More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_3346 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_3346  transcriptional regulator, MerR family  100 
 
 		 241 aa  484  1e-136  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.152739  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4378  transcriptional regulator, MerR family  55.79 
 
 		 242 aa  248  5e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1354  transcriptional regulator, MerR family  51.46 
 
 		 254 aa  233  2.0000000000000002e-60  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1265  transcriptional regulator, MerR family  51.06 
 
 		 252 aa  223  3e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4229  transcriptional regulator, MerR family  47.64 
 
 		 258 aa  212  3.9999999999999995e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1345  transcriptional regulator, MerR family  48.29 
 
 		 246 aa  211  1e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1862  transcriptional regulator, MerR family  46.81 
 
 		 247 aa  186  3e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0767866 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3990  transcriptional regulator, MerR family  42.06 
 
 		 248 aa  168  6e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.340501  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2659  transcriptional regulator, MerR family  36.36 
 
 		 246 aa  107  1e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.587322  normal  0.281971 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0668  transcriptional regulator, MerR family  47.9 
 
 		 272 aa  97.8  1e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000812117  hitchhiker  0.0000325432 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0913  transcriptional regulator, MerR family  30.94 
 
 		 260 aa  97.8  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.251711  normal  0.260144 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1534  transcriptional regulator, MerR family  35.59 
 
 		 249 aa  89  7e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0334786  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3594  transcriptional regulator, MerR family  35 
 
 		 278 aa  76.6  0.0000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4880  transcriptional regulator, MerR family  49.4 
 
 		 249 aa  75.9  0.0000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0543  transcriptional regulator, MerR family  43.3 
 
 		 252 aa  75.5  0.0000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4382  regulatory protein, MerR  31.44 
 
 		 256 aa  73.6  0.000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.534251 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4036  transcriptional regulator, MerR family  48.19 
 
 		 262 aa  73.6  0.000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000546536  normal  0.0325517 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2419  regulatory protein, MerR  32.4 
 
 		 246 aa  73.6  0.000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.110485  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8430  putative transcriptional regulator, MerR family  38.4 
 
 		 251 aa  72.8  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.750305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4873  MerR family transcriptional regulator  41.49 
 
 		 260 aa  69.3  0.00000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.686737  normal  0.0317113 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2048  transcriptional regulator, MerR family  39.29 
 
 		 265 aa  69.3  0.00000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.144756 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4282  transcriptional regulator, MerR family  29.03 
 
 		 308 aa  67.4  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.416101  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0374  MerR family transcriptional regulator  39.42 
 
 		 254 aa  66.6  0.0000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0448793  hitchhiker  0.00531151 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09690  predicted transcriptional regulator  51.09 
 
 		 290 aa  66.6  0.0000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.311796  normal  0.878429 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2015  putative transcriptional regulator, MerR family  44.59 
 
 		 264 aa  65.9  0.0000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6059  transcriptional regulator, MerR family  30.28 
 
 		 258 aa  65.5  0.0000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2417  putative transcriptional regulator, MerR family  29.61 
 
 		 304 aa  65.1  0.0000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2819  transcriptional regulator, MerR family protein  31.96 
 
 		 129 aa  63.9  0.000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2640  transcriptional regulator, MerR family  39.56 
 
 		 283 aa  63.9  0.000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0868  transcriptional regulator, MerR family  38.82 
 
 		 254 aa  63.2  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.915054 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0129  hypothetical protein  30.53 
 
 		 347 aa  63.2  0.000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.257512  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0065  transcriptional regulator, MerR family  36.63 
 
 		 252 aa  63.2  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8874  transcriptional regulator, MerR family  35.87 
 
 		 249 aa  63.2  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1413  hypothetical protein  25.45 
 
 		 315 aa  62  0.000000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2173  regulatory protein, MerR  29.52 
 
 		 147 aa  62  0.000000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4099  transcription activator effector binding protein  37.84 
 
 		 276 aa  60.8  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3609  transcriptional regulator, MerR family  38.38 
 
 		 288 aa  60.8  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.279155  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4698  transcriptional regulator, MerR family  41.49 
 
 		 253 aa  60.5  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1943  transcriptional regulator of MerR family protein  36.36 
 
 		 135 aa  60.5  0.00000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.555422  normal  0.0105773 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1581  hypothetical protein  25 
 
 		 315 aa  59.3  0.00000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0073  transcriptional regulator, MerR family  40.4 
 
 		 133 aa  59.7  0.00000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5720  MerR family transcriptional regulator  40.58 
 
 		 260 aa  59.3  0.00000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5341  MerR family transcriptional regulator  26.07 
 
 		 260 aa  59.3  0.00000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.138898  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5430  MerR family transcriptional regulator  26.07 
 
 		 260 aa  59.3  0.00000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.792567  normal  1 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0073  hypothetical protein  36.14 
 
 		 314 aa  58.9  0.00000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.0572864  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2836  transcriptional regulator, MerR family  31.71 
 
 		 135 aa  58.9  0.00000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.906455  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2028  transcriptional regulator, MerR family  36.26 
 
 		 283 aa  58.9  0.00000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000014266  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1079  TipAS antibiotic-recognition domain-containing protein  27 
 
