More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_2018 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_2018  putative transcriptional regulator, MerR family  100 
 
 		 286 aa  563  1.0000000000000001e-159  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.253438  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7229  putative transcriptional regulator, MerR family  57.19 
 
 		 272 aa  297  1e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.385629 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4044  transcriptional regulator, MerR family  54.18 
 
 		 271 aa  243  3e-63  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0218982 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2528  transcriptional regulator, MerR family  52.41 
 
 		 293 aa  241  9e-63  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2109  transcription activator, effector binding  53.61 
 
 		 283 aa  235  5.0000000000000005e-61  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.309412  normal  0.0724645 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4099  transcription activator effector binding protein  48.91 
 
 		 276 aa  231  1e-59  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2992  transcriptional regulator, MerR family  48.57 
 
 		 282 aa  229  5e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.663692  normal  0.0173107 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1701  MerR family transcriptional regulator  33.1 
 
 		 280 aa  140  3e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.126124  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0247  MerR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 287 aa  135  7.000000000000001e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3825  transcriptional activator ligand binding domain protein  23.94 
 
 		 280 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4810  transcription activator effector binding  32.74 
 
 		 274 aa  111  1.0000000000000001e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.858088  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2895  transcriptional regulator, MerR family  25.63 
 
 		 269 aa  110  4.0000000000000004e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1820  MerR family transcriptional regulator  26.6 
 
 		 270 aa  107  3e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.404333  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3506  transcription activator, effector binding  31.93 
 
 		 274 aa  104  2e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.771694  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0010  hypothetical protein  24.48 
 
 		 270 aa  102  5e-21  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2598  transcriptional regulator, MerR family  26.52 
 
 		 271 aa  99.8  4e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000630559  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2780  transcriptional regulator, MerR family  24.2 
 
 		 269 aa  99.8  4e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000880145 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2481  transcriptional regulator, MerR family  28.72 
 
 		 269 aa  99.8  5e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.564945  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2545  transcriptional regulator, MerR family  24.2 
 
 		 269 aa  99.8  5e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2638  transcriptional regulator, MerR family  27.14 
 
 		 273 aa  99.4  6e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2354  MerR family transcriptional regulator  25.96 
 
 		 269 aa  97.8  2e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000403249  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2317  MerR family transcriptional regulator  25.44 
 
 		 269 aa  97.4  2e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0566035  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0425  MerR family transcriptional regulator  69.44 
 
 		 132 aa  97.4  2e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.321126  normal  0.815952 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2588  transcriptional regulator, MerR family  25.96 
 
 		 269 aa  97.8  2e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.40806e-18 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3667  transcriptional regulator, MerR family  27.34 
 
 		 276 aa  97.1  3e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.372345  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5012  MerR family transcriptional regulator  25.94 
 
 		 289 aa  97.1  3e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.147011  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0684  MerR family transcriptional regulator  31.46 
 
 		 279 aa  94.4  2e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1495  MerR family transcriptional regulator  26.62 
 
 		 276 aa  94  3e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00542237  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1731  MerR family transcriptional regulator  26.62 
 
 		 276 aa  93.6  4e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.867101  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1523  MerR family transcriptional regulator  26.26 
 
 		 276 aa  93.2  4e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.193632  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1641  MerR family transcriptional regulator  26.26 
 
 		 276 aa  93.6  4e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1677  transcriptional regulator, MerR family  25.9 
 
 		 276 aa  92.8  5e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.128581  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2630  transcriptional regulator, MerR family  24.2 
 
 		 269 aa  92.4  7e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00281071  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3830  transcriptional regulator, MerR family  24.91 
 
 		 274 aa  92.4  8e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1708  transcriptional regulator, MerR family  26.26 
 
 		 276 aa  92  9e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1782  transcriptional regulator, MerR family  26.62 
 
 		 276 aa  91.7  1e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.381283  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2401  MerR family transcriptional regulator  23.13 
 
 		 269 aa  90.9  2e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.908212  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1485  MerR family transcriptional regulator  25.54 
 
 		 276 aa  91.3  2e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0543962  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2576  MerR family transcriptional regulator  23.13 
 
 		 269 aa  90.9  2e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.473387  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1527  MerR family transcriptional regulator  25.36 
 
 		 276 aa  87  3e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03030  predicted transcriptional regulator  28.37 
 
 		 276 aa  85.9  8e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4799  transcriptional regulator, MerR family  31.23 
 
 		 258 aa  85.5  8e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2144  transcriptional regulator, MerR family  26.33 
 
 		 272 aa  85.5  9e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6982  MerR family transcriptional regulator  32.42 
 
 		 270 aa  84.3  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.80949  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3560  MerR family transcriptional regulator  27.15 
 
 		 287 aa  83.2  0.000000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.453881 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3503  transcriptional regulator, putative  23.13 
 
 		 273 aa  79.3  0.00000000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.590051  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5047  MerR family transcriptional regulator  29.51 
 
 		 276 aa  78.2  0.0000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.574995  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0225  putative transcriptional regulator, MerR family  31.41 
 
 		 262 aa  75.9  0.0000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3493  transcriptional regulator, MerR family  22.55 
 
 		 273 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3205  MerR family transcriptional regulator  22.91 
 
 		 273 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.208736  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7266  transcriptional regulator, MerR family  27.35 
 
