75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_13800 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_13800  predicted transcriptional regulator  100 
 
 		 297 aa  578  1e-164  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.854888  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8866  putative transcriptional regulator, MerR family  39.42 
 
 		 279 aa  65.1  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.249264  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22770  predicted transcriptional regulator  46.38 
 
 		 284 aa  57.8  0.0000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3560  MerR family transcriptional regulator  40.28 
 
 		 287 aa  57.4  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.453881 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06160  serine/threonine protein phosphatase  59.18 
 
 		 361 aa  57  0.0000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1629  transcriptional regulator, MerR family  37.19 
 
 		 306 aa  55.8  0.0000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0882685  normal  0.393491 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3767  transcriptional regulator, MerR family  50.85 
 
 		 264 aa  55.1  0.000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.237591  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2402  transcriptional regulator, MerR family  57.14 
 
 		 272 aa  55.1  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.290341  hitchhiker  0.00583984 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13400  predicted transcriptional regulator  49.15 
 
 		 346 aa  55.5  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4623  transcriptional regulator, MerR family  44.93 
 
 		 297 aa  55.5  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3493  transcriptional regulator, MerR family  37.7 
 
 		 273 aa  54.3  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0385  transcription activator, effector binding  43.96 
 
 		 286 aa  53.9  0.000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4163  transcriptional regulator, MerR family  44.62 
 
 		 275 aa  53.9  0.000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20290  predicted transcriptional regulator  44.44 
 
 		 277 aa  54.3  0.000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0400625  normal  0.347976 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2316  regulatory protein, MerR  50 
 
 		 369 aa  53.1  0.000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.280801  normal  0.123157 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3833  MerR family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 270 aa  53.1  0.000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000100059  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1424  MerR family transcriptional regulator  37.78 
 
 		 279 aa  52  0.00001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.140644 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3503  transcriptional regulator, putative  37.7 
 
 		 273 aa  52  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.590051  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3205  MerR family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 273 aa  51.6  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.208736  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4810  transcription activator effector binding  42.62 
 
 		 274 aa  51.2  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.858088  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3506  transcription activator, effector binding  30.11 
 
 		 274 aa  51.2  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.771694  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5383  transcriptional regulator, MerR family  43.53 
 
 		 266 aa  51.2  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.94507 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0978  MerR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 267 aa  50.8  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00933333  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0331  MerR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 281 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1146  transcriptional regulator, MerR family  37.93 
 
 		 267 aa  50.8  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0993  MerR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 267 aa  50.8  0.00003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1063  MerR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 267 aa  50.8  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4179  transcriptional activator ligand binding domain protein  46.67 
 
 		 279 aa  50.4  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.803381 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2311  putative transcriptional regulator, MerR family  43.06 
 
 		 399 aa  50.4  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0980  MerR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 267 aa  50.8  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.812542  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2735  putative transcriptional regulator, MerR family  39.06 
 
 		 264 aa  50.4  0.00004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0721242  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6982  MerR family transcriptional regulator  39.68 
 
 		 270 aa  50.1  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.80949  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4799  transcriptional regulator, MerR family  46.55 
 
 		 258 aa  50.1  0.00005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1527  MerR family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 276 aa  49.7  0.00005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3667  transcriptional regulator, MerR family  32.81 
 
 		 276 aa  49.3  0.00007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.372345  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1677  transcriptional regulator, MerR family  32.81 
 
 		 276 aa  49.3  0.00007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.128581  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1708  transcriptional regulator, MerR family  32.81 
 
 		 276 aa  49.3  0.00008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2808  transcriptional regulator, MerR family  44.44 
 
 		 276 aa  49.3  0.00008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.44001  normal  0.316047 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1782  transcriptional regulator, MerR family  32.81 
 
 		 276 aa  49.3  0.00008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.381283  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2263  transcriptional regulator, MerR family  50 
 
 		 281 aa  49.3  0.00008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1731  MerR family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 276 aa  49.3  0.00008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.867101  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1485  MerR family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 276 aa  49.3  0.00009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0543962  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1495  MerR family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 276 aa  49.3  0.00009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00542237  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1641  MerR family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 276 aa  49.3  0.00009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1523  MerR family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 276 aa  48.9  0.00009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.193632  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2898  transcriptional regulator, MerR family  33.06 
 
 		 282 aa  48.9  0.00009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0932  MerR family transcriptional regulator  43.08 
 
 		 290 aa  48.9  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2419  protein serine/threonine phosphatase  46.67 
 
 		 355 aa  48.5  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.111892 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1993  transcriptional regulator, MerR family  43.08 
 
 		 272 aa  48.5  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19550  serine/threonine protein phosphatase  45 
 
 		 361 aa  48.9  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.17725  normal  0.381768 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03030  predicted transcriptional regulator  46.03 
 
 		 276 aa  48.9  0.0001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2529  transcriptional regulator, MerR family  37.5 
 
 		 270 aa  48.1  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2018  putative transcriptional regulator, MerR family  37.37 
 
 		 286 aa  48.1  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.253438  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0225  putative transcriptional regulator, MerR family  44.83 
 
 		 262 aa  47.4  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3507  MerR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 292 aa  46.6  0.0005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.401792  normal  0.0867153 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0684  MerR family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 279 aa  46.2  0.0006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7266  transcriptional regulator, MerR family  38.1 
 
 		 274 aa  46.2  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0379  transcriptional regulator, MerR family  36.46 
 
 		 327 aa  45.8  0.0009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0455  MerR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 261 aa  45.8  0.0009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00278493  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2401  MerR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 269 aa  45.8  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.908212  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0445  MerR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 261 aa  45.4  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0194713  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2159  MerR family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 265 aa  45.4  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2305  transcriptional regulator, MerR family  41.27 
 
 		 268 aa  45.4  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.643594 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1754  transcriptional regulator, MerR family  44.44 
 
 		 257 aa  45.4  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.99712  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2576  MerR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 269 aa  45.8  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.473387  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5047  MerR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 276 aa  44.7  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.574995  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2780  transcriptional regulator, MerR family  36.36 
 
 		 269 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000880145 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2545  transcriptional regulator, MerR family  36.36 
 
 		 269 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0479  MerR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 354 aa  43.5  0.004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.369084 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3830  transcriptional regulator, MerR family  38.18 
 
 		 274 aa  43.9  0.004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5012  MerR family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 289 aa  43.1  0.006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.147011  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6980  transcriptional regulator, MerR family  51.11 
 
 		 299 aa  42.7  0.007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1820  MerR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 270 aa  42.4  0.009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.404333  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1974  transcriptional regulator, MerR family  43.33 
 
 		 283 aa  42.4  0.009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00000269645  unclonable  0.0000000367636 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2029  regulatory protein, MerR  40 
 
 		 178 aa  42.4  0.009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.115977  normal  0.362141 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>