More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_1715 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009972  Haur_1715  MerR family transcriptional regulator  100 
 
 		 244 aa  495  1e-139  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.382422  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5846  transcriptional regulator, MerR family  36.28 
 
 		 245 aa  123  2e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.411679 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1167  transcriptional regulator, MerR family  35.29 
 
 		 235 aa  116  3e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5056  putative transcriptional regulator, MerR family  34.29 
 
 		 227 aa  106  3e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.589555 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2297  regulatory protein, MerR  30.9 
 
 		 245 aa  103  3e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1320  transcriptional regulator, MerR family  30.04 
 
 		 254 aa  101  8e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1011  transcriptional regulator, MerR family  32.89 
 
 		 235 aa  100  2e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00242771 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2421  MerR family transcriptional regulator  28.19 
 
 		 242 aa  99.8  4e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0993046 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0439  MerR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 228 aa  97.1  2e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3497  transcriptional regulator, MerR family  31.3 
 
 		 227 aa  94  2e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6176  transcriptional regulator, MerR family  29.92 
 
 		 244 aa  93.2  4e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.700284  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1563  transcriptional regulator, MerR family  31.89 
 
 		 234 aa  89.4  5e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.246216  normal  0.968218 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1948  transcriptional regulator, MerR family  28.04 
 
 		 273 aa  87.4  2e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.566007  hitchhiker  0.00390596 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5382  transcriptional regulator, MerR family  32.12 
 
 		 301 aa  79.7  0.00000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0194  transcriptional regulator, MerR family  30.1 
 
 		 252 aa  77.8  0.0000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1516  transcriptional regulator, MerR family  24.84 
 
 		 248 aa  73.2  0.000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3253  transcriptional regulator, MerR family  27.27 
 
 		 249 aa  73.6  0.000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000117096  decreased coverage  0.00000535061 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3149  transcriptional regulator, MerR family  30.5 
 
 		 253 aa  72.8  0.000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5351  transcriptional regulator, MerR family  34.15 
 
 		 144 aa  60.5  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0379309  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3788  MerR family transcriptional regulator  37.27 
 
 		 144 aa  60.5  0.00000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.318416  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1642  transcriptional regulator, MerR family  34.15 
 
 		 143 aa  60.1  0.00000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.349097  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5283  transcriptional regulator, MerR family  34.15 
 
 		 143 aa  60.1  0.00000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1816  MerR family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 154 aa  59.7  0.00000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0245036  normal  0.855302 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2284  transcriptional regulator, MerR family  40 
 
 		 215 aa  57  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1351  transcriptional regulator MerR family CueR domain protein  36 
 
 		 142 aa  57.8  0.0000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3979  MerR family transcriptional regulator  37.63 
 
 		 174 aa  57  0.0000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.00581953  normal  0.426596 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8151  putative transcriptional regulator, MerR family  30.99 
 
 		 302 aa  56.6  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.963489 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3339  MerR family transcriptional regulator  37.63 
 
 		 157 aa  57  0.0000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.88053  normal  0.266963 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1504  regulatory protein, MerR  34.29 
 
 		 141 aa  57  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5946  MerR family transcriptional regulator PbrR  38.81 
 
 		 145 aa  57  0.0000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.543608 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3542  transcriptional regulator, MerR family  40.23 
 
 		 152 aa  57  0.0000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.387014 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2195  transcriptional regulator, MerR family  40 
 
 		 214 aa  57  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0089  MerR family transcriptional regulator  40.48 
 
 		 137 aa  56.6  0.0000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1662  MerR family transcriptional regulator  40 
 
 		 215 aa  56.2  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.727696  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3216  transcriptional regulator, MerR family  40.23 
 
 		 155 aa  56.6  0.0000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0853  MerR family transcriptional regulator  34.57 
 
 		 146 aa  55.8  0.0000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1215  transcriptional regulator, MerR family  35.14 
 
 		 152 aa  55.8  0.0000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.460716  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2593  MerR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 152 aa  55.8  0.0000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0365897  normal  0.180328 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3347  transcription regulator protein  40.23 
 
 		 159 aa  55.5  0.0000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.445877  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4949  putative transcriptional regulator, MerR family  31.93 
 
 		 147 aa  55.5  0.0000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0118636  normal  0.199786 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0114  transcriptional regulator, MerR family  33.9 
 
 		 329 aa  55.1  0.0000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000486675  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1527  MerR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 276 aa  54.7  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05447  transcription regulator protein  36.17 
 
 		 170 aa  54.3  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.015587 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3285  transcriptional regulator, MerR family  36.47 
 
 		 272 aa  54.3  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.235229  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4090  putative MerR/CueR family transcriptional regulator  39.77 
 
 		 137 aa  53.9  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.849727  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2024  MerR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 129 aa  53.9  0.000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1773  transcriptional regulator, MerR family  34.15 
 
 		 142 aa  53.9  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1816  transcriptional regulator, MerR family  31.71 
 