 		 274 aa  73.9  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1458  MerR family transcriptional regulator  30 
 
 		 161 aa  73.9  0.000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0168574  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0445  MerR family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 261 aa  73.6  0.000000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0194713  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0385  transcription activator, effector binding  28.28 
 
 		 286 aa  73.6  0.000000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0455  MerR family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 261 aa  73.2  0.000000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00278493  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3304  MCP methyltransferase, CheR-type  32.61 
 
 		 398 aa  72.4  0.000000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4163  transcriptional regulator, MerR family  29.53 
 
 		 275 aa  72.4  0.000000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2159  MerR family transcriptional regulator  25.74 
 
 		 265 aa  71.6  0.00000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22860  predicted transcriptional regulator  39.42 
 
 		 224 aa  72  0.00000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2263  transcriptional regulator, MerR family  49.28 
 
 		 281 aa  71.2  0.00000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3611  transcriptional regulator, MerR family  22.26 
 
 		 267 aa  71.2  0.00000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1609  MerR family transcriptional regulator  24.04 
 
 		 272 aa  70.1  0.00000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.822901  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2735  putative transcriptional regulator, MerR family  32.62 
 
 		 264 aa  70.1  0.00000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0721242  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2808  transcriptional regulator, MerR family  30.68 
 
 		 276 aa  69.7  0.00000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.44001  normal  0.316047 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0331  MerR family transcriptional regulator  19.66 
 
 		 281 aa  69.7  0.00000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3767  transcriptional regulator, MerR family  31.21 
 
 		 264 aa  69.3  0.00000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.237591  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0345  transcriptional regulator, MerR family  40.4 
 
 		 247 aa  68.2  0.0000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0129  hypothetical protein  33.64 
 
 		 347 aa  67.8  0.0000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.257512  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1866  transcriptional regulator  33.98 
 
 		 247 aa  68.2  0.0000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000190425  hitchhiker  0.000000000849298 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1410  MerR family transcriptional regulator  21.53 
 
 		 277 aa  67.8  0.0000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0323  transcription regulator family  31.75 
 
 		 253 aa  66.6  0.0000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22770  predicted transcriptional regulator  48.57 
 
 		 284 aa  66.2  0.0000000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3507  MerR family transcriptional regulator  28.82 
 
 		 292 aa  66.2  0.0000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.401792  normal  0.0867153 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0065  transcriptional regulator, MerR family  40.2 
 
 		 252 aa  65.9  0.0000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0978  MerR family transcriptional regulator  35.87 
 
 		 267 aa  65.9  0.0000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00933333  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3833  MerR family transcriptional regulator  35.77 
 
 		 270 aa  65.1  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000100059  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4400  transcriptional regulator, MerR family  33.74 
 
 		 303 aa  65.5  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.462564  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0993  MerR family transcriptional regulator  35.87 
 
 		 267 aa  65.5  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0980  MerR family transcriptional regulator  35.87 
 
 		 267 aa  65.1  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.812542  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1063  MerR family transcriptional regulator  35.87 
 
 		 267 aa  65.5  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1079  TipAS antibiotic-recognition domain-containing protein  32.85 
 
 		 252 aa  64.7  0.000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.23199 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1993  transcriptional regulator, MerR family  47.14 
 
 		 272 aa  65.1  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1146  transcriptional regulator, MerR family  35.87 
 
 		 267 aa  65.1  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3393  transcriptional regulator, MerR family  45.07 
 
 		 254 aa  64.3  0.000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.988274  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2075  MerR family transcriptional regulator  39.64 
 
 		 304 aa  64.7  0.000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.491392 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4624  transcriptional regulator, MerR family  38.57 
 
 		 333 aa  63.9  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4442  putative transcriptional regulator, MerR family  35.04 
 
 		 253 aa  63.5  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00264375  hitchhiker  0.000476994 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1222  transcriptional regulator, MerR family  44.29 
 
 		 254 aa  63.2  0.000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.867665  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0384  transcriptional regulator, MerR family  38.89 
 
 		 258 aa  63.2  0.000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0450143  decreased coverage  0.00634425 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4179  transcriptional activator ligand binding domain protein  29.69 
 
 		 279 aa  63.2  0.000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.803381 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2603  transcriptional regulator, MerR family  39.13 
 
 		 274 aa  63.2  0.000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.241665  normal  0.676341 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2419  protein serine/threonine phosphatase  45.59 
 
 		 355 aa  63.2  0.000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.111892 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34160  predicted transcriptional regulator  34.11 
 
 		 278 aa  62.8  0.000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.153651 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23430  predicted transcriptional regulator  30 
 
 		 271 aa  62.8  0.000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0376314  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64500  putative transcriptional regulator  36 
 
 		 270 aa  62.8  0.000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04340  predicted transcriptional regulator  43.84 
 
 		 245 aa  62.4  0.000000008  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0339  MerR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 253 aa  62.4  0.000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.841288 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1424  MerR family transcriptional regulator  28.09 
 
 		 279 aa  62.4  0.000000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.140644 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3285  transcriptional regulator, MerR family  40.66 
 
 		 272 aa  62.4  0.000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.235229  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3564  MerR family transcriptional regulator  31.09 
 
 		 245 aa  62  0.00000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>