More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_3186 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013517  Sterm_3186  transcriptional regulator, MerR family  100 
 
 		 327 aa  666    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3049  MerR family transcriptional regulator  45.43 
 
 		 335 aa  261  1e-68  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0114  transcriptional regulator, MerR family  42.42 
 
 		 329 aa  250  2e-65  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000486675  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2778  transcriptional regulator, MerR family  31.46 
 
 		 305 aa  171  1e-41  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.779446  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2039  MerR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 306 aa  111  2.0000000000000002e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00422777  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03630  transcription activator effector binding  33.33 
 
 		 231 aa  96.7  5e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000171758  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3713  MerR family transcriptional regulator  42.7 
 
 		 97 aa  70.1  0.00000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000895581  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0034  MerR family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 144 aa  69.3  0.00000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1357  MerR family transcriptional regulator  27.87 
 
 		 342 aa  68.2  0.0000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.744828  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1816  transcriptional regulator, MerR family  30.17 
 
 		 144 aa  66.6  0.0000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.228936 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1785  MerR family transcriptional regulator  34.58 
 
 		 134 aa  65.9  0.0000000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.370686  normal  0.0498641 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4579  MerR family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 134 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.923905  decreased coverage  0.00324593 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1663  MerR family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 343 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.350781  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0660  MerR family transcriptional regulator  30 
 
 		 137 aa  63.9  0.000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2836  transcriptional regulator, MerR family  28.45 
 
 		 135 aa  63.2  0.000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.906455  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3844  transcriptional regulator, MerR family  31.67 
 
 		 139 aa  63.2  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.603426 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0653  regulatory protein, MerR  30.91 
 
 		 132 aa  62.8  0.000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1137  transcriptional regulator, MerR family  32.71 
 
 		 159 aa  62.8  0.000000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5281  MerR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 122 aa  62  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1663  MerR family transcriptional regulator  27.56 
 
 		 343 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1517  MerR family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 342 aa  62  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.242009 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2572  MerR family transcriptional regulator  30.33 
 
 		 141 aa  62  0.00000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.957862  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5283  transcriptional regulator, MerR family  30.25 
 
 		 143 aa  61.6  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5038  MerR family transcriptional regulator  29.92 
 
 		 342 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.99192 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2824  transcriptional regulator, MerR family  45.71 
 
 		 251 aa  62  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00132895  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1642  transcriptional regulator, MerR family  30.25 
 
 		 143 aa  61.6  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.349097  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5860  MerR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 134 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2217  MerR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 134 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5026  MerR family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 121 aa  61.2  0.00000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4871  MerR family transcriptional regulator  30.58 
 
 		 122 aa  60.8  0.00000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2298  MerR family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 343 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5264  transcriptional regulator, MerR family  30.58 
 
 		 122 aa  60.8  0.00000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5407  MerR family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 121 aa  61.2  0.00000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2165  MerR family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 343 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.123028  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3003  transcriptional regulator, MerR family  30.43 
 
 		 339 aa  60.8  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.101668  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2241  MerR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 134 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.388969  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5339  transcriptional regulator, MerR family  30.58 
 
 		 122 aa  60.8  0.00000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2255  MerR family transcriptional regulator  28.79 
 
 		 134 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.198615  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2134  MerR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 134 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.17623  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1060  MerR family transcriptional regulator  28.03 
 
 		 134 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.089973  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0749  transcriptional regulator, heavy metal-dependent  28.45 
 
 		 133 aa  60.5  0.00000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4970  MerR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 122 aa  60.5  0.00000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5545  MerR family transcriptional regulator  28.79 
 
 		 139 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.71393 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2773  MerR family transcriptional regulator  32.71 
 
 		 132 aa  60.5  0.00000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1777  MerR family transcriptional regulator  26.89 
 
 		 145 aa  60.5  0.00000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0630  MerR family transcriptional regulator  29.31 
 
 		 136 aa  60.1  0.00000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000318098 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1534  MerR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 182 aa  60.1  0.00000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4226  MerR family transcriptional regulator  32 
 
 		 150 aa  60.1  0.00000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.795335  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3941  MerR family transcriptional regulator  33.6 
 
 		 128 aa  60.1  0.00000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.708141  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4315  MerR family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 130 aa  60.1  0.00000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0585  MerR family transcriptional regulator  29.31 
 
 		 136 aa  60.1  0.00000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.853287  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2847  transcriptional regulator, MerR family  24.39 
 
 		 169 aa  60.1  0.00000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.444422  hitchhiker  0.0000160217 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1498  MerR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 163 aa  59.7  0.00000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0624  MerR family transcriptional regulator  29.31 
 
