More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_3713 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_3713  MerR family transcriptional regulator  100 
 
 		 97 aa  193  6e-49  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000895581  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0114  transcriptional regulator, MerR family  46.51 
 
 		 329 aa  82.8  0.000000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000486675  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3049  MerR family transcriptional regulator  43.18 
 
 		 335 aa  76.3  0.0000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3186  transcriptional regulator, MerR family  42.7 
 
 		 327 aa  70.1  0.000000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2778  transcriptional regulator, MerR family  39.36 
 
 		 305 aa  69.3  0.00000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.779446  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18550  predicted transcriptional regulator  39.44 
 
 		 244 aa  62  0.000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0148  MerR family transcriptional regulator  35.87 
 
 		 257 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.290112  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0420  MerR family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 258 aa  57.4  0.00000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5104  transcriptional activator tipA, putative  35.37 
 
 		 243 aa  55.5  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4836  transcriptional activator tipA  35.37 
 
 		 243 aa  55.8  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0129  putative transcriptional activator tipA  37.88 
 
 		 244 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.634344  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5071  putative transcriptional activator tipA  35.37 
 
 		 243 aa  55.5  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5200  transcriptional activator tipA  35.37 
 
 		 243 aa  55.8  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5109  putative transcriptional activator tipA  35.37 
 
 		 243 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00019726  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1919  MerR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 268 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0931546  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5111  putative transcriptional activator tipA  36.36 
 
 		 244 aa  54.7  0.0000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.252328  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4678  transcriptional activator  35.37 
 
 		 243 aa  54.7  0.0000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1617  putative transcriptional regulator, MerR family  34.85 
 
 		 252 aa  54.7  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.870774 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0420  transcriptional regulator, MerR family  30.56 
 
 		 255 aa  54.3  0.0000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4694  transcriptional activator  37.88 
 
 		 243 aa  53.9  0.0000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4791  MerR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 241 aa  53.9  0.0000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1357  MerR family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 342 aa  53.9  0.0000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.744828  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24960  predicted transcriptional regulator  23.91 
 
 		 270 aa  53.5  0.0000009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0745  aldo/keto reductase  31.58 
 
 		 449 aa  51.6  0.000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1320  transcriptional regulator, MerR family  37.31 
 
 		 255 aa  50.8  0.000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0065  transcriptional regulator, MerR family  30.26 
 
 		 252 aa  51.2  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0088  hypothetical protein  32.39 
 
 		 253 aa  50.8  0.000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3564  MerR family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 245 aa  50.4  0.000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1655  MerR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 237 aa  50.1  0.00001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.112658  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1972  MerR family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 238 aa  50.1  0.00001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1083  transcriptional regulator, MerR family  36.51 
 
 		 254 aa  49.7  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0124198  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0276  MerR family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 288 aa  50.1  0.00001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000161709  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0411  MerR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 169 aa  49.7  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.715886  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0950  MerR family transcriptional regulator  35 
 
 		 63 aa  49.3  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.823957  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4962  MerR family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 253 aa  48.9  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23430  predicted transcriptional regulator  28.79 
 
 		 271 aa  48.9  0.00002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0376314  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1773  transcriptional regulator, MerR family  40.54 
 
 		 142 aa  48.9  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3653  transcriptional regulator, MerR family  30.67 
 
 		 234 aa  48.9  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.885436  normal  0.0353896 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3346  transcriptional regulator, MerR family  34.38 
 
 		 252 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00536383  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2895  transcriptional regulator, MerR family  32.93 
 
 		 269 aa  49.3  0.00002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3016  MerR family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 252 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0080  transcriptional regulator, MerR family  35.71 
 
 		 137 aa  48.9  0.00003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.671013 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2165  MerR family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 343 aa  48.1  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.123028  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3676  transcriptional regulator, MerR family  32.39 
 
 		 143 aa  48.1  0.00004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.511555  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3675  MerR family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 270 aa  48.1  0.00004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.325472  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2173  regulatory protein, MerR  35.21 
 
 		 147 aa  48.1  0.00004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0323  transcription regulator family  30.43 
 
 		 253 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0140  putative transcriptional regulator, MerR family  38.03 
 
 		 126 aa  48.1  0.00004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0752186 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0271  MerR family transcriptional regulator  25 
 
