More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_0003 on replicon NC_012034
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012034  Athe_0003  DNA polymerase III, beta subunit  100 
 
 
368 aa  733    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000559768  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2372  DNA polymerase III subunit beta  31.35 
 
 
366 aa  189  1e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0002  DNA polymerase III subunit beta  31.89 
 
 
366 aa  187  2e-46  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.279408  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0002  DNA polymerase III subunit beta  31.89 
 
 
366 aa  187  2e-46  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.316057  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0002  DNA polymerase III, beta subunit  30.91 
 
 
367 aa  177  2e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.150547  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0002  DNA polymerase III subunit beta  29.33 
 
 
370 aa  174  2.9999999999999996e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0002  DNA polymerase III subunit beta  30.11 
 
 
366 aa  168  1e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.039801  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0002  DNA polymerase III, beta subunit  29.03 
 
 
365 aa  158  2e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.610199  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0002  DNA polymerase III, beta subunit  28.19 
 
 
373 aa  154  2e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.394263  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0002  DNA polymerase III, beta subunit  27.27 
 
 
375 aa  153  5.9999999999999996e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.000000418991  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0002  DNA polymerase III, beta subunit  27.01 
 
 
369 aa  149  6e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0001  DNA polymerase III, beta subunit  28 
 
 
372 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0872728  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0003  DNA polymerase III, beta subunit  28.42 
 
 
366 aa  147  2.0000000000000003e-34  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000553224  hitchhiker  0.000000389013 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0003  DNA polymerase III, beta subunit  26.6 
 
 
374 aa  148  2.0000000000000003e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00459981  hitchhiker  0.00000116577 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0002  DNA polymerase III, beta subunit  27.35 
 
 
370 aa  148  2.0000000000000003e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0002  DNA-directed DNA polymerase  29.84 
 
 
409 aa  147  3e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0002  DNA polymerase III subunit beta  28.5 
 
 
379 aa  145  8.000000000000001e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0173994  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0002  DNA polymerase III subunit beta  28.5 
 
 
379 aa  145  8.000000000000001e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000820509  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0001  DNA polymerase III subunit beta  27.39 
 
 
390 aa  145  1e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.174171  normal  0.105878 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0002  DNA polymerase III, beta subunit  27.25 
 
 
375 aa  145  1e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000684448  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0002  DNA polymerase III subunit beta  28.5 
 
 
379 aa  144  2e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0872061  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0002  DNA polymerase III subunit beta  27.7 
 
 
378 aa  144  2e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1551  DNA polymerase III, beta subunit  27.01 
 
 
367 aa  144  3e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.422589  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0002  DNA polymerase III, beta subunit  28.73 
 
 
376 aa  144  3e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0002  DNA polymerase III subunit beta  27.82 
 
 
381 aa  143  5e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0002  DNA polymerase III, beta subunit  25.8 
 
 
372 aa  143  5e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0618208  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5318  DNA polymerase III subunit beta  27.82 
 
 
381 aa  142  7e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.00172021  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0002  DNA polymerase III subunit beta  27.18 
 
 
378 aa  142  7e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000167002  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0002  DNA polymerase III subunit beta  27.82 
 
 
381 aa  142  7e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000341772  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0816  DNA polymerase III, beta subunit  26.88 
 
 
366 aa  142  8e-33  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.731986  normal  0.187979 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1045  DNA polymerase III subunit beta  26.46 
 
 
393 aa  142  8e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000409555  unclonable  0.00000000281863 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1016  DNA polymerase III subunit beta  26.46 
 
 
393 aa  142  8e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0002  DNA polymerase III subunit beta  28.23 
 
 
379 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00656712  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4880  DNA polymerase III, beta subunit  28.35 
 
 
379 aa  142  9.999999999999999e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0815  DNA polymerase III, beta subunit  28.69 
 
 
375 aa  142  9.999999999999999e-33  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  unclonable  0.000000015774  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0002  DNA polymerase III, beta subunit  27.37 
 
 
372 aa  142  9.999999999999999e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000259068  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0002  DNA polymerase III subunit beta  28.23 
 
 
379 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.478099 
 
 
-
 
NC_002936  DET1227  DNA polymerase III, beta subunit  27.06 
 
 
378 aa  141  1.9999999999999998e-32  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.0000128167  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0002  DNA polymerase III, beta subunit  27.32 
 
 
372 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0002  DNA polymerase III, beta subunit  25.8 
 
 
372 aa  141  1.9999999999999998e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0003  DNA polymerase III subunit beta  27.68 
 
 
373 aa  140  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.174848  normal  0.920378 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0002  DNA polymerase III subunit beta  28.72 
 
 
381 aa  139  4.999999999999999e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000678483  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1009  DNA polymerase III, beta subunit  26.79 
 
 
378 aa  140  4.999999999999999e-32  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.0000000000512645  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0002  DNA polymerase III subunit beta  27.97 
 
 
379 aa  139  7e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.341639  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0002  DNA polymerase III subunit beta  27.97 
 
 
379 aa  139  7e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0132884  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0003  DNA polymerase III subunit beta  27.53 
 
 
373 aa  139  1e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.991791  normal  0.512948 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0002  DNA polymerase III subunit beta  27.53 
 
 
373 aa  138  1e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.969312  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0002  DNA polymerase III, beta subunit  27.97 
 
 
375 aa  138  1e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1278  DNA polymerase III subunit beta  27.97 
 
 
373 aa  139  1e-31  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  unclonable  2.76035e-25  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0002  DNA polymerase III, beta subunit  27.68 
 
 
375 aa  137  2e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.301651  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1036  DNA polymerase III, beta subunit  26.79 
 
