More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_20960 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_20960  predicted transcriptional regulator  100 
 
 		 310 aa  609  1e-173  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.376744  normal  0.903432 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2417  putative transcriptional regulator, MerR family  69.77 
 
 		 304 aa  395  1e-109  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4282  transcriptional regulator, MerR family  67.31 
 
 		 308 aa  385  1e-106  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.416101  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3594  transcriptional regulator, MerR family  54.27 
 
 		 278 aa  265  8.999999999999999e-70  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1534  transcriptional regulator, MerR family  34.18 
 
 		 249 aa  89.7  5e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0334786  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4036  transcriptional regulator, MerR family  38.26 
 
 		 262 aa  85.9  9e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000546536  normal  0.0325517 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0913  transcriptional regulator, MerR family  38.46 
 
 		 260 aa  84  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.251711  normal  0.260144 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2048  transcriptional regulator, MerR family  42.96 
 
 		 265 aa  82  0.00000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.144756 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0868  transcriptional regulator, MerR family  31.6 
 
 		 254 aa  82  0.00000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.915054 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5430  MerR family transcriptional regulator  40 
 
 		 260 aa  80.1  0.00000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.792567  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5341  MerR family transcriptional regulator  40 
 
 		 260 aa  80.1  0.00000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.138898  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5720  MerR family transcriptional regulator  39.42 
 
 		 260 aa  80.1  0.00000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6059  transcriptional regulator, MerR family  31.25 
 
 		 258 aa  72.8  0.000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0374  MerR family transcriptional regulator  41.07 
 
 		 254 aa  72.8  0.000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0448793  hitchhiker  0.00531151 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2028  transcriptional regulator, MerR family  31.82 
 
 		 283 aa  72  0.00000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000014266  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4382  regulatory protein, MerR  36 
 
 		 256 aa  70.9  0.00000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.534251 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4873  MerR family transcriptional regulator  50 
 
 		 260 aa  71.6  0.00000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.686737  normal  0.0317113 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2015  putative transcriptional regulator, MerR family  47.13 
 
 		 264 aa  70.1  0.00000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4880  transcriptional regulator, MerR family  37.37 
 
 		 249 aa  68.2  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8874  transcriptional regulator, MerR family  37.19 
 
 		 249 aa  67.8  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1265  transcriptional regulator, MerR family  37.93 
 
 		 252 aa  67.4  0.0000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0543  transcriptional regulator, MerR family  50 
 
 		 252 aa  67.4  0.0000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0668  transcriptional regulator, MerR family  33.94 
 
 		 272 aa  66.6  0.0000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000812117  hitchhiker  0.0000325432 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4378  transcriptional regulator, MerR family  45.61 
 
 		 242 aa  64.3  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8430  putative transcriptional regulator, MerR family  44.44 
 
 		 251 aa  64.3  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.750305  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2659  transcriptional regulator, MerR family  36.04 
 
 		 246 aa  62.8  0.000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.587322  normal  0.281971 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2640  transcriptional regulator, MerR family  30.09 
 
 		 283 aa  62  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3346  transcriptional regulator, MerR family  44.07 
 
 		 241 aa  61.6  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.152739  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0734  regulatory protein, MerR  38.26 
 
 		 154 aa  61.2  0.00000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.308445  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4229  transcriptional regulator, MerR family  45.61 
 
 		 258 aa  61.6  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3862  precorrin-8X methylmutase  32.41 
 
 		 368 aa  60.5  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.268065  normal  1 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4528  transcriptional regulator, MerR family  38.53 
 
 		 129 aa  60.8  0.00000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.355526 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4509  transcriptional regulator, MerR family  39.45 
 
 		 129 aa  60.5  0.00000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0125189 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1354  transcriptional regulator, MerR family  42.11 
 
 		 254 aa  59.7  0.00000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3623  MerR family transcriptional regulator  35.51 
 
 		 142 aa  58.5  0.0000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3961  MerR family transcriptional regulator  35.51 
 
 		 142 aa  58.5  0.0000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.146237  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1345  transcriptional regulator, MerR family  42.11 
 
 		 246 aa  58.2  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1155  transcriptional regulator, MerR family  36.89 
 
 		 128 aa  57.8  0.0000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0258201  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3108  MerR family transcriptional regulator  33.98 
 
 		 154 aa  57  0.0000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.798682  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2464  transcriptional regulator, MerR family  31.73 
 
 		 137 aa  57  0.0000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1777  MerR family transcriptional regulator  36.04 
 
 		 145 aa  57  0.0000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1755  MerR family transcriptional regulator  30.49 
 
 		 342 aa  56.2  0.0000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.581641  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6549  transcriptional regulator, MerR family  33.94 
 
 		 128 aa  56.6  0.0000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.135068  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3563  transcriptional regulator, MerR family  33.04 
 
 		 143 aa  56.2  0.0000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6337  MerR family transcriptional regulator  30.49 
 
