More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_0002 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_0002  DNA polymerase III subunit beta  100 
 
 		 396 aa  790    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0135269  normal  0.401999 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0002  DNA polymerase III, beta subunit  58.27 
 
 		 375 aa  452  1.0000000000000001e-126  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000684448  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0002  DNA polymerase III, beta subunit  58.16 
 
 		 379 aa  440  9.999999999999999e-123  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.000269969  hitchhiker  0.00612818 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0002  DNA polymerase III subunit beta  56.78 
 
 		 380 aa  438  1e-121  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.000000143991  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0002  DNA polymerase III subunit beta  56.52 
 
 		 408 aa  428  1e-119  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00020  DNA polymerase III, beta subunit  54.76 
 
 		 376 aa  427  1e-118  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0002  DNA polymerase III, beta subunit  53.98 
 
 		 376 aa  423  1e-117  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.000000849521  normal  0.168185 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0002  DNA polymerase III, beta subunit  53.69 
 
 		 377 aa  417  9.999999999999999e-116  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0002  DNA polymerase III, beta subunit  53.21 
 
 		 376 aa  411  1e-114  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0002  DNA-directed DNA polymerase  53.57 
 
 		 379 aa  411  1e-113  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000640008  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0002  DNA polymerase III, beta subunit  52.43 
 
 		 378 aa  405  1.0000000000000001e-112  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0002  DNA polymerase III subunit beta  52.81 
 
 		 378 aa  392  1e-108  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0259305  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0086  DNA polymerase III subunit beta  49.36 
 
 		 379 aa  387  1e-106  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0002  DNA polymerase III, beta subunit  50.51 
 
 		 374 aa  385  1e-106  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000000025514 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0002  DNA polymerase III, beta subunit  50.26 
 
 		 374 aa  386  1e-106  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0002  DNA polymerase III, beta subunit  51.02 
 
 		 383 aa  380  1e-104  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00435185 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00020  DNA polymerase III, beta subunit  49.23 
 
 		 378 aa  378  1e-104  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00020  DNA polymerase III, beta subunit  48.46 
 
 		 374 aa  377  1e-103  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.218776  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0002  DNA polymerase III, beta subunit  50.5 
 
 		 386 aa  374  1e-102  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0003  DNA polymerase III, beta subunit  48.27 
 
 		 396 aa  369  1e-101  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5295  DNA polymerase III, beta subunit  49.49 
 
 		 384 aa  367  1e-100  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0002  DNA polymerase III, beta subunit  48.39 
 
 		 388 aa  366  1e-100  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0002  DNA polymerase III, beta subunit  49.5 
 
 		 387 aa  367  1e-100  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0002  DNA polymerase III subunit beta  47.9 
 
 		 398 aa  361  1e-98  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.298765  normal  0.252015 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0002  DNA polymerase III, beta subunit  46.85 
 
 		 408 aa  360  2e-98  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0002  DNA polymerase III subunit beta  48.27 
 
 		 398 aa  360  3e-98  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.042032 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0002  DNA polymerase III subunit beta  48.27 
 
 		 398 aa  358  7e-98  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0010  DNA polymerase III subunit beta  48.27 
 
 		 398 aa  358  7e-98  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.716793  normal  0.123554 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9328  DNA-directed DNA polymerase  48.46 
 
 		 365 aa  357  1.9999999999999998e-97  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.608924  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10002  DNA polymerase III subunit beta  46.31 
 
 		 402 aa  357  1.9999999999999998e-97  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0003  DNA polymerase III, beta subunit  45.82 
 
 		 402 aa  355  5e-97  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.0000138278  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0826  DNA polymerase III subunit beta  48.4 
 
 		 398 aa  355  6.999999999999999e-97  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00020  DNA polymerase III, beta subunit  46.8 
 
 		 374 aa  352  8e-96  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0003  DNA polymerase III, beta subunit  48.49 
 
