More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_4163 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_4163  transcriptional regulator, MerR family  100 
 
 		 275 aa  555  1e-157  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0932  MerR family transcriptional regulator  72.53 
 
 		 290 aa  399  9.999999999999999e-111  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7266  transcriptional regulator, MerR family  41.16 
 
 		 274 aa  191  9e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6982  MerR family transcriptional regulator  40.36 
 
 		 270 aa  191  1e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.80949  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2735  putative transcriptional regulator, MerR family  40.37 
 
 		 264 aa  190  2e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0721242  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2808  transcriptional regulator, MerR family  40.44 
 
 		 276 aa  187  1e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.44001  normal  0.316047 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2529  transcriptional regulator, MerR family  40.44 
 
 		 270 aa  176  4e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5047  MerR family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 276 aa  166  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.574995  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3507  MerR family transcriptional regulator  35.69 
 
 		 292 aa  147  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.401792  normal  0.0867153 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4623  transcriptional regulator, MerR family  33.11 
 
 		 297 aa  135  8e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3767  transcriptional regulator, MerR family  28.94 
 
 		 264 aa  104  1e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.237591  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4799  transcriptional regulator, MerR family  34.25 
 
 		 258 aa  102  5e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4810  transcription activator effector binding  29.45 
 
 		 274 aa  100  2e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.858088  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3506  transcription activator, effector binding  28.47 
 
 		 274 aa  92  9e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.771694  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0385  transcription activator, effector binding  31.07 
 
 		 286 aa  90.5  3e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0331  MerR family transcriptional regulator  23.83 
 
 		 281 aa  89.4  7e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4179  transcriptional activator ligand binding domain protein  30 
 
 		 279 aa  86.7  3e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.803381 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2144  transcriptional regulator, MerR family  25.54 
 
 		 272 aa  86.3  5e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0445  MerR family transcriptional regulator  23.77 
 
 		 261 aa  85.9  7e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0194713  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0225  putative transcriptional regulator, MerR family  29.41 
 
 		 262 aa  83.6  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3493  transcriptional regulator, MerR family  22.79 
 
 		 273 aa  82.4  0.000000000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0455  MerR family transcriptional regulator  22.64 
 
 		 261 aa  82.4  0.000000000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00278493  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3503  transcriptional regulator, putative  22.02 
 
 		 273 aa  80.9  0.00000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.590051  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0010  hypothetical protein  26.48 
 
 		 270 aa  80.9  0.00000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4099  transcription activator effector binding protein  27.56 
 
 		 276 aa  79  0.00000000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3205  MerR family transcriptional regulator  21.17 
 
 		 273 aa  77.4  0.0000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.208736  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2481  transcriptional regulator, MerR family  25.93 
 
 		 269 aa  77.4  0.0000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.564945  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2159  MerR family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 265 aa  76.3  0.0000000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19550  serine/threonine protein phosphatase  37.7 
 
 		 361 aa  75.5  0.000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.17725  normal  0.381768 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2895  transcriptional regulator, MerR family  24.1 
 
 		 269 aa  74.7  0.000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22770  predicted transcriptional regulator  48.68 
 
 		 284 aa  72.8  0.000000000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2018  putative transcriptional regulator, MerR family  29.53 
 
 		 286 aa  72.4  0.000000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.253438  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0705  transcriptional regulator, MerR family  25.27 
 
 		 278 aa  71.6  0.00000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2780  transcriptional regulator, MerR family  21.38 
 
 		 269 aa  70.1  0.00000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000880145 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22860  predicted transcriptional regulator  30.83 
 
 		 224 aa  70.1  0.00000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8866  putative transcriptional regulator, MerR family  31.74 
 
 		 279 aa  69.7  0.00000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.249264  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1820  MerR family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 270 aa  69.3  0.00000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.404333  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0978  MerR family transcriptional regulator  29.66 
 
 		 267 aa  69.3  0.00000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00933333  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2545  transcriptional regulator, MerR family  28.47 
 
 		 269 aa  69.3  0.00000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3833  MerR family transcriptional regulator  26.48 
 
 		 270 aa  69.7  0.00000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000100059  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0993  MerR family transcriptional regulator  29.66 
 
 		 267 aa  69.3  0.00000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0980  MerR family transcriptional regulator  29.66 
 
 		 267 aa  68.9  0.00000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.812542  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1063  MerR family transcriptional regulator  29.66 
 
 		 267 aa  69.3  0.00000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0684  MerR family transcriptional regulator  25.38 
 
 		 279 aa  69.3  0.00000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1993  transcriptional regulator, MerR family  32.82 
 
 		 272 aa  69.3  0.00000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1146  transcriptional regulator, MerR family  29.66 
 
 		 267 aa  68.9  0.00000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2317  MerR family transcriptional regulator  21.3 
 
 		 269 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0566035  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2311  putative transcriptional regulator, MerR family  37.14 
 
