More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_4036 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_4036  transcriptional regulator, MerR family  100 
 
 		 262 aa  488  1e-137  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000546536  normal  0.0325517 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0913  transcriptional regulator, MerR family  50 
 
 		 260 aa  154  2e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.251711  normal  0.260144 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4880  transcriptional regulator, MerR family  45.2 
 
 		 249 aa  141  9.999999999999999e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1534  transcriptional regulator, MerR family  64.76 
 
 		 249 aa  133  3e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0334786  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8430  putative transcriptional regulator, MerR family  40.72 
 
 		 251 aa  91.7  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.750305  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0668  transcriptional regulator, MerR family  43.1 
 
 		 272 aa  86.7  3e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000812117  hitchhiker  0.0000325432 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1354  transcriptional regulator, MerR family  35.03 
 
 		 254 aa  83.2  0.000000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4873  MerR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 260 aa  79.7  0.00000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.686737  normal  0.0317113 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8874  transcriptional regulator, MerR family  40.16 
 
 		 249 aa  79.3  0.00000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2419  regulatory protein, MerR  39.25 
 
 		 246 aa  79  0.00000000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.110485  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4382  regulatory protein, MerR  40.83 
 
 		 256 aa  76.3  0.0000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.534251 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3346  transcriptional regulator, MerR family  48.19 
 
 		 241 aa  74.3  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.152739  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0543  transcriptional regulator, MerR family  33.53 
 
 		 252 aa  72.8  0.000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2659  transcriptional regulator, MerR family  38.33 
 
 		 246 aa  73.2  0.000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.587322  normal  0.281971 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2417  putative transcriptional regulator, MerR family  33.33 
 
 		 304 aa  72  0.000000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4378  transcriptional regulator, MerR family  45.78 
 
 		 242 aa  71.6  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0374  MerR family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 254 aa  71.6  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0448793  hitchhiker  0.00531151 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2028  transcriptional regulator, MerR family  27.54 
 
 		 283 aa  70.9  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000014266  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3594  transcriptional regulator, MerR family  36.19 
 
 		 278 aa  69.3  0.00000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2831  MerR family transcriptional regulator  40.18 
 
 		 175 aa  68.9  0.00000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.116752 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1265  transcriptional regulator, MerR family  35.83 
 
 		 252 aa  68.9  0.00000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2819  transcriptional regulator, MerR family protein  35.51 
 
 		 129 aa  68.6  0.00000000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1663  MerR family transcriptional regulator  32.91 
 
 		 343 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.350781  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4282  transcriptional regulator, MerR family  34.4 
 
 		 308 aa  67.8  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.416101  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1955  MerR family transcriptional regulator  35.79 
 
 		 128 aa  67  0.0000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5038  MerR family transcriptional regulator  36.43 
 
 		 342 aa  66.2  0.0000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.99192 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3990  transcriptional regulator, MerR family  32.37 
 
 		 248 aa  66.2  0.0000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.340501  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1755  MerR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 342 aa  65.9  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.581641  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0987  MerR family transcriptional regulator  40.54 
 
 		 160 aa  65.9  0.0000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.758767  hitchhiker  0.000750648 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6337  MerR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 342 aa  66.2  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1742  MerR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 342 aa  66.2  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1517  MerR family transcriptional regulator  35.66 
 
 		 342 aa  65.5  0.0000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.242009 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0442  transcriptional regulator, MerR family  39.09 
 
 		 132 aa  65.1  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.856657  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2640  transcriptional regulator, MerR family  32.08 
 
 		 283 aa  64.7  0.000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20960  predicted transcriptional regulator  36.52 
 
 		 310 aa  64.7  0.000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.376744  normal  0.903432 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0993  MerR family transcriptional regulator  38.53 
 
 		 137 aa  64.3  0.000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.335093  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2048  transcriptional regulator, MerR family  39.34 
 
 		 265 aa  64.3  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.144756 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1663  MerR family transcriptional regulator  32.28 
 
 		 343 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5720  MerR family transcriptional regulator  33.5 
 
 		 260 aa  63.5  0.000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0868  transcriptional regulator, MerR family  44.78 
 
 		 254 aa  63.5  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.915054 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2015  putative transcriptional regulator, MerR family  46.27 
 
 		 264 aa  63.2  0.000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2173  regulatory protein, MerR  32.71 
 
 		 147 aa  62.8  0.000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04340  predicted transcriptional regulator  37.62 
 
 		 245 aa  62.8  0.000000005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2788  MerR family transcriptional regulator  37.78 
 
 		 127 aa  62.8  0.000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.291885  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2967  MerR family transcriptional regulator  37.78 
 
 		 127 aa  62.8  0.000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5341  MerR family transcriptional regulator  44.12 
 
 		 260 aa  62.8  0.000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.138898  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2868  MerR family transcriptional regulator  35.51 
 
 		 129 aa  62.4  0.000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000311414  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5430  MerR family transcriptional regulator  44.12 
 
 		 260 aa  62.8  0.000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.792567  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1862  transcriptional regulator, MerR family  36.07 
 
