More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_7229 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_7229  putative transcriptional regulator, MerR family  100 
 
 		 272 aa  549  1e-155  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.385629 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4044  transcriptional regulator, MerR family  59.63 
 
 		 271 aa  300  2e-80  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0218982 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2018  putative transcriptional regulator, MerR family  57.19 
 
 		 286 aa  297  1e-79  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.253438  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2109  transcription activator, effector binding  59.32 
 
 		 283 aa  282  4.0000000000000003e-75  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.309412  normal  0.0724645 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2528  transcriptional regulator, MerR family  50.35 
 
 		 293 aa  265  8e-70  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2992  transcriptional regulator, MerR family  51.46 
 
 		 282 aa  258  6e-68  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.663692  normal  0.0173107 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4099  transcription activator effector binding protein  48.9 
 
 		 276 aa  254  8e-67  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1701  MerR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 280 aa  147  1.0000000000000001e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.126124  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0247  MerR family transcriptional regulator  34.39 
 
 		 287 aa  140  1.9999999999999998e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2895  transcriptional regulator, MerR family  30.07 
 
 		 269 aa  135  9e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2545  transcriptional regulator, MerR family  29.52 
 
 		 269 aa  129  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2780  transcriptional regulator, MerR family  29.45 
 
 		 269 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000880145 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2630  transcriptional regulator, MerR family  31.54 
 
 		 269 aa  125  9e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00281071  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1820  MerR family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 270 aa  124  1e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.404333  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2401  MerR family transcriptional regulator  29.15 
 
 		 269 aa  124  2e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.908212  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2354  MerR family transcriptional regulator  29.26 
 
 		 269 aa  124  2e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000403249  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2317  MerR family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 269 aa  124  2e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0566035  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2576  MerR family transcriptional regulator  29.15 
 
 		 269 aa  124  2e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.473387  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2588  transcriptional regulator, MerR family  29.26 
 
 		 269 aa  124  2e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.40806e-18 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2598  transcriptional regulator, MerR family  29.2 
 
 		 271 aa  118  7.999999999999999e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000630559  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2638  transcriptional regulator, MerR family  29.88 
 
 		 273 aa  115  6e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3825  transcriptional activator ligand binding domain protein  25.44 
 
 		 280 aa  115  6.9999999999999995e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2481  transcriptional regulator, MerR family  31.12 
 
 		 269 aa  113  3e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.564945  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3830  transcriptional regulator, MerR family  27.7 
 
 		 274 aa  113  4.0000000000000004e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5012  MerR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 289 aa  105  6e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.147011  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0425  MerR family transcriptional regulator  69.44 
 
 		 132 aa  104  2e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.321126  normal  0.815952 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0010  hypothetical protein  28.16 
 
 		 270 aa  99  7e-20  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4799  transcriptional regulator, MerR family  33.71 
 
 		 258 aa  99  8e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6982  MerR family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 270 aa  95.1  1e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.80949  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3506  transcription activator, effector binding  28.62 
 
 		 274 aa  90.5  2e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.771694  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4810  transcription activator effector binding  29.33 
 
 		 274 aa  90.1  3e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.858088  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1523  MerR family transcriptional regulator  25 
 
 		 276 aa  87.4  2e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.193632  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1641  MerR family transcriptional regulator  25 
 
 		 276 aa  87.4  2e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03030  predicted transcriptional regulator  33.92 
 
 		 276 aa  86.7  4e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1708  transcriptional regulator, MerR family  25 
 
 		 276 aa  86.3  5e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1495  MerR family transcriptional regulator  25 
 
 		 276 aa  86.3  5e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00542237  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0345  transcriptional regulator, MerR family  30.17 
 
 		 247 aa  86.3  5e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4179  transcriptional activator ligand binding domain protein  29.43 
 
 		 279 aa  84.7  0.000000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.803381 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1782  transcriptional regulator, MerR family  24.47 
 
 		 276 aa  85.1  0.000000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.381283  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1677  transcriptional regulator, MerR family  24.31 
 
 		 276 aa  83.2  0.000000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.128581  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1485  MerR family transcriptional regulator  24.65 
 
 		 276 aa  83.2  0.000000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0543962  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3503  transcriptional regulator, putative  23.71 
 
 		 273 aa  82.4  0.000000000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.590051  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3667  transcriptional regulator, MerR family  23.51 
 
 		 276 aa  82.4  0.000000000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.372345  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1731  MerR family transcriptional regulator  23.96 
 
 		 276 aa  80.5  0.00000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.867101  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3493  transcriptional regulator, MerR family  23.67 
 
 		 273 aa  80.1  0.00000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1527  MerR family transcriptional regulator  23.93 
 
 		 276 aa  80.1  0.00000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2144  transcriptional regulator, MerR family  25.9 
 
 		 272 aa  80.1  0.00000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3611  transcriptional regulator, MerR family  22.74 
 
 		 267 aa  78.6  0.00000000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2735  putative transcriptional regulator, MerR family  32.16 
 
