More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_3594 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_3594  transcriptional regulator, MerR family  100 
 
 		 278 aa  544  1e-154  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4282  transcriptional regulator, MerR family  56.67 
 
 		 308 aa  297  1e-79  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.416101  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2417  putative transcriptional regulator, MerR family  54 
 
 		 304 aa  290  2e-77  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20960  predicted transcriptional regulator  54.27 
 
 		 310 aa  249  3e-65  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.376744  normal  0.903432 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5341  MerR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 260 aa  88.6  9e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.138898  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5430  MerR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 260 aa  88.6  9e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.792567  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5720  MerR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 260 aa  87.8  2e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1534  transcriptional regulator, MerR family  34.76 
 
 		 249 aa  87.4  2e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0334786  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4378  transcriptional regulator, MerR family  37.5 
 
 		 242 aa  83.2  0.000000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0913  transcriptional regulator, MerR family  31.43 
 
 		 260 aa  82.4  0.000000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.251711  normal  0.260144 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2659  transcriptional regulator, MerR family  44.55 
 
 		 246 aa  81.3  0.00000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.587322  normal  0.281971 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3346  transcriptional regulator, MerR family  30.61 
 
 		 241 aa  78.2  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.152739  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6059  transcriptional regulator, MerR family  35.2 
 
 		 258 aa  76.3  0.0000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4873  MerR family transcriptional regulator  41.12 
 
 		 260 aa  75.5  0.0000000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.686737  normal  0.0317113 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8430  putative transcriptional regulator, MerR family  43.81 
 
 		 251 aa  75.1  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.750305  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2048  transcriptional regulator, MerR family  36.02 
 
 		 265 aa  74.7  0.000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.144756 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4382  regulatory protein, MerR  41.67 
 
 		 256 aa  74.3  0.000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.534251 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4880  transcriptional regulator, MerR family  30.96 
 
 		 249 aa  73.6  0.000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0868  transcriptional regulator, MerR family  39.64 
 
 		 254 aa  73.6  0.000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.915054 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0668  transcriptional regulator, MerR family  36.94 
 
 		 272 aa  72.4  0.000000000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000812117  hitchhiker  0.0000325432 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4229  transcriptional regulator, MerR family  42.22 
 
 		 258 aa  72.4  0.000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1265  transcriptional regulator, MerR family  44.3 
 
 		 252 aa  72  0.00000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4036  transcriptional regulator, MerR family  36.19 
 
 		 262 aa  70.1  0.00000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000546536  normal  0.0325517 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1345  transcriptional regulator, MerR family  38.89 
 
 		 246 aa  69.3  0.00000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0543  transcriptional regulator, MerR family  39.02 
 
 		 252 aa  67.8  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0374  MerR family transcriptional regulator  38.84 
 
 		 254 aa  67  0.0000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0448793  hitchhiker  0.00531151 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1354  transcriptional regulator, MerR family  31.51 
 
 		 254 aa  66.6  0.0000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1862  transcriptional regulator, MerR family  38.95 
 
 		 247 aa  64.7  0.000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0767866 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2015  putative transcriptional regulator, MerR family  45.59 
 
 		 264 aa  63.5  0.000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2819  transcriptional regulator, MerR family protein  35.16 
 
 		 129 aa  63.5  0.000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09690  predicted transcriptional regulator  45.65 
 
 		 290 aa  63.5  0.000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.311796  normal  0.878429 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2419  regulatory protein, MerR  33.91 
 
 		 246 aa  62.4  0.000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.110485  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3990  transcriptional regulator, MerR family  35.29 
 
 		 248 aa  62  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.340501  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2173  regulatory protein, MerR  31.3 
 
 		 147 aa  61.2  0.00000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0920  MerR family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 141 aa  60.5  0.00000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.320526  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8874  transcriptional regulator, MerR family  35.9 
 
 		 249 aa  60.5  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0437  MerR family transcriptional regulator  35.77 
 
 		 161 aa  60.1  0.00000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2028  transcriptional regulator, MerR family  37.88 
 
 		 283 aa  60.1  0.00000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000014266  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2640  transcriptional regulator, MerR family  24.24 
 
 		 283 aa  59.7  0.00000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3862  precorrin-8X methylmutase  41.94 
 
 		 368 aa  59.3  0.00000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.268065  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0442  transcriptional regulator, MerR family  44.44 
 
 		 132 aa  59.3  0.00000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.856657  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1790  transcriptional regulator  37.96 
 
 		 141 aa  58.9  0.00000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.269282  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2017  MerR family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 140 aa  58.9  0.00000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1941  MerR family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 140 aa  58.9  0.00000009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2464  transcriptional regulator, MerR family  32.73 
 
 		 137 aa  58.5  0.0000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0747  MerR family transcriptional regulator  33.6 
 
 		 141 aa  57.8  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3563  transcriptional regulator, MerR family  33.98 
 