 		 377 aa  348  9e-95  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.000000000316606  hitchhiker  0.00386911 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0002  DNA polymerase III, beta subunit  48.99 
 
 		 377 aa  348  1e-94  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  hitchhiker  0.00244113  unclonable  0.0000000186271 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0003  DNA polymerase III, beta subunit  46.77 
 
 		 386 aa  344  2e-93  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.301808 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0002  DNA polymerase III subunit beta  46.95 
 
 		 378 aa  338  7e-92  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.065739  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00020  DNA polymerase III subunit beta  46.45 
 
 		 379 aa  319  6e-86  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00000000251098  normal  0.535088 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0002  DNA polymerase III subunit beta  46.19 
 
 		 380 aa  315  9.999999999999999e-85  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.000348637  normal  0.134322 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3544  DNA polymerase III subunit beta  43.62 
 
 		 364 aa  306  5.0000000000000004e-82  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.908435  normal  0.835762 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0044  DNA polymerase III, beta subunit  39.59 
 
 		 374 aa  297  3e-79  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1435  DNA polymerase III subunit beta  39.07 
 
 		 374 aa  294  2e-78  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.674698  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5871  DNA polymerase III, beta subunit  41.2 
 
 		 404 aa  275  1.0000000000000001e-72  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.24159  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0738  DNA polymerase III beta subunit family protein  38.1 
 
 		 433 aa  255  8e-67  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.911699 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0002  DNA polymerase III, beta subunit  28.57 
 
 		 375 aa  168  2e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.000000418991  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00020  DNA polymerase III, beta subunit  29.01 
 
 		 365 aa  167  4e-40  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.443906  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0002  DNA polymerase III subunit beta  27.71 
 
 		 366 aa  167  4e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.279408  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0002  DNA polymerase III subunit beta  27.71 
 
 		 366 aa  167  4e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.316057  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0002  DNA polymerase III subunit beta  26.14 
 
 		 366 aa  162  7e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.039801  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0003  DNA polymerase III, beta subunit  26.97 
 
 		 366 aa  162  8.000000000000001e-39  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000553224  hitchhiker  0.000000389013 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2372  DNA polymerase III subunit beta  25.63 
 
 		 366 aa  156  5.0000000000000005e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0002  DNA polymerase III, beta subunit  29.11 
 
 		 369 aa  155  9e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1016  DNA polymerase III subunit beta  28.33 
 
 		 393 aa  150  5e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0002  DNA polymerase III subunit beta  28.08 
 
 		 387 aa  150  5e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.273248  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0199  DNA polymerase III subunit beta  28.21 
 
 		 374 aa  150  5e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.0000579402  normal  0.0770055 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1045  DNA polymerase III subunit beta  28.33 
 
 		 393 aa  150  5e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000409555  unclonable  0.00000000281863 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0001  DNA polymerase III subunit beta  26.85 
 
 		 385 aa  149  8e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00020  DNA polymerase III, beta subunit  27.74 
 
 		 365 aa  148  1.0000000000000001e-34  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000592113  decreased coverage  0.0000599685 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00001  DNA polymerase III subunit beta  26.6 
 
 		 385 aa  148  2.0000000000000003e-34  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.280893  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0002  DNA polymerase III, beta subunit  26.91 
 
 		 378 aa  148  2.0000000000000003e-34  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.000189832  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2552  DNA polymerase III subunit beta  27.86 
 
 		 377 aa  146  5e-34  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0587336  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2082  DNA polymerase IF1 subunit beta  26.89 
 
 		 382 aa  146  7.0000000000000006e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0161872  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00001  DNA polymerase III subunit beta  25.86 
 
 		 385 aa  143  6e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0002  DNA polymerase III subunit beta  28.36 
 
 		 377 aa  142  8e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.00213885  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0002  DNA polymerase III subunit beta  28.36 
 
 		 377 aa  142  8e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0177596  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00001  DNA polymerase III subunit beta  27.27 
 