 		 264 aa  78.6  0.0000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0721242  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3205  MerR family transcriptional regulator  25.27 
 
 		 273 aa  77.4  0.0000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.208736  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3833  MerR family transcriptional regulator  27.76 
 
 		 270 aa  75.9  0.0000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000100059  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7266  transcriptional regulator, MerR family  27.24 
 
 		 274 aa  75.9  0.0000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0445  MerR family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 261 aa  75.5  0.0000000000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0194713  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5047  MerR family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 276 aa  75.5  0.0000000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.574995  normal  1 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0129  hypothetical protein  40.62 
 
 		 347 aa  75.1  0.000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.257512  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0684  MerR family transcriptional regulator  29.1 
 
 		 279 aa  75.1  0.000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0455  MerR family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 261 aa  75.1  0.000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00278493  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1458  MerR family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 161 aa  74.7  0.000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0168574  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0225  putative transcriptional regulator, MerR family  30.22 
 
 		 262 aa  74.3  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1609  MerR family transcriptional regulator  20.7 
 
 		 272 aa  73.2  0.000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.822901  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64500  putative transcriptional regulator  27.27 
 
 		 270 aa  73.2  0.000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2529  transcriptional regulator, MerR family  30.5 
 
 		 270 aa  72.4  0.000000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22860  predicted transcriptional regulator  32.94 
 
 		 224 aa  72  0.000000000009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0385  transcription activator, effector binding  28.83 
 
 		 286 aa  72  0.000000000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3560  MerR family transcriptional regulator  25.52 
 
 		 287 aa  71.6  0.00000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.453881 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2263  transcriptional regulator, MerR family  34.25 
 
 		 281 aa  70.5  0.00000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0331  MerR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 281 aa  70.5  0.00000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0065  transcriptional regulator, MerR family  42.24 
 
 		 252 aa  70.1  0.00000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1424  MerR family transcriptional regulator  26.98 
 
 		 279 aa  69.7  0.00000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.140644 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3304  MCP methyltransferase, CheR-type  34.41 
 
 		 398 aa  69.3  0.00000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2808  transcriptional regulator, MerR family  30.14 
 
 		 276 aa  69.3  0.00000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.44001  normal  0.316047 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0323  transcription regulator family  35.16 
 
 		 253 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0932  MerR family transcriptional regulator  35.64 
 
 		 290 aa  68.2  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1866  transcriptional regulator  45.83 
 
 		 247 aa  68.2  0.0000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000190425  hitchhiker  0.000000000849298 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4624  transcriptional regulator, MerR family  43.52 
 
 		 333 aa  67.4  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4163  transcriptional regulator, MerR family  28.68 
 
 		 275 aa  67.4  0.0000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3767  transcriptional regulator, MerR family  28.45 
 
 		 264 aa  67  0.0000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.237591  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5600  putative transcriptional regulator  28.17 
 
 		 270 aa  66.6  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0226  transcriptional regulator, MerR family  38.04 
 
 		 276 aa  66.2  0.0000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000814651  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0331  putative transcriptional activator tipA  27.07 
 
 		 249 aa  65.9  0.0000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.275925  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1581  hypothetical protein  47.14 
 
 		 315 aa  65.9  0.0000000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3105  transcriptional regulator, MerR family  38.2 
 
 		 255 aa  65.5  0.0000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0154295  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0978  MerR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 267 aa  64.7  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00933333  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0073  hypothetical protein  44.29 
 
 		 314 aa  64.7  0.000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.0572864  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1413  hypothetical protein  47.14 
 
 		 315 aa  65.1  0.000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1754  transcriptional regulator, MerR family  22.63 
 
 		 257 aa  65.5  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.99712  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3285  transcriptional regulator, MerR family  42.86 
 
 		 272 aa  65.1  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.235229  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2538  MerR family transcriptional regulator  41.05 
 
 		 157 aa  64.7  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3106  regulator of pmrA, putative  42.86 
 
 		 257 aa  63.9  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0273598  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0993  MerR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 267 aa  64.3  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0980  MerR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 267 aa  64.3  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.812542  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2797  MerR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 255 aa  64.3  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1063  MerR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 267 aa  64.3  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4703  MerR family transcriptional regulator  30.63 
 
 		 256 aa  64.3  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.279975  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3675  MerR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 270 aa  64.3  0.000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.325472  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19550  serine/threonine protein phosphatase  44.93 
 
 		 361 aa  64.7  0.000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.17725  normal  0.381768 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34160  predicted transcriptional regulator  35.87 
 
 		 278 aa  64.3  0.000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.153651 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1146  transcriptional regulator, MerR family  32.26 
 
 		 267 aa  64.3  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3393  transcriptional regulator, MerR family  37.63 
 
 		 254 aa  63.5  0.000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.988274  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5383  transcriptional regulator, MerR family  40.85 
 
 		 266 aa  63.2  0.000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.94507 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>