More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeg_0689 on replicon NC_013385
Organism: Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013385  Adeg_0689  DNA polymerase III, beta subunit  100 
 
 		 386 aa  768    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0002  DNA polymerase III, beta subunit  62.5 
 
 		 372 aa  434  1e-120  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0002  DNA polymerase III, beta subunit  28.95 
 
 		 367 aa  155  2e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.150547  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0002  DNA polymerase III, beta subunit  29.47 
 
 		 365 aa  151  2e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.610199  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0002  DNA polymerase III subunit beta  30.36 
 
 		 387 aa  142  9.999999999999999e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.273248  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0001  DNA polymerase III subunit beta  30.31 
 
 		 390 aa  140  3e-32  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.174171  normal  0.105878 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1549  DNA polymerase III, beta subunit  28.94 
 
 		 374 aa  136  7.000000000000001e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.15445  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0003  DNA polymerase III, beta subunit  28.5 
 
 		 374 aa  133  6e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00459981  hitchhiker  0.00000116577 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0003  DNA polymerase III, beta subunit  26.51 
 
 		 368 aa  132  1.0000000000000001e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000559768  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2082  DNA polymerase IF1 subunit beta  29.9 
 
 		 382 aa  132  1.0000000000000001e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0161872  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1016  DNA polymerase III subunit beta  31.94 
 
 		 393 aa  131  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1045  DNA polymerase III subunit beta  31.94 
 
 		 393 aa  131  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000409555  unclonable  0.00000000281863 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00020  DNA polymerase III, beta subunit  26.84 
 
 		 367 aa  131  2.0000000000000002e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0002  DNA polymerase III, beta subunit  30.43 
 
 		 389 aa  131  2.0000000000000002e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.105928  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0002  DNA polymerase III, beta subunit  25.33 
 
 		 367 aa  129  7.000000000000001e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.226085  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0002  DNA polymerase III, beta subunit  24.29 
 
 		 370 aa  127  3e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000729086  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0340  DNA polymerase III subunit beta  29.18 
 
 		 394 aa  126  5e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0199  DNA polymerase III subunit beta  29.38 
 
 		 374 aa  126  5e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.0000579402  normal  0.0770055 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00001  DNA polymerase III subunit beta  26.53 
 
 		 385 aa  125  9e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00001  DNA polymerase III subunit beta  28.61 
 
 		 388 aa  123  7e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.652632 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00001  DNA polymerase III subunit beta  26.46 
 
 		 385 aa  123  7e-27  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.280893  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0002  DNA polymerase III subunit beta  27.48 
 
 		 379 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0872061  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0001  DNA polymerase III subunit beta  29.44 
 
 		 385 aa  121  1.9999999999999998e-26  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.392011  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0002  DNA polymerase III subunit beta  26.85 
 
 		 381 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000341772  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5318  DNA polymerase III subunit beta  26.85 
 
 		 381 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.00172021  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0002  DNA polymerase III, beta subunit  25.07 
 
 		 372 aa  121  3e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0618208  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0002  DNA polymerase III subunit beta  26.79 
 
 		 381 aa  121  3e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0002  DNA polymerase III subunit beta  27.48 
 
 		 379 aa  120  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0173994  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0002  DNA polymerase III subunit beta  27.48 
 
 		 379 aa  120  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000820509  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0002  DNA polymerase III subunit beta  27.48 
 
 		 379 aa  120  6e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00656712  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0002  DNA polymerase III subunit beta  27.48 
 
 		 379 aa  120  6e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.478099 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0002  DNA polymerase III, beta subunit  25.07 
 
 		 372 aa  119  9e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1227  DNA polymerase III, beta subunit  28.17 
 
 		 378 aa  119  9.999999999999999e-26  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.0000128167  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0002  DNA polymerase III subunit beta  26.79 
 
 		 381 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000678483  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0001  DNA polymerase III subunit beta  25.51 
 
 		 385 aa  118  1.9999999999999998e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0002  DNA polymerase III, beta subunit  24.27 
 
 		 372 aa  118  1.9999999999999998e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0002  DNA polymerase III, beta subunit  30.73 
 
 		 376 aa  118  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0616  DNA polymerase III, beta subunit  26.74 
 
 		 372 aa  118  1.9999999999999998e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0002  DNA polymerase III subunit beta  27.23 
 
 		 379 aa  117  3e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.341639  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1009  DNA polymerase III, beta subunit  28.17 
 
 		 378 aa  117  3e-25  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.0000000000512645  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0002  DNA polymerase III subunit beta  27.23 
 
 		 379 aa  117  3e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0132884  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0002  DNA polymerase III subunit beta  25.83 
 
 		 377 aa  117  3e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.00213885  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0002  DNA polymerase III subunit beta  25.83 
 
 		 377 aa  117  3e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0177596  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2552  DNA polymerase III subunit beta  25.19 
 
 		 377 aa  117  3.9999999999999997e-25  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0587336  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0002  DNA polymerase III subunit beta  25.89 
 
 		 378 aa  117  3.9999999999999997e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3235  DNA polymerase III, beta subunit  28.05 
 
 		 374 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0867918 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00001  DNA polymerase III subunit beta  26.2 
 
 		 386 aa  117  5e-25  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0001  DNA polymerase III subunit beta  29.29 
 
 		 385 aa  116  6e-25  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0001  DNA polymerase III, beta subunit  24.68 
 
 		 372 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0872728  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4880  DNA polymerase III, beta subunit  28.13 
 
 		 379 aa  115  1.0000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1328  DNA polymerase III subunit beta  25.94 
 
