152 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_1563 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_1563  transcriptional regulator, MerR family  100 
 
 		 234 aa  445  1.0000000000000001e-124  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.246216  normal  0.968218 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5382  transcriptional regulator, MerR family  48.11 
 
 		 301 aa  131  6.999999999999999e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1011  transcriptional regulator, MerR family  41.44 
 
 		 235 aa  126  3e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00242771 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5056  putative transcriptional regulator, MerR family  38.7 
 
 		 227 aa  125  6e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.589555 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0439  MerR family transcriptional regulator  42.17 
 
 		 228 aa  123  2e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1167  transcriptional regulator, MerR family  38.05 
 
 		 235 aa  122  5e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1320  transcriptional regulator, MerR family  44.02 
 
 		 254 aa  118  9e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1948  transcriptional regulator, MerR family  37.02 
 
 		 273 aa  117  9.999999999999999e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.566007  hitchhiker  0.00390596 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5846  transcriptional regulator, MerR family  42.73 
 
 		 245 aa  116  3.9999999999999997e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.411679 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2421  MerR family transcriptional regulator  39.01 
 
 		 242 aa  114  1.0000000000000001e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0993046 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2297  regulatory protein, MerR  38.22 
 
 		 245 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3253  transcriptional regulator, MerR family  37.5 
 
 		 249 aa  103  2e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000117096  decreased coverage  0.00000535061 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1715  MerR family transcriptional regulator  30.57 
 
 		 244 aa  92  7e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.382422  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6176  transcriptional regulator, MerR family  35.83 
 
 		 244 aa  91.7  9e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.700284  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3497  transcriptional regulator, MerR family  40.54 
 
 		 227 aa  90.1  2e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1516  transcriptional regulator, MerR family  23.7 
 
 		 248 aa  71.6  0.000000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3149  transcriptional regulator, MerR family  27.78 
 
 		 253 aa  60.8  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4947  regulatory protein, MerR  38.02 
 
 		 129 aa  51.2  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.459947  decreased coverage  0.00286067 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2141  MerR family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 181 aa  51.6  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0481912  normal  0.077667 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5613  transcriptional regulator, MerR family  47.22 
 
 		 283 aa  51.6  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.395167  normal  0.0913658 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0379  transcriptional regulator, MerR family  39.84 
 
 		 327 aa  50.4  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2278  MerR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 273 aa  49.7  0.00004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.408305  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25610  predicted transcriptional regulator  35.78 
 
 		 129 aa  49.3  0.00005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4880  transcriptional regulator, MerR family  36.96 
 
 		 249 aa  49.3  0.00005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0323  transcription regulator family  32.47 
 
 		 253 aa  49.3  0.00005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06140  predicted transcriptional regulator  36.11 
 
 		 129 aa  48.9  0.00006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3056  transcriptional regulator, MerR family  34.38 
 
 		 344 aa  48.5  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.247137 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1008  transcriptional regulator, MerR family  36.54 
 
 		 110 aa  48.5  0.0001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3218  transcriptional regulator, MerR family  35.82 
 
 		 138 aa  48.1  0.0001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1739  MerR family transcriptional regulator  23.3 
 
 		 141 aa  47.4  0.0002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.784519 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0198  MerR family transcriptional regulator  42.65 
 
 		 137 aa  47.4  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1053  MerR family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 173 aa  47.8  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.582501 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4209  putative transcriptional regulator, MerR family  35.65 
 
 		 145 aa  47.8  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.370014  hitchhiker  0.000986554 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1098  transcriptional regulator, MerR family  35.82 
 
 		 134 aa  47  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1777  MerR family transcriptional regulator  37.35 
 
 		 145 aa  47  0.0003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3455  MerR family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 152 aa  46.6  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.340256  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3507  MerR family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 292 aa  47  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.401792  normal  0.0867153 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4066  MerR family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 152 aa  46.6  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0636  transcriptional regulator, MerR family  33.87 
 
 		 160 aa  46.2  0.0004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1662  MerR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 215 aa  46.2  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.727696  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2316  regulatory protein, MerR  40.28 
 
 		 369 aa  46.2  0.0004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.280801  normal  0.123157 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4528  transcriptional regulator, MerR family  39.71 
 
 		 129 aa  46.2  0.0004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.355526 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2284  transcriptional regulator, MerR family  38.24 
 
 		 215 aa  46.2  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1150  transcriptional regulator, MerR family  33.33 
 
 		 135 aa  45.8  0.0006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00496019 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2195  transcriptional regulator, MerR family  38.24 
 
 		 214 aa  45.8  0.0006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4179  transcriptional activator ligand binding domain protein  37.11 
 
 		 279 aa  45.4  0.0007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.803381 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18180  predicted transcriptional regulator  30.43 
 
