More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_2015 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_2015  putative transcriptional regulator, MerR family  100 
 
 		 264 aa  519  1e-146  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0374  MerR family transcriptional regulator  65.75 
 
 		 254 aa  309  2.9999999999999997e-83  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0448793  hitchhiker  0.00531151 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0543  transcriptional regulator, MerR family  57.42 
 
 		 252 aa  273  2.0000000000000002e-72  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2048  transcriptional regulator, MerR family  56.98 
 
 		 265 aa  271  6e-72  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.144756 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4382  regulatory protein, MerR  52.73 
 
 		 256 aa  243  1.9999999999999999e-63  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.534251 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4873  MerR family transcriptional regulator  52.34 
 
 		 260 aa  242  5e-63  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.686737  normal  0.0317113 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8874  transcriptional regulator, MerR family  53.4 
 
 		 249 aa  202  6e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6059  transcriptional regulator, MerR family  36.86 
 
 		 258 aa  146  3e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0868  transcriptional regulator, MerR family  43.92 
 
 		 254 aa  143  3e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.915054 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5341  MerR family transcriptional regulator  34.4 
 
 		 260 aa  126  3e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.138898  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5430  MerR family transcriptional regulator  34.4 
 
 		 260 aa  126  3e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.792567  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5720  MerR family transcriptional regulator  34 
 
 		 260 aa  125  6e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2662  transcriptional regulator, MerR family  54.46 
 
 		 126 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00193678  hitchhiker  0.00916479 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2659  transcriptional regulator, MerR family  37.8 
 
 		 246 aa  85.9  6e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.587322  normal  0.281971 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09690  predicted transcriptional regulator  40.38 
 
 		 290 aa  82.8  0.000000000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.311796  normal  0.878429 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0913  transcriptional regulator, MerR family  32.1 
 
 		 260 aa  77.8  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.251711  normal  0.260144 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0668  transcriptional regulator, MerR family  42.59 
 
 		 272 aa  75.1  0.000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000812117  hitchhiker  0.0000325432 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4378  transcriptional regulator, MerR family  42.48 
 
 		 242 aa  75.1  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8430  putative transcriptional regulator, MerR family  34.92 
 
 		 251 aa  72  0.000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.750305  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4036  transcriptional regulator, MerR family  35.95 
 
 		 262 aa  71.6  0.00000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000546536  normal  0.0325517 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4229  transcriptional regulator, MerR family  42.16 
 
 		 258 aa  71.6  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1862  transcriptional regulator, MerR family  40.37 
 
 		 247 aa  70.5  0.00000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0767866 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1354  transcriptional regulator, MerR family  38.02 
 
 		 254 aa  71.2  0.00000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3346  transcriptional regulator, MerR family  44 
 
 		 241 aa  70.1  0.00000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.152739  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3990  transcriptional regulator, MerR family  40.38 
 
 		 248 aa  68.2  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.340501  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2417  putative transcriptional regulator, MerR family  50.77 
 
 		 304 aa  68.2  0.0000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1534  transcriptional regulator, MerR family  40 
 
 		 249 aa  68.6  0.0000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0334786  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1345  transcriptional regulator, MerR family  36.92 
 
 		 246 aa  66.6  0.0000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4880  transcriptional regulator, MerR family  31.3 
 
 		 249 aa  66.2  0.0000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35600  predicted transcriptional regulator  41.24 
 
 		 319 aa  66.2  0.0000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.172761  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1265  transcriptional regulator, MerR family  43.24 
 
 		 252 aa  65.5  0.0000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3594  transcriptional regulator, MerR family  36.97 
 
 		 278 aa  65.1  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4282  transcriptional regulator, MerR family  42.86 
 
 		 308 aa  63.5  0.000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.416101  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3862  precorrin-8X methylmutase  38.1 
 
 		 368 aa  63.2  0.000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.268065  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2419  regulatory protein, MerR  43.14 
 
 		 246 aa  61.6  0.00000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.110485  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5097  transcriptional regulator, MerR family  42.65 
 
 		 303 aa  59.7  0.00000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0313452 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3285  transcriptional regulator, MerR family  36.27 
 
 		 272 aa  58.2  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.235229  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2107  regulatory protein, MerR:Albicidin resistance  37.86 
 
 		 342 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.814054  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2453  transcriptional regulator, MerR family  35.11 
 
 		 155 aa  57.4  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00000100878  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1517  MerR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 342 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.242009 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0047  MerR family transcriptional regulator  45.36 
 
 		 264 aa  57  0.0000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0339  MerR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 253 aa  56.6  0.0000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.841288 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1943  transcriptional regulator of MerR family protein  41.18 
 
 		 135 aa  56.6  0.0000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.555422  normal  0.0105773 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5038  MerR family transcriptional regulator  34.86 
 
 		 342 aa  56.2  0.0000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.99192 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2640  transcriptional regulator, MerR family  25 
 
 		 283 aa  56.2  0.0000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1955  MerR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 128 aa  56.2  0.0000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1755  MerR family transcriptional regulator  29.1 
 
 		 342 aa  55.8  0.0000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.581641  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6337  MerR family transcriptional regulator  29.1 
 
 		 342 aa  55.8  0.0000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1742  MerR family transcriptional regulator  29.1 
 
 		 342 aa  55.8  0.0000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20960  predicted transcriptional regulator  41.96 
 
