More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_6980 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_6980  transcriptional regulator, MerR family  100 
 
 		 299 aa  587  1e-166  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4214  putative transcriptional regulator, MerR family  49.17 
 
 		 319 aa  250  2e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.290445  hitchhiker  0.000447036 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5322  transcriptional regulator, MerR family  48.43 
 
 		 320 aa  239  5e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35600  predicted transcriptional regulator  43.23 
 
 		 319 aa  233  3e-60  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.172761  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8151  putative transcriptional regulator, MerR family  44.01 
 
 		 302 aa  222  7e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.963489 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1614  transcriptional regulator, MerR family  42.38 
 
 		 295 aa  221  9e-57  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.256957  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5097  transcriptional regulator, MerR family  43.56 
 
 		 303 aa  213  1.9999999999999998e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0313452 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0824  MerR family transcriptional regulator  44.63 
 
 		 300 aa  177  1e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.39583  normal  0.651241 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4400  transcriptional regulator, MerR family  48.65 
 
 		 303 aa  167  2e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.462564  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2162  transcriptional regulator, MerR family  36.22 
 
 		 338 aa  166  5e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0710491 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3003  transcriptional regulator, MerR family  36.86 
 
 		 339 aa  158  1e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.101668  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1311  MerR family transcriptional regulator  38 
 
 		 330 aa  139  6e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.852377  normal  0.0692282 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1354  regulatory protein, MerR  42.33 
 
 		 333 aa  135  9.999999999999999e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2075  MerR family transcriptional regulator  39.42 
 
 		 304 aa  72.8  0.000000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.491392 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3925  MerR family transcriptional regulator  46.27 
 
 		 147 aa  66.2  0.0000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.847498  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2779  MerR family transcriptional regulator  40.24 
 
 		 180 aa  65.1  0.000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.573882  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0802  MerR family transcriptional regulator  44.78 
 
 		 165 aa  64.7  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0285806 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3209  MerR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 138 aa  63.5  0.000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2028  transcriptional regulator, MerR family  26.5 
 
 		 283 aa  63.5  0.000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000014266  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2780  MerR family transcriptional regulator  44.62 
 
 		 144 aa  63.5  0.000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.891963  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4962  MerR family transcriptional regulator  27.17 
 
 		 253 aa  63.5  0.000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1484  MerR family transcriptional regulator  35.35 
 
 		 126 aa  63.5  0.000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.944176  normal  0.368372 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3393  transcriptional regulator, MerR family  41.43 
 
 		 254 aa  63.2  0.000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.988274  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2443  MerR family transcriptional regulator  50 
 
 		 140 aa  63.2  0.000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3373  MerR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 136 aa  63.2  0.000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0297855  normal  0.469131 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2326  MerR family transcriptional regulator  33.93 
 
 		 150 aa  62.8  0.000000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2470  MerR family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 138 aa  62.4  0.000000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4917  MerR family transcriptional regulator  44.62 
 
 		 186 aa  62.4  0.000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00475602 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1534  MerR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 182 aa  61.6  0.00000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1339  transcriptional regulator of MerR family protein  39.39 
 
 		 130 aa  62  0.00000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1498  MerR family transcriptional regulator  29.1 
 
 		 163 aa  62  0.00000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2284  transcriptional regulator, MerR family  42.16 
 
 		 215 aa  60.8  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0221  MerR family transcriptional regulator  29.85 
 
 		 149 aa  61.2  0.00000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.998323  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3192  MerR family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 126 aa  61.2  0.00000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.375407 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1687  MerR family transcriptional regulator  32.71 
 
 		 129 aa  61.6  0.00000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0211  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  29.85 
 
 		 149 aa  61.2  0.00000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4848  MerR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 254 aa  61.2  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4862  MerR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 254 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5255  transcriptional regulator, MerR family  30.56 
 
 		 253 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2141  MerR family transcriptional regulator  42.16 
 
 		 181 aa  61.2  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0481912  normal  0.077667 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2195  transcriptional regulator, MerR family  42.16 
 
 		 214 aa  61.2  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0295  MerR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 149 aa  61.2  0.00000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5331  transcriptional regulator, MerR family  30.56 
 
 		 253 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2847  transcriptional regulator, MerR family  32.08 
 
 		 169 aa  61.6  0.00000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.444422  hitchhiker  0.0000160217 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3237  MerR family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 137 aa  60.8  0.00000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1504  MerR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 166 aa  61.6  0.00000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5020  MerR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 254 aa  60.8  0.00000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5400  MerR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 253 aa  60.8  0.00000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1662  MerR family transcriptional regulator  42.16 
 
 		 215 aa  60.5  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.727696  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3216  transcriptional regulator, MerR family  33.93 
 
