More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_3003 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_3003  transcriptional regulator, MerR family  100 
 
 		 339 aa  682    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.101668  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2162  transcriptional regulator, MerR family  42.65 
 
 		 338 aa  247  2e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0710491 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1311  MerR family transcriptional regulator  43.97 
 
 		 330 aa  226  4e-58  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.852377  normal  0.0692282 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1354  regulatory protein, MerR  43.79 
 
 		 333 aa  222  7e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35600  predicted transcriptional regulator  37.72 
 
 		 319 aa  202  8e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.172761  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4214  putative transcriptional regulator, MerR family  42.74 
 
 		 319 aa  178  1e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.290445  hitchhiker  0.000447036 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6980  transcriptional regulator, MerR family  36.86 
 
 		 299 aa  172  6.999999999999999e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1614  transcriptional regulator, MerR family  41.2 
 
 		 295 aa  170  4e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.256957  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5322  transcriptional regulator, MerR family  38.6 
 
 		 320 aa  169  7e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8151  putative transcriptional regulator, MerR family  39.52 
 
 		 302 aa  167  2.9999999999999998e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.963489 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4400  transcriptional regulator, MerR family  42.41 
 
 		 303 aa  162  7e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.462564  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5097  transcriptional regulator, MerR family  34.02 
 
 		 303 aa  151  1e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0313452 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0824  MerR family transcriptional regulator  33.63 
 
 		 300 aa  125  1e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.39583  normal  0.651241 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2075  MerR family transcriptional regulator  29.45 
 
 		 304 aa  82.4  0.000000000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.491392 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2847  transcriptional regulator, MerR family  37.07 
 
 		 169 aa  75.9  0.0000000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.444422  hitchhiker  0.0000160217 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1498  MerR family transcriptional regulator  38.18 
 
 		 163 aa  75.5  0.000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1504  MerR family transcriptional regulator  37.27 
 
 		 166 aa  72  0.00000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1484  MerR family transcriptional regulator  39.45 
 
 		 126 aa  70.9  0.00000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.944176  normal  0.368372 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1785  MerR family transcriptional regulator  33.02 
 
 		 134 aa  71.2  0.00000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.370686  normal  0.0498641 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1915  MerR family transcriptional regulator  32.46 
 
 		 136 aa  70.5  0.00000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2509  MerR family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 151 aa  70.5  0.00000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.591979 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1407  MerR family transcriptional regulator  37.07 
 
 		 133 aa  70.5  0.00000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1534  MerR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 182 aa  70.1  0.00000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1687  MerR family transcriptional regulator  35.34 
 
 		 129 aa  68.6  0.0000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3209  MerR family transcriptional regulator  35.65 
 
 		 138 aa  68.2  0.0000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2588  MerR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 129 aa  68.2  0.0000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0158199 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3925  MerR family transcriptional regulator  39.33 
 
 		 147 aa  67.8  0.0000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.847498  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2655  MerR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 129 aa  67.8  0.0000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0080  transcriptional regulator, MerR family  46.97 
 
 		 137 aa  66.6  0.0000000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.671013 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2809  putative transcriptional regulator, MerR family  34.09 
 
 		 186 aa  66.2  0.0000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1357  MerR family transcriptional regulator  33.02 
 
 		 342 aa  66.2  0.0000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.744828  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2762  MerR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 129 aa  66.2  0.0000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4163  transcriptional regulator, MerR family  31.91 
 
 		 275 aa  65.9  0.0000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1961  MerR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 134 aa  65.9  0.0000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.778807  normal  0.944936 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0585  MerR family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 136 aa  65.5  0.000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.853287  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0624  MerR family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 136 aa  65.5  0.000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4350  transcriptional regulator, MerR family  44.62 
 
 		 131 aa  65.9  0.000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2326  MerR family transcriptional regulator  39.18 
 
 		 150 aa  65.1  0.000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4917  MerR family transcriptional regulator  40.79 
 
 		 186 aa  64.7  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00475602 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0630  MerR family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 136 aa  65.1  0.000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000318098 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0802  MerR family transcriptional regulator  39.02 
 
 		 165 aa  65.1  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0285806 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3690  regulatory protein, MerR  31.62 
 
 		 143 aa  65.1  0.000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2780  MerR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 144 aa  64.3  0.000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.891963  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1150  transcriptional regulator, MerR family  42.03 
 
 		 135 aa  63.9  0.000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00496019 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02170  predicted transcriptional regulator  44.62 
 
 		 133 aa  63.9  0.000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002186  zinc-responsive transcriptional regulator  28.04 
 
 		 132 aa  63.9  0.000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00879391  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3192  MerR family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 126 aa  63.2  0.000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.375407 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00208  zinc-responsive transcriptional regulator  26.56 
 
 		 132 aa  63.2  0.000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1394  MerR family transcriptional regulator  42.65 
 
 		 188 aa  63.2  0.000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3534  MerR family transcriptional regulator  30.17 
 
