More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_5322 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_5322  transcriptional regulator, MerR family  100 
 
 		 320 aa  630  1e-179  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4214  putative transcriptional regulator, MerR family  61.64 
 
 		 319 aa  347  1e-94  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.290445  hitchhiker  0.000447036 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35600  predicted transcriptional regulator  47.23 
 
 		 319 aa  255  6e-67  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.172761  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6980  transcriptional regulator, MerR family  48.43 
 
 		 299 aa  255  7e-67  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8151  putative transcriptional regulator, MerR family  48.04 
 
 		 302 aa  239  4e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.963489 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1614  transcriptional regulator, MerR family  44.95 
 
 		 295 aa  222  8e-57  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.256957  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5097  transcriptional regulator, MerR family  45.66 
 
 		 303 aa  221  1.9999999999999999e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0313452 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0824  MerR family transcriptional regulator  50.32 
 
 		 300 aa  205  8e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.39583  normal  0.651241 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4400  transcriptional regulator, MerR family  41.12 
 
 		 303 aa  194  2e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.462564  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2162  transcriptional regulator, MerR family  39.45 
 
 		 338 aa  185  7e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0710491 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1311  MerR family transcriptional regulator  39.63 
 
 		 330 aa  173  2.9999999999999996e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.852377  normal  0.0692282 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1354  regulatory protein, MerR  40.85 
 
 		 333 aa  171  2e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3003  transcriptional regulator, MerR family  38.3 
 
 		 339 aa  168  9e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.101668  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2075  MerR family transcriptional regulator  31.79 
 
 		 304 aa  81.3  0.00000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.491392 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1357  MerR family transcriptional regulator  26.47 
 
 		 342 aa  72  0.00000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.744828  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3209  MerR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 138 aa  70.1  0.00000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2028  transcriptional regulator, MerR family  27.32 
 
 		 283 aa  70.1  0.00000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000014266  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1449  Cd(II)/Pb(II)-responsive transcriptional regulator  35.83 
 
 		 156 aa  69.3  0.00000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3373  MerR family transcriptional regulator  36.13 
 
 		 136 aa  67.8  0.0000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0297855  normal  0.469131 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2443  MerR family transcriptional regulator  51.52 
 
 		 140 aa  67.4  0.0000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16670  putative transcriptional regulator CadR  35 
 
 		 156 aa  67.8  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3925  MerR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 147 aa  66.6  0.0000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.847498  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2008  transcriptional regulator, MerR family  48.48 
 
 		 148 aa  65.1  0.000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.505788  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3456  MerR family transcriptional regulator  37.38 
 
 		 149 aa  64.3  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4834  transcriptional regulator, MerR family  41.82 
 
 		 144 aa  64.3  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.300455  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3961  MerR family transcriptional regulator  45.59 
 
 		 142 aa  63.9  0.000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.146237  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1150  transcriptional regulator, MerR family  44.12 
 
 		 135 aa  63.9  0.000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00496019 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3393  transcriptional regulator, MerR family  45.07 
 
 		 254 aa  64.3  0.000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.988274  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3623  MerR family transcriptional regulator  45.59 
 
 		 142 aa  63.9  0.000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4917  MerR family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 186 aa  63.2  0.000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00475602 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4945  regulatory protein, MerR  44.74 
 
 		 147 aa  63.2  0.000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0828053  hitchhiker  0.00815362 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3410  hypothetical protein  41 
 
 		 142 aa  62.8  0.000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1961  MerR family transcriptional regulator  40 
 
 		 134 aa  62.4  0.000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.778807  normal  0.944936 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0052  transcriptional regulator, MerR family  35.48 
 
 		 157 aa  62  0.00000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2470  MerR family transcriptional regulator  41.77 
 
 		 138 aa  62.4  0.00000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4947  regulatory protein, MerR  43.94 
 
 		 129 aa  62.4  0.00000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.459947  decreased coverage  0.00286067 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2809  putative transcriptional regulator, MerR family  35.58 
 
 		 186 aa  62.4  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4070  transcriptional regulator, MerR family  36.52 
 
 		 132 aa  62.4  0.00000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.336663 
 
 
-
 
NC_009008  RSP_4277  MerR family transcriptional regulator  38 
 
 		 140 aa  62  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2814  transcriptional regulator, MerR family  45.21 
 
 		 138 aa  61.6  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3339  MerR family transcriptional regulator  34.11 
 
 		 157 aa  61.6  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.88053  normal  0.266963 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3690  regulatory protein, MerR  40.85 
 
 		 143 aa  61.6  0.00000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5946  MerR family transcriptional regulator PbrR  43.94 
 
 		 145 aa  61.2  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.543608 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0802  MerR family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 165 aa  61.2  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0285806 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0593  MerR family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 137 aa  61.2  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.429444  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1785  MerR family transcriptional regulator  27.69 
 
 		 134 aa  61.6  0.00000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.370686  normal  0.0498641 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4873  MerR family transcriptional regulator  30.22 
 
