More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_0668 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013204  Elen_0668  transcriptional regulator, MerR family  100 
 
 
272 aa  540  9.999999999999999e-153  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000812117  hitchhiker  0.0000325432 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2659  transcriptional regulator, MerR family  40.28 
 
 
246 aa  129  5.0000000000000004e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.587322  normal  0.281971 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4378  transcriptional regulator, MerR family  43.62 
 
 
242 aa  109  6e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2419  regulatory protein, MerR  39.81 
 
 
246 aa  107  3e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.110485  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3990  transcriptional regulator, MerR family  36.69 
 
 
248 aa  105  5e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.340501  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1862  transcriptional regulator, MerR family  37.77 
 
 
247 aa  98.6  9e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0767866 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1354  transcriptional regulator, MerR family  40.41 
 
 
254 aa  98.2  1e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3346  transcriptional regulator, MerR family  47.9 
 
 
241 aa  97.8  2e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.152739  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1534  transcriptional regulator, MerR family  46.85 
 
 
249 aa  96.3  4e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0334786  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1265  transcriptional regulator, MerR family  44.92 
 
 
252 aa  91.7  1e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0543  transcriptional regulator, MerR family  38 
 
 
252 aa  89.7  4e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4880  transcriptional regulator, MerR family  35.98 
 
 
249 aa  88.2  1e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4873  MerR family transcriptional regulator  37.91 
 
 
260 aa  87.4  2e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.686737  normal  0.0317113 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4036  transcriptional regulator, MerR family  44.14 
 
 
262 aa  87.4  2e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000546536  normal  0.0325517 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0913  transcriptional regulator, MerR family  44.25 
 
 
260 aa  85.5  8e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.251711  normal  0.260144 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4229  transcriptional regulator, MerR family  30.3 
 
 
258 aa  84  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4382  regulatory protein, MerR  37.28 
 
 
256 aa  83.6  0.000000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.534251 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8430  putative transcriptional regulator, MerR family  55.88 
 
 
251 aa  83.2  0.000000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.750305  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8874  transcriptional regulator, MerR family  42.06 
 
 
249 aa  78.6  0.00000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1345  transcriptional regulator, MerR family  31.43 
 
 
246 aa  78.2  0.0000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6059  transcriptional regulator, MerR family  31.82 
 
 
258 aa  77  0.0000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5720  MerR family transcriptional regulator  33.16 
 
 
260 aa  74.7  0.000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2048  transcriptional regulator, MerR family  34.69 
 
 
265 aa  75.1  0.000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.144756 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0374  MerR family transcriptional regulator  41.67 
 
 
254 aa  73.2  0.000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0448793  hitchhiker  0.00531151 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09690  predicted transcriptional regulator  36.19 
 
 
290 aa  73.6  0.000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.311796  normal  0.878429 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2015  putative transcriptional regulator, MerR family  53.85 
 
 
264 aa  73.2  0.000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3594  transcriptional regulator, MerR family  36.94 
 
 
278 aa  72.4  0.000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1517  MerR family transcriptional regulator  41.75 
 
 
342 aa  72.4  0.000000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.242009 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5038  MerR family transcriptional regulator  41.75 
 
 
342 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.99192 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2640  transcriptional regulator, MerR family  41.35 
 
 
283 aa  71.2  0.00000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5341  MerR family transcriptional regulator  32.12 
 
 
260 aa  71.2  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.138898  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5430  MerR family transcriptional regulator  32.12 
 
 
260 aa  71.2  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.792567  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0868  transcriptional regulator, MerR family  44.62 
 
 
254 aa  67.4  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.915054 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34160  predicted transcriptional regulator  41.84 
 
 
278 aa  67.4  0.0000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.153651 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2819  transcriptional regulator, MerR family protein  37.5 
 
 
129 aa  67.4  0.0000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6337  MerR family transcriptional regulator  38.83 
 
 
342 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1755  MerR family transcriptional regulator  38.83 
 
 
342 aa  67  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.581641  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1742  MerR family transcriptional regulator  38.83 
 
 
342 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1304  zinc-responsive transcriptional regulator  42.59 
 
 
140 aa  66.6  0.0000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1663  MerR family transcriptional regulator  37.89 
 
 
343 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.350781  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1663  MerR family transcriptional regulator  27.78 
 
 
343 aa  66.6  0.0000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2028  transcriptional regulator, MerR family  41.79 
 
 
283 aa  65.9  0.0000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000014266  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0339  MerR family transcriptional regulator  39.25 
 
 
253 aa  65.9  0.0000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.841288 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2538  MerR family transcriptional regulator  47.76 
 
 
157 aa  63.9  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2173  regulatory protein, MerR  35.71 
 
 
147 aa  64.7  0.000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2417  putative transcriptional regulator, MerR family  43.28 
 
 
304 aa  64.3  0.000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0255  transcriptional regulator, MerR family  36.28 
 
 
251 aa  63.9  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0812  MerR family transcriptional regulator  47.76 
 
 
143 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2198  MerR family transcriptional regulator  44.71 
 
