More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_4873 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_4873  MerR family transcriptional regulator  100 
 
 		 260 aa  511  1e-144  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.686737  normal  0.0317113 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4382  regulatory protein, MerR  87.89 
 
 		 256 aa  443  1e-123  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.534251 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0543  transcriptional regulator, MerR family  55.34 
 
 		 252 aa  256  3e-67  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2048  transcriptional regulator, MerR family  50 
 
 		 265 aa  228  1e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.144756 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2015  putative transcriptional regulator, MerR family  52.34 
 
 		 264 aa  217  1e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0374  MerR family transcriptional regulator  50.39 
 
 		 254 aa  216  2e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0448793  hitchhiker  0.00531151 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8874  transcriptional regulator, MerR family  46 
 
 		 249 aa  193  2e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6059  transcriptional regulator, MerR family  42.86 
 
 		 258 aa  126  3e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0868  transcriptional regulator, MerR family  43.84 
 
 		 254 aa  119  3.9999999999999996e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.915054 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5720  MerR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 260 aa  119  6e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5341  MerR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 260 aa  117  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.138898  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5430  MerR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 260 aa  117  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.792567  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2662  transcriptional regulator, MerR family  46.9 
 
 		 126 aa  107  2e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00193678  hitchhiker  0.00916479 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09690  predicted transcriptional regulator  41.67 
 
 		 290 aa  89  7e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.311796  normal  0.878429 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0668  transcriptional regulator, MerR family  44.04 
 
 		 272 aa  86.3  5e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000812117  hitchhiker  0.0000325432 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1354  transcriptional regulator, MerR family  38.66 
 
 		 254 aa  84.3  0.000000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4378  transcriptional regulator, MerR family  47.37 
 
 		 242 aa  82  0.000000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4036  transcriptional regulator, MerR family  35.29 
 
 		 262 aa  80.9  0.00000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000546536  normal  0.0325517 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2659  transcriptional regulator, MerR family  34.36 
 
 		 246 aa  79.7  0.00000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.587322  normal  0.281971 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2417  putative transcriptional regulator, MerR family  55.38 
 
 		 304 aa  76.3  0.0000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1862  transcriptional regulator, MerR family  44.21 
 
 		 247 aa  75.1  0.000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0767866 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3594  transcriptional regulator, MerR family  41.12 
 
 		 278 aa  75.1  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2419  regulatory protein, MerR  39.55 
 
 		 246 aa  73.9  0.000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.110485  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1534  transcriptional regulator, MerR family  35.83 
 
 		 249 aa  73.2  0.000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0334786  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4880  transcriptional regulator, MerR family  52.24 
 
 		 249 aa  72.4  0.000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8430  putative transcriptional regulator, MerR family  52.94 
 
 		 251 aa  72  0.000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.750305  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3990  transcriptional regulator, MerR family  36.02 
 
 		 248 aa  70.9  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.340501  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4282  transcriptional regulator, MerR family  45.71 
 
 		 308 aa  70.5  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.416101  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0913  transcriptional regulator, MerR family  48.53 
 
 		 260 aa  70.5  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.251711  normal  0.260144 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3862  precorrin-8X methylmutase  34.21 
 
 		 368 aa  70.1  0.00000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.268065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3346  transcriptional regulator, MerR family  41.49 
 
 		 241 aa  69.3  0.00000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.152739  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1345  transcriptional regulator, MerR family  38.95 
 
 		 246 aa  68.9  0.00000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4229  transcriptional regulator, MerR family  50.85 
 
 		 258 aa  67.8  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1339  transcriptional regulator of MerR family protein  45.59 
 
 		 130 aa  67.4  0.0000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5097  transcriptional regulator, MerR family  47.83 
 
 		 303 aa  67  0.0000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0313452 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1265  transcriptional regulator, MerR family  44.29 
 
 		 252 aa  67  0.0000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34160  predicted transcriptional regulator  34.91 
 
 		 278 aa  66.2  0.0000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.153651 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2028  transcriptional regulator, MerR family  33.64 
 
 		 283 aa  64.7  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000014266  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3623  MerR family transcriptional regulator  46.38 
 
 		 142 aa  63.9  0.000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3961  MerR family transcriptional regulator  46.38 
 
 		 142 aa  63.9  0.000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.146237  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1790  transcriptional regulator  40.91 
 
 		 141 aa  63.5  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.269282  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0437  MerR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 161 aa  63.5  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3410  hypothetical protein  39.29 
 
 		 142 aa  63.2  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3393  transcriptional regulator, MerR family  42.86 
 
 		 254 aa  62.8  0.000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.988274  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2343  MerR family transcriptional regulator  44.19 
 
 		 146 aa  62.8  0.000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.264422  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0211  MerR family transcriptional regulator  36.03 
 
 		 140 aa  62.4  0.000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1517  MerR family transcriptional regulator  34.13 
 
