More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_4378 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_4378  transcriptional regulator, MerR family  100 
 
 		 242 aa  474  1e-133  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3346  transcriptional regulator, MerR family  55.79 
 
 		 241 aa  248  5e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.152739  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1354  transcriptional regulator, MerR family  52.08 
 
 		 254 aa  222  3e-57  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1265  transcriptional regulator, MerR family  50 
 
 		 252 aa  208  7e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1345  transcriptional regulator, MerR family  46.81 
 
 		 246 aa  193  2e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4229  transcriptional regulator, MerR family  43.39 
 
 		 258 aa  184  1.0000000000000001e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1862  transcriptional regulator, MerR family  43.33 
 
 		 247 aa  176  3e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0767866 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3990  transcriptional regulator, MerR family  38.84 
 
 		 248 aa  139  4.999999999999999e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.340501  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0668  transcriptional regulator, MerR family  42.95 
 
 		 272 aa  104  1e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000812117  hitchhiker  0.0000325432 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2659  transcriptional regulator, MerR family  46.02 
 
 		 246 aa  102  7e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.587322  normal  0.281971 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2419  regulatory protein, MerR  49.15 
 
 		 246 aa  84.3  0.000000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.110485  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3594  transcriptional regulator, MerR family  37.5 
 
 		 278 aa  82.8  0.000000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1534  transcriptional regulator, MerR family  45.36 
 
 		 249 aa  83.2  0.000000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0334786  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4873  MerR family transcriptional regulator  47.37 
 
 		 260 aa  82  0.000000000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.686737  normal  0.0317113 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0543  transcriptional regulator, MerR family  44.44 
 
 		 252 aa  82.4  0.000000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0913  transcriptional regulator, MerR family  46 
 
 		 260 aa  82.4  0.000000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.251711  normal  0.260144 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4382  regulatory protein, MerR  46.88 
 
 		 256 aa  79  0.00000000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.534251 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4880  transcriptional regulator, MerR family  48.86 
 
 		 249 aa  76.6  0.0000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0374  MerR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 254 aa  76.3  0.0000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0448793  hitchhiker  0.00531151 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0868  transcriptional regulator, MerR family  32.76 
 
 		 254 aa  75.9  0.0000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.915054 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2048  transcriptional regulator, MerR family  45.45 
 
 		 265 aa  75.1  0.0000000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.144756 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6059  transcriptional regulator, MerR family  34.94 
 
 		 258 aa  74.7  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5720  MerR family transcriptional regulator  31.7 
 
 		 260 aa  71.2  0.00000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4036  transcriptional regulator, MerR family  45.78 
 
 		 262 aa  71.6  0.00000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000546536  normal  0.0325517 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5341  MerR family transcriptional regulator  31.7 
 
 		 260 aa  71.2  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.138898  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5430  MerR family transcriptional regulator  31.7 
 
 		 260 aa  71.2  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.792567  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2015  putative transcriptional regulator, MerR family  44.44 
 
 		 264 aa  70.1  0.00000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2173  regulatory protein, MerR  34.29 
 
 		 147 aa  70.5  0.00000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2417  putative transcriptional regulator, MerR family  52.63 
 
 		 304 aa  69.7  0.00000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8430  putative transcriptional regulator, MerR family  48 
 
 		 251 aa  69.3  0.00000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.750305  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2819  transcriptional regulator, MerR family protein  32.99 
 
 		 129 aa  68.6  0.0000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2640  transcriptional regulator, MerR family  27.86 
 
 		 283 aa  67.4  0.0000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3961  MerR family transcriptional regulator  34.58 
 
 		 142 aa  67.4  0.0000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.146237  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2152  MerR family transcriptional regulator  33.96 
 
 		 137 aa  67.4  0.0000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.845816  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3623  MerR family transcriptional regulator  34.58 
 
 		 142 aa  67.4  0.0000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8874  transcriptional regulator, MerR family  39 
 
 		 249 aa  67.4  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4282  transcriptional regulator, MerR family  49.12 
 
 		 308 aa  66.2  0.0000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.416101  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2900  MerR family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 140 aa  65.9  0.0000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0065  transcriptional regulator, MerR family  33.58 
 
 		 252 aa  65.5  0.0000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4537  Hg(II)-responsive transcriptional regulator  28.57 
 
 		 132 aa  65.5  0.0000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09690  predicted transcriptional regulator  42.86 
 
 		 290 aa  65.1  0.0000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.311796  normal  0.878429 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3410  hypothetical protein  35.51 
 
 		 142 aa  65.1  0.0000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0800  MerR family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 142 aa  65.1  0.000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.876996 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3209  MerR family transcriptional regulator  38.61 
 
 		 138 aa  63.9  0.000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4698  transcriptional regulator, MerR family  41.24 
 
 		 253 aa  64.3  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0993  MerR family transcriptional regulator  36.45 
 
 		 137 aa  64.3  0.000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.335093  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3156  MerR family transcriptional regulator  54.24 
 
