More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_3990 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_3990  transcriptional regulator, MerR family  100 
 
 		 248 aa  484  1e-136  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.340501  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4229  transcriptional regulator, MerR family  41.96 
 
 		 258 aa  198  7.999999999999999e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1345  transcriptional regulator, MerR family  46.19 
 
 		 246 aa  198  7.999999999999999e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3346  transcriptional regulator, MerR family  42.06 
 
 		 241 aa  175  7e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.152739  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1862  transcriptional regulator, MerR family  41.7 
 
 		 247 aa  157  1e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0767866 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1354  transcriptional regulator, MerR family  39.42 
 
 		 254 aa  157  2e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1265  transcriptional regulator, MerR family  41.28 
 
 		 252 aa  152  5e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4378  transcriptional regulator, MerR family  38.84 
 
 		 242 aa  147  2.0000000000000003e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0668  transcriptional regulator, MerR family  36.09 
 
 		 272 aa  101  9e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000812117  hitchhiker  0.0000325432 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2659  transcriptional regulator, MerR family  44.95 
 
 		 246 aa  94.4  1e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.587322  normal  0.281971 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0868  transcriptional regulator, MerR family  39.42 
 
 		 254 aa  71.2  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.915054 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4873  MerR family transcriptional regulator  36.02 
 
 		 260 aa  70.9  0.00000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.686737  normal  0.0317113 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2048  transcriptional regulator, MerR family  41.51 
 
 		 265 aa  70.1  0.00000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.144756 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0913  transcriptional regulator, MerR family  37.07 
 
 		 260 aa  70.1  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.251711  normal  0.260144 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0543  transcriptional regulator, MerR family  40.4 
 
 		 252 aa  70.1  0.00000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8874  transcriptional regulator, MerR family  38.61 
 
 		 249 aa  68.9  0.00000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1534  transcriptional regulator, MerR family  31.96 
 
 		 249 aa  68.9  0.00000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0334786  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2419  regulatory protein, MerR  42.73 
 
 		 246 aa  68.2  0.0000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.110485  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4036  transcriptional regulator, MerR family  32.37 
 
 		 262 aa  67.4  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000546536  normal  0.0325517 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8430  putative transcriptional regulator, MerR family  52.54 
 
 		 251 aa  67.4  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.750305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4382  regulatory protein, MerR  43.14 
 
 		 256 aa  67.4  0.0000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.534251 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6059  transcriptional regulator, MerR family  40 
 
 		 258 aa  66.6  0.0000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0374  MerR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 254 aa  65.5  0.0000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0448793  hitchhiker  0.00531151 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2170  transcriptional regulator, MerR family  36.08 
 
 		 133 aa  64.7  0.000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000807108 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5720  MerR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 260 aa  65.1  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5341  MerR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 260 aa  65.1  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.138898  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5430  MerR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 260 aa  65.1  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.792567  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3456  MerR family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 149 aa  63.9  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2015  putative transcriptional regulator, MerR family  43.48 
 
 		 264 aa  63.9  0.000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2640  transcriptional regulator, MerR family  46.77 
 
 		 283 aa  64.3  0.000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5280  transcriptional regulator CadR  34.34 
 
 		 148 aa  63.5  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3299  MerR family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 149 aa  63.5  0.000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0169089  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3133  MerR family transcriptional regulator  32.46 
 
 		 139 aa  63.5  0.000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.845727  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2028  transcriptional regulator, MerR family  36.79 
 
 		 283 aa  63.9  0.000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000014266  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2819  transcriptional regulator, MerR family protein  31.73 
 
 		 129 aa  63.9  0.000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2173  regulatory protein, MerR  31.73 
 
 		 147 aa  63.2  0.000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4880  transcriptional regulator, MerR family  48.39 
 
 		 249 aa  62.8  0.000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2662  transcriptional regulator, MerR family  38.05 
 
 		 126 aa  62  0.000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00193678  hitchhiker  0.00916479 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3594  transcriptional regulator, MerR family  35.29 
 
 		 278 aa  61.6  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3726  MerR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 140 aa  61.6  0.00000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4838  regulatory protein, MerR  34.34 
 
 		 148 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2633  Cd(II)/Pb(II)-responsive transcriptional regulator  32.28 
 
 		 162 aa  60.8  0.00000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.673518 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4237  MerR family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 136 aa  60.8  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.428618  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1755  MerR family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 342 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.581641  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2831  MerR family transcriptional regulator  33.91 
 
 		 175 aa  60.5  0.00000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.116752 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6337  MerR family transcriptional regulator  31.28 
 
 		 342 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1742  MerR family transcriptional regulator  31.28 
 
