More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_1394 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_1394  MerR family transcriptional regulator  100 
 
 		 188 aa  367  1e-101  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2779  MerR family transcriptional regulator  65.41 
 
 		 185 aa  233  1.0000000000000001e-60  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0575166  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2008  transcriptional regulator, MerR family  56.59 
 
 		 191 aa  204  7e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2214  transcriptional regulator, MerR family  58.72 
 
 		 177 aa  201  5e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000011193 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0139  transcriptional regulator, MerR family  60.47 
 
 		 183 aa  199  1.9999999999999998e-50  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0264  MerR family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 173 aa  132  3e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.829201  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3014  MerR family transcriptional regulator  41.3 
 
 		 195 aa  120  9e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.20917  normal  0.37376 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2794  MerR family transcriptional regulator  37.57 
 
 		 181 aa  117  9e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0148  MerR family transcriptional regulator  48.72 
 
 		 257 aa  76.6  0.0000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.290112  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1919  MerR family transcriptional regulator  47.44 
 
 		 268 aa  76.6  0.0000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0931546  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04067  SAM-dependent methyltransferase  32.24 
 
 		 390 aa  75.5  0.0000000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.882987  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03143  zinc-responsive transcriptional regulator  34.33 
 
 		 141 aa  74.7  0.0000000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0421  transcriptional regulator, MerR family  34.33 
 
 		 141 aa  74.7  0.0000000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0421  zinc-responsive transcriptional regulator  34.33 
 
 		 141 aa  74.7  0.0000000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0879681  hitchhiker  0.0000172555 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4614  zinc-responsive transcriptional regulator  34.33 
 
 		 141 aa  74.7  0.0000000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000341039  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3678  zinc-responsive transcriptional regulator  34.33 
 
 		 141 aa  74.7  0.0000000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3775  zinc-responsive transcriptional regulator  34.33 
 
 		 141 aa  74.7  0.0000000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.02383  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3486  zinc-responsive transcriptional regulator  34.33 
 
 		 141 aa  74.7  0.0000000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0751902  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3587  zinc-responsive transcriptional regulator  34.33 
 
 		 141 aa  74.7  0.0000000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.205456  normal  0.141164 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03094  hypothetical protein  34.33 
 
 		 141 aa  74.7  0.0000000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1357  MerR family transcriptional regulator  46.91 
 
 		 342 aa  74.7  0.0000000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.744828  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3607  zinc-responsive transcriptional regulator  34.33 
 
 		 141 aa  72.8  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0303153  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3680  zinc-responsive transcriptional regulator  34.33 
 
 		 141 aa  72.8  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0767  MerR family transcriptional regulator  31.49 
 
 		 390 aa  71.6  0.000000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1437  MerR family transcriptional regulator  31.49 
 
 		 390 aa  71.2  0.000000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3715  zinc-responsive transcriptional regulator  38.32 
 
 		 141 aa  70.9  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.325937 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3608  zinc-responsive transcriptional regulator  38.32 
 
 		 141 aa  70.9  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.260442 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3778  zinc-responsive transcriptional regulator  38.32 
 
 		 141 aa  70.9  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.508161  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2298  MerR family transcriptional regulator  41.57 
 
 		 343 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3724  zinc-responsive transcriptional regulator  38.32 
 
 		 141 aa  69.7  0.00000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.299789  hitchhiker  0.00578388 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0077  MerR family transcriptional regulator  34.97 
 
 		 391 aa  69.7  0.00000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4698  transcriptional regulator, MerR family  43.62 
 
 		 253 aa  70.1  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2165  MerR family transcriptional regulator  41.57 
 
 		 343 aa  69.3  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.123028  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2107  regulatory protein, MerR:Albicidin resistance  40.66 
 
 		 342 aa  67.8  0.00000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.814054  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4622  transcriptional regulator, MerR family  33.83 
 
 		 144 aa  67.8  0.00000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.821242  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3534  MerR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 143 aa  68.2  0.00000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0358234  normal  0.617564 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2470  MerR family transcriptional regulator  46.75 
 
 		 138 aa  67.8  0.00000000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0034  MerR family transcriptional regulator  34.68 
 
 		 144 aa  67.8  0.0000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1079  TipAS antibiotic-recognition domain-containing protein  49.25 
 
 		 252 aa  67  0.0000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.23199 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5055  MerR family transcriptional regulator  43.37 
 
 		 251 aa  67  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.561645  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0494  zinc-responsive transcriptional regulator  38.61 
 
 		 153 aa  67  0.0000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5143  MerR family transcriptional regulator  43.37 
 
 		 251 aa  67  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0035  transcriptional regulator, MerR family  32.37 
 
 		 167 aa  66.6  0.0000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.987448  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7265  MerR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 391 aa  67  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0017  MerR family transcriptional regulator  32.37 
 
 		 167 aa  66.6  0.0000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.801756 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1260  transcriptional regulator  34.68 
 
 		 131 aa  66.6  0.0000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.332121  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1150  transcriptional regulator, MerR family  51.47 
 
 		 135 aa  67  0.0000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00496019 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0585  MerR family transcriptional regulator  33.06 
 
 		 136 aa  65.9  0.0000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.853287  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0624  MerR family transcriptional regulator  33.06 
 
