260 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_1320 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_1320  transcriptional regulator, MerR family  100 
 
 		 254 aa  483  1e-135  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3253  transcriptional regulator, MerR family  46.33 
 
 		 249 aa  155  7e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000117096  decreased coverage  0.00000535061 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1011  transcriptional regulator, MerR family  42.67 
 
 		 235 aa  135  8e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00242771 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1563  transcriptional regulator, MerR family  44.02 
 
 		 234 aa  118  9.999999999999999e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.246216  normal  0.968218 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5382  transcriptional regulator, MerR family  42.79 
 
 		 301 aa  115  5e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1715  MerR family transcriptional regulator  30.04 
 
 		 244 aa  101  9e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.382422  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5846  transcriptional regulator, MerR family  38.76 
 
 		 245 aa  99.8  4e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.411679 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1167  transcriptional regulator, MerR family  31.63 
 
 		 235 aa  89  6e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5056  putative transcriptional regulator, MerR family  32.02 
 
 		 227 aa  82.8  0.000000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.589555 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2421  MerR family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 242 aa  80.1  0.00000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0993046 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1948  transcriptional regulator, MerR family  27.8 
 
 		 273 aa  76.3  0.0000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.566007  hitchhiker  0.00390596 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0439  MerR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 228 aa  75.5  0.0000000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2297  regulatory protein, MerR  35.27 
 
 		 245 aa  73.2  0.000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3497  transcriptional regulator, MerR family  31.41 
 
 		 227 aa  64.7  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1516  transcriptional regulator, MerR family  22.97 
 
 		 248 aa  65.1  0.000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3788  MerR family transcriptional regulator  32.06 
 
 		 144 aa  62  0.00000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.318416  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6176  transcriptional regulator, MerR family  26.89 
 
 		 244 aa  56.2  0.0000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.700284  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2307  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  31.01 
 
 		 132 aa  54.7  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0094  Hg(II)-responsive transcriptional regulator  33.86 
 
 		 136 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0211  transcriptional regulator, MerR family protein  33.75 
 
 		 148 aa  53.5  0.000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2041  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  32.65 
 
 		 134 aa  53.1  0.000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00900822  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3149  transcriptional regulator, MerR family  27.92 
 
 		 253 aa  52  0.000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1913  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  31.63 
 
 		 134 aa  52  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0400556  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3704  MerR family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 116 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0596  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  31.63 
 
 		 134 aa  52  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0271  MerR family transcriptional regulator  24.03 
 
 		 156 aa  51.6  0.00001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2106  MerR family transcriptional regulator  43.59 
 
 		 156 aa  51.2  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.63412  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2284  transcriptional regulator, MerR family  38.46 
 
 		 215 aa  50.1  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3492  transcriptional regulator, MerR family protein  28.69 
 
 		 135 aa  50.1  0.00003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2195  transcriptional regulator, MerR family  38.46 
 
 		 214 aa  49.7  0.00004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0194  transcriptional regulator, MerR family  29.29 
 
 		 252 aa  49.7  0.00004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0499  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  30.61 
 
 		 144 aa  49.7  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4304  MerR family transcriptional regulator  31.53 
 
 		 164 aa  49.3  0.00005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.614703  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1662  MerR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 215 aa  49.3  0.00005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.727696  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2241  MerR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 134 aa  49.7  0.00005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.388969  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1678  MerR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 132 aa  49.7  0.00005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5860  MerR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 134 aa  49.3  0.00006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2217  MerR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 134 aa  49.3  0.00006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23510  predicted transcriptional regulator  38.16 
 
 		 138 aa  49.3  0.00006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.719058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1336  MerR family transcriptional regulator  29.81 
 
 		 134 aa  49.3  0.00006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0745  aldo/keto reductase  39.29 
 
 		 449 aa  48.9  0.00008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1199  MerR family transcriptional regulator  41.05 
 
 		 138 aa  48.5  0.00009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.00877844  normal  0.661473 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5545  MerR family transcriptional regulator  29.47 
 
 		 139 aa  48.9  0.00009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.71393 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4400  transcriptional regulator, MerR family  34.23 
 
 		 303 aa  48.1  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.462564  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0531  transcriptional regulator, MerR family  39.19 
 
 		 155 aa  48.1  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2024  MerR family transcriptional regulator  28.92 
 
 		 129 aa  48.1  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4072  transcriptional regulator, MerR family  36.46 
 
 		 140 aa  48.1  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.44146 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0433  zinc-responsive transcriptional regulator  28.3 
 
 		 173 aa  47.8  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0237  MerR family transcriptional regulator  33.93 
 
 		 132 aa  47.8  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1967  MerR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 141 aa  47.8  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.775323  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2255  MerR family transcriptional regulator  29.47 
 
 		 134 aa  47.4  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.198615  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2189  MerR family transcriptional regulator  32.46 
 
