More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_5341 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_5341  MerR family transcriptional regulator  100 
 
 		 260 aa  515  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.138898  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5430  MerR family transcriptional regulator  100 
 
 		 260 aa  515  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.792567  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5720  MerR family transcriptional regulator  99.23 
 
 		 260 aa  513  1e-144  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0868  transcriptional regulator, MerR family  59.6 
 
 		 254 aa  296  3e-79  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.915054 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6059  transcriptional regulator, MerR family  51.17 
 
 		 258 aa  262  3e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8874  transcriptional regulator, MerR family  34.15 
 
 		 249 aa  143  3e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2048  transcriptional regulator, MerR family  39.9 
 
 		 265 aa  128  8.000000000000001e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.144756 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0374  MerR family transcriptional regulator  38.38 
 
 		 254 aa  125  6e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0448793  hitchhiker  0.00531151 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4382  regulatory protein, MerR  38.34 
 
 		 256 aa  124  1e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.534251 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0543  transcriptional regulator, MerR family  36.46 
 
 		 252 aa  124  2e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4873  MerR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 260 aa  117  9.999999999999999e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.686737  normal  0.0317113 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2015  putative transcriptional regulator, MerR family  37.63 
 
 		 264 aa  116  3.9999999999999997e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2662  transcriptional regulator, MerR family  45.05 
 
 		 126 aa  98.2  1e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00193678  hitchhiker  0.00916479 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09690  predicted transcriptional regulator  41.5 
 
 		 290 aa  93.2  4e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.311796  normal  0.878429 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0913  transcriptional regulator, MerR family  33.48 
 
 		 260 aa  86.7  4e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.251711  normal  0.260144 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2659  transcriptional regulator, MerR family  36.56 
 
 		 246 aa  82.8  0.000000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.587322  normal  0.281971 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3594  transcriptional regulator, MerR family  43.33 
 
 		 278 aa  82.4  0.000000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1534  transcriptional regulator, MerR family  31.13 
 
 		 249 aa  80.9  0.00000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0334786  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8430  putative transcriptional regulator, MerR family  56.06 
 
 		 251 aa  81.3  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.750305  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1354  transcriptional regulator, MerR family  33.12 
 
 		 254 aa  78.6  0.00000000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2417  putative transcriptional regulator, MerR family  53.97 
 
 		 304 aa  75.9  0.0000000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4282  transcriptional regulator, MerR family  55.56 
 
 		 308 aa  74.3  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.416101  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0255  transcriptional regulator, MerR family  47.31 
 
 		 251 aa  74.3  0.000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1862  transcriptional regulator, MerR family  51.67 
 
 		 247 aa  73.9  0.000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0767866 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4698  transcriptional regulator, MerR family  44.68 
 
 		 253 aa  72  0.000000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0668  transcriptional regulator, MerR family  46.58 
 
 		 272 aa  70.9  0.00000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000812117  hitchhiker  0.0000325432 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4378  transcriptional regulator, MerR family  31.7 
 
 		 242 aa  71.2  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4014  MerR family transcriptional regulator  35.66 
 
 		 144 aa  70.5  0.00000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2151  transcriptional regulator, MerR family  40.54 
 
 		 253 aa  69.7  0.00000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.447172 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2603  transcriptional regulator, MerR family  32.54 
 
 		 274 aa  69.3  0.00000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.241665  normal  0.676341 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1345  transcriptional regulator, MerR family  46.88 
 
 		 246 aa  68.9  0.00000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4229  transcriptional regulator, MerR family  48.48 
 
 		 258 aa  68.2  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1962  transcriptional regulator, MerR family  30.96 
 
 		 250 aa  67.8  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4880  transcriptional regulator, MerR family  33.33 
 
 		 249 aa  67.8  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2331  MerR family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 153 aa  67.4  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.324696 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2419  regulatory protein, MerR  42.42 
 
 		 246 aa  67.4  0.0000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.110485  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0969  MerR family transcriptional regulator  35.77 
 
 		 252 aa  66.2  0.0000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00256708  hitchhiker  0.0060004 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1079  TipAS antibiotic-recognition domain-containing protein  35.34 
 
 		 252 aa  66.2  0.0000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.23199 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4834  transcriptional regulator, MerR family  35.66 
 
 		 144 aa  65.9  0.0000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.300455  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0047  MerR family transcriptional regulator  31.22 
 
 		 264 aa  64.7  0.000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3393  transcriptional regulator, MerR family  39.56 
 
 		 254 aa  65.1  0.000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.988274  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3990  transcriptional regulator, MerR family  38.89 
 
 		 248 aa  65.1  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.340501  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1265  transcriptional regulator, MerR family  41.11 
 
 		 252 aa  64.7  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0749  transcriptional regulator, heavy metal-dependent  34.86 
 
 		 133 aa  63.5  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4036  transcriptional regulator, MerR family  41.03 
 
 		 262 aa  63.5  0.000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000546536  normal  0.0325517 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23430  predicted transcriptional regulator  35.04 
 
 		 271 aa  63.5  0.000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0376314  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0747  MerR family transcriptional regulator  48.57 
 
 		 141 aa  63.9  0.000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1222  transcriptional regulator, MerR family  40.4 
 