 		 136 aa  65.9  0.0000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3393  transcriptional regulator, MerR family  35 
 
 		 254 aa  66.2  0.0000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.988274  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0938  MerR family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 398 aa  65.9  0.0000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4442  putative transcriptional regulator, MerR family  47.37 
 
 		 253 aa  66.2  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00264375  hitchhiker  0.000476994 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4579  MerR family transcriptional regulator  33.06 
 
 		 134 aa  66.2  0.0000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.923905  decreased coverage  0.00324593 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0969  MerR family transcriptional regulator  49.25 
 
 		 252 aa  65.9  0.0000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00256708  hitchhiker  0.0060004 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06140  predicted transcriptional regulator  36.59 
 
 		 129 aa  65.9  0.0000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5434  MerR family transcriptional regulator  42.17 
 
 		 251 aa  65.9  0.0000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.736735  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3408  zinc-responsive transcriptional regulator  34.48 
 
 		 171 aa  65.5  0.0000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0271  MerR family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 156 aa  65.1  0.0000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0445  zinc-responsive transcriptional regulator  37.5 
 
 		 159 aa  65.5  0.0000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.261357 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0384  transcriptional regulator, MerR family  48.19 
 
 		 258 aa  65.5  0.0000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0450143  decreased coverage  0.00634425 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3411  zinc-responsive transcriptional regulator  42.11 
 
 		 158 aa  65.1  0.0000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6009  transcriptional regulator, MerR family  34.17 
 
 		 129 aa  65.1  0.0000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.241161  normal  0.0668881 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3793  transcriptional regulator, MerR family  31.82 
 
 		 139 aa  65.1  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0853  MerR family transcriptional regulator  37.38 
 
 		 146 aa  64.7  0.0000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2543  MerR family transcriptional regulator  35 
 
 		 128 aa  64.7  0.0000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.212021  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0630  MerR family transcriptional regulator  33.06 
 
 		 136 aa  64.7  0.0000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000318098 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2718  transcriptional regulator, MerR family  36.75 
 
 		 150 aa  64.7  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.654055  hitchhiker  0.0000347436 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18550  predicted transcriptional regulator  47.56 
 
 		 244 aa  64.7  0.0000000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1517  MerR family transcriptional regulator  37.37 
 
 		 342 aa  64.3  0.0000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.242009 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2558  MerR family transcriptional regulator  36.54 
 
 		 139 aa  64.7  0.0000000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16670  putative transcriptional regulator CadR  41.41 
 
 		 156 aa  64.3  0.0000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2481  transcriptional regulator, MerR family  38.94 
 
 		 269 aa  63.9  0.000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.564945  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35600  predicted transcriptional regulator  30.28 
 
 		 319 aa  63.9  0.000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.172761  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2538  transcriptional regulator, MerR family  33.87 
 
 		 147 aa  63.9  0.000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.329159  normal  0.129188 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3016  MerR family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 252 aa  63.9  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0255  transcriptional regulator, MerR family  46.15 
 
 		 251 aa  63.9  0.000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1967  MerR family transcriptional regulator  33.07 
 
 		 141 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.775323  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0250  MerR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 392 aa  63.9  0.000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.757542 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4898  MerR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 147 aa  63.2  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.627224  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5579  transcriptional regulator, MerR family  31.06 
 
 		 144 aa  63.5  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7157  transcriptional regulator, MerR family  33.33 
 
 		 129 aa  63.5  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.267404  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0653  regulatory protein, MerR  32.26 
 
 		 132 aa  63.2  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0010  hypothetical protein  40.24 
 
 		 270 aa  63.5  0.000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4536  transcriptional regulator, MerR family  36.97 
 
 		 146 aa  63.5  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.228678  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1320  transcriptional regulator, MerR family  44.33 
 
 		 255 aa  63.2  0.000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0080  transcriptional regulator, MerR family  38.96 
 
 		 137 aa  63.2  0.000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.671013 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3844  transcriptional regulator, MerR family  30.91 
 
 		 139 aa  63.5  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.603426 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0760  MerR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 267 aa  63.2  0.000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0248072  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1449  Cd(II)/Pb(II)-responsive transcriptional regulator  41.41 
 
 		 156 aa  63.2  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0297  zinc-responsive transcriptional regulator  35.58 
 
 		 159 aa  63.2  0.000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3285  transcriptional regulator, MerR family  45.12 
 
 		 272 aa  63.5  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.235229  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0420  MerR family transcriptional regulator  36.9 
 
 		 258 aa  62.8  0.000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2797  MerR family transcriptional regulator  35.24 
 
 		 255 aa  62.8  0.000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1413  hypothetical protein  36.36 
 
 		 315 aa  62.8  0.000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3346  transcriptional regulator, MerR family  29.81 
 
 		 252 aa  62.8  0.000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00536383  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1630  MerR family transcriptional regulator  43.06 
 
 		 155 aa  62.8  0.000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3003  transcriptional regulator, MerR family  42.65 
 
 		 339 aa  62.8  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.101668  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1060  MerR family transcriptional regulator  44.59 
 
 		 134 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.089973  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0433  zinc-responsive transcriptional regulator  42.11 
 
 		 173 aa  62.4  0.000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25610  predicted transcriptional regulator  35.77 
 
 		 129 aa  62.8  0.000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>