 		 386 aa  115  1.0000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0993  DNA polymerase III, beta subunit  27.53 
 
 		 376 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1036  DNA polymerase III, beta subunit  27.39 
 
 		 378 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.0000000328779  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0002  DNA polymerase III, beta subunit  29.16 
 
 		 366 aa  114  2.0000000000000002e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00540998  normal  0.944506 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0002  DNA polymerase III, beta subunit  28.83 
 
 		 374 aa  114  3e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.017071  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0002  DNA polymerase III subunit beta  25.26 
 
 		 370 aa  114  4.0000000000000004e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2720  DNA polymerase III, beta subunit  26.36 
 
 		 372 aa  114  4.0000000000000004e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.737243  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00001  DNA polymerase III subunit beta  26.57 
 
 		 397 aa  114  4.0000000000000004e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.284448  normal  0.0167825 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0002  DNA polymerase III, beta subunit  26.67 
 
 		 365 aa  113  5e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0003  DNA polymerase III, beta subunit  24.8 
 
 		 366 aa  113  5e-24  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00001  DNA polymerase III subunit beta  25.57 
 
 		 385 aa  112  7.000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.354313  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0002  DNA-directed DNA polymerase  26.65 
 
 		 409 aa  113  7.000000000000001e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0003  DNA polymerase III, beta subunit  25.59 
 
 		 366 aa  112  1.0000000000000001e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000553224  hitchhiker  0.000000389013 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3720  DNA polymerase III, beta subunit  28.87 
 
 		 374 aa  112  2.0000000000000002e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.626306  normal  0.408951 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2372  DNA polymerase III subunit beta  24.41 
 
 		 366 aa  111  2.0000000000000002e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0002  DNA polymerase III subunit beta  25.77 
 
 		 378 aa  111  3e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000167002  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1551  DNA polymerase III, beta subunit  27.08 
 
 		 367 aa  110  4.0000000000000004e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.422589  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2688  DNA polymerase III, beta subunit  27.15 
 
 		 369 aa  109  6e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0188688  hitchhiker  0.00114167 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0002  DNA polymerase III subunit beta  27.37 
 
 		 361 aa  108  1e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00000320383  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0002  DNA polymerase III subunit beta  24.94 
 
 		 366 aa  108  1e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.039801  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12563  DNA polymerase III, beta chain  26.32 
 
 		 362 aa  109  1e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.152259  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0002  DNA polymerase III subunit beta  24.73 
 
 		 366 aa  109  1e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.279408  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0002  DNA polymerase III subunit beta  24.73 
 
 		 366 aa  109  1e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.316057  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0002  DNA polymerase III, beta subunit  24.42 
 
 		 370 aa  108  2e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0002  DNA polymerase III, beta subunit  26.56 
 
 		 367 aa  107  3e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.00000348538  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0535  DNA polymerase III, beta subunit  25.45 
 
 		 366 aa  107  5e-22  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0002  DNA polymerase III, beta subunit  25.07 
 
 		 373 aa  106  6e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.394263  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00020  DNA polymerase III, beta subunit  25.33 
 
 		 365 aa  106  6e-22  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.443906  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0816  DNA polymerase III, beta subunit  27.9 
 
 		 366 aa  106  7e-22  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.731986  normal  0.187979 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0002  DNA polymerase III, beta subunit  28.35 
 
 		 366 aa  105  9e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000466477  normal  0.315264 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0953  DNA polymerase III, beta subunit  25.76 
 
 		 374 aa  105  1e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0002  DNA polymerase III, beta subunit  25.19 
 
 		 372 aa  105  1e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000259068  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0937  DNA polymerase III, beta subunit  26.96 
 
 		 375 aa  105  2e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0002  DNA polymerase III subunit beta  27.15 
 
 		 365 aa  104  2e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.0000000590568  unclonable  0.00000000000512174 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00020  DNA polymerase III, beta subunit  25.98 
 
 		 365 aa  105  2e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000592113  decreased coverage  0.0000599685 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0002  DNA polymerase III, beta subunit  28.53 
 
 		 369 aa  104  3e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0662  DNA polymerase III, beta subunit  26.68 
 
 		 366 aa  103  5e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000326321  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0002  DNA polymerase III, beta subunit  28.05 
 
 		 375 aa  103  6e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.000000418991  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1752  DNA polymerase III, beta subunit  24.81 
 
 		 374 aa  103  7e-21  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.236146  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1513  DNA polymerase III, beta subunit  29.29 
 
 		 381 aa  103  7e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000166783  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0686  DNA polymerase III, beta subunit  25.97 
 
 		 366 aa  102  8e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0347365  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00003  DNA polymerase III, beta subunit  25 
 
 		 366 aa  101  3e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0000112219  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00020  DNA polymerase III, beta subunit  27.91 
 
 		 374 aa  99.8  8e-20  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0002  DNA polymerase III, beta subunit  23.95 
 
 		 373 aa  99  1e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00126039  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00443  DNA polymerase III subunit beta  25.65 
 
 		 366 aa  99.4  1e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0102  DNA polymerase III subunit beta  25.51 
 
 		 367 aa  99  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03482  DNA polymerase III subunit beta  27.68 
 
 		 366 aa  99  1e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0002  DNA polymerase III subunit beta  26.46 
 
 		 378 aa  98.6  1e-19  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0347  DNA polymerase III subunit beta  24.08 
 
 		 366 aa  98.2  2e-19  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.229839  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1226  DNA polymerase III, beta subunit  27.23 
 
 		 366 aa  98.2  2e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.123805  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>