 		 146 aa  63.9  0.000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.215145  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3237  MerR family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 137 aa  63.9  0.000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1079  TipAS antibiotic-recognition domain-containing protein  41.05 
 
 		 252 aa  63.5  0.000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.23199 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2028  transcriptional regulator, MerR family  46.55 
 
 		 283 aa  63.5  0.000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000014266  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3456  MerR family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 149 aa  63.5  0.000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2325  MerR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 147 aa  63.2  0.000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3299  MerR family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 149 aa  61.6  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0169089  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3609  transcriptional regulator, MerR family  37.86 
 
 		 288 aa  61.2  0.00000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.279155  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1943  transcriptional regulator of MerR family protein  35.29 
 
 		 135 aa  61.2  0.00000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.555422  normal  0.0105773 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0969  MerR family transcriptional regulator  40 
 
 		 252 aa  60.5  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00256708  hitchhiker  0.0060004 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2300  MerR family transcriptional regulator  34.91 
 
 		 134 aa  60.1  0.00000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.639917  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5562  transcriptional regulator  30.84 
 
 		 139 aa  59.7  0.00000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.21316  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0080  transcriptional regulator, MerR family  37.39 
 
 		 137 aa  59.7  0.00000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.671013 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2509  MerR family transcriptional regulator  32.48 
 
 		 151 aa  59.7  0.00000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.591979 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2686  MerR family transcriptional regulator  35.79 
 
 		 172 aa  59.7  0.00000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0073  hypothetical protein  26.97 
 
 		 314 aa  59.3  0.00000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.0572864  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34160  predicted transcriptional regulator  40 
 
 		 278 aa  58.9  0.00000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.153651 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1955  MerR family transcriptional regulator  26.79 
 
 		 128 aa  58.9  0.00000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0129  hypothetical protein  25.48 
 
 		 347 aa  58.9  0.00000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.257512  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1474  MerR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 135 aa  58.9  0.00000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.70041  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2538  MerR family transcriptional regulator  32.46 
 
 		 157 aa  58.5  0.00000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02950  Hg(II)-responsive transcriptional regulator  32.67 
 
 		 131 aa  58.2  0.0000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0289893  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2633  Cd(II)/Pb(II)-responsive transcriptional regulator  35.42 
 
 		 162 aa  58.2  0.0000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.673518 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24960  predicted transcriptional regulator  32.08 
 
 		 270 aa  58.2  0.0000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3726  MerR family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 140 aa  58.2  0.0000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4307  transcriptional regulator, MerR family  42.37 
 
 		 141 aa  57.8  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00729055  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1339  transcriptional regulator of MerR family protein  30.69 
 
 		 130 aa  57  0.0000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3941  MerR family transcriptional regulator  35.58 
 
 		 128 aa  57.8  0.0000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.708141  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7266  transcriptional regulator, MerR family  35.54 
 
 		 274 aa  57.8  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0171  MerR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 134 aa  57.4  0.0000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2326  MerR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 150 aa  57.4  0.0000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3373  MerR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 136 aa  57  0.0000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0297855  normal  0.469131 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0073  transcriptional regulator, MerR family  45.16 
 
 		 133 aa  56.6  0.0000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2453  transcriptional regulator, MerR family  38.32 
 
 		 155 aa  57  0.0000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00000100878  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3133  MerR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 139 aa  57  0.0000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.845727  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2831  MerR family transcriptional regulator  32.23 
 
 		 175 aa  57  0.0000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.116752 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2144  MerR family transcriptional regulator  37.66 
 
 		 129 aa  57  0.0000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.000183728  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25610  predicted transcriptional regulator  36.51 
 
 		 129 aa  57  0.0000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2170  transcriptional regulator, MerR family  27.89 
 
 		 133 aa  57  0.0000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000807108 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2309  MerR family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 258 aa  57  0.0000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.535608  normal  0.356789 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1617  putative transcriptional regulator, MerR family  37.17 
 
 		 252 aa  56.6  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.870774 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1667  regulatory protein, MerR  37.74 
 
 		 136 aa  56.2  0.0000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2323  putative transcriptional regulator MerR  37.84 
 
 		 144 aa  56.2  0.0000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2325  MerR family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 135 aa  56.2  0.0000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2760  Hg(II)-responsive transcriptional regulator  38.24 
 
 		 135 aa  56.2  0.0000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0162  MerR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 119 aa  56.2  0.0000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2269  MerR family transcriptional regulator  36.27 
 
 		 135 aa  55.8  0.0000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.220473  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2322  MerR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 139 aa  55.8  0.0000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3108  MerR family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 154 aa  55.8  0.0000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.798682  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0094  Hg(II)-responsive transcriptional regulator  40.62 
 
 		 136 aa  55.8  0.0000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1755  MerR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 342 aa  55.5  0.0000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.581641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2967  MerR family transcriptional regulator  34 
 
 		 127 aa  55.5  0.0000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6337  MerR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 342 aa  55.5  0.0000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1742  MerR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 342 aa  55.5  0.0000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>