 		 156 aa  48.1  0.00004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5502  MerR family transcriptional regulator  44 
 
 		 135 aa  47.8  0.00005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5221  MerR family transcriptional regulator  44 
 
 		 135 aa  47.8  0.00005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5456  transcriptional regulator, MerR family  44 
 
 		 135 aa  47.8  0.00005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5053  MerR family transcriptional regulator  44 
 
 		 135 aa  47.8  0.00005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5069  MerR family transcriptional regulator  44 
 
 		 135 aa  47.8  0.00005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.587051  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5464  transcriptional regulator, MerR family  44 
 
 		 135 aa  47.8  0.00005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5621  MerR family transcriptional regulator  44 
 
 		 135 aa  47.8  0.00005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5550  transcriptional regulator, MerR family  44 
 
 		 135 aa  47.8  0.00005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5166  MerR family transcriptional regulator  44 
 
 		 135 aa  47.8  0.00005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0409  TipAS antibiotic-recognition domain protein  28.17 
 
 		 259 aa  47.4  0.00006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2107  regulatory protein, MerR:Albicidin resistance  34.38 
 
 		 342 aa  47.8  0.00006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.814054  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3712  MerR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 251 aa  47.4  0.00007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2617  transcriptional regulator MerR family  35.63 
 
 		 130 aa  47.4  0.00007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0874214  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0537  MerR family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 133 aa  47.4  0.00007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.705155  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1256  transcriptional regulator, MerR family  38.98 
 
 		 142 aa  47.4  0.00007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2008  transcriptional regulator, MerR family  35.82 
 
 		 191 aa  47.4  0.00007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1394  MerR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 188 aa  47.4  0.00007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1895  transcriptional regulator, MerR family  31.71 
 
 		 260 aa  47  0.00009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000198345  unclonable  1.71834e-16 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4039  MerR family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 130 aa  47  0.00009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.576602  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4917  MerR family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 186 aa  47  0.00009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00475602 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64500  putative transcriptional regulator  32.35 
 
 		 270 aa  47  0.00009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2211  MerR family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 166 aa  46.6  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.132223  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1962  transcriptional regulator, MerR family  31.51 
 
 		 250 aa  46.6  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0041  MerR family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 166 aa  46.6  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.21109  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1366  MerR family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 166 aa  46.6  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0373128  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1856  MerR family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 166 aa  46.6  0.0001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.424581  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4916  multidrug-efflux transporter 1 regulator  33.9 
 
 		 64 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2377  MerR family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 166 aa  46.6  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04780  transcriptional regulator, MerR family  36.07 
 
 		 118 aa  46.6  0.0001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000795596  normal  0.576293 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4050  MerR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 122 aa  46.2  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2216  MerR family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 166 aa  46.6  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.741024  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2249  MerR family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 166 aa  46.2  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.391648  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2364  MerR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 188 aa  46.2  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0143687  normal  0.157085 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1663  MerR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 343 aa  46.2  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0331  putative transcriptional activator tipA  28 
 
 		 249 aa  46.6  0.0001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.275925  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1663  MerR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 343 aa  46.2  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.350781  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1127  MerR family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 166 aa  46.6  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0247655  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0535  transcriptional regulator, MerR family  35.59 
 
 		 254 aa  46.2  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.438553  normal  0.258616 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0478  MerR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 146 aa  46.2  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14720  predicted transcriptional regulator  28.57 
 
 		 148 aa  45.8  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.590627  normal  0.772199 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2298  MerR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 343 aa  45.4  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5038  MerR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 342 aa  45.8  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.99192 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1755  MerR family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 342 aa  45.4  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.581641  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2824  transcriptional regulator, MerR family  34.33 
 
 		 251 aa  45.4  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00132895  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5494  transcriptional regulator, MerR family  42 
 
 		 135 aa  45.4  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0836  MerR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 155 aa  46.2  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3609  transcriptional regulator, MerR family  31.75 
 
 		 288 aa  45.8  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.279155  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0626  transcriptional regulator  34.38 
 
 		 115 aa  45.8  0.0002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0211  MerR family transcriptional regulator  26.6 
 
 		 140 aa  45.4  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1820  MerR family transcriptional regulator  30.68 
 
 		 270 aa  46.2  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.404333  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1008  MerR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 253 aa  45.1  0.0003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>