More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH_1009 on replicon NC_007799
Organism: Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007354  Ecaj_0815  DNA polymerase III, beta subunit  90.79 
 
 		 375 aa  691    Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  unclonable  0.000000015774  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1009  DNA polymerase III, beta subunit  100 
 
 		 369 aa  741    Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1010  DNA polymerase III, beta subunit, truncation  97.78 
 
 		 182 aa  353  2e-96  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.295074  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1067  DNA polymerase III, beta subunit  47.01 
 
 		 365 aa  320  1.9999999999999998e-86  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0458358  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0004  DNA polymerase III subunit beta  38.67 
 
 		 372 aa  278  8e-74  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000114385  unclonable  5.12755e-25 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0002  DNA polymerase III subunit beta  37.07 
 
 		 372 aa  277  2e-73  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0002  DNA polymerase III subunit beta  38.56 
 
 		 373 aa  275  6e-73  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.125376 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2239  DNA polymerase III subunit beta  37.23 
 
 		 373 aa  273  3e-72  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0102545  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0708  DNA polymerase III subunit beta  37.87 
 
 		 371 aa  272  8.000000000000001e-72  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.147601  normal  0.843721 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0002  DNA polymerase III subunit beta  36.97 
 
 		 372 aa  270  2.9999999999999997e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.120269  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0002  DNA polymerase III subunit beta  36.7 
 
 		 373 aa  270  4e-71  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0861969  hitchhiker  0.000000929484 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0003  DNA polymerase III subunit beta  38.03 
 
 		 373 aa  268  8e-71  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.174848  normal  0.920378 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0162  DNA polymerase III subunit beta  36 
 
 		 372 aa  266  4e-70  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.281652  normal  0.419565 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0002  DNA polymerase III subunit beta  36.44 
 
 		 372 aa  266  4e-70  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0002  DNA polymerase III subunit beta  37.23 
 
 		 373 aa  266  5e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0823829  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0003  DNA polymerase III subunit beta  37.77 
 
 		 373 aa  265  1e-69  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.991791  normal  0.512948 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0002  DNA polymerase III subunit beta  37.77 
 
 		 373 aa  265  1e-69  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.969312  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0002  DNA polymerase III subunit beta  36.17 
 
 		 372 aa  263  2e-69  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.205747 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0002  DNA polymerase III subunit beta  35.73 
 
 		 372 aa  262  6e-69  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000275643  normal  0.722211 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0002  DNA polymerase III subunit beta  36.27 
 
 		 372 aa  262  6.999999999999999e-69  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0002  DNA polymerase III subunit beta  35.11 
 
 		 372 aa  261  1e-68  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0730917  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3047  DNA polymerase III subunit beta  36.36 
 
 		 371 aa  260  3e-68  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.579013  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2795  DNA polymerase III subunit beta  36.63 
 
 		 370 aa  257  2e-67  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.924667  normal  0.594035 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1437  DNA polymerase III subunit beta  35.81 
 
 		 374 aa  255  1.0000000000000001e-66  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0351  DNA polymerase III subunit beta  35.9 
 
 		 412 aa  254  2.0000000000000002e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.203557  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0003  DNA polymerase III subunit beta  36.07 
 
 		 372 aa  253  4.0000000000000004e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.295963  hitchhiker  0.00000350231 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1343  DNA polymerase III subunit beta  36.07 
 
 		 372 aa  253  5.000000000000001e-66  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3705  DNA polymerase III subunit beta  34.93 
 
 		 372 aa  253  5.000000000000001e-66  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0432616 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0012  DNA polymerase III subunit beta  36.07 
 
 		 372 aa  252  6e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0002  DNA polymerase III subunit beta  35.73 
 
 		 372 aa  251  1e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0002  DNA polymerase III subunit beta  35.47 
 
 		 372 aa  251  2e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4329  DNA polymerase III subunit beta  35.2 
 