 		 136 aa  60.1  0.00000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6337  MerR family transcriptional regulator  26.77 
 
 		 342 aa  59.7  0.00000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1742  MerR family transcriptional regulator  26.77 
 
 		 342 aa  59.7  0.00000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0409  TipAS antibiotic-recognition domain protein  28.97 
 
 		 259 aa  59.7  0.00000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1755  MerR family transcriptional regulator  26.77 
 
 		 342 aa  59.7  0.00000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.581641  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2780  MerR family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 144 aa  59.7  0.00000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.891963  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1504  MerR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 166 aa  59.7  0.00000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2331  MerR family transcriptional regulator  30.91 
 
 		 153 aa  59.7  0.00000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.324696 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1866  transcriptional regulator  44.78 
 
 		 247 aa  59.7  0.00000007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000190425  hitchhiker  0.000000000849298 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3347  transcription regulator protein  31.82 
 
 		 159 aa  59.3  0.00000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.445877  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5351  transcriptional regulator, MerR family  31 
 
 		 144 aa  59.3  0.00000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0379309  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1913  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  34.26 
 
 		 134 aa  59.3  0.00000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0400556  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2041  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  33.96 
 
 		 134 aa  59.3  0.00000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00900822  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0596  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  34.26 
 
 		 134 aa  59.3  0.00000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2107  regulatory protein, MerR:Albicidin resistance  28 
 
 		 342 aa  59.3  0.00000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.814054  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3184  transcriptional regulator, MerR family  31.4 
 
 		 142 aa  59.3  0.00000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0499  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  34.26 
 
 		 144 aa  59.3  0.00000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1241  MerR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 144 aa  59.3  0.00000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18550  predicted transcriptional regulator  38.89 
 
 		 244 aa  59.3  0.00000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4536  transcriptional regulator, MerR family  27.19 
 
 		 146 aa  58.5  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.228678  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4856  MerR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 122 aa  59.3  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35600  predicted transcriptional regulator  27.33 
 
 		 319 aa  58.9  0.0000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.172761  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0017  MerR family transcriptional regulator  30.63 
 
 		 167 aa  58.9  0.0000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.801756 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3299  MerR family transcriptional regulator  25.6 
 
 		 149 aa  58.9  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0169089  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0035  transcriptional regulator, MerR family  30.63 
 
 		 167 aa  58.5  0.0000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.987448  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0148  MerR family transcriptional regulator  29.66 
 
 		 257 aa  58.5  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.290112  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0019  transcription activator effector binding  32.56 
 
 		 176 aa  58.9  0.0000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.833859  normal  0.221599 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2144  MerR family transcriptional regulator  33.02 
 
 		 129 aa  58.9  0.0000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.000183728  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10060  Cu(I)-responsive transcriptional regulator, MerR family  30.84 
 
 		 138 aa  59.3  0.0000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.198613  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0080  transcriptional regulator, MerR family  40.85 
 
 		 137 aa  58.9  0.0000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.671013 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2841  zinc-responsive transcriptional regulator  32.73 
 
 		 139 aa  58.9  0.0000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0481985  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0385  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  29.91 
 
 		 154 aa  58.9  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000075209 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0162  MerR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 119 aa  58.2  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0543  transcriptional regulator, MerR family  32.41 
 
 		 158 aa  58.2  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.166066  hitchhiker  0.000000593111 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5294  transcriptional regulator, MerR family  29.75 
 
 		 122 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2814  transcriptional regulator, MerR family  40.3 
 
 		 138 aa  58.2  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2588  MerR family transcriptional regulator  28.83 
 
 		 129 aa  58.2  0.0000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0158199 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3242  transcriptional regulator, MerR family  31.13 
 
 		 132 aa  58.5  0.0000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0186  transcriptional regulator, AraC family  28.49 
 
 		 452 aa  58.2  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1328  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  31.78 
 
 		 142 aa  58.2  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.185828  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1967  MerR family transcriptional regulator  30.19 
 
 		 141 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.775323  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0373  transcriptional regulator, MerR family  32.41 
 
 		 158 aa  58.2  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2683  MerR family transcriptional regulator  31.73 
 
 		 142 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.903809  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2918  transcriptional regulator, MerR family  23.81 
 
 		 154 aa  57.4  0.0000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.247446  normal  0.104462 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3161  MerR family transcriptional regulator  29.09 
 
 		 155 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.309754 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2694  MerR family transcriptional regulator  31.73 
 
 		 142 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2655  zinc-responsive transcriptional regulator  32.71 
 
 		 133 aa  57.4  0.0000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>