110 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_3253 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_3253  transcriptional regulator, MerR family  100 
 
 		 249 aa  479  1e-134  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000117096  decreased coverage  0.00000535061 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1320  transcriptional regulator, MerR family  45.85 
 
 		 254 aa  172  5e-42  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1011  transcriptional regulator, MerR family  41.28 
 
 		 235 aa  120  3e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00242771 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5382  transcriptional regulator, MerR family  42.18 
 
 		 301 aa  112  7.000000000000001e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5846  transcriptional regulator, MerR family  38.32 
 
 		 245 aa  103  3e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.411679 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1563  transcriptional regulator, MerR family  37.38 
 
 		 234 aa  100  1e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.246216  normal  0.968218 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0439  MerR family transcriptional regulator  32.74 
 
 		 228 aa  87  2e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5056  putative transcriptional regulator, MerR family  31.67 
 
 		 227 aa  87  3e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.589555 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1167  transcriptional regulator, MerR family  33.84 
 
 		 235 aa  86.3  4e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1715  MerR family transcriptional regulator  28.02 
 
 		 244 aa  83.6  0.000000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.382422  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2297  regulatory protein, MerR  31.33 
 
 		 245 aa  83.2  0.000000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1948  transcriptional regulator, MerR family  31.95 
 
 		 273 aa  78.2  0.0000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.566007  hitchhiker  0.00390596 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2421  MerR family transcriptional regulator  31.72 
 
 		 242 aa  77.8  0.0000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0993046 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6176  transcriptional regulator, MerR family  34.05 
 
 		 244 aa  76.6  0.0000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.700284  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3497  transcriptional regulator, MerR family  35.6 
 
 		 227 aa  59.3  0.00000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0194  transcriptional regulator, MerR family  31.58 
 
 		 252 aa  56.6  0.0000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0140  putative transcriptional regulator, MerR family  45.61 
 
 		 126 aa  48.9  0.00008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0752186 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2796  MerR family transcriptional regulator  39.77 
 
 		 132 aa  47.8  0.0001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0478  MerR family transcriptional regulator  35.85 
 
 		 146 aa  48.1  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0379  transcriptional regulator, MerR family  40.28 
 
 		 327 aa  48.5  0.0001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000376  predicted transcriptional regulator LiuR of leucine degradation pathway MerR family  35.51 
 
 		 128 aa  48.1  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1898  transcriptional regulator, putative  34.75 
 
 		 134 aa  47.8  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2321  MerR family transcriptional regulator  34.75 
 
 		 134 aa  47.8  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2393  MerR family transcriptional regulator  34.75 
 
 		 134 aa  47.8  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.790409 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2726  transcriptional regulator, MerR family protein  33.9 
 
 		 136 aa  47.8  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.505695  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1768  MerR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 166 aa  47.4  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1673  MerR family transcriptional regulator  34.75 
 
 		 134 aa  47.8  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2569  MerR family transcriptional regulator  34.19 
 
 		 133 aa  47.8  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1720  MerR family transcriptional regulator  34.75 
 
 		 134 aa  47.4  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2845  MerR family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 135 aa  47.8  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2972  MerR family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 135 aa  47.8  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.54764  normal  0.504684 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1741  MerR family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 166 aa  47.4  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0950545  normal  0.107699 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2244  regulatory protein, MerR  34.19 
 
 		 135 aa  47  0.0003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2827  MerR family transcriptional regulator  34.75 
 
 		 135 aa  47  0.0003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1531  transcriptional regulator, MerR family  34.75 
 
 		 135 aa  47  0.0003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.152534  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3653  MerR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 133 aa  46.6  0.0004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0576381 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1854  MerR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 166 aa  45.8  0.0006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.674161  normal  0.0887351 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3149  transcriptional regulator, MerR family  24.87 
 
 		 253 aa  45.8  0.0006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3222  MerR family transcriptional regulator  33.06 
 
 		 132 aa  45.8  0.0007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.012049 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1516  transcriptional regulator, MerR family  21.51 
 
 		 248 aa  45.8  0.0007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0461  MerR family transcriptional regulator  33.93 
 
 		 174 aa  45.4  0.0008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0313707  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1150  transcriptional regulator, MerR family  36.23 
 
 		 135 aa  44.7  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00496019 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1538  MerR family transcriptional regulator  37.19 
 
 		 153 aa  45.4  0.001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.129222  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6249  MerR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 166 aa  45.1  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.256623  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1830  MerR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 166 aa  45.1  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00524998  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0004  MerR family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 169 aa  45.4  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2152  putative transcriptional regulator, MerR family  30.56 
 
 		 121 aa  45.1  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1459  MerR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 132 aa  45.1  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.425414 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0479  MerR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 354 aa  44.7  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.369084 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2513  transcriptional regulator, MerR family  28.33 
 
 		 230 aa  45.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.106172  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2080  transcriptional regulator, MerR family  26.13 
 