 		 342 aa  62  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.242009 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3156  MerR family transcriptional regulator  47.14 
 
 		 146 aa  61.6  0.00000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.215145  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0824  MerR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 300 aa  61.2  0.00000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.39583  normal  0.651241 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35600  predicted transcriptional regulator  40.43 
 
 		 319 aa  61.6  0.00000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.172761  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0065  transcriptional regulator, MerR family  35.71 
 
 		 252 aa  60.8  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5322  transcriptional regulator, MerR family  29 
 
 		 320 aa  60.8  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2300  MerR family transcriptional regulator  48.53 
 
 		 134 aa  61.2  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.639917  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0409  TipAS antibiotic-recognition domain protein  45.59 
 
 		 259 aa  60.8  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2543  MerR family transcriptional regulator  44.12 
 
 		 128 aa  61.2  0.00000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.212021  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1646  MerR family transcriptional regulator  35.07 
 
 		 133 aa  61.2  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2018  putative transcriptional regulator, MerR family  47.14 
 
 		 286 aa  60.8  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.253438  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1955  MerR family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 128 aa  60.5  0.00000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0047  MerR family transcriptional regulator  55.56 
 
 		 264 aa  60.1  0.00000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4834  transcriptional regulator, MerR family  42.86 
 
 		 144 aa  60.1  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.300455  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3285  transcriptional regulator, MerR family  36.27 
 
 		 272 aa  60.5  0.00000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.235229  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1851  MerR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 162 aa  59.7  0.00000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.138506  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5020  MerR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 254 aa  60.1  0.00000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4848  MerR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 254 aa  59.7  0.00000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4862  MerR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 254 aa  59.7  0.00000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20960  predicted transcriptional regulator  51.56 
 
 		 310 aa  59.7  0.00000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.376744  normal  0.903432 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5400  MerR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 253 aa  59.7  0.00000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5255  transcriptional regulator, MerR family  29.63 
 
 		 253 aa  59.7  0.00000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5331  transcriptional regulator, MerR family  29.63 
 
 		 253 aa  59.7  0.00000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2538  MerR family transcriptional regulator  36.27 
 
 		 157 aa  59.3  0.00000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2848  MerR family transcriptional regulator  33.83 
 
 		 142 aa  59.3  0.00000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1663  MerR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 343 aa  58.9  0.00000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.350781  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2640  transcriptional regulator, MerR family  32.08 
 
 		 283 aa  58.9  0.00000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2900  MerR family transcriptional regulator  44.29 
 
 		 140 aa  58.9  0.00000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2470  MerR family transcriptional regulator  42 
 
 		 138 aa  58.5  0.00000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2453  transcriptional regulator, MerR family  35.16 
 
 		 155 aa  58.5  0.00000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00000100878  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5038  MerR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 342 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.99192 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4283  MerR family transcriptional regulator  36.61 
 
 		 113 aa  58.2  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.85164  normal  0.1781 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1885  MerR family transcriptional regulator  39.8 
 
 		 113 aa  58.2  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.375979 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2152  MerR family transcriptional regulator  44.12 
 
 		 137 aa  58.2  0.0000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.845816  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0800  MerR family transcriptional regulator  44.29 
 
 		 142 aa  58.2  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.876996 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2173  regulatory protein, MerR  35.79 
 
 		 147 aa  58.2  0.0000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2572  MerR family transcriptional regulator  40.82 
 
 		 141 aa  58.5  0.0000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.957862  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6337  MerR family transcriptional regulator  34.13 
 
 		 342 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4537  Hg(II)-responsive transcriptional regulator  40 
 
 		 132 aa  58.2  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2819  transcriptional regulator, MerR family protein  34.74 
 
 		 129 aa  58.2  0.0000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1742  MerR family transcriptional regulator  34.13 
 
 		 342 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1755  MerR family transcriptional regulator  34.13 
 
 		 342 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.581641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2357  MerR family transcriptional regulator  46.27 
 
 		 136 aa  57.4  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.120567 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2214  transcriptional regulator, MerR family  31.58 
 
 		 177 aa  57.8  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000011193 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3373  MerR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 136 aa  57.8  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0297855  normal  0.469131 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0339  MerR family transcriptional regulator  36.56 
 
 		 253 aa  57.4  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.841288 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2443  MerR family transcriptional regulator  46.27 
 
 		 140 aa  57.8  0.0000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1943  transcriptional regulator of MerR family protein  41.18 
 
 		 135 aa  57.4  0.0000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.555422  normal  0.0105773 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5275  MerR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 253 aa  57  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3209  MerR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 138 aa  57  0.0000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7842  transcriptional regulator, MerR family  34.45 
 
 		 149 aa  57  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0802  transcriptional regulator, MerR family  38.61 
 
 		 142 aa  56.6  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2333  MerR family transcriptional regulator  34.86 
 
 		 162 aa  57  0.0000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00701798  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1663  MerR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 343 aa  57  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>