 		 342 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3108  MerR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 154 aa  60.1  0.00000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.798682  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3609  transcriptional regulator, MerR family  34.78 
 
 		 288 aa  60.1  0.00000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.279155  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1617  putative transcriptional regulator, MerR family  42.22 
 
 		 252 aa  59.7  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.870774 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5038  MerR family transcriptional regulator  30.04 
 
 		 342 aa  59.3  0.00000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.99192 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0065  transcriptional regulator, MerR family  44.78 
 
 		 252 aa  58.9  0.00000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3680  transcriptional regulator, MerR family  32.38 
 
 		 133 aa  58.9  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.446637  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1255  mercuric resistance operon regulatory protein MerR  30.83 
 
 		 130 aa  58.9  0.00000008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3237  MerR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 137 aa  58.9  0.00000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0137  MerR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 145 aa  58.9  0.00000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34160  predicted transcriptional regulator  33.33 
 
 		 278 aa  57.8  0.0000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.153651 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09690  predicted transcriptional regulator  35.89 
 
 		 290 aa  58.5  0.0000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.311796  normal  0.878429 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2417  putative transcriptional regulator, MerR family  44.07 
 
 		 304 aa  57.8  0.0000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1943  transcriptional regulator of MerR family protein  30.48 
 
 		 135 aa  58.2  0.0000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.555422  normal  0.0105773 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4282  transcriptional regulator, MerR family  40.62 
 
 		 308 aa  57.4  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.416101  normal  1 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0129  hypothetical protein  36.36 
 
 		 347 aa  57.8  0.0000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.257512  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1413  hypothetical protein  39.39 
 
 		 315 aa  57.4  0.0000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4226  MerR family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 150 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.795335  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1663  MerR family transcriptional regulator  29.8 
 
 		 343 aa  57  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.350781  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0831  MerR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 145 aa  57.8  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1517  MerR family transcriptional regulator  37.86 
 
 		 342 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.242009 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3209  MerR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 138 aa  56.6  0.0000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13367  MerR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 146 aa  57  0.0000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.272142  normal  1 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0073  hypothetical protein  37.88 
 
 		 314 aa  56.6  0.0000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.0572864  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2024  mercuric resistance operon regulatory protein MerR  30.08 
 
 		 130 aa  55.8  0.0000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3410  hypothetical protein  34.29 
 
 		 142 aa  55.8  0.0000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2572  MerR family transcriptional regulator  32.11 
 
 		 141 aa  55.8  0.0000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.957862  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2325  MerR family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 135 aa  55.5  0.0000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0171  MerR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 134 aa  55.5  0.0000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3620  transcriptional regulator, MerR family  28.57 
 
 		 148 aa  55.5  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2494  transcriptional regulator, MerR family  28.57 
 
 		 148 aa  55.5  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.453842  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4536  transcriptional regulator, MerR family  34.65 
 
 		 146 aa  55.5  0.0000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.228678  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5193  MerR family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 147 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1581  hypothetical protein  37.88 
 
 		 315 aa  55.1  0.000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2256  MerR family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 144 aa  55.1  0.000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1790  transcriptional regulator  35.94 
 
 		 141 aa  54.7  0.000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.269282  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0420  transcriptional regulator, MerR family  32.98 
 
 		 255 aa  55.1  0.000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3662  transcriptional regulator, MerR family  36.75 
 
 		 146 aa  54.7  0.000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1304  zinc-responsive transcriptional regulator  37.96 
 
 		 140 aa  54.7  0.000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6346  MerR family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 128 aa  55.1  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.240028  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25610  predicted transcriptional regulator  34.82 
 
 		 129 aa  54.7  0.000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10060  Cu(I)-responsive transcriptional regulator, MerR family  35.24 
 
 		 138 aa  54.7  0.000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.198613  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1646  MerR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 133 aa  55.1  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5140  MerR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 147 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2675  MerR family transcriptional regulator  38.82 
 
 		 150 aa  54.3  0.000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.995117  normal  0.398735 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0339  MerR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 253 aa  54.7  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.841288 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0437  MerR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 161 aa  53.9  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1678  MerR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 132 aa  54.3  0.000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5013  MerR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 147 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2739  MerR family transcriptional regulator  45.1 
 
 		 253 aa  54.3  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0220  MerR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 135 aa  53.5  0.000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0194  MerR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 135 aa  53.5  0.000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0470  putative transcriptional regulator, MerR family  30.77 
 
 		 133 aa  53.5  0.000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6757  MerR family transcriptional regulator  35.4 
 
 		 128 aa  53.9  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.288009  normal  0.0279244 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>