More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_4798 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007948  Bpro_4798  MerR family transcriptional regulator  100 
 
 
136 aa  273  4e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2323  putative transcriptional regulator MerR  64.66 
 
 
144 aa  188  2e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4341  putative transcriptional regulator MerR  64.18 
 
 
151 aa  188  2e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0094  Hg(II)-responsive transcriptional regulator  63.7 
 
 
136 aa  188  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2232  putative transcriptional regulator MerR  66.67 
 
 
144 aa  186  1e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.620327  normal  0.3464 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0168  putative transcriptional regulator MerR  63.16 
 
 
144 aa  185  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2129  putative transcriptional regulator MerR  61.76 
 
 
144 aa  184  4e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1213  transcriptional regulator, MerR family  61.76 
 
 
144 aa  183  6e-46  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.276419  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1217  putative transcriptional regulator MerR  62.41 
 
 
144 aa  183  7e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6344  Hg(II) resistance regulatory protein MerR  63.16 
 
 
162 aa  183  8e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000851109  unclonable  0.0000000537327 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6498  putative transcriptional regulator MerR  62.5 
 
 
144 aa  182  1.0000000000000001e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0239269  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6171  putative transcriptional regulator MerR  62.5 
 
 
144 aa  182  1.0000000000000001e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000597544  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15480  putative transcriptional regulator MerR  62.5 
 
 
144 aa  182  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000744936  unclonable  4.377399999999999e-22 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2341  putative transcriptional regulator MerR  62.5 
 
 
144 aa  182  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0101  putative transcriptional regulator MerR  62.5 
 
 
144 aa  182  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.656805  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1338  MerR family transcriptional regulator  68.25 
 
 
135 aa  181  3e-45  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.683374  normal 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0083  putative transcriptional regulator MerR  61.03 
 
 
144 aa  180  5.0000000000000004e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.68539 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2269  MerR family transcriptional regulator  62.96 
 
 
135 aa  180  7e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.220473  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1474  MerR family transcriptional regulator  62.96 
 
 
135 aa  180  7e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.70041  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1339  mercuric resistance operon regulatory protein  62.41 
 
 
135 aa  178  2e-44  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1783  putative transcriptional regulator MerR  62.41 
 
 
144 aa  178  2e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.45958  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2312  MerR family transcriptional regulator  60.9 
 
 
135 aa  175  2e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  unclonable  0.000000000000678056  hitchhiker  0.000026005 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1301  MerR family transcriptional regulator  60.9 
 
 
135 aa  175  2e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.440008 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0486  MerR family transcriptional regulator  62.41 
 
 
135 aa  174  4e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4014  MerR family transcriptional regulator  58.96 
 
 
144 aa  172  1.9999999999999998e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2760  Hg(II)-responsive transcriptional regulator  59.7 
 
 
135 aa  171  3.9999999999999995e-42  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1395  MerR family transcriptional regulator  62.02 
 
 
146 aa  170  5e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.686505  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1661  MerR family transcriptional regulator  60.16 
 
 
137 aa  157  5e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.282422  normal  0.34807 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0164  transcriptional regulator, MerR family  55.04 
 
 
135 aa  148  2e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.768188  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0159  transcriptional regulator, MerR family  55.04 
 
 
135 aa  148  2e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0238  MerR family transcriptional regulator  52.8 
 
 
141 aa  141  3e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0237  MerR family transcriptional regulator  60.16 
 
 
132 aa  140  8e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3492  transcriptional regulator, MerR family protein  50.4 
 
 
135 aa  126  9.000000000000001e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5990  mercury resistance regulatory protein MerR  48.8 
 
 
132 aa  126  1.0000000000000001e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.479863 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0115  Hg(II)-responsive transcriptional regulator  51.2 
 
 
132 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.889131  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02955  Hg(II)-responsive transcriptional regulator  48 
 
 
128 aa  124  3e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0202543  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1620  MerR family transcriptional regulator  62.11 
 
 
110 aa  125  3e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.230477  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1943  transcriptional regulator of MerR family protein  45.74 
 
 
135 aa  122  2e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.555422  normal  0.0105773 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4315  MerR family transcriptional regulator  46.4 
 
 
130 aa  120  6e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0171  MerR family transcriptional regulator  48.82 
 
 
134 aa  120  7e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02950  Hg(II)-responsive transcriptional regulator  46.88 
 
 
131 aa  108  2.0000000000000002e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0289893  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2699  MerR family transcriptional regulator  43.18 
 
 
171 aa  108  3e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2198  MerR family transcriptional regulator  46.4 
 
 
135 aa  105  3e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2509  MerR family transcriptional regulator  45.67 
 
 
151 aa  105  3e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.591979 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3623  MerR family transcriptional regulator  45.3 
 
 
142 aa  104  4e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3961  MerR family transcriptional regulator  45.3 
 
 
142 aa  104  4e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.146237  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4117  MerR family transcriptional regulator  42.19 
 
 
140 aa  103  8e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2836  transcriptional regulator, MerR family  43.18 
 
 
135 aa  102  1e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.906455  normal 
 
 
-
 
NC_009008  RSP_4277  MerR family transcriptional regulator  42.19 
 
 
140 aa  102  1e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4537  Hg(II)-responsive transcriptional regulator  41.6 
 