 		 372 aa  249  4e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1429  DNA polymerase III subunit beta  36.77 
 
 		 375 aa  249  5e-65  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.314703  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0002  DNA polymerase III subunit beta  36.07 
 
 		 372 aa  248  9e-65  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.142435  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0002  DNA polymerase III subunit beta  35.54 
 
 		 374 aa  248  1e-64  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2834  DNA polymerase III subunit beta  36 
 
 		 372 aa  248  1e-64  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3374  DNA polymerase III subunit beta  35.83 
 
 		 372 aa  248  2e-64  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4592  DNA polymerase III subunit beta  35.2 
 
 		 372 aa  246  4e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0352599 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0002  DNA polymerase III subunit beta  36.07 
 
 		 373 aa  243  3e-63  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0966551  normal  0.572668 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3543  DNA polymerase III subunit beta  34.13 
 
 		 372 aa  243  5e-63  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0002  DNA polymerase III subunit beta  35.11 
 
 		 372 aa  243  5e-63  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.474691  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0002  DNA polymerase III subunit beta  34.13 
 
 		 397 aa  237  3e-61  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00789927  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0002  DNA polymerase III subunit beta  33.87 
 
 		 397 aa  235  7e-61  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.41342  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0004  DNA polymerase III subunit beta  33.6 
 
 		 385 aa  232  6e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.638398  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0002  DNA polymerase III, beta subunit  35.9 
 
 		 372 aa  227  2e-58  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000259068  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1278  DNA polymerase III subunit beta  33.33 
 
 		 373 aa  219  7.999999999999999e-56  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  unclonable  2.76035e-25  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0002  DNA polymerase III subunit beta  31 
 
 		 367 aa  216  5.9999999999999996e-55  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.186277  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0002  DNA polymerase III, beta subunit  32.02 
 
 		 376 aa  216  7e-55  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0002  DNA polymerase III, beta subunit  33.51 
 
 		 367 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0002  DNA polymerase III, beta subunit  34.57 
 
 		 372 aa  214  1.9999999999999998e-54  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0002  DNA polymerase III, beta subunit  31.18 
 
 		 367 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00000485336  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00020  DNA polymerase III subunit beta  33.96 
 
 		 367 aa  213  3.9999999999999995e-54  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0002  DNA polymerase III subunit beta  33.51 
 
 		 367 aa  211  1e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0002  DNA polymerase III subunit beta  32.61 
 
 		 367 aa  209  5e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.121469  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0011  DNA polymerase III subunit beta  32.61 
 
 		 367 aa  208  2e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.12322  hitchhiker  0.00002839 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1226  DNA polymerase III, beta subunit  32.16 
 
 		 366 aa  207  2e-52  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.123805  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0002  DNA polymerase III subunit beta  32.61 
 
 		 367 aa  208  2e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.123405  normal  0.0743731 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0002  DNA polymerase III, beta subunit  31.9 
 
 		 366 aa  207  3e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000136085  unclonable  0.00000000917615 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0014  DNA-directed DNA polymerase  31.81 
 
 		 366 aa  206  5e-52  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000733559  hitchhiker  0.000643873 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00003  DNA polymerase III, beta subunit  31.18 
 
 		 366 aa  205  8e-52  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0000112219  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0002  DNA polymerase III subunit beta  32.35 
 
 		 367 aa  205  8e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000396971  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0004  DNA polymerase III subunit beta  32.35 
 
 		 367 aa  205  9e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0002  DNA polymerase III, beta subunit  31.45 
 
 		 366 aa  205  1e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000158001  unclonable  0.00000341195 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0002  DNA polymerase III, beta subunit  31.64 
 
 		 366 aa  204  2e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000000637071  unclonable  0.00000000000326658 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0002  DNA polymerase III, beta subunit  31.64 
 
 		 366 aa  204  2e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000634429  hitchhiker  0.000143129 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0002  DNA polymerase III, beta subunit  31.65 
 