 		 143 aa  62.8  0.000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0358234  normal  0.617564 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1155  transcriptional regulator, MerR family  39.18 
 
 		 128 aa  62.8  0.000000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0258201  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3397  MerR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 117 aa  62.8  0.000000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1266  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  44.62 
 
 		 139 aa  62  0.00000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0668949 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1517  MerR family transcriptional regulator  25.85 
 
 		 342 aa  62  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.242009 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3164  MerR family transcriptional regulator  44.62 
 
 		 139 aa  62  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1755  MerR family transcriptional regulator  37.86 
 
 		 342 aa  62  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.581641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2655  zinc-responsive transcriptional regulator  28.18 
 
 		 133 aa  62  0.00000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2080  transcriptional regulator, MerR family  29.82 
 
 		 256 aa  62.4  0.00000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.632784  hitchhiker  0.000000000732695 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2391  Cd(II)/Pb(II)-responsive transcriptional regulator  32 
 
 		 151 aa  61.2  0.00000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0284263  normal  0.3053 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1639  MerR family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 159 aa  62  0.00000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.270848  normal  0.040207 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1667  regulatory protein, MerR  43.08 
 
 		 136 aa  62  0.00000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0034  MerR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 144 aa  61.6  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6337  MerR family transcriptional regulator  37.86 
 
 		 342 aa  62  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3393  transcriptional regulator, MerR family  39.42 
 
 		 254 aa  61.2  0.00000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.988274  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2104  transcriptional regulator, MerR family  32 
 
 		 151 aa  61.2  0.00000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1742  MerR family transcriptional regulator  37.86 
 
 		 342 aa  62  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3486  transcriptional regulator, MerR family  40 
 
 		 135 aa  61.2  0.00000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3186  transcriptional regulator, MerR family  30.43 
 
 		 327 aa  60.8  0.00000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2779  MerR family transcriptional regulator  38.82 
 
 		 180 aa  61.2  0.00000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.573882  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2107  regulatory protein, MerR:Albicidin resistance  44.12 
 
 		 342 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.814054  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1630  MerR family transcriptional regulator  44.12 
 
 		 155 aa  60.8  0.00000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1645  regulatory protein, MerR  44.62 
 
 		 154 aa  60.8  0.00000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0841182  normal  0.942746 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5351  transcriptional regulator, MerR family  30.71 
 
 		 144 aa  60.8  0.00000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0379309  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2494  transcriptional regulator, MerR family  36.92 
 
 		 148 aa  60.5  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.453842  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3026  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  43.08 
 
 		 139 aa  60.1  0.00000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3620  transcriptional regulator, MerR family  36.92 
 
 		 148 aa  60.5  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3456  MerR family transcriptional regulator  30 
 
 		 149 aa  60.5  0.00000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1866  transcriptional regulator  30.65 
 
 		 247 aa  60.1  0.00000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000190425  hitchhiker  0.000000000849298 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1160  MerR family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 133 aa  60.1  0.00000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.392851 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0932  MerR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 290 aa  60.1  0.00000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3790  MerR family transcriptional regulator  32.11 
 
 		 132 aa  60.1  0.00000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0361759  normal  0.548118 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4066  MerR family transcriptional regulator  32.11 
 
 		 132 aa  60.1  0.00000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3461  transcriptional regulator, MerR family protein  32.76 
 
 		 146 aa  60.1  0.00000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3712  MerR family transcriptional regulator  24.22 
 
 		 251 aa  60.1  0.00000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4323  MerR family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 146 aa  60.1  0.00000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1373  MerR family transcriptional regulator  28.46 
 
 		 159 aa  59.7  0.00000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.366441  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3680  transcriptional regulator, MerR family  34.23 
 
 		 133 aa  59.7  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.446637  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4158  MerR family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 135 aa  59.7  0.00000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.144769 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1415  transcriptional regulator, MerR family  37.31 
 
 		 143 aa  59.3  0.00000008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.0000000599633  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0831  MerR family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 145 aa  59.7  0.00000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3105  transcriptional regulator, MerR family  25 
 
 		 255 aa  59.3  0.00000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0154295  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4579  MerR family transcriptional regulator  29.37 
 
 		 134 aa  59.3  0.00000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.923905  decreased coverage  0.00324593 
 
 
-
 
NC_002936  DET1287  MerR family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 250 aa  58.9  0.0000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.917745  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1151  MerR family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 133 aa  58.9  0.0000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.100669  hitchhiker  0.000000311334 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2298  MerR family transcriptional regulator  43.08 
 
 		 343 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2195  transcriptional regulator, MerR family  44.62 
 
 		 214 aa  58.9  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1662  MerR family transcriptional regulator  44.62 
 
 		 215 aa  58.5  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.727696  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1678  MerR family transcriptional regulator  29.6 
 
 		 132 aa  58.9  0.0000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3495  MerR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 133 aa  59.3  0.0000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.444785 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0323  transcription regulator family  25.71 
 
 		 253 aa  59.3  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>