 		 252 aa  58.9  0.00000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.23199 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35820  predicted transcriptional regulator  47.54 
 
 		 134 aa  58.9  0.00000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0831  MerR family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 145 aa  58.5  0.00000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2155  transcriptional regulator, MerR family  40.3 
 
 		 167 aa  57.8  0.0000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.000155365  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0477  MerR family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 173 aa  58.2  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3456  MerR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 149 aa  57.4  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1617  putative transcriptional regulator, MerR family  36.54 
 
 		 252 aa  57.4  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.870774 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1639  MerR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 159 aa  57  0.0000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.270848  normal  0.040207 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0714  putative transcriptional regulator, MerR family  40 
 
 		 142 aa  56.6  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4537  Hg(II)-responsive transcriptional regulator  29.6 
 
 		 132 aa  57  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2686  MerR family transcriptional regulator  42.37 
 
 		 172 aa  56.6  0.0000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0969  MerR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 252 aa  56.6  0.0000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00256708  hitchhiker  0.0060004 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0586  DNA-binding transcriptional regulator CueR  31.25 
 
 		 135 aa  56.2  0.0000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.775911 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3299  MerR family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 149 aa  56.2  0.0000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0169089  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0530  DNA-binding transcriptional regulator CueR  31.25 
 
 		 135 aa  56.2  0.0000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4307  transcriptional regulator, MerR family  44.07 
 
 		 141 aa  56.2  0.0000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00729055  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00438  DNA-binding transcriptional activator of copper-responsive regulon genes  31.25 
 
 		 135 aa  55.8  0.0000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3123  transcriptional regulator, MerR family  31.25 
 
 		 135 aa  55.8  0.0000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.856714  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0526  DNA-binding transcriptional regulator CueR  31.25 
 
 		 135 aa  55.8  0.0000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00443  hypothetical protein  31.25 
 
 		 135 aa  55.8  0.0000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3129  DNA-binding transcriptional regulator CueR  31.25 
 
 		 135 aa  55.8  0.0000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.943376  hitchhiker  0.0000753695 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0422  DNA-binding transcriptional regulator CueR  31.25 
 
 		 135 aa  55.8  0.0000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2662  transcriptional regulator, MerR family  32.99 
 
 		 126 aa  55.8  0.0000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00193678  hitchhiker  0.00916479 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0566  DNA-binding transcriptional regulator CueR  31.25 
 
 		 135 aa  55.8  0.0000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0963  DNA-binding transcriptional regulator CueR  33.33 
 
 		 136 aa  55.5  0.0000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.55262  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7229  putative transcriptional regulator, MerR family  30.87 
 
 		 272 aa  55.5  0.0000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.385629 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2739  MerR family transcriptional regulator  32.92 
 
 		 253 aa  55.5  0.0000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0339  MerR family transcriptional regulator  25.42 
 
 		 253 aa  55.1  0.0000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.841288 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1517  MerR family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 342 aa  54.7  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.242009 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2325  MerR family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 147 aa  54.3  0.000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3680  transcriptional regulator, MerR family  30.58 
 
 		 133 aa  54.7  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.446637  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2831  MerR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 175 aa  54.7  0.000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.116752 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1667  regulatory protein, MerR  43.55 
 
 		 136 aa  54.3  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2267  MerR family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 132 aa  53.9  0.000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.312011  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2665  MerR family transcriptional regulator  36.45 
 
 		 639 aa  53.9  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0129  putative transcriptional activator tipA  32.14 
 
 		 244 aa  53.9  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.634344  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3726  MerR family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 140 aa  53.9  0.000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2572  MerR family transcriptional regulator  29.75 
 
 		 141 aa  53.9  0.000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.957862  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2326  MerR family transcriptional regulator  30.25 
 
 		 150 aa  54.3  0.000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5104  transcriptional activator tipA, putative  32.14 
 
 		 243 aa  53.5  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0546  DNA-binding transcriptional regulator CueR  31.25 
 
 		 138 aa  53.5  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1400  MerR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 161 aa  53.5  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0548  DNA-binding transcriptional regulator CueR  31.25 
 
 		 138 aa  53.1  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2900  MerR family transcriptional regulator  32.46 
 
 		 140 aa  53.5  0.000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0553  DNA-binding transcriptional regulator CueR  31.25 
 
 		 138 aa  53.5  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.985745  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0563  DNA-binding transcriptional regulator CueR  31.25 
 
 		 138 aa  53.5  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.620757  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0607  DNA-binding transcriptional regulator CueR  31.25 
 
 		 138 aa  53.5  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2453  transcriptional regulator, MerR family  33.88 
 
 		 155 aa  53.5  0.000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00000100878  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1415  transcriptional regulator, MerR family  27.82 
 
 		 143 aa  53.1  0.000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.0000000599633  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0029  transcriptional regulator, MerR family  33.33 
 
 		 134 aa  53.1  0.000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5111  putative transcriptional activator tipA  32.14 
 
 		 244 aa  53.1  0.000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.252328  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3156  MerR family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 146 aa  53.1  0.000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.215145  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0115  Hg(II)-responsive transcriptional regulator  32.79 
 
 		 132 aa  52.8  0.000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.889131  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>