More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene WD1067 on replicon NC_002978
Organism: Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002978  WD1067  DNA polymerase III, beta subunit  100 
 
 		 365 aa  744    Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0458358  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0815  DNA polymerase III, beta subunit  46.2 
 
 		 375 aa  334  2e-90  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  unclonable  0.000000015774  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1009  DNA polymerase III, beta subunit  47.01 
 
 		 369 aa  331  1e-89  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3047  DNA polymerase III subunit beta  42.43 
 
 		 371 aa  312  5.999999999999999e-84  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.579013  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3705  DNA polymerase III subunit beta  42.32 
 
 		 372 aa  306  3e-82  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0432616 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2239  DNA polymerase III subunit beta  42.47 
 
 		 373 aa  305  1.0000000000000001e-81  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0102545  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0002  DNA polymerase III subunit beta  42.32 
 
 		 372 aa  303  2.0000000000000002e-81  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0002  DNA polymerase III subunit beta  43.01 
 
 		 373 aa  303  4.0000000000000003e-81  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0861969  hitchhiker  0.000000929484 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0004  DNA polymerase III subunit beta  40.7 
 
 		 372 aa  302  6.000000000000001e-81  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000114385  unclonable  5.12755e-25 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0002  DNA polymerase III subunit beta  43.13 
 
 		 372 aa  302  7.000000000000001e-81  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.142435  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0003  DNA polymerase III subunit beta  41.13 
 
 		 373 aa  300  3e-80  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.991791  normal  0.512948 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0002  DNA polymerase III subunit beta  41.13 
 
 		 373 aa  299  4e-80  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.969312  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0003  DNA polymerase III subunit beta  40.86 
 
 		 373 aa  298  8e-80  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.174848  normal  0.920378 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0002  DNA polymerase III subunit beta  40.97 
 
 		 372 aa  294  1e-78  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0002  DNA polymerase III subunit beta  40.7 
 
 		 372 aa  295  1e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.120269  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0002  DNA polymerase III subunit beta  40.05 
 
 		 373 aa  293  3e-78  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0823829  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0002  DNA polymerase III subunit beta  40.05 
 
 		 373 aa  293  3e-78  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.125376 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0002  DNA polymerase III subunit beta  41.24 
 
 		 372 aa  293  5e-78  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0002  DNA polymerase III subunit beta  40.7 
 
 		 372 aa  291  1e-77  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0730917  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0002  DNA polymerase III subunit beta  40.7 
 
 		 372 aa  289  4e-77  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.205747 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0002  DNA polymerase III subunit beta  40.16 
 
 		 372 aa  288  8e-77  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000275643  normal  0.722211 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3543  DNA polymerase III subunit beta  41.24 
 
 		 372 aa  288  1e-76  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0708  DNA polymerase III subunit beta  40.7 
 
 		 371 aa  285  1.0000000000000001e-75  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.147601  normal  0.843721 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0002  DNA polymerase III subunit beta  40.16 
 
 		 372 aa  281  2e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4329  DNA polymerase III subunit beta  40.7 
 
 		 372 aa  279  5e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0002  DNA polymerase III subunit beta  40.43 
 
 		 372 aa  278  9e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2795  DNA polymerase III subunit beta  40.54 
 
 		 370 aa  277  2e-73  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.924667  normal  0.594035 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0004  DNA polymerase III subunit beta  40.7 
 
 		 385 aa  277  2e-73  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.638398  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0002  DNA polymerase III subunit beta  40.43 
 
 		 397 aa  276  3e-73  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00789927  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0002  DNA polymerase III subunit beta  40.16 
 
 		 397 aa  275  1.0000000000000001e-72  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.41342  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0351  DNA polymerase III subunit beta  39.89 
 
 		 412 aa  273  3e-72  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.203557  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4592  DNA polymerase III subunit beta  40.16 
 
 		 372 aa  272  7e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0352599 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1437  DNA polymerase III subunit beta  37.8 
 
 		 374 aa  271  2e-71  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0003  DNA polymerase III subunit beta  39.08 
 