 		 310 aa  55.8  0.0000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.376744  normal  0.903432 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34160  predicted transcriptional regulator  42.86 
 
 		 278 aa  55.5  0.0000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.153651 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0824  MerR family transcriptional regulator  44.12 
 
 		 300 aa  55.5  0.0000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.39583  normal  0.651241 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1032  transcriptional regulator, MerR family  31.97 
 
 		 144 aa  55.5  0.0000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.920994  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1663  MerR family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 343 aa  55.5  0.0000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.350781  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2836  transcriptional regulator, MerR family  39.62 
 
 		 135 aa  55.1  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.906455  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2170  transcriptional regulator, MerR family  30.08 
 
 		 133 aa  55.1  0.000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000807108 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1851  MerR family transcriptional regulator  34.26 
 
 		 162 aa  54.7  0.000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.138506  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1079  TipAS antibiotic-recognition domain-containing protein  41.79 
 
 		 252 aa  53.9  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.23199 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3961  MerR family transcriptional regulator  40.58 
 
 		 142 aa  53.9  0.000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.146237  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4834  transcriptional regulator, MerR family  41.79 
 
 		 144 aa  54.3  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.300455  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4400  transcriptional regulator, MerR family  30.2 
 
 		 303 aa  54.3  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.462564  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3623  MerR family transcriptional regulator  40.58 
 
 		 142 aa  53.9  0.000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4091  MerR family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 138 aa  53.9  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.903901  normal  0.433272 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3346  transcriptional regulator, MerR family  30.38 
 
 		 252 aa  53.5  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00536383  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2323  putative transcriptional regulator MerR  41.79 
 
 		 144 aa  53.5  0.000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2819  transcriptional regulator, MerR family protein  33.33 
 
 		 129 aa  53.5  0.000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2028  transcriptional regulator, MerR family  33.33 
 
 		 283 aa  53.5  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000014266  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4950  regulatory protein, MerR  34.07 
 
 		 146 aa  53.5  0.000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0034872 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1339  transcriptional regulator of MerR family protein  39.71 
 
 		 130 aa  53.9  0.000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00438  DNA-binding transcriptional activator of copper-responsive regulon genes  32.69 
 
 		 135 aa  53.1  0.000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3123  transcriptional regulator, MerR family  32.69 
 
 		 135 aa  53.1  0.000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.856714  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1339  mercuric resistance operon regulatory protein  35.87 
 
 		 135 aa  53.5  0.000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00443  hypothetical protein  32.69 
 
 		 135 aa  53.1  0.000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0803  HTH-type transcriptional regulator CueR (copper export regulator)  38.75 
 
 		 132 aa  53.1  0.000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0530  DNA-binding transcriptional regulator CueR  32.69 
 
 		 135 aa  53.1  0.000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0586  DNA-binding transcriptional regulator CueR  32.69 
 
 		 135 aa  53.1  0.000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.775911 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0526  DNA-binding transcriptional regulator CueR  32.69 
 
 		 135 aa  53.1  0.000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0422  DNA-binding transcriptional regulator CueR  32.69 
 
 		 135 aa  53.1  0.000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0566  DNA-binding transcriptional regulator CueR  32.69 
 
 		 135 aa  53.1  0.000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2868  MerR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 129 aa  53.1  0.000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000311414  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2198  MerR family transcriptional regulator  38.3 
 
 		 135 aa  53.5  0.000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4014  MerR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 144 aa  53.1  0.000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3129  DNA-binding transcriptional regulator CueR  32.69 
 
 		 135 aa  53.1  0.000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.943376  hitchhiker  0.0000753695 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1663  MerR family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 343 aa  52.8  0.000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8151  putative transcriptional regulator, MerR family  40.86 
 
 		 302 aa  52.8  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.963489 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1614  transcriptional regulator, MerR family  32.82 
 
 		 295 aa  52.8  0.000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.256957  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0963  DNA-binding transcriptional regulator CueR  35.05 
 
 		 136 aa  52.8  0.000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.55262  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4798  MerR family transcriptional regulator  34 
 
 		 136 aa  52.8  0.000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2173  regulatory protein, MerR  35.9 
 
 		 147 aa  52.8  0.000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0159  transcriptional regulator, MerR family  35 
 
 		 135 aa  52.8  0.000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0164  transcriptional regulator, MerR family  35 
 
 		 135 aa  52.8  0.000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.768188  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00890  predicted transcriptional regulator  35 
 
 		 129 aa  52.8  0.000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0548  DNA-binding transcriptional regulator CueR  34.02 
 
 		 138 aa  52.8  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1357  MerR family transcriptional regulator  30.63 
 
 		 342 aa  52.8  0.000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.744828  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2165  MerR family transcriptional regulator  29.85 
 
 		 343 aa  52.4  0.000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.123028  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0969  MerR family transcriptional regulator  41.79 
 
 		 252 aa  52.4  0.000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00256708  hitchhiker  0.0060004 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5322  transcriptional regulator, MerR family  41.18 
 
 		 320 aa  52.4  0.000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3026  transcriptional regulator, MerR family  33.61 
 
 		 137 aa  52.4  0.000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4214  putative transcriptional regulator, MerR family  39.13 
 
 		 319 aa  52.4  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.290445  hitchhiker  0.000447036 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0553  DNA-binding transcriptional regulator CueR  34.02 
 
 		 138 aa  52  0.000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.985745  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>