 		 260 aa  61.6  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.686737  normal  0.0317113 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4237  MerR family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 136 aa  60.8  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.428618  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2718  transcriptional regulator, MerR family  41.79 
 
 		 150 aa  61.2  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.654055  hitchhiker  0.0000347436 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2326  MerR family transcriptional regulator  36.27 
 
 		 150 aa  60.8  0.00000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0831  MerR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 145 aa  60.8  0.00000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002186  zinc-responsive transcriptional regulator  30.4 
 
 		 132 aa  60.8  0.00000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00879391  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4117  MerR family transcriptional regulator  37 
 
 		 140 aa  61.2  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2343  MerR family transcriptional regulator  36.27 
 
 		 146 aa  60.5  0.00000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.264422  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1755  MerR family transcriptional regulator  38.32 
 
 		 342 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.581641  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2267  MerR family transcriptional regulator  37.96 
 
 		 132 aa  60.1  0.00000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.312011  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2655  zinc-responsive transcriptional regulator  29.03 
 
 		 133 aa  60.1  0.00000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2780  MerR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 144 aa  60.1  0.00000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.891963  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2558  MerR family transcriptional regulator  46.97 
 
 		 139 aa  60.1  0.00000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6337  MerR family transcriptional regulator  38.32 
 
 		 342 aa  60.1  0.00000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3461  transcriptional regulator, MerR family protein  40.91 
 
 		 146 aa  60.1  0.00000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1777  MerR family transcriptional regulator  31.09 
 
 		 145 aa  60.1  0.00000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1742  MerR family transcriptional regulator  38.32 
 
 		 342 aa  60.1  0.00000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4323  MerR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 146 aa  60.1  0.00000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2686  MerR family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 172 aa  59.7  0.00000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3563  transcriptional regulator, MerR family  36.52 
 
 		 143 aa  59.7  0.00000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2900  MerR family transcriptional regulator  37.27 
 
 		 140 aa  59.7  0.00000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4523  MerR family transcriptional regulator  39.44 
 
 		 149 aa  59.7  0.00000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1915  MerR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 136 aa  59.3  0.00000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2300  MerR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 134 aa  59.3  0.00000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.639917  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4350  transcriptional regulator, MerR family  41.94 
 
 		 131 aa  59.3  0.00000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3026  transcriptional regulator, MerR family  38.46 
 
 		 137 aa  59.3  0.00000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2918  transcriptional regulator, MerR family  43.84 
 
 		 154 aa  59.3  0.00000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.247446  normal  0.104462 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1517  MerR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 342 aa  59.3  0.00000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.242009 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3299  MerR family transcriptional regulator  35.51 
 
 		 149 aa  59.3  0.00000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0169089  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3397  MerR family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 117 aa  59.3  0.00000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2572  MerR family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 141 aa  59.3  0.00000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.957862  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3979  MerR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 174 aa  58.5  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.00581953  normal  0.426596 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2847  transcriptional regulator, MerR family  43.94 
 
 		 169 aa  58.9  0.0000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.444422  hitchhiker  0.0000160217 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4382  regulatory protein, MerR  35.25 
 
 		 256 aa  58.9  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.534251 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0812  MerR family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 143 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1384  regulatory protein, MerR  45.31 
 
 		 132 aa  58.9  0.0000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5038  MerR family transcriptional regulator  38.3 
 
 		 342 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.99192 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0543  transcriptional regulator, MerR family  37.04 
 
 		 158 aa  58.5  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.166066  hitchhiker  0.000000593111 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0373  transcriptional regulator, MerR family  37.04 
 
 		 158 aa  58.5  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2509  MerR family transcriptional regulator  36.04 
 
 		 151 aa  58.9  0.0000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.591979 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1032  transcriptional regulator, MerR family  42.42 
 
 		 144 aa  58.9  0.0000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.920994  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2848  MerR family transcriptional regulator  38.38 
 
 		 142 aa  58.5  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4039  MerR family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 130 aa  58.9  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.576602  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25610  predicted transcriptional regulator  43.08 
 
 		 129 aa  58.9  0.0000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06140  predicted transcriptional regulator  43.08 
 
 		 129 aa  58.9  0.0000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1504  MerR family transcriptional regulator  36.89 
 
 		 166 aa  58.5  0.0000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1534  MerR family transcriptional regulator  42.25 
 
 		 182 aa  58.9  0.0000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1678  MerR family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 132 aa  58.2  0.0000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2760  Hg(II)-responsive transcriptional regulator  34.51 
 
 		 135 aa  58.2  0.0000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1151  MerR family transcriptional regulator  39.56 
 
 		 133 aa  58.2  0.0000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.100669  hitchhiker  0.000000311334 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2008  transcriptional regulator, MerR family  30.1 
 
 		 191 aa  57.8  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4537  Hg(II)-responsive transcriptional regulator  36.76 
 
 		 132 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2024  MerR family transcriptional regulator  22.76 
 
 		 129 aa  58.5  0.0000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1498  MerR family transcriptional regulator  43.94 
 
 		 163 aa  58.2  0.0000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>