 		 130 aa  48.1  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3242  transcriptional regulator, MerR family  31.91 
 
 		 132 aa  47.8  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0115  Hg(II)-responsive transcriptional regulator  37.5 
 
 		 132 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.889131  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2770  regulatory protein MerR  31.01 
 
 		 142 aa  47  0.0003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0226  MerR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 154 aa  47  0.0003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1213  transcriptional regulator, MerR family  31.78 
 
 		 144 aa  47  0.0003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.276419  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0886  mercuric resistance operon regulatory protein  36.51 
 
 		 119 aa  47  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.374839  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5193  MerR family transcriptional regulator  29.93 
 
 		 147 aa  47.4  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1217  putative transcriptional regulator MerR  31.01 
 
 		 144 aa  47  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4449  mercuric resistance operon regulatory protein  36.51 
 
 		 119 aa  47  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00937003  normal  0.868186 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4396  transcriptional regulator, MerR family  34.74 
 
 		 133 aa  46.6  0.0004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.742321  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1599  MerR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 131 aa  46.6  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1151  MerR family transcriptional regulator  27.08 
 
 		 133 aa  46.6  0.0004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.100669  hitchhiker  0.000000311334 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2141  MerR family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 181 aa  46.6  0.0004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0481912  normal  0.077667 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02950  Hg(II)-responsive transcriptional regulator  33.33 
 
 		 131 aa  46.6  0.0004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0289893  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4286  transcriptional regulator, MerR family  34.74 
 
 		 133 aa  46.6  0.0004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0144  MerR family transcriptional regulator  31.5 
 
 		 158 aa  46.2  0.0005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0168  putative transcriptional regulator MerR  31.01 
 
 		 144 aa  46.2  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3347  transcription regulator protein  31.96 
 
 		 159 aa  46.2  0.0006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.445877  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2454  transcriptional regulator, MerR family  30.91 
 
 		 159 aa  46.2  0.0006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.589296  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3712  MerR family transcriptional regulator  30 
 
 		 251 aa  45.8  0.0006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3117  transcriptional regulator, MerR family  33.33 
 
 		 86 aa  46.2  0.0006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.484464  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4158  MerR family transcriptional regulator  24.06 
 
 		 135 aa  45.8  0.0006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.144769 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4341  putative transcriptional regulator MerR  29.92 
 
 		 151 aa  45.8  0.0006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6360  transcriptional regulator, MerR family  35.53 
 
 		 152 aa  46.2  0.0006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.241077  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2256  MerR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 144 aa  45.8  0.0007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0677  MerR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 116 aa  45.8  0.0007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00486381  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0297  zinc-responsive transcriptional regulator  27.36 
 
 		 159 aa  45.8  0.0007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3338  transcriptional regulator, MerR family  31.88 
 
 		 124 aa  45.8  0.0007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.770495  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2198  MerR family transcriptional regulator  39.68 
 
 		 135 aa  45.8  0.0007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2170  transcriptional regulator, MerR family  36.47 
 
 		 133 aa  45.8  0.0007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000807108 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0443  zinc-responsive transcriptional regulator  37.7 
 
 		 163 aa  45.4  0.0008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1287  MerR family transcriptional regulator  40.48 
 
 		 155 aa  45.4  0.0008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.422706  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0203  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  28.07 
 
 		 135 aa  45.4  0.0008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1329  transcriptional regulator, MerR family  30.11 
 
 		 142 aa  45.4  0.0009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000000199488  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4898  MerR family transcriptional regulator  29.36 
 
 		 147 aa  44.7  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.627224  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1339  mercuric resistance operon regulatory protein  30.77 
 
 		 135 aa  45.1  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0743  MerR family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 119 aa  45.1  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6498  putative transcriptional regulator MerR  31.01 
 
 		 144 aa  45.1  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0239269  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2954  transcriptional regulator, MerR family  30.11 
 
 		 142 aa  45.4  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7478  MerR family transcriptional regulator  35.87 
 
 		 149 aa  44.7  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0101  putative transcriptional regulator MerR  31.01 
 
 		 144 aa  45.1  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.656805  n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6344  Hg(II) resistance regulatory protein MerR  31.01 
 
 		 162 aa  45.1  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000851109  unclonable  0.0000000537327 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3026  transcriptional regulator, MerR family  30.12 
 
 		 137 aa  45.1  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2435  MerR family transcriptional regulator  35.64 
 
 		 135 aa  45.1  0.001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2898  transcriptional regulator, MerR family  37.14 
 
 		 282 aa  45.1  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1137  transcriptional regulator, MerR family  26.61 
 
 		 159 aa  44.7  0.001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3063  MerR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 142 aa  44.7  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.858131  normal  0.492052 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2134  MerR family transcriptional regulator  27.37 
 
 		 134 aa  45.1  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.17623  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>