244 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_2029 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_2029  regulatory protein, MerR  100 
 
 		 178 aa  353  5.999999999999999e-97  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.115977  normal  0.362141 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2316  regulatory protein, MerR  69.23 
 
 		 369 aa  125  3e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.280801  normal  0.123157 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2419  protein serine/threonine phosphatase  69.57 
 
 		 355 aa  115  3e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.111892 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19550  serine/threonine protein phosphatase  56.04 
 
 		 361 aa  97.4  9e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.17725  normal  0.381768 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1993  transcriptional regulator, MerR family  42.86 
 
 		 272 aa  73.9  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06160  serine/threonine protein phosphatase  45.36 
 
 		 361 aa  72.8  0.000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20290  predicted transcriptional regulator  46.07 
 
 		 277 aa  71.2  0.000000000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0400625  normal  0.347976 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1458  MerR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 161 aa  68.6  0.00000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0168574  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1629  transcriptional regulator, MerR family  41 
 
 		 306 aa  66.6  0.0000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0882685  normal  0.393491 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1424  MerR family transcriptional regulator  41.3 
 
 		 279 aa  65.1  0.0000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.140644 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3833  MerR family transcriptional regulator  48.53 
 
 		 270 aa  64.3  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000100059  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3611  transcriptional regulator, MerR family  25.81 
 
 		 267 aa  63.2  0.000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6982  MerR family transcriptional regulator  36.64 
 
 		 270 aa  63.5  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.80949  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2895  transcriptional regulator, MerR family  45 
 
 		 269 aa  62  0.000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0455  MerR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 261 aa  60.5  0.00000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00278493  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0445  MerR family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 261 aa  60.1  0.00000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0194713  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0932  MerR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 290 aa  59.7  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4163  transcriptional regulator, MerR family  36.73 
 
 		 275 aa  59.7  0.00000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2144  transcriptional regulator, MerR family  31.87 
 
 		 272 aa  58.5  0.00000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2305  transcriptional regulator, MerR family  46.24 
 
 		 268 aa  58.2  0.00000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.643594 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5047  MerR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 276 aa  57  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.574995  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3767  transcriptional regulator, MerR family  43.94 
 
 		 264 aa  56.6  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.237591  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7266  transcriptional regulator, MerR family  48.44 
 
 		 274 aa  56.6  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13400  predicted transcriptional regulator  52.83 
 
 		 346 aa  56.6  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2545  transcriptional regulator, MerR family  41.94 
 
 		 269 aa  56.2  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2780  transcriptional regulator, MerR family  41.94 
 
 		 269 aa  56.2  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000880145 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7229  putative transcriptional regulator, MerR family  40.91 
 
 		 272 aa  57  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.385629 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2311  putative transcriptional regulator, MerR family  49.09 
 
 		 399 aa  56.2  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0331  MerR family transcriptional regulator  26.47 
 
 		 281 aa  55.8  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3507  MerR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 292 aa  55.8  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.401792  normal  0.0867153 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0760  MerR family transcriptional regulator  42.37 
 
 		 267 aa  55.1  0.0000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0248072  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2109  transcription activator, effector binding  45.76 
 
 		 283 aa  55.1  0.0000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.309412  normal  0.0724645 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0225  putative transcriptional regulator, MerR family  34.55 
 
 		 262 aa  55.1  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4179  transcriptional activator ligand binding domain protein  39.24 
 
 		 279 aa  54.7  0.0000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.803381 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4099  transcription activator effector binding protein  40 
 
 		 276 aa  53.9  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0479  MerR family transcriptional regulator  49.09 
 
 		 354 aa  53.5  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.369084 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1972  MerR family transcriptional regulator  28.17 
 
 		 238 aa  53.1  0.000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2354  MerR family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 269 aa  52.8  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000403249  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2018  putative transcriptional regulator, MerR family  44.64 
 
 		 286 aa  53.5  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.253438  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2159  MerR family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 265 aa  52.8  0.000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2824  transcriptional regulator, MerR family  45.45 
 
 		 251 aa  53.1  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00132895  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2588  transcriptional regulator, MerR family  40.32 
 
 		 269 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.40806e-18 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2317  MerR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 269 aa  52.4  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0566035  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0379  transcriptional regulator, MerR family  34.34 
 
 		 327 aa  52.8  0.000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2529  transcriptional regulator, MerR family  43.94 
 
 		 270 aa  52.8  0.000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3506  transcription activator, effector binding  32.54 
 
 		 274 aa  52  0.000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.771694  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3793  transcriptional regulator, MerR family  31.33 
 
 		 139 aa  52  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2401  MerR family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 269 aa  51.6  0.000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.908212  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2576  MerR family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 269 aa  51.6  0.000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.473387  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64500  putative transcriptional regulator  47.06 
 
 		 270 aa  51.6  0.000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4623  transcriptional regulator, MerR family  50 
 
