More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlut_00020 on replicon NC_012803
Organism: Micrococcus luteus NCTC 2665



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012803  Mlut_00020  DNA polymerase III, beta subunit  100 
 
 
374 aa  741    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0002  DNA polymerase III, beta subunit  65.59 
 
 
374 aa  482  1e-135  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000000025514 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0002  DNA polymerase III, beta subunit  64.78 
 
 
374 aa  480  1e-134  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0002  DNA polymerase III, beta subunit  58.51 
 
 
377 aa  426  1e-118  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00020  DNA polymerase III, beta subunit  57.87 
 
 
376 aa  422  1e-117  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0002  DNA polymerase III, beta subunit  56.53 
 
 
376 aa  420  1e-116  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0002  DNA polymerase III, beta subunit  57.29 
 
 
378 aa  418  1e-116  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0002  DNA polymerase III, beta subunit  57.07 
 
 
376 aa  418  1e-116  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.000000849521  normal  0.168185 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0002  DNA polymerase III subunit beta  54.5 
 
 
408 aa  406  1.0000000000000001e-112  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00020  DNA polymerase III, beta subunit  53.74 
 
 
374 aa  402  1e-111  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.218776  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00020  DNA polymerase III, beta subunit  53.6 
 
 
378 aa  400  9.999999999999999e-111  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0002  DNA polymerase III, beta subunit  57.07 
 
 
383 aa  401  9.999999999999999e-111  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00435185 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0002  DNA polymerase III, beta subunit  51.06 
 
 
375 aa  377  1e-103  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000684448  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0002  DNA-directed DNA polymerase  50.8 
 
 
379 aa  369  1e-101  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000640008  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0002  DNA polymerase III subunit beta  49.6 
 
 
380 aa  365  1e-100  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.000000143991  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0002  DNA polymerase III subunit beta  46.8 
 
 
396 aa  352  7e-96  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0135269  normal  0.401999 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0002  DNA polymerase III, beta subunit  50 
 
 
379 aa  345  8e-94  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.000269969  hitchhiker  0.00612818 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0002  DNA polymerase III subunit beta  50.93 
 
 
378 aa  342  5e-93  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0259305  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0003  DNA polymerase III, beta subunit  45.5 
 
 
402 aa  338  9.999999999999999e-92  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.0000138278  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0002  DNA polymerase III, beta subunit  46.35 
 
 
386 aa  330  2e-89  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0002  DNA polymerase III, beta subunit  45.48 
 
 
388 aa  330  3e-89  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0002  DNA polymerase III subunit beta  46.54 
 
 
378 aa  328  7e-89  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.065739  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10002  DNA polymerase III subunit beta  44.33 
 
 
402 aa  327  2.0000000000000001e-88  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0002  DNA polymerase III, beta subunit  46.08 
 
 
408 aa  325  7e-88  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0002  DNA polymerase III, beta subunit  47.8 
 
 
387 aa  324  1e-87  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0003  DNA polymerase III, beta subunit  44.42 
 
 
396 aa  324  2e-87  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0002  DNA polymerase III subunit beta  43.9 
 
 
398 aa  322  8e-87  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.298765  normal  0.252015 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0003  DNA polymerase III, beta subunit  47.14 
 
 
386 aa  321  1.9999999999999998e-86  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.301808 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0003  DNA polymerase III, beta subunit  47.07 
 
 
377 aa  319  3.9999999999999996e-86  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.000000000316606  hitchhiker  0.00386911 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0002  DNA polymerase III subunit beta  43.23 
 
 
398 aa  317  2e-85  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.042032 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0826  DNA polymerase III subunit beta  43.9 
 
 
398 aa  317  3e-85  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0002  DNA polymerase III subunit beta  43.23 
 
 
398 aa  316  4e-85  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0010  DNA polymerase III subunit beta  43.23 
 
 
398 aa  316  4e-85  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.716793  normal  0.123554 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0086  DNA polymerase III subunit beta  43.68 
 
