53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_2039 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_2039  MerR family transcriptional regulator  100 
 
 		 306 aa  631  1e-180  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00422777  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3186  transcriptional regulator, MerR family  29.55 
 
 		 327 aa  111  1.0000000000000001e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2778  transcriptional regulator, MerR family  28.34 
 
 		 305 aa  103  4e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.779446  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0114  transcriptional regulator, MerR family  25 
 
 		 329 aa  89.7  5e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000486675  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3049  MerR family transcriptional regulator  24.47 
 
 		 335 aa  86.7  4e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03630  transcription activator effector binding  32.9 
 
 		 231 aa  71.2  0.00000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000171758  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0186  transcriptional regulator, AraC family  34.18 
 
 		 452 aa  63.9  0.000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2100  transcriptional regulator, MerR family  30.19 
 
 		 284 aa  57.4  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.444835  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0208  MerR family regulatory protein  24.81 
 
 		 154 aa  52.8  0.000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.7803  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0411  MerR family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 169 aa  52  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.715886  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0420  MerR family transcriptional regulator  24.38 
 
 		 258 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1008  MerR family transcriptional regulator  28.26 
 
 		 253 aa  51.6  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0226  MerR family transcriptional regulator  24.81 
 
 		 154 aa  51.6  0.00002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1663  MerR family transcriptional regulator  22.78 
 
 		 343 aa  50.4  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0276  MerR family transcriptional regulator  25.68 
 
 		 288 aa  50.1  0.00005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000161709  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1517  MerR family transcriptional regulator  26.73 
 
 		 342 aa  50.1  0.00005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.242009 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1663  MerR family transcriptional regulator  25.74 
 
 		 343 aa  49.3  0.00007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.350781  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4400  transcriptional regulator, MerR family  23.57 
 
 		 303 aa  48.5  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.462564  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5038  MerR family transcriptional regulator  26.73 
 
 		 342 aa  48.9  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.99192 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1742  MerR family transcriptional regulator  24.75 
 
 		 342 aa  47.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1357  MerR family transcriptional regulator  23.76 
 
 		 342 aa  47.4  0.0003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.744828  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1614  transcriptional regulator, MerR family  29.35 
 
 		 295 aa  47.4  0.0003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.256957  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6337  MerR family transcriptional regulator  24.75 
 
 		 342 aa  47.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1697  MerR family transcriptional regulator  22.31 
 
 		 157 aa  47.8  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.115653  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1755  MerR family transcriptional regulator  24.75 
 
 		 342 aa  47.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.581641  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1655  MerR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 237 aa  47  0.0004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.112658  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4703  MerR family transcriptional regulator  25.13 
 
 		 256 aa  47  0.0004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.279975  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4158  MerR family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 135 aa  46.2  0.0006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.144769 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1617  putative transcriptional regulator, MerR family  33.33 
 
 		 252 aa  46.2  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.870774 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1972  MerR family transcriptional regulator  25.49 
 
 		 238 aa  45.8  0.0008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2298  MerR family transcriptional regulator  24.75 
 
 		 343 aa  45.8  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1895  transcriptional regulator, MerR family  24.53 
 
 		 260 aa  45.8  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000198345  unclonable  1.71834e-16 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2144  transcriptional regulator, MerR family  21.02 
 
 		 272 aa  45.4  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2165  MerR family transcriptional regulator  24.75 
 
 		 343 aa  45.4  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.123028  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18550  predicted transcriptional regulator  22.66 
 
 		 244 aa  44.7  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3497  transcriptional regulator, MerR family  34.78 
 
 		 227 aa  44.7  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1320  transcriptional regulator, MerR family  27.27 
 
 		 255 aa  44.7  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5047  MerR family transcriptional regulator  27.66 
 
 		 276 aa  44.7  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.574995  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2107  regulatory protein, MerR:Albicidin resistance  25.56 
 
 		 342 aa  45.1  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.814054  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1150  transcriptional regulator, MerR family  24.35 
 
 		 135 aa  43.9  0.003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00496019 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1826  MerR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 256 aa  44.3  0.003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1657  transcriptional regulator, MerR family  27.59 
 
 		 272 aa  43.5  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1781  transcriptional regulator, MerR family  25.55 
 
 		 254 aa  43.1  0.005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5097  transcriptional regulator, MerR family  27.4 
 
 		 303 aa  43.5  0.005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0313452 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6176  transcriptional regulator, MerR family  31.34 
 
 		 244 aa  43.5  0.005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.700284  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4179  transcriptional activator ligand binding domain protein  27.18 
 
 		 279 aa  43.1  0.006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.803381 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7266  transcriptional regulator, MerR family  27.66 
 
 		 274 aa  43.1  0.007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1563  transcriptional regulator, MerR family  30.68 
 
 		 234 aa  42.7  0.007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.246216  normal  0.968218 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0464  transcriptional regulator, MerR family  24.29 
 
 		 254 aa  42.7  0.007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4163  transcriptional regulator, MerR family  24.47 
 
 		 275 aa  42.7  0.007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0535  transcriptional regulator, MerR family  25 
 
 		 254 aa  42.4  0.009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.438553  normal  0.258616 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0950  MerR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 63 aa  42.4  0.01  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.823957  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0923  MerR family transcriptional regulator  23.85 
 
 		 119 aa  42.4  0.01  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.190958  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>