 
378 aa  137  2e-31  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.0000000328779  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0002  DNA polymerase III, beta subunit  27.92 
 
 
375 aa  137  2e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0003  DNA polymerase III, beta subunit  26.54 
 
 
366 aa  138  2e-31  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2552  DNA polymerase III subunit beta  27.11 
 
 
377 aa  137  3.0000000000000003e-31  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0587336  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2239  DNA polymerase III subunit beta  26.89 
 
 
373 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0102545  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0708  DNA polymerase III subunit beta  25.67 
 
 
371 aa  137  3.0000000000000003e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.147601  normal  0.843721 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0002  DNA polymerase III, beta subunit  26.74 
 
 
367 aa  137  4e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.00000000146926  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0002  DNA polymerase sliding clamp subunit  26.06 
 
 
376 aa  137  4e-31  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000188302  unclonable  1.4129e-28 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0340  DNA polymerase III subunit beta  27.46 
 
 
394 aa  136  5e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0002  DNA polymerase III subunit beta  27.59 
 
 
373 aa  136  5e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0823829  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0002  DNA polymerase III subunit beta  27.59 
 
 
373 aa  136  7.000000000000001e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.125376 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0162  DNA polymerase III subunit beta  26.13 
 
 
372 aa  136  7.000000000000001e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.281652  normal  0.419565 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0002  DNA polymerase III subunit beta  28.12 
 
 
372 aa  135  9e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.142435  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2082  DNA polymerase IF1 subunit beta  24.35 
 
 
382 aa  135  9.999999999999999e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0161872  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00020  DNA polymerase III, beta subunit  26.95 
 
 
365 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.443906  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1009  DNA polymerase III, beta subunit  28.15 
 
 
369 aa  135  1.9999999999999998e-30  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0953  DNA polymerase III, beta subunit  26.58 
 
 
374 aa  135  1.9999999999999998e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD1067  DNA polymerase III, beta subunit  26.95 
 
 
365 aa  134  3e-30  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0458358  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0002  DNA polymerase III subunit beta  26.68 
 
 
367 aa  134  3e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.186277  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0002  DNA polymerase III subunit beta  25.33 
 
 
372 aa  134  3e-30  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000275643  normal  0.722211 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0002  DNA polymerase III, beta subunit  26.13 
 
 
374 aa  134  3e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.017071  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0002  DNA polymerase III, beta subunit  26.98 
 
 
374 aa  134  3e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000000025514 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4122  DNA polymerase III subunit beta  26.49 
 
 
366 aa  132  6.999999999999999e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.381174  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4171  DNA polymerase III subunit beta  26.49 
 
 
366 aa  132  6.999999999999999e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.264257  normal  0.345578 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4065  DNA polymerase III subunit beta  26.49 
 
 
366 aa  132  6.999999999999999e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00365243  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00020  DNA polymerase III, beta subunit  26.08 
 
 
365 aa  132  6.999999999999999e-30  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000592113  decreased coverage  0.0000599685 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4229  DNA polymerase III subunit beta  26.49 
 
 
366 aa  132  6.999999999999999e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4049  DNA polymerase III subunit beta  26.49 
 
 
366 aa  132  9e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.22368  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3705  DNA polymerase III subunit beta  25 
 
 
372 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0432616 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0033  DNA polymerase III subunit beta  26.15 
 
 
366 aa  132  1.0000000000000001e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.0000000234864  normal  0.233091 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0689  DNA polymerase III, beta subunit  26.51 
 
 
386 aa  132  1.0000000000000001e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0002  DNA polymerase III subunit beta  27.11 
 
 
377 aa  131  2.0000000000000002e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.00213885  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0002  DNA polymerase III subunit beta  27.11 
 
 
377 aa  131  2.0000000000000002e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0177596  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0002  DNA polymerase III subunit beta  26.22 
 
 
366 aa  131  2.0000000000000002e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.161415  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2795  DNA polymerase III subunit beta  25.47 
 
 
370 aa  131  2.0000000000000002e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.924667  normal  0.594035 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0001  DNA polymerase III subunit beta  27.25 
 
 
385 aa  131  2.0000000000000002e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3720  DNA polymerase III, beta subunit  27.22 
 
 
374 aa  130  4.0000000000000003e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.626306  normal  0.408951 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0002  DNA polymerase III subunit beta  25.68 
 
 
366 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00514307  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2506  DNA polymerase III subunit beta  26.61 
 
 
366 aa  130  4.0000000000000003e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.000000000000126636  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0002  DNA polymerase III subunit beta  25.88 
 
 
366 aa  130  4.0000000000000003e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000143561  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3374  DNA polymerase III subunit beta  27.32 
 
 
372 aa  130  4.0000000000000003e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0002  DNA polymerase III, beta subunit  27.22 
 
 
366 aa  130  4.0000000000000003e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.348811  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4152  DNA polymerase III subunit beta  25.68 
 
 
366 aa  129  6e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000517824  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3441  DNA polymerase III subunit beta  26.69 
 
 
371 aa  129  6e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.325472  normal  0.470058 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4176  DNA polymerase III subunit beta  25.68 
 
 
366 aa  129  6e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000208549  normal  0.014688 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0002  DNA polymerase III subunit beta  25.68 
 
 
366 aa  129  6e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.020055  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0002  DNA polymerase III subunit beta  25.61 
 
 
366 aa  129  7.000000000000001e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00825161  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0002  DNA polymerase III subunit beta  25.68 
 
 
366 aa  129  8.000000000000001e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00000790466  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0002  DNA polymerase III subunit beta  24.29 
 
 
387 aa  129  8.000000000000001e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.273248  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4329  DNA polymerase III subunit beta  25.99 
 
 
372 aa  129  8.000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>