More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_4382 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_4382  regulatory protein, MerR  100 
 
 		 256 aa  492  9.999999999999999e-139  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.534251 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4873  MerR family transcriptional regulator  87.89 
 
 		 260 aa  443  1e-123  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.686737  normal  0.0317113 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0543  transcriptional regulator, MerR family  55.34 
 
 		 252 aa  252  5.000000000000001e-66  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2048  transcriptional regulator, MerR family  52.34 
 
 		 265 aa  230  2e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.144756 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0374  MerR family transcriptional regulator  51.95 
 
 		 254 aa  226  4e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0448793  hitchhiker  0.00531151 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2015  putative transcriptional regulator, MerR family  52.73 
 
 		 264 aa  219  3.9999999999999997e-56  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8874  transcriptional regulator, MerR family  48 
 
 		 249 aa  204  2e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5720  MerR family transcriptional regulator  38.34 
 
 		 260 aa  125  8.000000000000001e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6059  transcriptional regulator, MerR family  37.95 
 
 		 258 aa  125  8.000000000000001e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5341  MerR family transcriptional regulator  38.34 
 
 		 260 aa  124  1e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.138898  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5430  MerR family transcriptional regulator  38.34 
 
 		 260 aa  124  1e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.792567  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0868  transcriptional regulator, MerR family  40.59 
 
 		 254 aa  123  3e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.915054 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2662  transcriptional regulator, MerR family  50 
 
 		 126 aa  109  3e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00193678  hitchhiker  0.00916479 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09690  predicted transcriptional regulator  40.12 
 
 		 290 aa  86.3  4e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.311796  normal  0.878429 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1354  transcriptional regulator, MerR family  42.61 
 
 		 254 aa  85.9  6e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2659  transcriptional regulator, MerR family  36.45 
 
 		 246 aa  84  0.000000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.587322  normal  0.281971 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0668  transcriptional regulator, MerR family  46.67 
 
 		 272 aa  84  0.000000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000812117  hitchhiker  0.0000325432 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4378  transcriptional regulator, MerR family  46.88 
 
 		 242 aa  79  0.00000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4036  transcriptional regulator, MerR family  36.6 
 
 		 262 aa  77.4  0.0000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000546536  normal  0.0325517 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1534  transcriptional regulator, MerR family  39.34 
 
 		 249 aa  77.4  0.0000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0334786  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2417  putative transcriptional regulator, MerR family  56.92 
 
 		 304 aa  75.5  0.0000000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4880  transcriptional regulator, MerR family  54.29 
 
 		 249 aa  74.7  0.000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0913  transcriptional regulator, MerR family  30.15 
 
 		 260 aa  73.9  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.251711  normal  0.260144 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1862  transcriptional regulator, MerR family  45.74 
 
 		 247 aa  73.9  0.000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0767866 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2419  regulatory protein, MerR  35.29 
 
 		 246 aa  74.3  0.000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.110485  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3594  transcriptional regulator, MerR family  42.06 
 
 		 278 aa  74.3  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3346  transcriptional regulator, MerR family  31.44 
 
 		 241 aa  73.6  0.000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.152739  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8430  putative transcriptional regulator, MerR family  55.88 
 
 		 251 aa  72.8  0.000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.750305  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3862  precorrin-8X methylmutase  37.38 
 
 		 368 aa  70.5  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.268065  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1345  transcriptional regulator, MerR family  36.36 
 
 		 246 aa  70.1  0.00000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4229  transcriptional regulator, MerR family  41.67 
 
 		 258 aa  69.7  0.00000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1265  transcriptional regulator, MerR family  45.45 
 
 		 252 aa  68.9  0.00000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4282  transcriptional regulator, MerR family  49.23 
 
 		 308 aa  67.4  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.416101  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3990  transcriptional regulator, MerR family  43.14 
 
 		 248 aa  67.4  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.340501  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2343  MerR family transcriptional regulator  43.52 
 
 		 146 aa  67.4  0.0000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.264422  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34160  predicted transcriptional regulator  43.56 
 
 		 278 aa  65.9  0.0000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.153651 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3393  transcriptional regulator, MerR family  45.24 
 
 		 254 aa  65.9  0.0000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.988274  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1339  transcriptional regulator of MerR family protein  44.12 
 
 		 130 aa  65.5  0.0000000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0437  MerR family transcriptional regulator  41.82 
 
 		 161 aa  65.5  0.0000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1790  transcriptional regulator  41.82 
 
 		 141 aa  65.1  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.269282  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5097  transcriptional regulator, MerR family  45.59 
 
 		 303 aa  65.1  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0313452 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2028  transcriptional regulator, MerR family  27.43 
 
 		 283 aa  63.2  0.000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000014266  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35600  predicted transcriptional regulator  41.11 
 
 		 319 aa  63.2  0.000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.172761  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3410  hypothetical protein  41.07 
 
 		 142 aa  63.2  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0211  MerR family transcriptional regulator  39.23 
 
 		 140 aa  62.8  0.000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3623  MerR family transcriptional regulator  40 
 
