More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_3542 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



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Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014151  Cfla_3542  transcriptional regulator, MerR family  100 
 
 		 143 aa  280  6.000000000000001e-75  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0490383 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2453  transcriptional regulator, MerR family  44.96 
 
 		 155 aa  99.4  2e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00000100878  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3184  transcriptional regulator, MerR family  42.03 
 
 		 142 aa  96.3  1e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2836  transcriptional regulator, MerR family  41.67 
 
 		 135 aa  93.2  1e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.906455  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2399  transcriptional regulator, MerR family  41.79 
 
 		 132 aa  92  2e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000424023  normal  0.796089 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1338  MerR family transcriptional regulator  41.73 
 
 		 135 aa  89.4  2e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.683374  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2686  MerR family transcriptional regulator  38.28 
 
 		 172 aa  86.7  9e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2155  transcriptional regulator, MerR family  38.51 
 
 		 167 aa  85.9  2e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.000155365  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3347  transcription regulator protein  39.55 
 
 		 159 aa  85.1  3e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.445877  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3492  transcriptional regulator, MerR family protein  35.43 
 
 		 135 aa  84.7  4e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4315  MerR family transcriptional regulator  36.22 
 
 		 130 aa  84.7  4e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1339  mercuric resistance operon regulatory protein  41.09 
 
 		 135 aa  84  6e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0137  MerR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 145 aa  83.6  8e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2352  MerR family transcriptional regulator  39.26 
 
 		 152 aa  83.6  9e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0477  MerR family transcriptional regulator  39.1 
 
 		 173 aa  82.4  0.000000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02041  Hg(II)-responsive transcriptional regulator  34.78 
 
 		 116 aa  82.4  0.000000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4798  MerR family transcriptional regulator  39.55 
 
 		 136 aa  82  0.000000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3237  MerR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 137 aa  82  0.000000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3209  MerR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 138 aa  81.3  0.000000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3373  MerR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 136 aa  81.3  0.000000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0297855  normal  0.469131 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02955  Hg(II)-responsive transcriptional regulator  36.22 
 
 		 128 aa  80.9  0.000000000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0202543  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2312  MerR family transcriptional regulator  41.53 
 
 		 135 aa  80.5  0.000000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  unclonable  0.000000000000678056  hitchhiker  0.000026005 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1301  MerR family transcriptional regulator  41.53 
 
 		 135 aa  80.5  0.000000000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.440008 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0747  MerR family transcriptional regulator  38.06 
 
 		 141 aa  80.5  0.000000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3726  MerR family transcriptional regulator  36.43 
 
 		 140 aa  80.5  0.000000000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0373  transcriptional regulator, MerR family  36.69 
 
 		 158 aa  79.7  0.00000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0543  transcriptional regulator, MerR family  36.69 
 
 		 158 aa  79.7  0.00000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.166066  hitchhiker  0.000000593111 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3680  transcriptional regulator, MerR family  35.43 
 
 		 133 aa  79.7  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.446637  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1032  transcriptional regulator, MerR family  33.59 
 
 		 144 aa  80.1  0.00000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.920994  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4536  transcriptional regulator, MerR family  40.98 
 
 		 146 aa  79  0.00000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.228678  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1771  transcriptional regulator, MerR family  33.33 
 
 		 151 aa  79.3  0.00000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.13408  normal  0.537849 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0115  Hg(II)-responsive transcriptional regulator  37.88 
 
 		 132 aa  79.3  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.889131  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3542  transcriptional regulator, MerR family  37.01 
 
 		 152 aa  79  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.387014 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0803  HTH-type transcriptional regulator CueR (copper export regulator)  31.78 
 
 		 132 aa  79.3  0.00000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2024  mercuric resistance operon regulatory protein MerR  35.16 
 
 		 130 aa  78.2  0.00000000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4537  Hg(II)-responsive transcriptional regulator  35.43 
 
 		 132 aa  78.6  0.00000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0237  MerR family transcriptional regulator  43.36 
 
 		 132 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1217  putative transcriptional regulator MerR  39.5 
 
 		 144 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2900  MerR family transcriptional regulator  36.8 
 
 		 140 aa  78.2  0.00000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2232  putative transcriptional regulator MerR  37.88 
 
 		 144 aa  78.2  0.00000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.620327  normal  0.3464 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2470  MerR family transcriptional regulator  37.69 
 
 		 138 aa  77.8  0.00000000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2343  MerR family transcriptional regulator  38.76 
 
 		 146 aa  78.2  0.00000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.264422  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0553  DNA-binding transcriptional regulator CueR  33.33 
 
 		 138 aa  77.8  0.00000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.985745  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0563  DNA-binding transcriptional regulator CueR  33.33 
 
 		 138 aa  77.8  0.00000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.620757  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0546  DNA-binding transcriptional regulator CueR  33.33 
 
 		 138 aa  77.8  0.00000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0548  DNA-binding transcriptional regulator CueR  33.33 
 
 		 138 aa  77.8  0.00000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0607  DNA-binding transcriptional regulator CueR  33.33 
 
 		 138 aa  77.8  0.00000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1504  regulatory protein, MerR  36.43 
 
 		 141 aa  77.4  0.00000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4341  putative transcriptional regulator MerR  38.17 
 
 		 151 aa  77  0.00000000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1255  mercuric resistance operon regulatory protein MerR  34.38 
 
 		 130 aa  77  0.00000000000008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0168  putative transcriptional regulator MerR  37.88 
 