 		 399 aa  68.6  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7229  putative transcriptional regulator, MerR family  28.68 
 
 		 272 aa  67.4  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.385629 
 
 
-
 
NC_004310  BR0221  MerR family transcriptional regulator  35.78 
 
 		 149 aa  68.2  0.0000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.998323  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2354  MerR family transcriptional regulator  22.22 
 
 		 269 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000403249  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0211  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  35.78 
 
 		 149 aa  67.4  0.0000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0479  MerR family transcriptional regulator  36.54 
 
 		 354 aa  67.8  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.369084 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16760  predicted transcriptional regulator  33.33 
 
 		 306 aa  67.8  0.0000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.342499  normal  0.498002 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2588  transcriptional regulator, MerR family  22.22 
 
 		 269 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.40806e-18 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3560  MerR family transcriptional regulator  25.68 
 
 		 287 aa  67  0.0000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.453881 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03030  predicted transcriptional regulator  34.29 
 
 		 276 aa  67  0.0000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2401  MerR family transcriptional regulator  28.47 
 
 		 269 aa  66.6  0.0000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.908212  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2576  MerR family transcriptional regulator  28.47 
 
 		 269 aa  66.6  0.0000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.473387  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1424  MerR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 279 aa  66.6  0.0000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.140644 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0295  MerR family transcriptional regulator  33.94 
 
 		 149 aa  66.2  0.0000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06160  serine/threonine protein phosphatase  37.5 
 
 		 361 aa  66.2  0.0000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1687  MerR family transcriptional regulator  30.7 
 
 		 129 aa  65.9  0.0000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13400  predicted transcriptional regulator  43.42 
 
 		 346 aa  65.5  0.000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2316  regulatory protein, MerR  37.93 
 
 		 369 aa  65.5  0.000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.280801  normal  0.123157 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2780  MerR family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 144 aa  65.1  0.000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.891963  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2898  transcriptional regulator, MerR family  35.92 
 
 		 282 aa  64.7  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1663  MerR family transcriptional regulator  29.86 
 
 		 343 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.350781  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1484  MerR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 126 aa  64.3  0.000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.944176  normal  0.368372 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2630  transcriptional regulator, MerR family  27.74 
 
 		 269 aa  64.3  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00281071  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3611  transcriptional regulator, MerR family  29.67 
 
 		 267 aa  64.3  0.000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1663  MerR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 343 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2762  MerR family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 129 aa  63.9  0.000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1785  MerR family transcriptional regulator  31.86 
 
 		 134 aa  64.7  0.000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.370686  normal  0.0498641 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1517  MerR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 342 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.242009 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3003  transcriptional regulator, MerR family  33.05 
 
 		 339 aa  63.9  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.101668  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1083  transcriptional regulator, MerR family  31.78 
 
 		 254 aa  63.5  0.000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0124198  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1504  MerR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 166 aa  63.5  0.000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2992  transcriptional regulator, MerR family  32.41 
 
 		 282 aa  63.5  0.000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.663692  normal  0.0173107 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1485  MerR family transcriptional regulator  20.97 
 
 		 276 aa  63.5  0.000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0543962  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2588  MerR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 129 aa  63.5  0.000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0158199 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1866  transcriptional regulator  28.57 
 
 		 247 aa  63.2  0.000000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000190425  hitchhiker  0.000000000849298 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1534  MerR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 182 aa  63.2  0.000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3192  MerR family transcriptional regulator  31.86 
 
 		 126 aa  63.2  0.000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.375407 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5383  transcriptional regulator, MerR family  34.44 
 
 		 266 aa  62.8  0.000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.94507 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1328  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  30.91 
 
 		 142 aa  62.8  0.000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.185828  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1498  MerR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 163 aa  63.2  0.000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2847  transcriptional regulator, MerR family  28.95 
 
 		 169 aa  62.8  0.000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.444422  hitchhiker  0.0000160217 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0247  MerR family transcriptional regulator  25.74 
 
 		 287 aa  62.8  0.000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2655  MerR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 129 aa  62.8  0.000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1708  transcriptional regulator, MerR family  19.01 
 
 		 276 aa  62.4  0.000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1641  MerR family transcriptional regulator  19.01 
 
 		 276 aa  62.4  0.000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0760  MerR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 267 aa  62.4  0.000000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0248072  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1008  MerR family transcriptional regulator  37.65 
 
 		 253 aa  62.4  0.000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1755  MerR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 342 aa  62.4  0.000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.581641  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0537  MerR family transcriptional regulator  32.74 
 
 		 133 aa  62  0.000000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.705155  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6337  MerR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 342 aa  62.4  0.000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1742  MerR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 342 aa  62.4  0.000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1523  MerR family transcriptional regulator  19.01 
 
 		 276 aa  62  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.193632  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2598  transcriptional regulator, MerR family  22.63 
 
 		 271 aa  61.6  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000630559  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>