa  136  5e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00001  DNA polymerase III subunit beta  25.06 
 
 		 385 aa  136  5e-31  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.280893  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00001  DNA polymerase III subunit beta  25.06 
 
 		 385 aa  136  7.000000000000001e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0002  DNA polymerase III subunit beta  25.58 
 
 		 381 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000678483  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2552  DNA polymerase III subunit beta  24.81 
 
 		 377 aa  134  1.9999999999999998e-30  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0587336  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0011  DNA polymerase III subunit beta  29.29 
 
 		 367 aa  134  3e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.12322  hitchhiker  0.00002839 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0816  DNA polymerase III, beta subunit  25 
 
 		 366 aa  134  3e-30  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.731986  normal  0.187979 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0002  DNA polymerase III subunit beta  24.94 
 
 		 379 aa  134  3e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0872061  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0002  DNA polymerase III, beta subunit  26.67 
 
 		 367 aa  134  3e-30  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.870835  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0007  DNA-directed DNA polymerase  26.55 
 
 		 366 aa  134  3e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000118658  unclonable  0.000000000121971 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0002  DNA polymerase III, beta subunit  26.8 
 
 		 366 aa  134  3e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000267756  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0002  DNA polymerase III subunit beta  29.29 
 
 		 367 aa  134  3e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.123405  normal  0.0743731 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0002  DNA polymerase III subunit beta  24.81 
 
 		 377 aa  134  3.9999999999999996e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0177596  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0002  DNA polymerase III subunit beta  24.94 
 
 		 379 aa  134  3.9999999999999996e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00656712  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0002  DNA polymerase III, beta subunit  26.05 
 
 		 368 aa  133  3.9999999999999996e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0002  DNA polymerase III subunit beta  26.02 
 
 		 381 aa  133  3.9999999999999996e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1009  DNA polymerase III, beta subunit  23.42 
 
 		 369 aa  133  3.9999999999999996e-30  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0002  DNA polymerase III, beta subunit  26.51 
 
 		 367 aa  133  3.9999999999999996e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00000744787  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0002  DNA polymerase III, beta subunit  23.82 
 
 		 367 aa  134  3.9999999999999996e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.00000000146926  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2506  DNA polymerase III subunit beta  25.26 
 
 		 366 aa  133  3.9999999999999996e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.000000000000126636  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00443  DNA polymerase III subunit beta  25.13 
 
 		 366 aa  133  3.9999999999999996e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0002  DNA polymerase III subunit beta  24.94 
 
 		 379 aa  134  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.478099 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0002  DNA polymerase III subunit beta  24.81 
 
 		 377 aa  134  3.9999999999999996e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.00213885  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0002  DNA polymerase III subunit beta  22.14 
 
 		 370 aa  133  5e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0002  DNA polymerase III, beta subunit  24.54 
 
 		 372 aa  133  6e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000138199  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0001  DNA polymerase III subunit beta  28.83 
 
 		 385 aa  132  6.999999999999999e-30  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0002  DNA polymerase III subunit beta  25.32 
 
 		 381 aa  132  6.999999999999999e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000341772  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5318  DNA polymerase III subunit beta  25.32 
 
 		 381 aa  132  6.999999999999999e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.00172021  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4145  DNA polymerase III, beta subunit  25.79 
 
 		 368 aa  132  7.999999999999999e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.258487 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0001  DNA polymerase III subunit beta  27.94 
 
 		 390 aa  132  1.0000000000000001e-29  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.174171  normal  0.105878 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0002  DNA polymerase III subunit beta  25.45 
 
 		 379 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000820509  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>