More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_1345 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_1345  transcriptional regulator, MerR family  100 
 
 		 246 aa  489  1e-137  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4229  transcriptional regulator, MerR family  56.68 
 
 		 258 aa  286  2e-76  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3346  transcriptional regulator, MerR family  48.29 
 
 		 241 aa  211  1e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.152739  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1354  transcriptional regulator, MerR family  46.06 
 
 		 254 aa  199  3.9999999999999996e-50  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4378  transcriptional regulator, MerR family  46.81 
 
 		 242 aa  193  2e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1862  transcriptional regulator, MerR family  43.48 
 
 		 247 aa  191  1e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0767866 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3990  transcriptional regulator, MerR family  46.19 
 
 		 248 aa  190  2e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.340501  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1265  transcriptional regulator, MerR family  44.73 
 
 		 252 aa  171  7.999999999999999e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2659  transcriptional regulator, MerR family  34.93 
 
 		 246 aa  99  7e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.587322  normal  0.281971 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0913  transcriptional regulator, MerR family  31.2 
 
 		 260 aa  82.4  0.000000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.251711  normal  0.260144 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0668  transcriptional regulator, MerR family  36.36 
 
 		 272 aa  75.1  0.000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000812117  hitchhiker  0.0000325432 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0543  transcriptional regulator, MerR family  41.58 
 
 		 252 aa  75.1  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0868  transcriptional regulator, MerR family  45.07 
 
 		 254 aa  73.2  0.000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.915054 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4382  regulatory protein, MerR  36.36 
 
 		 256 aa  70.1  0.00000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.534251 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1582  hypothetical protein  25.67 
 
 		 249 aa  69.7  0.00000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2173  regulatory protein, MerR  29.41 
 
 		 147 aa  69.3  0.00000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3594  transcriptional regulator, MerR family  38.89 
 
 		 278 aa  69.3  0.00000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5720  MerR family transcriptional regulator  46.88 
 
 		 260 aa  68.9  0.00000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5341  MerR family transcriptional regulator  46.88 
 
 		 260 aa  68.9  0.00000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.138898  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0374  MerR family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 254 aa  68.9  0.00000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0448793  hitchhiker  0.00531151 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5430  MerR family transcriptional regulator  46.88 
 
 		 260 aa  68.9  0.00000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.792567  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4873  MerR family transcriptional regulator  38.95 
 
 		 260 aa  68.9  0.00000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.686737  normal  0.0317113 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2419  regulatory protein, MerR  30.98 
 
 		 246 aa  68.6  0.00000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.110485  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2819  transcriptional regulator, MerR family protein  30.25 
 
 		 129 aa  68.6  0.00000000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2048  transcriptional regulator, MerR family  40.38 
 
 		 265 aa  67.8  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.144756 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1411  hypothetical protein  23.96 
 
 		 250 aa  67  0.0000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6059  transcriptional regulator, MerR family  31.29 
 
 		 258 aa  66.2  0.0000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0065  transcriptional regulator, MerR family  38.54 
 
 		 252 aa  65.5  0.0000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09690  predicted transcriptional regulator  47.83 
 
 		 290 aa  63.9  0.000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.311796  normal  0.878429 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8874  transcriptional regulator, MerR family  34.34 
 
 		 249 aa  63.9  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2015  putative transcriptional regulator, MerR family  44.59 
 
 		 264 aa  63.2  0.000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8430  putative transcriptional regulator, MerR family  37.4 
 
 		 251 aa  63.5  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.750305  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1534  transcriptional regulator, MerR family  36.08 
 
 		 249 aa  63.2  0.000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0334786  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4880  transcriptional regulator, MerR family  38.37 
 
 		 249 aa  62.4  0.000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3609  transcriptional regulator, MerR family  35.92 
 
 		 288 aa  62.4  0.000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.279155  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0255  transcriptional regulator, MerR family  39.8 
 
 		 251 aa  60.5  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4036  transcriptional regulator, MerR family  41.94 
 
 		 262 aa  60.5  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000546536  normal  0.0325517 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4282  transcriptional regulator, MerR family  40.35 
 
 		 308 aa  59.3  0.00000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.416101  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2417  putative transcriptional regulator, MerR family  40.35 
 
 		 304 aa  58.9  0.00000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4698  transcriptional regulator, MerR family  34.29 
 
 		 253 aa  58.5  0.00000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2325  MerR family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 135 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1079  TipAS antibiotic-recognition domain-containing protein  32.41 
 
 		 252 aa  58.2  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.23199 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4442  putative transcriptional regulator, MerR family  27.66 
 
 		 253 aa  57.8  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00264375  hitchhiker  0.000476994 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0420  transcriptional regulator, MerR family  33.33 
 