 		 385 aa  141  1.9999999999999998e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.354313  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0002  DNA polymerase III subunit beta  27.01 
 
 		 378 aa  139  7.999999999999999e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0001  DNA polymerase III subunit beta  26.45 
 
 		 390 aa  137  2e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.174171  normal  0.105878 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0002  DNA polymerase III, beta subunit  28.25 
 
 		 374 aa  137  4e-31  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.00000374529  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0001  DNA polymerase III subunit beta  27.16 
 
 		 385 aa  137  5e-31  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0816  DNA polymerase III, beta subunit  26.88 
 
 		 366 aa  136  8e-31  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.731986  normal  0.187979 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0002  DNA polymerase III subunit beta  27.3 
 
 		 379 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00656712  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0002  DNA polymerase III subunit beta  27.3 
 
 		 379 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0872061  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0002  DNA polymerase III subunit beta  27.3 
 
 		 379 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.478099 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0993  DNA polymerase III, beta subunit  26.12 
 
 		 376 aa  135  1.9999999999999998e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0002  DNA polymerase III subunit beta  27.3 
 
 		 379 aa  134  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000820509  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0002  DNA polymerase III subunit beta  27.42 
 
 		 381 aa  134  3.9999999999999996e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000678483  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0002  DNA polymerase III subunit beta  27.3 
 
 		 379 aa  133  5e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0173994  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0002  DNA polymerase III subunit beta  27.05 
 
 		 379 aa  133  6e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.341639  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0815  DNA polymerase III, beta subunit  25.13 
 
 		 375 aa  133  6e-30  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  unclonable  0.000000015774  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0002  DNA polymerase III subunit beta  27.05 
 
 		 379 aa  133  6e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0132884  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0002  DNA polymerase III, beta subunit  26.77 
 
 		 365 aa  132  7.999999999999999e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.610199  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0002  DNA polymerase III subunit beta  27.94 
 
 		 381 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1513  DNA polymerase III, beta subunit  26.85 
 
 		 381 aa  131  2.0000000000000002e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000166783  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0340  DNA polymerase III subunit beta  26.54 
 
 		 394 aa  131  3e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5318  DNA polymerase III subunit beta  27.76 
 
 		 381 aa  130  6e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.00172021  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0002  DNA polymerase III subunit beta  27.76 
 
 		 381 aa  130  6e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000341772  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0003  DNA polymerase III, beta subunit  26.26 
 
 		 366 aa  129  1.0000000000000001e-28  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0003  DNA polymerase III, beta subunit  26.79 
 
 		 374 aa  128  2.0000000000000002e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00459981  hitchhiker  0.00000116577 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0002  DNA polymerase III subunit beta  23.74 
 
 		 370 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00001  DNA polymerase III subunit beta  26.21 
 
 		 388 aa  128  2.0000000000000002e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.652632 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1036  DNA polymerase III, beta subunit  25.44 
 
 		 378 aa  127  3e-28  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.0000000328779  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0001  DNA polymerase III, beta subunit  25.45 
 
 		 365 aa  127  3e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.336764  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0002  DNA polymerase III, beta subunit  25.89 
 
 		 367 aa  127  3e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.150547  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00020  DNA polymerase III subunit beta  28.03 
 
 		 367 aa  127  3e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0002  DNA polymerase III, beta subunit  25.45 
 
 		 365 aa  127  3e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.0000318907  decreased coverage  0.000394754 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0003  DNA polymerase III, beta subunit  27.85 
 
 		 360 aa  127  4.0000000000000003e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  unclonable  0.0000000103313  normal  1 
 
 
 
NC_002939  GSU0001  DNA polymerase III, beta subunit  26.18 
 
 		 372 aa  126  5e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0872728  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0002  DNA polymerase III subunit beta  27.27 
 
 		 367 aa  126  6e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.121469  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1009  DNA polymerase III, beta subunit  24.94 
 
 		 378 aa  125  1e-27  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.0000000000512645  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>