 		 143 aa  57.4  0.0000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1160  MerR family transcriptional regulator  42.65 
 
 		 133 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.392851 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4528  transcriptional regulator, MerR family  50 
 
 		 129 aa  57.4  0.0000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.355526 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2665  MerR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 639 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3961  MerR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 142 aa  56.6  0.0000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.146237  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0980  MerR family transcriptional regulator  34.82 
 
 		 648 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3623  MerR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 142 aa  56.6  0.0000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3237  MerR family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 137 aa  56.6  0.0000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2848  MerR family transcriptional regulator  42.65 
 
 		 142 aa  56.2  0.0000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2357  MerR family transcriptional regulator  44.62 
 
 		 136 aa  55.8  0.0000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.120567 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3726  MerR family transcriptional regulator  36 
 
 		 140 aa  55.8  0.0000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2543  MerR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 128 aa  55.8  0.0000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.212021  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2788  MerR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 127 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.291885  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2967  MerR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 127 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2572  MerR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 141 aa  55.1  0.000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.957862  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1777  MerR family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 145 aa  55.1  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2662  transcriptional regulator, MerR family  36.78 
 
 		 126 aa  55.1  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00193678  hitchhiker  0.00916479 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3680  transcriptional regulator, MerR family  33.98 
 
 		 133 aa  54.3  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.446637  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2170  transcriptional regulator, MerR family  30.56 
 
 		 133 aa  54.7  0.000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000807108 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2558  MerR family transcriptional regulator  43.28 
 
 		 139 aa  54.3  0.000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5500  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  34.07 
 
 		 132 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0912  MerR family transcriptional regulator  43.08 
 
 		 125 aa  53.9  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06140  predicted transcriptional regulator  37.25 
 
 		 129 aa  53.9  0.000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0901  MerR family transcriptional regulator  43.08 
 
 		 125 aa  53.9  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0327374 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0895  MerR family transcriptional regulator  43.08 
 
 		 125 aa  53.9  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63170  putative transcriptional regulator  35.92 
 
 		 132 aa  53.9  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4536  transcriptional regulator, MerR family  35.58 
 
 		 146 aa  53.5  0.000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.228678  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6549  transcriptional regulator, MerR family  43.75 
 
 		 128 aa  53.5  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.135068  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0713  MerR family transcriptional regulator  39.78 
 
 		 125 aa  53.5  0.000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.979534  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1504  regulatory protein, MerR  31.07 
 
 		 141 aa  53.1  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4624  transcriptional regulator, MerR family  34.31 
 
 		 333 aa  53.5  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0047  MerR family transcriptional regulator  60.98 
 
 		 264 aa  53.1  0.000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4039  MerR family transcriptional regulator  30 
 
 		 130 aa  53.5  0.000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.576602  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1687  MerR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 129 aa  53.1  0.000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2633  Cd(II)/Pb(II)-responsive transcriptional regulator  31.68 
 
 		 162 aa  53.1  0.000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.673518 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10060  Cu(I)-responsive transcriptional regulator, MerR family  42.86 
 
 		 138 aa  53.1  0.000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.198613  n/a   
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4307  transcriptional regulator, MerR family  43.94 
 
 		 141 aa  53.1  0.000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00729055  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2760  Hg(II)-responsive transcriptional regulator  38.81 
 
 		 135 aa  52.8  0.000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3941  MerR family transcriptional regulator  39.68 
 
 		 128 aa  52.8  0.000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.708141  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4917  MerR family transcriptional regulator  34.35 
 
 		 186 aa  52.8  0.000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00475602 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2333  MerR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 162 aa  52.8  0.000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00701798  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1339  transcriptional regulator of MerR family protein  36.92 
 
 		 130 aa  52.8  0.000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2443  MerR family transcriptional regulator  41.79 
 
 		 140 aa  52.8  0.000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2509  MerR family transcriptional regulator  39.24 
 
 		 151 aa  52.8  0.000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.591979 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1955  MerR family transcriptional regulator  24.11 
 
 		 128 aa  52  0.000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3133  MerR family transcriptional regulator  34 
 
 		 139 aa  52.4  0.000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.845727  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4537  Hg(II)-responsive transcriptional regulator  31.68 
 
 		 132 aa  52  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3299  MerR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 149 aa  52  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0169089  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0203  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  28.7 
 
 		 135 aa  52  0.00001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1785  MerR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 134 aa  51.6  0.00001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.370686  normal  0.0498641 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2233  MerR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 138 aa  52  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.366472 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3444  transcriptional regulator, MerR family  30.1 
 
 		 144 aa  51.6  0.00001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0545873  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02170  predicted transcriptional regulator  42.19 
 
 		 133 aa  52  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3662  transcriptional regulator, MerR family  34.68 
 
 		 146 aa  52  0.00001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>