 		 155 aa  60.5  0.00000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5289  transcriptional regulator, MerR family  26.67 
 
 		 251 aa  60.5  0.00000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2588  MerR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 129 aa  60.1  0.00000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0158199 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2655  MerR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 129 aa  60.1  0.00000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2900  MerR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 140 aa  60.1  0.00000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0802  transcriptional regulator, MerR family  33.93 
 
 		 142 aa  60.1  0.00000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3339  MerR family transcriptional regulator  37.37 
 
 		 157 aa  59.7  0.00000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.88053  normal  0.266963 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3542  transcriptional regulator, MerR family  33.93 
 
 		 152 aa  59.7  0.00000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.387014 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5668  transcriptional regulator, MerR family  29.86 
 
 		 253 aa  59.7  0.00000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009008  RSP_4277  MerR family transcriptional regulator  38.83 
 
 		 140 aa  59.7  0.00000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4117  MerR family transcriptional regulator  46.03 
 
 		 140 aa  59.7  0.00000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2558  MerR family transcriptional regulator  37.07 
 
 		 139 aa  59.3  0.00000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2198  transcriptional regulator, MerR family  34.29 
 
 		 134 aa  59.3  0.00000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0812  MerR family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 143 aa  58.9  0.00000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4624  transcriptional regulator, MerR family  48.48 
 
 		 333 aa  58.9  0.00000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3347  transcription regulator protein  33.33 
 
 		 159 aa  58.5  0.0000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.445877  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0178  MerR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 142 aa  58.9  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0926305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4918  MerR family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 152 aa  58.9  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00502538 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1070  transcriptional regulator, MerR family  30.63 
 
 		 256 aa  58.9  0.0000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.01274  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2152  MerR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 137 aa  58.5  0.0000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.845816  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2992  transcriptional regulator, MerR family  35.48 
 
 		 282 aa  58.2  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.663692  normal  0.0173107 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4072  transcriptional regulator, MerR family  36.73 
 
 		 140 aa  58.9  0.0000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.44146 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4350  transcriptional regulator, MerR family  42.37 
 
 		 131 aa  58.9  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00438  DNA-binding transcriptional activator of copper-responsive regulon genes  42.37 
 
 		 135 aa  58.2  0.0000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3123  transcriptional regulator, MerR family  42.37 
 
 		 135 aa  58.2  0.0000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.856714  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1287  MerR family transcriptional regulator  30.63 
 
 		 250 aa  57.8  0.0000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.917745  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3129  DNA-binding transcriptional regulator CueR  42.37 
 
 		 135 aa  58.2  0.0000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.943376  hitchhiker  0.0000753695 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0526  DNA-binding transcriptional regulator CueR  42.37 
 
 		 135 aa  58.2  0.0000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5275  MerR family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 253 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2773  MerR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 132 aa  57.8  0.0000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4163  transcriptional regulator, MerR family  31.21 
 
 		 275 aa  57.8  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0586  DNA-binding transcriptional regulator CueR  42.37 
 
 		 135 aa  58.2  0.0000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.775911 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0660  MerR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 137 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3979  MerR family transcriptional regulator  37.37 
 
 		 174 aa  58.2  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.00581953  normal  0.426596 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2665  MerR family transcriptional regulator  27.47 
 
 		 639 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0422  DNA-binding transcriptional regulator CueR  42.37 
 
 		 135 aa  58.2  0.0000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0537  MerR family transcriptional regulator  31.73 
 
 		 133 aa  57.8  0.0000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.705155  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0323  transcription regulator family  25.21 
 
 		 253 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0566  DNA-binding transcriptional regulator CueR  42.37 
 
 		 135 aa  58.2  0.0000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2848  MerR family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 142 aa  58.2  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3218  transcriptional regulator, MerR family  27.82 
 
 		 138 aa  57.8  0.0000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00443  hypothetical protein  42.37 
 
 		 135 aa  58.2  0.0000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3486  transcriptional regulator, MerR family  37.14 
 
 		 135 aa  58.2  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2762  MerR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 129 aa  57.8  0.0000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0831  MerR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 145 aa  57.8  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1151  MerR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 133 aa  58.2  0.0000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.100669  hitchhiker  0.000000311334 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0530  DNA-binding transcriptional regulator CueR  42.37 
 
 		 135 aa  58.2  0.0000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3690  regulatory protein, MerR  30.09 
 
 		 143 aa  57.4  0.0000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3726  MerR family transcriptional regulator  32.09 
 
 		 140 aa  57.4  0.0000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0993  MerR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 137 aa  57.4  0.0000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.335093  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3961  MerR family transcriptional regulator  35 
 
 		 142 aa  57.4  0.0000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.146237  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>