 		 152 aa  45.4  0.0007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.575083  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0851  regulatory protein MerR  47.62 
 
 		 222 aa  45.4  0.0008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3534  MerR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 143 aa  45.4  0.0008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0358234  normal  0.617564 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4357  transcriptional regulator, MerR family  44.12 
 
 		 269 aa  45.1  0.0008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00580847 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0751  Resolvase domain protein  46.51 
 
 		 209 aa  45.1  0.0009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1241  Resolvase domain protein  47.62 
 
 		 222 aa  45.1  0.0009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0456632  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22860  predicted transcriptional regulator  39.47 
 
 		 224 aa  44.7  0.001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06160  serine/threonine protein phosphatase  41.79 
 
 		 361 aa  45.1  0.001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2909  MerR family transcriptional regulator  36.27 
 
 		 292 aa  44.3  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3477  MerR family transcriptional regulator  30.84 
 
 		 120 aa  44.7  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.137212  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2781  Resolvase domain protein  47.62 
 
 		 222 aa  44.7  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.912906 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13367  MerR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 146 aa  45.1  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.272142  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2419  protein serine/threonine phosphatase  39.73 
 
 		 355 aa  44.7  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.111892 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1266  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  34.33 
 
 		 139 aa  45.1  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0668949 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3164  MerR family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 139 aa  45.1  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04765  putative transcriptional regulator protein  32.08 
 
 		 109 aa  44.7  0.001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.397475  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4027  transcriptional regulator, MerR family  45.45 
 
 		 269 aa  44.3  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0740  MerR family transcriptional regulator  38.82 
 
 		 299 aa  44.3  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1724  MerR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 134 aa  44.3  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.232228 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0303  transcriptional regulator, MerR family  29.33 
 
 		 154 aa  44.3  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00540997  normal  0.988288 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0963  DNA-binding transcriptional regulator CueR  31.86 
 
 		 136 aa  44.3  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.55262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0768  MerR family transcriptional regulator  38.82 
 
 		 299 aa  44.3  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.819465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3026  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  34.33 
 
 		 139 aa  43.9  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2039  MerR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 306 aa  43.9  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00422777  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22770  predicted transcriptional regulator  40 
 
 		 284 aa  44.3  0.002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0553  DNA-binding transcriptional regulator CueR  31.82 
 
 		 138 aa  43.9  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.985745  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0607  DNA-binding transcriptional regulator CueR  31.82 
 
 		 138 aa  43.9  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0563  DNA-binding transcriptional regulator CueR  31.82 
 
 		 138 aa  43.9  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.620757  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0546  DNA-binding transcriptional regulator CueR  31.82 
 
 		 138 aa  43.9  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0548  DNA-binding transcriptional regulator CueR  31.82 
 
 		 138 aa  43.9  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0803  HTH-type transcriptional regulator CueR (copper export regulator)  32.84 
 
 		 132 aa  43.9  0.002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2841  zinc-responsive transcriptional regulator  30.95 
 
 		 139 aa  43.9  0.002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0481985  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1913  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  36.76 
 
 		 134 aa  43.5  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0400556  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2152  MerR family transcriptional regulator  30.12 
 
 		 137 aa  43.1  0.003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.845816  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2831  MerR family transcriptional regulator  41.86 
 
 		 175 aa  43.1  0.003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.116752 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0596  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  36.76 
 
 		 134 aa  43.5  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0064  MerR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 242 aa  43.5  0.003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3790  MerR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 132 aa  43.5  0.003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0361759  normal  0.548118 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4066  MerR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 132 aa  43.5  0.003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1458  MerR family transcriptional regulator  26.74 
 
 		 161 aa  43.5  0.003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0168574  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0747  MerR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 141 aa  43.5  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1103  MerR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 135 aa  42.7  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.394367  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1604  MerR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 135 aa  42.7  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0392  MerR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 135 aa  42.7  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0882  MerR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 135 aa  42.7  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.656142 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4090  putative MerR/CueR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 137 aa  42.7  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.849727  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0455  MerR family transcriptional regulator  30 
 
 		 261 aa  43.1  0.004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00278493  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4464  MerR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 130 aa  43.1  0.004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4295  MerR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 130 aa  43.1  0.004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4195  MerR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 130 aa  43.1  0.004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1919  MerR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 268 aa  43.1  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0931546  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4678  MerR family transcriptional regulator  46.03 
 
 		 276 aa  43.1  0.004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.825044  normal  0.111013 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3156  MerR family transcriptional regulator  31.08 
 
 		 146 aa  42.7  0.004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.215145  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2009  transcriptional regulator, MerR family  38.81 
 
 		 152 aa  43.1  0.004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>