 		 255 aa  57.4  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3410  hypothetical protein  32.38 
 
 		 142 aa  57  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0831  MerR family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 145 aa  57.4  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1222  transcriptional regulator, MerR family  33.33 
 
 		 254 aa  56.6  0.0000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.867665  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2183  putative transcriptional regulator, MerR family  42.7 
 
 		 242 aa  57  0.0000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3726  MerR family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 140 aa  57  0.0000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0969  MerR family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 252 aa  56.2  0.0000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00256708  hitchhiker  0.0060004 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1955  MerR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 128 aa  56.2  0.0000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2155  transcriptional regulator, MerR family  41.79 
 
 		 167 aa  56.6  0.0000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.000155365  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3209  MerR family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 138 aa  56.6  0.0000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3299  MerR family transcriptional regulator  32.94 
 
 		 149 aa  56.2  0.0000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0169089  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2640  transcriptional regulator, MerR family  40.98 
 
 		 283 aa  56.2  0.0000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2509  MerR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 151 aa  56.6  0.0000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.591979 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2453  transcriptional regulator, MerR family  31.06 
 
 		 155 aa  56.2  0.0000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00000100878  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3611  transcriptional regulator, MerR family  32.97 
 
 		 267 aa  56.2  0.0000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3680  transcriptional regulator, MerR family  36 
 
 		 133 aa  55.8  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.446637  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2633  Cd(II)/Pb(II)-responsive transcriptional regulator  35.16 
 
 		 162 aa  55.8  0.0000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.673518 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5351  transcriptional regulator, MerR family  34.29 
 
 		 144 aa  55.8  0.0000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0379309  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0477  MerR family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 173 aa  55.8  0.0000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3456  MerR family transcriptional regulator  27.84 
 
 		 149 aa  55.5  0.0000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0993  MerR family transcriptional regulator  32.38 
 
 		 137 aa  55.5  0.0000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.335093  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2028  transcriptional regulator, MerR family  42.62 
 
 		 283 aa  55.5  0.0000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000014266  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3133  MerR family transcriptional regulator  38.2 
 
 		 139 aa  55.1  0.0000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.845727  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2572  MerR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 141 aa  55.1  0.0000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.957862  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1617  putative transcriptional regulator, MerR family  35.79 
 
 		 252 aa  54.7  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.870774 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0129  hypothetical protein  23.9 
 
 		 347 aa  54.7  0.000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.257512  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2868  MerR family transcriptional regulator  29.51 
 
 		 129 aa  54.7  0.000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000311414  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5283  transcriptional regulator, MerR family  30.84 
 
 		 143 aa  53.9  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1678  MerR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 132 aa  54.3  0.000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0220  MerR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 135 aa  54.3  0.000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3237  MerR family transcriptional regulator  39.33 
 
 		 137 aa  54.3  0.000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0470  putative transcriptional regulator, MerR family  29.9 
 
 		 133 aa  54.3  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4537  Hg(II)-responsive transcriptional regulator  27.59 
 
 		 132 aa  53.9  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4536  transcriptional regulator, MerR family  32.17 
 
 		 146 aa  54.3  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.228678  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3108  MerR family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 154 aa  54.3  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.798682  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1103  MerR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 135 aa  53.9  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.394367  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1117  MerR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 135 aa  53.9  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2902  MerR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 135 aa  53.9  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1604  MerR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 135 aa  53.9  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2912  MerR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 135 aa  53.9  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0392  MerR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 135 aa  53.9  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0882  MerR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 135 aa  53.9  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.656142 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0194  MerR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 135 aa  54.3  0.000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0137  MerR family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 145 aa  54.7  0.000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1962  transcriptional regulator, MerR family  33.98 
 
 		 250 aa  53.9  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2900  MerR family transcriptional regulator  39.44 
 
 		 140 aa  54.3  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0894  MerR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 135 aa  54.3  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1642  transcriptional regulator, MerR family  30.84 
 
 		 143 aa  53.9  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.349097  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2662  transcriptional regulator, MerR family  43.4 
 
 		 126 aa  53.5  0.000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00193678  hitchhiker  0.00916479 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0437  MerR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 161 aa  53.5  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3542  transcriptional regulator, MerR family  30.33 
 
 		 143 aa  53.9  0.000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0490383 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3156  MerR family transcriptional regulator  39.44 
 
 		 146 aa  53.5  0.000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.215145  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4002  MerR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 135 aa  53.5  0.000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0088  hypothetical protein  30.11 
 
 		 253 aa  53.1  0.000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1790  transcriptional regulator  33 
 
 		 141 aa  53.1  0.000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.269282  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2326  MerR family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 150 aa  53.1  0.000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2831  MerR family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 175 aa  53.1  0.000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.116752 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>