 		 372 aa  270  2.9999999999999997e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.295963  hitchhiker  0.00000350231 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2834  DNA polymerase III subunit beta  39.35 
 
 		 372 aa  270  2.9999999999999997e-71  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3374  DNA polymerase III subunit beta  39.89 
 
 		 372 aa  270  2.9999999999999997e-71  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0012  DNA polymerase III subunit beta  38.81 
 
 		 372 aa  264  2e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1343  DNA polymerase III subunit beta  38.81 
 
 		 372 aa  264  2e-69  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0162  DNA polymerase III subunit beta  36.39 
 
 		 372 aa  262  8e-69  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.281652  normal  0.419565 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1429  DNA polymerase III subunit beta  38.13 
 
 		 375 aa  260  2e-68  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.314703  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0002  DNA polymerase III subunit beta  38.01 
 
 		 372 aa  258  1e-67  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.474691  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1278  DNA polymerase III subunit beta  38.71 
 
 		 373 aa  253  5.000000000000001e-66  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  unclonable  2.76035e-25  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0002  DNA polymerase III subunit beta  37.53 
 
 		 374 aa  251  1e-65  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0002  DNA polymerase III subunit beta  37.63 
 
 		 373 aa  249  4e-65  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0966551  normal  0.572668 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0002  DNA polymerase III, beta subunit  34.88 
 
 		 367 aa  243  5e-63  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00000485336  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0014  DNA-directed DNA polymerase  36.04 
 
 		 366 aa  238  9e-62  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000733559  hitchhiker  0.000643873 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0002  DNA polymerase III, beta subunit  35.42 
 
 		 366 aa  236  5.0000000000000005e-61  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000472427  hitchhiker  0.00139326 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0002  DNA polymerase III subunit beta  32.7 
 
 		 367 aa  236  6e-61  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.186277  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0010  DNA polymerase III, beta subunit  35.42 
 
 		 366 aa  235  7e-61  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000642144  hitchhiker  0.00000000134313 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0002  DNA polymerase III, beta subunit  35.42 
 
 		 366 aa  235  7e-61  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000577304  unclonable  0.000000000023362 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0009  DNA polymerase III, beta subunit  35.42 
 
 		 366 aa  235  9e-61  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0002  DNA polymerase III subunit beta  34.88 
 
 		 367 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0002  DNA polymerase III, beta subunit  36.29 
 
 		 372 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000259068  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00003  DNA polymerase III, beta subunit  33.6 
 
 		 366 aa  231  1e-59  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0000112219  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0007  DNA-directed DNA polymerase  33.79 
 
 		 366 aa  230  3e-59  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000118658  unclonable  0.000000000121971 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0002  DNA polymerase III, beta subunit  33.97 
 
 		 366 aa  230  3e-59  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000267756  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0002  DNA polymerase III, beta subunit  33.79 
 
 		 366 aa  230  3e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000136085  unclonable  0.00000000917615 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0002  DNA polymerase III, beta subunit  34.88 
 
 		 366 aa  230  3e-59  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000000490932  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0002  DNA polymerase III subunit beta  35.15 
 
 		 367 aa  230  3e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0002  DNA polymerase III, beta subunit  34.6 
 
 		 366 aa  229  4e-59  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000000103765  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0002  DNA polymerase III, beta subunit  34.6 
 
 		 366 aa  229  4e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000848773  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0002  DNA polymerase III, beta subunit  34.6 
 
 		 366 aa  229  4e-59  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000000637071  unclonable  0.00000000000326658 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0002  DNA polymerase III, beta subunit  34.6 
 
 		 366 aa  229  4e-59  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000634429  hitchhiker  0.000143129 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1226  DNA polymerase III, beta subunit  34.43 
 
 		 366 aa  229  7e-59  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.123805  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0002  DNA polymerase III, beta subunit  35.69 
 
 		 366 aa  228  1e-58  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.348811  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00020  DNA polymerase III subunit beta  34.88 
 
 		 367 aa  228  1e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0002  DNA polymerase III, beta subunit  33.97 
 