 		 247 aa  62  0.000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0767866 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4116  transcriptional regulator, MerR family  42.06 
 
 		 133 aa  62  0.000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0470  putative transcriptional regulator, MerR family  48.48 
 
 		 133 aa  61.2  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2267  MerR family transcriptional regulator  39.77 
 
 		 132 aa  61.2  0.00000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.312011  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2144  MerR family transcriptional regulator  39.42 
 
 		 129 aa  61.6  0.00000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.000183728  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1103  MerR family transcriptional regulator  48.48 
 
 		 135 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.394367  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1117  MerR family transcriptional regulator  48.48 
 
 		 135 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2902  MerR family transcriptional regulator  48.48 
 
 		 135 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1604  MerR family transcriptional regulator  48.48 
 
 		 135 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2912  MerR family transcriptional regulator  48.48 
 
 		 135 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0392  MerR family transcriptional regulator  48.48 
 
 		 135 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0882  MerR family transcriptional regulator  48.48 
 
 		 135 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.656142 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0220  MerR family transcriptional regulator  48.48 
 
 		 135 aa  61.6  0.00000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0194  MerR family transcriptional regulator  48.48 
 
 		 135 aa  61.6  0.00000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4002  MerR family transcriptional regulator  48.48 
 
 		 135 aa  61.6  0.00000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1400  MerR family transcriptional regulator  45.31 
 
 		 161 aa  62  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0894  MerR family transcriptional regulator  48.48 
 
 		 135 aa  61.6  0.00000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1657  transcriptional regulator, MerR family  31.58 
 
 		 272 aa  61.2  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2024  mercuric resistance operon regulatory protein MerR  31.78 
 
 		 130 aa  60.8  0.00000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1639  MerR family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 159 aa  60.8  0.00000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.270848  normal  0.040207 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4229  transcriptional regulator, MerR family  38.55 
 
 		 258 aa  60.8  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1345  transcriptional regulator, MerR family  41.94 
 
 		 246 aa  61.2  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16670  putative transcriptional regulator CadR  38.05 
 
 		 156 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6059  transcriptional regulator, MerR family  35.24 
 
 		 258 aa  60.8  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2165  MerR family transcriptional regulator  36.15 
 
 		 343 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.123028  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1097  transcriptional regulator, MerR family  41.12 
 
 		 133 aa  61.2  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1511  regulatory protein, MerR  41.38 
 
 		 178 aa  60.1  0.00000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.31333  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4509  transcriptional regulator, MerR family  42.45 
 
 		 129 aa  60.1  0.00000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0125189 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1449  Cd(II)/Pb(II)-responsive transcriptional regulator  35.34 
 
 		 156 aa  60.5  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0129  MerR family transcriptional regulator  40.8 
 
 		 127 aa  60.1  0.00000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.684226 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4528  transcriptional regulator, MerR family  41.9 
 
 		 129 aa  60.5  0.00000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.355526 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1255  mercuric resistance operon regulatory protein MerR  31.78 
 
 		 130 aa  60.1  0.00000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2152  MerR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 137 aa  59.7  0.00000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.845816  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2325  MerR family transcriptional regulator  46.97 
 
 		 135 aa  59.3  0.00000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2298  MerR family transcriptional regulator  36.15 
 
 		 343 aa  59.3  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4537  Hg(II)-responsive transcriptional regulator  32.29 
 
 		 132 aa  59.3  0.00000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3285  transcriptional regulator, MerR family  41.58 
 
 		 272 aa  59.3  0.00000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.235229  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2325  MerR family transcriptional regulator  38.96 
 
 		 147 aa  59.3  0.00000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1777  MerR family transcriptional regulator  39.62 
 
 		 145 aa  59.3  0.00000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0029  transcriptional regulator, MerR family  47.69 
 
 		 134 aa  59.3  0.00000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3299  MerR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 149 aa  58.5  0.00000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0169089  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2149  transcriptional regulator, MerR family  36.36 
 
 		 132 aa  58.2  0.0000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.705718  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3237  MerR family transcriptional regulator  36 
 
 		 171 aa  58.5  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.839111  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2352  MerR family transcriptional regulator  35.77 
 
 		 152 aa  58.2  0.0000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0494  zinc-responsive transcriptional regulator  31.82 
 
 		 153 aa  58.5  0.0000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2107  regulatory protein, MerR:Albicidin resistance  36.15 
 
 		 342 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.814054  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3731  transcriptional regulator, MerR family  34.81 
 
 		 160 aa  57.4  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05447  transcription regulator protein  33.58 
 
 		 170 aa  57.8  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.015587 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4834  transcriptional regulator, MerR family  33.57 
 
 		 144 aa  57.8  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.300455  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4624  transcriptional regulator, MerR family  35.9 
 
 		 333 aa  57.8  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1032  transcriptional regulator, MerR family  33.96 
 
 		 144 aa  57.4  0.0000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.920994  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4808  transcriptional regulator, MerR family  34.81 
 
 		 160 aa  57.4  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.820733 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>