 		 373 aa  204  2e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.394263  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0002  DNA polymerase III, beta subunit  33.6 
 
 		 372 aa  204  2e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000138199  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0002  DNA polymerase III, beta subunit  31.64 
 
 		 366 aa  204  2e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000000103765  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0002  DNA polymerase III, beta subunit  31.64 
 
 		 366 aa  204  2e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000848773  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0002  DNA polymerase III subunit beta  31.81 
 
 		 367 aa  204  3e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0002  DNA polymerase III, beta subunit  31.9 
 
 		 366 aa  204  3e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000000490932  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0002  DNA polymerase III, beta subunit  31.18 
 
 		 366 aa  204  3e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000472427  hitchhiker  0.00139326 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0010  DNA polymerase III, beta subunit  31.18 
 
 		 366 aa  203  4e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000642144  hitchhiker  0.00000000134313 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0002  DNA polymerase III, beta subunit  31.18 
 
 		 366 aa  203  4e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000577304  unclonable  0.000000000023362 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0009  DNA polymerase III, beta subunit  31.9 
 
 		 366 aa  202  5e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0007  DNA-directed DNA polymerase  31.55 
 
 		 366 aa  202  6e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000118658  unclonable  0.000000000121971 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0002  DNA polymerase III, beta subunit  34.13 
 
 		 367 aa  202  6e-51  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.00000000146926  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0002  DNA polymerase III, beta subunit  30.85 
 
 		 372 aa  202  8e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0618208  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0002  DNA polymerase III, beta subunit  30.85 
 
 		 372 aa  202  9.999999999999999e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3441  DNA polymerase III subunit beta  31.28 
 
 		 371 aa  201  1.9999999999999998e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.325472  normal  0.470058 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0002  DNA polymerase III subunit beta  30.81 
 
 		 371 aa  201  1.9999999999999998e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0002  DNA polymerase III, beta subunit  31.56 
 
 		 373 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00126039  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0002  DNA polymerase III subunit beta  30.75 
 
 		 371 aa  200  3e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0290452  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0002  DNA polymerase III, beta subunit  32.09 
 
 		 366 aa  200  3e-50  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000466477  normal  0.315264 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0002  DNA polymerase III, beta subunit  30.46 
 
 		 367 aa  200  3.9999999999999996e-50  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.00000348538  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0002  DNA polymerase III, beta subunit  31.1 
 
 		 366 aa  200  3.9999999999999996e-50  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000267756  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3715  DNA polymerase III, beta subunit  32 
 
 		 367 aa  199  7e-50  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.348294  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0001  DNA polymerase III, beta subunit  31.12 
 
 		 372 aa  198  1.0000000000000001e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0872728  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0002  DNA polymerase III subunit beta  30.16 
 
 		 368 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.481367  normal  0.530719 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2554  DNA polymerase III subunit beta  30.16 
 
 		 368 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.376427  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0002  DNA polymerase III, beta subunit  30.19 
 
 		 366 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.00000000544098  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0002  DNA polymerase III subunit beta  30.16 
 
 		 368 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0846842  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0002  DNA polymerase III subunit beta  30.05 
 
 		 368 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0232451  hitchhiker  0.0000583688 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0002  DNA polymerase III, beta subunit  31.83 
 
 		 376 aa  197  2.0000000000000003e-49  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0002  DNA polymerase III subunit beta  29.38 
 
 		 367 aa  197  3e-49  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000000905958  normal  0.127223 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00020  DNA polymerase III subunit beta  31.99 
 
 		 367 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3183  DNA polymerase III subunit beta  29.89 
 
 		 368 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00267181  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0002  DNA polymerase III subunit beta  29.89 
 
 		 368 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0645593  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0002  DNA polymerase III subunit beta  29.89 
 
 		 368 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.011531  normal  0.38726 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0002  DNA polymerase III subunit beta  30.46 
 
 		 371 aa  196  7e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.359453  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>