 		 144 aa  54.3  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.228936 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2916  MerR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 154 aa  53.9  0.000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.221684  normal  0.314176 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2331  transcriptional regulator, MerR family  30.49 
 
 		 141 aa  53.5  0.000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00979491  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1241  MerR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 144 aa  53.1  0.000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2710  MerR family transcriptional regulator  43.08 
 
 		 156 aa  53.5  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0420  transcriptional regulator, MerR family  31.94 
 
 		 255 aa  53.5  0.000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2017  MerR family transcriptional regulator  40 
 
 		 140 aa  53.1  0.000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0331  MerR family transcriptional regulator  25.26 
 
 		 281 aa  52.8  0.000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4066  MerR family transcriptional regulator  43.08 
 
 		 152 aa  53.1  0.000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1304  zinc-responsive transcriptional regulator  37.8 
 
 		 140 aa  53.1  0.000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1941  MerR family transcriptional regulator  40 
 
 		 140 aa  53.1  0.000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3455  MerR family transcriptional regulator  43.08 
 
 		 152 aa  53.1  0.000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.340256  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1150  transcriptional regulator, MerR family  35.62 
 
 		 135 aa  52.8  0.000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00496019 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2819  transcriptional regulator, MerR family protein  29.46 
 
 		 129 aa  52.8  0.000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1677  transcriptional regulator, MerR family  29 
 
 		 276 aa  52.8  0.000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.128581  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0947  transcriptional regulator, MerR family  45.31 
 
 		 137 aa  52.4  0.000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1731  MerR family transcriptional regulator  29 
 
 		 276 aa  52.4  0.000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.867101  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1328  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  45.83 
 
 		 142 aa  52.4  0.000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.185828  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4808  transcriptional regulator, MerR family  36.25 
 
 		 160 aa  52.4  0.000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.820733 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3731  transcriptional regulator, MerR family  36.25 
 
 		 160 aa  52.4  0.000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3404  MerR family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 155 aa  52.4  0.000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1523  MerR family transcriptional regulator  29 
 
 		 276 aa  52  0.000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.193632  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1495  MerR family transcriptional regulator  29 
 
 		 276 aa  52  0.000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00542237  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1641  MerR family transcriptional regulator  29 
 
 		 276 aa  52  0.000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1708  transcriptional regulator, MerR family  29 
 
 		 276 aa  52  0.000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19550  serine/threonine protein phosphatase  40.3 
 
 		 361 aa  52  0.000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.17725  normal  0.381768 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0379  transcriptional regulator, MerR family  34.07 
 
 		 327 aa  52  0.000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2848  MerR family transcriptional regulator  39.19 
 
 		 142 aa  52  0.000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4400  transcriptional regulator, MerR family  30.88 
 
 		 303 aa  52  0.000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.462564  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1485  MerR family transcriptional regulator  29 
 
 		 276 aa  52  0.000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0543962  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06555  Zn(II)-responsive regulator of ZntA  40.54 
 
 		 145 aa  52  0.000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1701  transcriptional regulator, MerR family  41.54 
 
 		 152 aa  51.2  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.201474  normal  0.917872 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4509  transcriptional regulator, MerR family  38.57 
 
 		 129 aa  51.6  0.00001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0125189 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4002  MerR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 152 aa  51.6  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2325  MerR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 135 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2009  transcriptional regulator, MerR family  41.54 
 
 		 152 aa  51.2  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0920  MerR family transcriptional regulator  33.73 
 
 		 141 aa  51.2  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.320526  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0455  MerR family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 261 aa  51.2  0.00001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00278493  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0760  MerR family transcriptional regulator  23.08 
 
 		 267 aa  51.2  0.00001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0248072  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3411  zinc-responsive transcriptional regulator  34.57 
 
 		 158 aa  51.6  0.00001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0626  transcriptional regulator  31.07 
 
 		 115 aa  51.6  0.00001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1777  MerR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 145 aa  51.2  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1678  MerR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 132 aa  51.2  0.00001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0211  MerR family transcriptional regulator  36.9 
 
 		 140 aa  51.2  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3186  transcriptional regulator, MerR family  31.94 
 
 		 327 aa  50.8  0.00002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0073  hypothetical protein  29.31 
 
 		 314 aa  51.2  0.00002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.0572864  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2170  transcriptional regulator, MerR family  34.15 
 
 		 133 aa  50.4  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000807108 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2278  MerR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 273 aa  51.2  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.408305  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4528  transcriptional regulator, MerR family  45.83 
 
 		 129 aa  51.2  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.355526 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000675  redox-sensitive transcriptional activator soxR  39.19 
 
 		 143 aa  50.4  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.27209  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0264  MerR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 173 aa  50.8  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.829201  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3972  MerR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 149 aa  50.8  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1866  transcriptional regulator  28.05 
 
 		 247 aa  50.8  0.00002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000190425  hitchhiker  0.000000000849298 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>