 		 254 aa  63.5  0.000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.867665  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0409  TipAS antibiotic-recognition domain protein  40.21 
 
 		 259 aa  63.5  0.000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2848  MerR family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 142 aa  63.2  0.000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0159  transcriptional regulator, MerR family  46.32 
 
 		 135 aa  62.8  0.000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0164  transcriptional regulator, MerR family  46.32 
 
 		 135 aa  62.8  0.000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.768188  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2640  transcriptional regulator, MerR family  25.54 
 
 		 283 aa  62.8  0.000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35600  predicted transcriptional regulator  33.68 
 
 		 319 aa  62  0.000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.172761  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0653  regulatory protein, MerR  34.86 
 
 		 132 aa  61.6  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0148  MerR family transcriptional regulator  29.75 
 
 		 257 aa  62  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.290112  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1339  transcriptional regulator of MerR family protein  33.6 
 
 		 130 aa  62  0.00000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3862  precorrin-8X methylmutase  31.62 
 
 		 368 aa  60.8  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.268065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4442  putative transcriptional regulator, MerR family  31.11 
 
 		 253 aa  60.5  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00264375  hitchhiker  0.000476994 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3285  transcriptional regulator, MerR family  32.48 
 
 		 272 aa  60.5  0.00000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.235229  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0115  Hg(II)-responsive transcriptional regulator  46.48 
 
 		 132 aa  60.1  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.889131  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2323  putative transcriptional regulator MerR  41.89 
 
 		 144 aa  60.1  0.00000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0630  MerR family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 136 aa  60.1  0.00000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000318098 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0083  putative transcriptional regulator MerR  40.26 
 
 		 144 aa  59.7  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.68539 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2496  transcriptional regulator, MerR family  38.61 
 
 		 259 aa  60.1  0.00000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0585  MerR family transcriptional regulator  34.51 
 
 		 136 aa  59.3  0.00000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.853287  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3299  MerR family transcriptional regulator  33.96 
 
 		 149 aa  59.7  0.00000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0169089  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0624  MerR family transcriptional regulator  34.51 
 
 		 136 aa  59.3  0.00000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2269  MerR family transcriptional regulator  42.67 
 
 		 135 aa  59.7  0.00000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.220473  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2129  putative transcriptional regulator MerR  40.26 
 
 		 144 aa  59.7  0.00000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1785  MerR family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 134 aa  59.7  0.00000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.370686  normal  0.0498641 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3346  transcriptional regulator, MerR family  26.07 
 
 		 241 aa  59.3  0.00000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.152739  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2760  Hg(II)-responsive transcriptional regulator  31.82 
 
 		 135 aa  59.3  0.00000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10060  Cu(I)-responsive transcriptional regulator, MerR family  35.71 
 
 		 138 aa  59.3  0.00000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.198613  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3961  MerR family transcriptional regulator  37.11 
 
 		 142 aa  58.9  0.00000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.146237  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3623  MerR family transcriptional regulator  37.11 
 
 		 142 aa  58.9  0.00000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1943  transcriptional regulator of MerR family protein  38.46 
 
 		 135 aa  58.9  0.00000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.555422  normal  0.0105773 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1517  MerR family transcriptional regulator  37.36 
 
 		 342 aa  58.9  0.00000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.242009 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1474  MerR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 135 aa  58.9  0.00000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.70041  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3410  hypothetical protein  37.84 
 
 		 142 aa  59.3  0.00000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5990  mercury resistance regulatory protein MerR  40.4 
 
 		 132 aa  58.9  0.00000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.479863 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3523  MerR family transcriptional regulator  37.19 
 
 		 139 aa  58.9  0.00000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3346  transcriptional regulator, MerR family  31.87 
 
 		 252 aa  58.9  0.00000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00536383  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0168  putative transcriptional regulator MerR  40.26 
 
 		 144 aa  58.9  0.00000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2028  transcriptional regulator, MerR family  34.58 
 
 		 283 aa  58.9  0.00000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000014266  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1357  MerR family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 342 aa  58.9  0.00000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.744828  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3375  MerR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 149 aa  58.5  0.00000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1915  MerR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 136 aa  58.5  0.0000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2267  MerR family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 132 aa  58.2  0.0000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.312011  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0660  MerR family transcriptional regulator  34.86 
 
 		 137 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1919  MerR family transcriptional regulator  32.28 
 
 		 268 aa  58.2  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0931546  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1663  MerR family transcriptional regulator  28.02 
 
 		 343 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4873  MerR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 141 aa  58.5  0.0000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.825064 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3456  MerR family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 149 aa  58.5  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1395  MerR family transcriptional regulator  38.83 
 
 		 146 aa  58.2  0.0000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.686505  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2538  transcriptional regulator, MerR family  35.66 
 
 		 147 aa  57.8  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.329159  normal  0.129188 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0065  transcriptional regulator, MerR family  38.24 
 
 		 252 aa  57.4  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1217  putative transcriptional regulator MerR  40.54 
 
 		 144 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0094  Hg(II)-responsive transcriptional regulator  34.15 
 
 		 136 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5143  MerR family transcriptional regulator  41.49 
 
 		 251 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>