 
379 aa  315  8e-85  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0002  DNA polymerase III, beta subunit  47.07 
 
 
377 aa  313  2.9999999999999996e-84  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  hitchhiker  0.00244113  unclonable  0.0000000186271 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1435  DNA polymerase III subunit beta  42.47 
 
 
374 aa  308  1.0000000000000001e-82  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.674698  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00020  DNA polymerase III subunit beta  47.75 
 
 
379 aa  304  2.0000000000000002e-81  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00000000251098  normal  0.535088 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0044  DNA polymerase III, beta subunit  38.98 
 
 
374 aa  303  2.0000000000000002e-81  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9328  DNA-directed DNA polymerase  44.59 
 
 
365 aa  300  3e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.608924  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5295  DNA polymerase III, beta subunit  42.19 
 
 
384 aa  298  1e-79  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0002  DNA polymerase III subunit beta  44.56 
 
 
380 aa  297  2e-79  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.000348637  normal  0.134322 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3544  DNA polymerase III subunit beta  43.36 
 
 
364 aa  271  1e-71  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.908435  normal  0.835762 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0738  DNA polymerase III beta subunit family protein  38.46 
 
 
433 aa  244  1.9999999999999999e-63  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.911699 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5871  DNA polymerase III, beta subunit  40.24 
 
 
404 aa  243  3.9999999999999997e-63  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.24159  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0002  DNA polymerase III, beta subunit  32.7 
 
 
375 aa  192  1e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.000000418991  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00020  DNA polymerase III, beta subunit  28.34 
 
 
365 aa  174  2.9999999999999996e-42  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.443906  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0003  DNA polymerase III, beta subunit  29.71 
 
 
366 aa  173  5.999999999999999e-42  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000553224  hitchhiker  0.000000389013 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0002  DNA polymerase III, beta subunit  30.93 
 
 
369 aa  171  1e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00020  DNA polymerase III, beta subunit  29.1 
 
 
365 aa  168  1e-40  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000592113  decreased coverage  0.0000599685 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0002  DNA polymerase III subunit beta  27.88 
 
 
366 aa  166  5.9999999999999996e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.279408  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0002  DNA polymerase III subunit beta  27.88 
 
 
366 aa  166  5.9999999999999996e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.316057  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0002  DNA polymerase III, beta subunit  26.34 
 
 
365 aa  152  8.999999999999999e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.610199  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0001  DNA polymerase III subunit beta  29.02 
 
 
385 aa  151  2e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0340  DNA polymerase III subunit beta  30.3 
 
 
394 aa  149  8e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0003  DNA polymerase III, beta subunit  28.53 
 
 
366 aa  147  2.0000000000000003e-34  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0001  DNA polymerase III subunit beta  28.31 
 
 
390 aa  147  3e-34  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.174171  normal  0.105878 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0002  DNA polymerase III, beta subunit  27.86 
 
 
376 aa  146  5e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00001  DNA polymerase III subunit beta  27.75 
 
 
385 aa  143  5e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1203  DNA polymerase III, beta subunit  26.33 
 
 
367 aa  143  6e-33  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0971789  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0231  DNA polymerase III, beta subunit  25 
 
 
367 aa  142  9.999999999999999e-33  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000000874025  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2552  DNA polymerase III subunit beta  26.56 
 
 
377 aa  142  9.999999999999999e-33  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0587336  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00001  DNA polymerase III subunit beta  28.23 
 
 
385 aa  140  1.9999999999999998e-32  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.280893  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00001  DNA polymerase III subunit beta  27.32 
 
 
397 aa  141  1.9999999999999998e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.284448  normal  0.0167825 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0002  DNA polymerase III subunit beta  26.03 
 
 
381 aa  140  3e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0993  DNA polymerase III, beta subunit  26.51 
 
 
376 aa  140  3e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0011  DNA polymerase III subunit beta  28.72 
 