 
135 aa  64.3  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2024  mercuric resistance operon regulatory protein MerR  39.8 
 
 
130 aa  63.5  0.000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1655  MerR family transcriptional regulator  40 
 
 
237 aa  63.2  0.000000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.112658  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0802  transcriptional regulator, MerR family  36.29 
 
 
142 aa  63.5  0.000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0464  transcriptional regulator, MerR family  49.32 
 
 
254 aa  63.2  0.000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1255  mercuric resistance operon regulatory protein MerR  38.78 
 
 
130 aa  62.8  0.000000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0303  transcriptional regulator, MerR family  36.28 
 
 
154 aa  62.8  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00540997  normal  0.988288 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4282  transcriptional regulator, MerR family  46.03 
 
 
308 aa  62.4  0.000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.416101  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3393  transcriptional regulator, MerR family  38.68 
 
 
254 aa  62.4  0.000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.988274  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0029  transcriptional regulator, MerR family  35.77 
 
 
134 aa  62  0.000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1739  MerR family transcriptional regulator  36.27 
 
 
141 aa  62  0.000000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.784519 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0178  MerR family transcriptional regulator  45.59 
 
 
142 aa  62.4  0.000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0926305  normal 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3961  MerR family transcriptional regulator  40.43 
 
 
142 aa  62  0.00000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.146237  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0980  MerR family transcriptional regulator  50 
 
 
648 aa  62  0.00000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2165  MerR family transcriptional regulator  35.77 
 
 
343 aa  62  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.123028  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0023  MerR family transcriptional regulator  36.44 
 
 
239 aa  61.6  0.00000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1950  MerR family transcriptional regulator  33.87 
 
 
149 aa  61.6  0.00000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.578606  normal  0.329857 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2831  MerR family transcriptional regulator  33.63 
 
 
175 aa  62  0.00000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.116752 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2543  MerR family transcriptional regulator  44.12 
 
 
128 aa  61.6  0.00000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.212021  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2325  MerR family transcriptional regulator  34.86 
 
 
147 aa  61.6  0.00000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3623  MerR family transcriptional regulator  40.43 
 
 
142 aa  62  0.00000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2773  MerR family transcriptional regulator  39.74 
 
 
132 aa  60.8  0.00000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0811  MerR family transcriptional regulator  41.94 
 
 
630 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.872651  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0073  hypothetical protein  47.69 
 
 
314 aa  61.2  0.00000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.0572864  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10060  Cu(I)-responsive transcriptional regulator, MerR family  44.78 
 
 
138 aa  60.8  0.00000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.198613  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0442  transcriptional regulator, MerR family  39.13 
 
 
132 aa  61.2  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.856657  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2633  Cd(II)/Pb(II)-responsive transcriptional regulator  37.25 
 
 
162 aa  61.2  0.00000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.673518 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0545  MerR family transcriptional regulator  41.94 
 
 
630 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1729  MerR family transcriptional regulator  41.94 
 
 
659 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2399  transcriptional regulator, MerR family  45.21 
 
 
132 aa  61.2  0.00000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000424023  normal  0.796089 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2665  MerR family transcriptional regulator  50 
 
 
639 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3675  MerR family transcriptional regulator  55.56 
 
 
270 aa  60.8  0.00000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.325472  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3941  MerR family transcriptional regulator  44.44 
 
 
128 aa  61.2  0.00000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.708141  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2107  regulatory protein, MerR:Albicidin resistance  35.77 
 
 
342 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.814054  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0393  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  33.33 
 
 
154 aa  60.5  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.493726  hitchhiker  2.73635e-17 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0388  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  33.33 
 
 
154 aa  60.5  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3237  MerR family transcriptional regulator  39.58 
 
 
137 aa  60.1  0.00000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0448  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  33.33 
 
 
154 aa  60.5  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  1.17179e-17 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2298  MerR family transcriptional regulator  35.77 
 
 
343 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2900  MerR family transcriptional regulator  41.25 
 
 
140 aa  60.5  0.00000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0407  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  33.33 
 
 
154 aa  60.5  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000267625 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0385  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  33.33 
 
 
154 aa  60.1  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000075209 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0129  hypothetical protein  46.58 
 
 
347 aa  59.7  0.00000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.257512  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4698  transcriptional regulator, MerR family  39.09 
 
 
253 aa  60.1  0.00000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0237  MerR family transcriptional regulator  39.78 
 
 
132 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0073  transcriptional regulator, MerR family  37.04 
 
 
133 aa  60.1  0.00000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1339  transcriptional regulator of MerR family protein  50 
 
 
130 aa  59.7  0.00000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0831  MerR family transcriptional regulator  34.51 
 
 
145 aa  60.1  0.00000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3156  MerR family transcriptional regulator  40.85 
 
 
146 aa  60.1  0.00000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.215145  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06140  predicted transcriptional regulator  35.54 
 
 
129 aa  59.7  0.00000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0065  transcriptional regulator, MerR family  46.15 
 
 
252 aa  59.7  0.00000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1395  MerR family transcriptional regulator  45.95 
 
 
146 aa  59.7  0.00000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.686505  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>