 		 342 aa  56.2  0.0000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1742  MerR family transcriptional regulator  30.49 
 
 		 342 aa  56.2  0.0000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2558  MerR family transcriptional regulator  36.63 
 
 		 139 aa  56.2  0.0000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0437  MerR family transcriptional regulator  36.28 
 
 		 161 aa  55.8  0.0000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1400  MerR family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 161 aa  55.5  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3990  transcriptional regulator, MerR family  33.66 
 
 		 248 aa  55.1  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.340501  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1790  transcriptional regulator  36.28 
 
 		 141 aa  55.1  0.000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.269282  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0980  MerR family transcriptional regulator  35.4 
 
 		 648 aa  55.1  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1862  transcriptional regulator, MerR family  33.71 
 
 		 247 aa  55.5  0.000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0767866 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1385  transcriptional regulator of MerR family protein  31.19 
 
 		 153 aa  54.7  0.000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0442  transcriptional regulator, MerR family  41.27 
 
 		 132 aa  55.1  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.856657  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2333  MerR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 162 aa  54.7  0.000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00701798  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0811  MerR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 630 aa  53.9  0.000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.872651  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09690  predicted transcriptional regulator  45.83 
 
 		 290 aa  53.9  0.000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.311796  normal  0.878429 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0545  MerR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 630 aa  53.9  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13367  MerR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 146 aa  54.3  0.000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.272142  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2819  transcriptional regulator, MerR family protein  28.72 
 
 		 129 aa  54.3  0.000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2017  MerR family transcriptional regulator  40 
 
 		 140 aa  53.9  0.000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1729  MerR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 659 aa  53.5  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1941  MerR family transcriptional regulator  40 
 
 		 140 aa  53.9  0.000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1639  MerR family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 159 aa  53.1  0.000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.270848  normal  0.040207 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2665  MerR family transcriptional regulator  32.23 
 
 		 639 aa  53.5  0.000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4873  MerR family transcriptional regulator  39.68 
 
 		 141 aa  53.5  0.000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.825064 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2509  MerR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 151 aa  53.5  0.000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.591979 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0047  MerR family transcriptional regulator  58.54 
 
 		 264 aa  53.5  0.000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4624  transcriptional regulator, MerR family  34.82 
 
 		 333 aa  53.1  0.000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2173  regulatory protein, MerR  28.42 
 
 		 147 aa  52.8  0.000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0920  MerR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 141 aa  52.8  0.000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.320526  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2848  MerR family transcriptional regulator  40.58 
 
 		 142 aa  52.8  0.000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2343  MerR family transcriptional regulator  33.09 
 
 		 146 aa  52.8  0.000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.264422  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4536  transcriptional regulator, MerR family  32.77 
 
 		 146 aa  52.8  0.000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.228678  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1851  MerR family transcriptional regulator  33.57 
 
 		 162 aa  52.4  0.000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.138506  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2593  MerR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 152 aa  52  0.00001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0365897  normal  0.180328 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3373  MerR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 136 aa  52  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0297855  normal  0.469131 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2357  MerR family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 136 aa  52  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.120567 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4537  Hg(II)-responsive transcriptional regulator  37.5 
 
 		 132 aa  52  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2572  MerR family transcriptional regulator  32.11 
 
 		 141 aa  52  0.00001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.957862  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1646  MerR family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 133 aa  52  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4698  transcriptional regulator, MerR family  32.35 
 
 		 253 aa  52  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0295  MerR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 149 aa  52  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3410  hypothetical protein  40.3 
 
 		 142 aa  52  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1667  regulatory protein, MerR  32.17 
 
 		 136 aa  51.2  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1160  MerR family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 133 aa  51.6  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.392851 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2107  regulatory protein, MerR:Albicidin resistance  31.51 
 
 		 342 aa  51.2  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.814054  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2233  MerR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 138 aa  51.2  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.366472 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10060  Cu(I)-responsive transcriptional regulator, MerR family  41.27 
 
 		 138 aa  51.2  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.198613  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3523  MerR family transcriptional regulator  34.58 
 
 		 139 aa  51.2  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1339  transcriptional regulator of MerR family protein  40.32 
 
 		 130 aa  51.2  0.00002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0137  MerR family transcriptional regulator  33.79 
 
 		 145 aa  51.2  0.00002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4917  MerR family transcriptional regulator  38.96 
 
 		 186 aa  51.6  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00475602 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2831  MerR family transcriptional regulator  32.74 
 
 		 175 aa  51.2  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.116752 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1785  MerR family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 134 aa  51.2  0.00002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.370686  normal  0.0498641 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1215  transcriptional regulator, MerR family  32.32 
 
 		 152 aa  50.8  0.00003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.460716  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3237  MerR family transcriptional regulator  38.64 
 
 		 137 aa  50.4  0.00003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0499  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  39.71 
 
 		 144 aa  50.4  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4947  regulatory protein, MerR  33.63 
 
 		 129 aa  50.8  0.00003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.459947  decreased coverage  0.00286067 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>