 
367 aa  139  8.999999999999999e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.12322  hitchhiker  0.00002839 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0002  DNA polymerase III subunit beta  28.72 
 
 
367 aa  139  8.999999999999999e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.123405  normal  0.0743731 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2082  DNA polymerase IF1 subunit beta  27.79 
 
 
382 aa  138  1e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0161872  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0662  DNA polymerase III, beta subunit  25 
 
 
366 aa  139  1e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000326321  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2372  DNA polymerase III subunit beta  25.07 
 
 
366 aa  139  1e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0002  DNA polymerase III subunit beta  25.19 
 
 
379 aa  137  2e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0872061  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0251  DNA polymerase III, beta subunit  31.55 
 
 
365 aa  138  2e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1045  DNA polymerase III subunit beta  29.75 
 
 
393 aa  137  3.0000000000000003e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000409555  unclonable  0.00000000281863 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0002  DNA polymerase III subunit beta  25.19 
 
 
379 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0173994  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1016  DNA polymerase III subunit beta  29.75 
 
 
393 aa  137  3.0000000000000003e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0002  DNA polymerase III subunit beta  25.19 
 
 
379 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000820509  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00001  DNA polymerase III subunit beta  29.26 
 
 
385 aa  137  3.0000000000000003e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.354313  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0002  DNA polymerase III, beta subunit  25.45 
 
 
378 aa  137  3.0000000000000003e-31  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.000189832  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0002  DNA polymerase III subunit beta  26.04 
 
 
377 aa  136  5e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0177596  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0002  DNA polymerase III subunit beta  26.3 
 
 
378 aa  136  5e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0002  DNA polymerase III subunit beta  26.04 
 
 
377 aa  136  5e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.00213885  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0002  DNA polymerase sliding clamp subunit  25.26 
 
 
376 aa  136  5e-31  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000188302  unclonable  1.4129e-28 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0002  DNA polymerase III subunit beta  24.94 
 
 
379 aa  136  6.0000000000000005e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00656712  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0002  DNA polymerase III subunit beta  24.94 
 
 
379 aa  136  6.0000000000000005e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.478099 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0686  DNA polymerase III, beta subunit  24.47 
 
 
366 aa  136  7.000000000000001e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0347365  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0004  DNA polymerase III subunit beta  28.46 
 
 
367 aa  136  7.000000000000001e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0002  DNA polymerase III subunit beta  24.94 
 
 
379 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.341639  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0002  DNA polymerase III subunit beta  24.94 
 
 
379 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0132884  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0002  DNA polymerase III, beta subunit  23.24 
 
 
380 aa  135  9.999999999999999e-31  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00020  DNA polymerase III, beta subunit  24.33 
 
 
367 aa  135  9.999999999999999e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0001  DNA polymerase III, beta subunit  25.74 
 
 
365 aa  134  1.9999999999999998e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.336764  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0002  DNA polymerase III, beta subunit  24.93 
 
 
367 aa  135  1.9999999999999998e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.150547  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0002  DNA polymerase III subunit beta  24.14 
 
 
370 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0002  DNA polymerase III, beta subunit  25.74 
 
 
365 aa  134  1.9999999999999998e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.0000318907  decreased coverage  0.000394754 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0010  DNA polymerase III subunit beta  28.2 
 
 
369 aa  134  3e-30  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.000914164  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2688  DNA polymerase III, beta subunit  28.07 
 
 
369 aa  133  3.9999999999999996e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0188688  hitchhiker  0.00114167 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0002  DNA polymerase III subunit beta  28.21 
 
 
387 aa  133  5e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.273248  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0749  DNA polymerase III, beta subunit  27.23 
 
 
377 aa  133  5e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00160623  normal  0.0661529 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0002  DNA polymerase III subunit beta  27.93 
 
 
367 aa  133  6e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000396971  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0002  DNA polymerase III, beta subunit  24.2 
 
 
370 aa  133  6e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000729086  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>