 		 142 aa  62.4  0.000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3961  MerR family transcriptional regulator  40 
 
 		 142 aa  62.4  0.000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.146237  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0409  TipAS antibiotic-recognition domain protein  47.22 
 
 		 259 aa  62  0.000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1955  MerR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 128 aa  61.6  0.00000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2538  MerR family transcriptional regulator  41.75 
 
 		 157 aa  61.6  0.00000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2173  regulatory protein, MerR  37.61 
 
 		 147 aa  61.6  0.00000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1851  MerR family transcriptional regulator  35.43 
 
 		 162 aa  60.8  0.00000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.138506  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4834  transcriptional regulator, MerR family  46.27 
 
 		 144 aa  60.8  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.300455  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0824  MerR family transcriptional regulator  45.59 
 
 		 300 aa  60.8  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.39583  normal  0.651241 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2470  MerR family transcriptional regulator  42 
 
 		 138 aa  60.5  0.00000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2543  MerR family transcriptional regulator  45.59 
 
 		 128 aa  60.8  0.00000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.212021  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2214  transcriptional regulator, MerR family  32.56 
 
 		 177 aa  60.5  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000011193 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2819  transcriptional regulator, MerR family protein  36.75 
 
 		 129 aa  60.8  0.00000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2357  MerR family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 136 aa  60.5  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.120567 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0065  transcriptional regulator, MerR family  35.71 
 
 		 252 aa  60.5  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2317  MerR family transcriptional regulator  30.84 
 
 		 269 aa  60.1  0.00000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0566035  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2018  putative transcriptional regulator, MerR family  45.71 
 
 		 286 aa  60.1  0.00000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.253438  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2453  transcriptional regulator, MerR family  37.5 
 
 		 155 aa  59.7  0.00000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00000100878  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8151  putative transcriptional regulator, MerR family  38.53 
 
 		 302 aa  59.3  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.963489 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1820  MerR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 270 aa  59.7  0.00000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.404333  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2300  MerR family transcriptional regulator  48.53 
 
 		 134 aa  59.7  0.00000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.639917  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3285  transcriptional regulator, MerR family  36.27 
 
 		 272 aa  59.7  0.00000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.235229  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1943  transcriptional regulator of MerR family protein  41.1 
 
 		 135 aa  59.7  0.00000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.555422  normal  0.0105773 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2848  MerR family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 142 aa  59.3  0.00000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4537  Hg(II)-responsive transcriptional regulator  43.08 
 
 		 132 aa  59.3  0.00000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5322  transcriptional regulator, MerR family  35.25 
 
 		 320 aa  58.9  0.00000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3156  MerR family transcriptional regulator  48.39 
 
 		 146 aa  58.9  0.00000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.215145  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0047  MerR family transcriptional regulator  56.52 
 
 		 264 aa  58.9  0.00000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3209  MerR family transcriptional regulator  33.87 
 
 		 138 aa  58.5  0.00000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5434  MerR family transcriptional regulator  38.61 
 
 		 251 aa  58.5  0.00000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.736735  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0802  transcriptional regulator, MerR family  40.59 
 
 		 142 aa  58.5  0.00000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1517  MerR family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 342 aa  58.5  0.00000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.242009 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1972  MerR family transcriptional regulator  26.13 
 
 		 238 aa  58.2  0.0000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7842  transcriptional regulator, MerR family  36.89 
 
 		 149 aa  58.5  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3662  transcriptional regulator, MerR family  46.03 
 
 		 146 aa  58.2  0.0000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1079  TipAS antibiotic-recognition domain-containing protein  39.36 
 
 		 252 aa  58.2  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.23199 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20960  predicted transcriptional regulator  50 
 
 		 310 aa  58.5  0.0000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.376744  normal  0.903432 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2640  transcriptional regulator, MerR family  30.36 
 
 		 283 aa  58.2  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3103  MerR family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 145 aa  58.5  0.0000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0869  MerR family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 145 aa  58.2  0.0000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0838  MerR family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 145 aa  58.5  0.0000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0295  MerR family transcriptional regulator  36.89 
 
 		 149 aa  57.8  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0178  MerR family transcriptional regulator  39.6 
 
 		 142 aa  57.4  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0926305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2900  MerR family transcriptional regulator  48.39 
 
 		 140 aa  57.4  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1617  putative transcriptional regulator, MerR family  40 
 
 		 252 aa  57.8  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.870774 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6337  MerR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 342 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5055  MerR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 251 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.561645  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2545  transcriptional regulator, MerR family  31 
 
 		 269 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1755  MerR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 342 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.581641  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4099  transcription activator effector binding protein  45.83 
 
 		 276 aa  57.4  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1742  MerR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 342 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5255  transcriptional regulator, MerR family  25.74 
 
 		 253 aa  57.4  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5143  MerR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 251 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4862  MerR family transcriptional regulator  25.74 
 
 		 254 aa  57  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1646  MerR family transcriptional regulator  33.6 
 
 		 133 aa  57  0.0000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>