 
132 aa  102  1e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2435  MerR family transcriptional regulator  43.94 
 
 
135 aa  103  1e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2399  transcriptional regulator, MerR family  41.54 
 
 
132 aa  103  1e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000424023  normal  0.796089 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2155  transcriptional regulator, MerR family  40.77 
 
 
167 aa  103  1e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.000155365  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4834  transcriptional regulator, MerR family  42.19 
 
 
144 aa  102  2e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.300455  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0477  MerR family transcriptional regulator  40.77 
 
 
173 aa  101  3e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2686  MerR family transcriptional regulator  43.65 
 
 
172 aa  99.8  1e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01412  Transcriptional regulator MerR  44 
 
 
150 aa  99.8  1e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.536111  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02041  Hg(II)-responsive transcriptional regulator  42.11 
 
 
116 aa  98.6  3e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2024  mercuric resistance operon regulatory protein MerR  40.62 
 
 
130 aa  97.8  4e-20  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2900  MerR family transcriptional regulator  43.44 
 
 
140 aa  97.4  5e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1255  mercuric resistance operon regulatory protein MerR  40.62 
 
 
130 aa  97.4  5e-20  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2322  MerR family transcriptional regulator  42.64 
 
 
139 aa  97.4  5e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1218  MerR family transcriptional regulator  39.06 
 
 
134 aa  97.1  7e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4360  MerR family transcriptional regulator  39.06 
 
 
134 aa  97.1  7e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2981  MerR family transcriptional regulator  39.06 
 
 
134 aa  97.1  7e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4384  MerR family transcriptional regulator  39.06 
 
 
134 aa  97.1  7e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2453  transcriptional regulator, MerR family  42.31 
 
 
155 aa  94.4  5e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00000100878  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2333  MerR family transcriptional regulator  39.37 
 
 
162 aa  94  6e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00701798  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2122  MerR family transcriptional regulator  42.31 
 
 
131 aa  93.6  7e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.392854  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3209  MerR family transcriptional regulator  37.59 
 
 
138 aa  93.6  9e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2352  MerR family transcriptional regulator  36.64 
 
 
152 aa  92.8  1e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0747  MerR family transcriptional regulator  38.46 
 
 
141 aa  92.4  2e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1097  transcriptional regulator, MerR family  38.17 
 
 
133 aa  92.4  2e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1123  MerR family transcriptional regulator  45.38 
 
 
144 aa  91.7  3e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0608  zinc-responsive transcriptional regulator  34.56 
 
 
144 aa  91.7  3e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000357731  normal  0.723537 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3156  MerR family transcriptional regulator  40.94 
 
 
146 aa  91.3  4e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.215145  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0310  zinc-responsive transcriptional regulator  35.07 
 
 
141 aa  91.3  5e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.44406  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3373  MerR family transcriptional regulator  38.76 
 
 
136 aa  91.3  5e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0297855  normal  0.469131 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3888  zinc-responsive transcriptional regulator  35.07 
 
 
141 aa  91.3  5e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00039361  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4950  regulatory protein, MerR  48.15 
 
 
146 aa  90.5  6e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0034872 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0800  MerR family transcriptional regulator  43.44 
 
 
142 aa  90.5  7e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.876996 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2325  MerR family transcriptional regulator  35.88 
 
 
147 aa  90.1  8e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3410  hypothetical protein  40.17 
 
 
142 aa  89.7  1e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3184  transcriptional regulator, MerR family  40.94 
 
 
142 aa  88.6  2e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0714  putative transcriptional regulator, MerR family  44.44 
 
 
142 aa  89  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3941  MerR family transcriptional regulator  34.11 
 
 
128 aa  87.8  4e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.708141  normal 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4954  regulatory protein, MerR  45.63 
 
 
143 aa  87.8  5e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00750643 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0993  MerR family transcriptional regulator  37.98 
 
 
137 aa  87.4  6e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.335093  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1623  MerR family transcriptional regulator  41.22 
 
 
133 aa  87  8e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.473197 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3797  transcriptional regulator, MerR family  39.66 
 
 
140 aa  87  9e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.360833  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4116  transcriptional regulator, MerR family  39.13 
 
 
133 aa  86.3  1e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2633  Cd(II)/Pb(II)-responsive transcriptional regulator  37.21 
 
 
162 aa  85.5  2e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.673518 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1304  zinc-responsive transcriptional regulator  37.1 
 
 
140 aa  85.5  2e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0373  transcriptional regulator, MerR family  37.96 
 
 
158 aa  85.1  3e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5562  transcriptional regulator  40 
 
 
139 aa  85.1  3e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.21316  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0543  transcriptional regulator, MerR family  37.96 
 
 
158 aa  85.1  3e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.166066  hitchhiker  0.000000593111 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3502  transcriptional regulator, MerR family  38.79 
 
 
140 aa  85.1  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.733746 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1790  transcriptional regulator  43.97 
 
 
141 aa  84.7  4e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.269282  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4091  MerR family transcriptional regulator  36.57 
 
 
138 aa  84.3  6e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.903901  normal  0.433272 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4517  zinc-responsive transcriptional regulator  32.84 
 
 
143 aa  82.8  0.000000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00152846  hitchhiker  0.0000330659 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>