 		 144 aa  77  0.00000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3133  MerR family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 139 aa  76.6  0.00000000000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.845727  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3216  transcriptional regulator, MerR family  36.22 
 
 		 155 aa  76.3  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3156  MerR family transcriptional regulator  36.43 
 
 		 146 aa  76.3  0.0000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.215145  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2331  MerR family transcriptional regulator  40 
 
 		 153 aa  76.6  0.0000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.324696 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3164  MerR family transcriptional regulator  36.43 
 
 		 139 aa  76.6  0.0000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1266  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  36.43 
 
 		 139 aa  76.6  0.0000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0668949 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3026  transcriptional regulator, MerR family  33.59 
 
 		 137 aa  76.3  0.0000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1097  transcriptional regulator, MerR family  31.78 
 
 		 133 aa  76.6  0.0000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5562  transcriptional regulator  34.88 
 
 		 139 aa  76.3  0.0000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.21316  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3502  transcriptional regulator, MerR family  33.08 
 
 		 140 aa  75.5  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.733746 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1026  MerR family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 140 aa  76.3  0.0000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.120689  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0094  Hg(II)-responsive transcriptional regulator  38.76 
 
 		 136 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1304  zinc-responsive transcriptional regulator  37.5 
 
 		 140 aa  75.5  0.0000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0714  putative transcriptional regulator, MerR family  36.69 
 
 		 142 aa  75.9  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2129  putative transcriptional regulator MerR  38.52 
 
 		 144 aa  75.5  0.0000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4091  MerR family transcriptional regulator  36.43 
 
 		 138 aa  74.7  0.0000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.903901  normal  0.433272 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2323  putative transcriptional regulator MerR  37.98 
 
 		 144 aa  75.1  0.0000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4834  transcriptional regulator, MerR family  32.85 
 
 		 144 aa  75.1  0.0000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.300455  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3979  MerR family transcriptional regulator  37.19 
 
 		 174 aa  74.7  0.0000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.00581953  normal  0.426596 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2760  Hg(II)-responsive transcriptional regulator  35.88 
 
 		 135 aa  75.5  0.0000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3797  transcriptional regulator, MerR family  32.85 
 
 		 140 aa  75.1  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.360833  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0800  MerR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 142 aa  75.1  0.0000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.876996 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3790  MerR family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 132 aa  75.1  0.0000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0361759  normal  0.548118 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4116  transcriptional regulator, MerR family  31.78 
 
 		 133 aa  75.1  0.0000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4066  MerR family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 132 aa  75.1  0.0000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2848  MerR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 142 aa  75.5  0.0000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00438  DNA-binding transcriptional activator of copper-responsive regulon genes  32.31 
 
 		 135 aa  74.7  0.0000000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3123  transcriptional regulator, MerR family  32.31 
 
 		 135 aa  74.7  0.0000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.856714  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00443  hypothetical protein  32.31 
 
 		 135 aa  74.7  0.0000000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009708  YpsIP31758_3026  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  35.66 
 
 		 139 aa  74.7  0.0000000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010468  EcolC_3129  DNA-binding transcriptional regulator CueR  32.31 
 
 		 135 aa  74.7  0.0000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.943376  hitchhiker  0.0000753695 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0993  MerR family transcriptional regulator  38.64 
 
 		 137 aa  74.7  0.0000000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.335093  normal  1 
 
 
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NC_009801  EcE24377A_0526  DNA-binding transcriptional regulator CueR  32.31 
 
 		 135 aa  74.7  0.0000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009800  EcHS_A0566  DNA-binding transcriptional regulator CueR  32.31 
 
 		 135 aa  74.7  0.0000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010658  SbBS512_E0422  DNA-binding transcriptional regulator CueR  32.31 
 
 		 135 aa  74.7  0.0000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013422  Hneap_1213  transcriptional regulator, MerR family  37.67 
 
 		 144 aa  74.7  0.0000000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.276419  n/a   
 
 
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NC_009439  Pmen_0812  MerR family transcriptional regulator  31.39 
 
 		 143 aa  74.3  0.0000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008347  Mmar10_2325  MerR family transcriptional regulator  36.8 
 
 		 147 aa  74.3  0.0000000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009832  Spro_1151  MerR family transcriptional regulator  35.66 
 
 		 133 aa  74.3  0.0000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.100669  hitchhiker  0.000000311334 
 
 
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NC_009720  Xaut_3339  MerR family transcriptional regulator  37.19 
 
 		 157 aa  74.3  0.0000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.88053  normal  0.266963 
 
 
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NC_008699  Noca_2198  MerR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 135 aa  73.9  0.0000000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007492  Pfl01_0660  MerR family transcriptional regulator  33.09 
 
 		 137 aa  73.6  0.0000000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010084  Bmul_2269  MerR family transcriptional regulator  35.88 
 
 		 135 aa  73.6  0.0000000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.220473  normal  1 
 
 
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NC_009438  Sputcn32_0171  MerR family transcriptional regulator  34.75 
 
 		 134 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007005  Psyr_0653  regulatory protein, MerR  33.08 
 
 		 132 aa  73.2  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010498  EcSMS35_0530  DNA-binding transcriptional regulator CueR  31.54 
 
 		 135 aa  73.2  0.000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008048  Sala_2558  MerR family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 139 aa  73.2  0.000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011353  ECH74115_0586  DNA-binding transcriptional regulator CueR  31.54 
 
 		 135 aa  73.2  0.000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.775911 
 
 
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NC_009565  TBFG_13367  MerR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 146 aa  72.4  0.000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.272142  normal  1 
 
 
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