 		 366 aa  227  2e-58  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000158001  unclonable  0.00000341195 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0002  DNA polymerase III, beta subunit  33.33 
 
 		 372 aa  226  4e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0618208  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0002  DNA polymerase III, beta subunit  33.06 
 
 		 372 aa  226  6e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0002  DNA polymerase III, beta subunit  33.06 
 
 		 366 aa  225  8e-58  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000466477  normal  0.315264 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0002  DNA polymerase III, beta subunit  33.79 
 
 		 366 aa  225  1e-57  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000000200886  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0002  DNA polymerase III, beta subunit  32.43 
 
 		 367 aa  223  3e-57  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.40244  normal  0.672581 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00020  DNA polymerase III subunit beta  35.15 
 
 		 367 aa  224  3e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0011  DNA polymerase III subunit beta  34.33 
 
 		 367 aa  223  4e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.12322  hitchhiker  0.00002839 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0002  DNA polymerase III subunit beta  34.33 
 
 		 367 aa  223  4e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.123405  normal  0.0743731 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0002  DNA polymerase III, beta subunit  33.79 
 
 		 367 aa  223  4e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03584  DNA polymerase III subunit beta  33.51 
 
 		 366 aa  223  4.9999999999999996e-57  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.120571  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0002  DNA polymerase III, beta subunit  33.51 
 
 		 366 aa  223  4.9999999999999996e-57  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000276402  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03528  hypothetical protein  33.51 
 
 		 366 aa  223  4.9999999999999996e-57  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0779462  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0002  DNA polymerase III subunit beta  33.51 
 
 		 366 aa  223  4.9999999999999996e-57  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0647653  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4211  DNA polymerase III subunit beta  33.51 
 
 		 366 aa  223  4.9999999999999996e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000853421  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5129  DNA polymerase III subunit beta  33.51 
 
 		 366 aa  223  4.9999999999999996e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000402669  normal  0.135624 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0002  DNA polymerase III subunit beta  32.7 
 
 		 367 aa  223  4.9999999999999996e-57  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000000905958  normal  0.127223 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4224  DNA polymerase III subunit beta  33.51 
 
 		 366 aa  223  4.9999999999999996e-57  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000133889  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3914  DNA polymerase III subunit beta  33.51 
 
 		 366 aa  223  4.9999999999999996e-57  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000199842  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0004  DNA polymerase III subunit beta  34.33 
 
 		 367 aa  223  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0002  DNA polymerase III, beta subunit  34.06 
 
 		 366 aa  223  4.9999999999999996e-57  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.00000000544098  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4066  DNA polymerase III subunit beta  33.51 
 
 		 366 aa  223  4.9999999999999996e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0145467  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0002  DNA polymerase III subunit beta  34.33 
 
 		 367 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.121469  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0002  DNA polymerase III subunit beta  35.42 
 
 		 371 aa  219  7.999999999999999e-56  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3441  DNA polymerase III subunit beta  35.15 
 
 		 371 aa  218  1e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.325472  normal  0.470058 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0002  DNA polymerase III subunit beta  33.24 
 
 		 367 aa  218  1e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0002  DNA polymerase III subunit beta  35.15 
 
 		 371 aa  218  1e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0290452  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4229  DNA polymerase III subunit beta  32.7 
 
 		 366 aa  218  2e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4171  DNA polymerase III subunit beta  32.7 
 
 		 366 aa  218  2e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.264257  normal  0.345578 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0002  DNA polymerase III subunit beta  33.51 
 
 		 365 aa  218  2e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.0000000590568  unclonable  0.00000000000512174 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4122  DNA polymerase III subunit beta  32.7 
 
 		 366 aa  218  2e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.381174  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4049  DNA polymerase III subunit beta  32.7 
 
 		 366 aa  217  2e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.22368  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4065  DNA polymerase III subunit beta  32.7 
 
 		 366 aa  218  2e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00365243  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0002  DNA polymerase III, beta subunit  32.53 
 
 		 372 aa  217  2.9999999999999998e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>