 		 297 aa  51.2  0.000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0226  transcriptional regulator, MerR family  40.35 
 
 		 276 aa  51.2  0.000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000814651  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2481  transcriptional regulator, MerR family  40.68 
 
 		 269 aa  50.8  0.000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.564945  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5383  transcriptional regulator, MerR family  45.45 
 
 		 266 aa  50.8  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.94507 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1410  MerR family transcriptional regulator  35 
 
 		 277 aa  50.4  0.00001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1866  transcriptional regulator  39.29 
 
 		 247 aa  50.8  0.00001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000190425  hitchhiker  0.000000000849298 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0684  MerR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 279 aa  49.7  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2992  transcriptional regulator, MerR family  36.67 
 
 		 282 aa  50.1  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.663692  normal  0.0173107 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3493  transcriptional regulator, MerR family  44.44 
 
 		 273 aa  49.7  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1731  MerR family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 276 aa  48.9  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.867101  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1677  transcriptional regulator, MerR family  37.7 
 
 		 276 aa  49.3  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.128581  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3560  MerR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 287 aa  49.3  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.453881 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3690  regulatory protein, MerR  38.81 
 
 		 143 aa  49.3  0.00003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1782  transcriptional regulator, MerR family  37.7 
 
 		 276 aa  49.3  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.381283  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0331  putative transcriptional activator tipA  30 
 
 		 249 aa  49.3  0.00003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.275925  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3667  transcriptional regulator, MerR family  37.7 
 
 		 276 aa  49.3  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.372345  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5012  MerR family transcriptional regulator  45.83 
 
 		 289 aa  48.9  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.147011  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3205  MerR family transcriptional regulator  42.59 
 
 		 273 aa  48.9  0.00004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.208736  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1708  transcriptional regulator, MerR family  37.7 
 
 		 276 aa  48.9  0.00004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1523  MerR family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 276 aa  48.9  0.00004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.193632  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1495  MerR family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 276 aa  48.9  0.00004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00542237  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1485  MerR family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 276 aa  48.9  0.00004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0543962  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1641  MerR family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 276 aa  48.9  0.00004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1701  MerR family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 280 aa  48.9  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.126124  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3346  transcriptional regulator, MerR family  37.93 
 
 		 252 aa  48.9  0.00004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00536383  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4810  transcription activator effector binding  49.09 
 
 		 274 aa  48.9  0.00004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.858088  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0247  MerR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 287 aa  48.9  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5283  transcriptional regulator, MerR family  32.76 
 
 		 143 aa  48.5  0.00004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2735  putative transcriptional regulator, MerR family  36.92 
 
 		 264 aa  48.9  0.00004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0721242  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1642  transcriptional regulator, MerR family  32.76 
 
 		 143 aa  48.5  0.00004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.349097  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0065  transcriptional regulator, MerR family  41.79 
 
 		 252 aa  48.5  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2630  transcriptional regulator, MerR family  38.33 
 
 		 269 aa  48.5  0.00005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00281071  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1527  MerR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 276 aa  48.5  0.00005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4044  transcriptional regulator, MerR family  40 
 
 		 271 aa  48.5  0.00005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0218982 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2284  transcriptional regulator, MerR family  36.84 
 
 		 215 aa  48.1  0.00006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0323  transcription regulator family  38.18 
 
 		 253 aa  48.1  0.00006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2195  transcriptional regulator, MerR family  36.84 
 
 		 214 aa  48.1  0.00007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2841  zinc-responsive transcriptional regulator  41.38 
 
 		 139 aa  48.1  0.00007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0481985  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3534  MerR family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 143 aa  47.8  0.00007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0358234  normal  0.617564 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2808  transcriptional regulator, MerR family  33.66 
 
 		 276 aa  47.8  0.00008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.44001  normal  0.316047 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2655  zinc-responsive transcriptional regulator  30.11 
 
 		 133 aa  47.8  0.00008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3347  transcription regulator protein  38.95 
 
 		 159 aa  47.8  0.00009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.445877  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1662  MerR family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 215 aa  47.8  0.00009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.727696  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0385  transcription activator, effector binding  33.33 
 
 		 286 aa  47.8  0.00009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3503  transcriptional regulator, putative  42.59 
 
 		 273 aa  47.4  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.590051  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06140  predicted transcriptional regulator  45.16 
 
 		 129 aa  47.4  0.0001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4116  transcriptional regulator, MerR family  36.43 
 
 		 133 aa  47.4  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1617  putative transcriptional regulator, MerR family  43.64 
 
 		 252 aa  47.4  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.870774 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4579  MerR family transcriptional regulator  36.94 
 
 		 134 aa  47  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.923905  decreased coverage  0.00324593 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0585  MerR family transcriptional regulator  36.27 
 
 		 136 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.853287  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>