 		 256 aa  44.7  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.632784  hitchhiker  0.000000000732695 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5131  MerR family transcriptional regulator  33.62 
 
 		 166 aa  44.7  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.533425  normal  0.589756 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1103  MerR family transcriptional regulator  40 
 
 		 135 aa  44.3  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.394367  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1117  MerR family transcriptional regulator  40 
 
 		 135 aa  44.3  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2902  MerR family transcriptional regulator  40 
 
 		 135 aa  44.3  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1604  MerR family transcriptional regulator  40 
 
 		 135 aa  44.3  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2912  MerR family transcriptional regulator  40 
 
 		 135 aa  44.3  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0392  MerR family transcriptional regulator  40 
 
 		 135 aa  44.3  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0882  MerR family transcriptional regulator  40 
 
 		 135 aa  44.3  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.656142 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1539  MerR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 292 aa  44.3  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0172454  normal  0.655759 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1866  transcriptional regulator  28.21 
 
 		 247 aa  43.9  0.002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000190425  hitchhiker  0.000000000849298 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1363  MerR family transcriptional regulator  40 
 
 		 134 aa  44.3  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.381305 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0894  MerR family transcriptional regulator  40 
 
 		 135 aa  44.3  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1614  transcriptional regulator, MerR family  31.68 
 
 		 295 aa  43.9  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.256957  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0194  MerR family transcriptional regulator  40 
 
 		 135 aa  44.3  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0220  MerR family transcriptional regulator  40 
 
 		 135 aa  44.3  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05481  hypothetical protein  37.5 
 
 		 127 aa  43.9  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2043  MerR family transcriptional regulator  38.04 
 
 		 155 aa  44.3  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.707806 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0470  putative transcriptional regulator, MerR family  40 
 
 		 133 aa  44.3  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38430  regulatory gene of gnyRDBHAL cluster, GnyR  36.67 
 
 		 134 aa  43.5  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.187805 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3477  MerR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 120 aa  43.5  0.003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.137212  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1865  transcriptional regulator, MerR family  41.1 
 
 		 128 aa  43.9  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.261396  normal  0.0420495 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2068  transcriptional regulator, MerR family  41.1 
 
 		 128 aa  43.9  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2769  transcriptional regulator, MerR family  28.83 
 
 		 230 aa  43.5  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.545239  normal  0.552398 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5067  MerR family transcriptional regulator  40.86 
 
 		 351 aa  43.1  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.424066  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5793  MerR family transcriptional regulator  40.86 
 
 		 351 aa  43.1  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.998817  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4304  MerR family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 164 aa  43.1  0.004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.614703  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2617  transcriptional regulator MerR family  52.63 
 
 		 130 aa  43.1  0.004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0874214  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2472  regulatory protein, MerR  58.06 
 
 		 130 aa  42.7  0.005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0886191 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0102  regulatory protein, MerR  33.63 
 
 		 130 aa  42.7  0.005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3534  MerR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 143 aa  43.1  0.005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0358234  normal  0.617564 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2325  MerR family transcriptional regulator  40 
 
 		 135 aa  42.7  0.005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0323  transcription regulator family  24.73 
 
 		 253 aa  42.7  0.005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10060  Cu(I)-responsive transcriptional regulator, MerR family  33.04 
 
 		 138 aa  42.7  0.005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.198613  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1617  putative transcriptional regulator, MerR family  31.71 
 
 		 252 aa  43.1  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.870774 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2743  transcriptional regulator, MerR family  58.06 
 
 		 130 aa  42.7  0.006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.785681  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2208  MerR family transcriptional regulator  40 
 
 		 190 aa  42.7  0.006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.194329  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3746  MerR family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 151 aa  42.7  0.006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4002  MerR family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 135 aa  42.4  0.006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1864  MerR family transcriptional regulator  40 
 
 		 198 aa  42.7  0.006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1156  regulatory protein, MerR  29.36 
 
 		 116 aa  42.7  0.006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001544  predicted transcriptional regulator LiuR of leucine degradation pathway MerR family  31.25 
 
 		 124 aa  42.7  0.006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2386  MerR family transcriptional regulator  40 
 
 		 255 aa  42  0.008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3791  MerR family transcriptional regulator  37.8 
 
 		 149 aa  42.4  0.008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.23211 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2300  MerR family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 134 aa  42  0.008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.639917  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2051  transcriptional regulator, MerR family  33.33 
 
 		 158 aa  42  0.008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0266  transcriptional regulator, MerR family  31.82 
 
 		 161 aa  42.4  0.008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00988584 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2421  Cd(II)/Pb(II)-responsive transcriptional regulator  33.33 
 
 		 158 aa  42  0.008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.732276  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4834  transcriptional regulator, MerR family  32.03 
 
 		 144 aa  42.4  0.008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.300455  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2235  MerR family transcriptional regulator  40.54 
 
 		 132 aa  42  0.009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>