More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_1516 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013216  Dtox_1516  transcriptional regulator, MerR family  100 
 
 		 248 aa  513  1e-144  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2421  MerR family transcriptional regulator  25.66 
 
 		 242 aa  97.4  2e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0993046 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1167  transcriptional regulator, MerR family  23.58 
 
 		 235 aa  96.3  4e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0439  MerR family transcriptional regulator  26.49 
 
 		 228 aa  90.1  3e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2297  regulatory protein, MerR  24.23 
 
 		 245 aa  89.4  6e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1011  transcriptional regulator, MerR family  25.43 
 
 		 235 aa  87  3e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00242771 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5846  transcriptional regulator, MerR family  25.11 
 
 		 245 aa  83.2  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.411679 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1948  transcriptional regulator, MerR family  24.55 
 
 		 273 aa  82  0.000000000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.566007  hitchhiker  0.00390596 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5056  putative transcriptional regulator, MerR family  23.11 
 
 		 227 aa  79  0.00000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.589555 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1715  MerR family transcriptional regulator  24.84 
 
 		 244 aa  73.2  0.000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.382422  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1563  transcriptional regulator, MerR family  23.7 
 
 		 234 aa  72  0.000000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.246216  normal  0.968218 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1320  transcriptional regulator, MerR family  22.97 
 
 		 254 aa  65.1  0.000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6176  transcriptional regulator, MerR family  22.08 
 
 		 244 aa  65.1  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.700284  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5382  transcriptional regulator, MerR family  22.78 
 
 		 301 aa  65.1  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3497  transcriptional regulator, MerR family  25.29 
 
 		 227 aa  60.8  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0548  DNA-binding transcriptional regulator CueR  43.24 
 
 		 138 aa  60.5  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0607  DNA-binding transcriptional regulator CueR  41.89 
 
 		 138 aa  58.2  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0563  DNA-binding transcriptional regulator CueR  41.89 
 
 		 138 aa  58.2  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.620757  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0546  DNA-binding transcriptional regulator CueR  41.89 
 
 		 138 aa  58.2  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0553  DNA-binding transcriptional regulator CueR  41.89 
 
 		 138 aa  58.2  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.985745  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0963  DNA-binding transcriptional regulator CueR  44.44 
 
 		 136 aa  57.4  0.0000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.55262  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3585  MerR family transcriptional regulator  36.79 
 
 		 152 aa  53.9  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00229473 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3828  MerR family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 122 aa  54.3  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05447  transcription regulator protein  31.15 
 
 		 170 aa  53.1  0.000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.015587 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0586  DNA-binding transcriptional regulator CueR  41.27 
 
 		 135 aa  53.1  0.000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.775911 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0530  DNA-binding transcriptional regulator CueR  41.27 
 
 		 135 aa  53.1  0.000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3108  MerR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 154 aa  53.1  0.000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.798682  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00438  DNA-binding transcriptional activator of copper-responsive regulon genes  41.27 
 
 		 135 aa  52.8  0.000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3123  transcriptional regulator, MerR family  41.27 
 
 		 135 aa  52.8  0.000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.856714  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00443  hypothetical protein  41.27 
 
 		 135 aa  52.8  0.000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0566  DNA-binding transcriptional regulator CueR  41.27 
 
 		 135 aa  52.8  0.000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0422  DNA-binding transcriptional regulator CueR  41.27 
 
 		 135 aa  52.8  0.000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0526  DNA-binding transcriptional regulator CueR  41.27 
 
 		 135 aa  52.8  0.000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3129  DNA-binding transcriptional regulator CueR  41.27 
 
 		 135 aa  52.8  0.000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.943376  hitchhiker  0.0000753695 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02170  predicted transcriptional regulator  36.17 
 
 		 133 aa  52.8  0.000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3149  transcriptional regulator, MerR family  25 
 
 		 253 aa  52  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1667  regulatory protein, MerR  36.99 
 
 		 136 aa  51.6  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3291  MerR family transcriptional regulator  48.28 
 
 		 289 aa  51.6  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3790  MerR family transcriptional regulator  45.65 
 
 		 132 aa  51.6  0.00001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0361759  normal  0.548118 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3103  MerR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 145 aa  52  0.00001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4066  MerR family transcriptional regulator  45.65 
 
 		 132 aa  51.6  0.00001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1266  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  39.68 
 
 		 139 aa  50.8  0.00002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0668949 
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4307  transcriptional regulator, MerR family  43.64 
 
 		 141 aa  50.8  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00729055  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3611  transcriptional regulator, MerR family  36.67 
 
 		 267 aa  50.4  0.00002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0080  transcriptional regulator, MerR family  39.71 
 
 		 137 aa  50.8  0.00002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.671013 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3534  MerR family transcriptional regulator  47.83 
 
 		 143 aa  50.8  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0358234  normal  0.617564 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3164  MerR family transcriptional regulator  39.68 
 
 		 139 aa  50.8  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1151  MerR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 133 aa  50.1  0.00003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.100669  hitchhiker  0.000000311334 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0194  transcriptional regulator, MerR family  24.43 
 
 		 252 aa  50.4  0.00003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3218  transcriptional regulator, MerR family  41.27 
 
 		 138 aa  50.4  0.00003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06140  predicted transcriptional regulator  41.27 
 
 		 129 aa  50.4  0.00003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0869  MerR family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 145 aa  50.1  0.00003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25610  predicted transcriptional regulator  41.27 
 
 		 129 aa  50.1  0.00003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0838  MerR family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 145 aa  50.1  0.00003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2538  MerR family transcriptional regulator  27.48 
 
 		 157 aa  49.7  0.00004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1256  transcriptional regulator, MerR family  43.1 
 
 		 142 aa  50.1  0.00004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3026  transcriptional regulator, MerR family  39.68 
 
 		 137 aa  49.7  0.00004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3892  MerR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 149 aa  49.7  0.00004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00526993  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1098  transcriptional regulator, MerR family  41.27 
 
 		 134 aa  49.7  0.00004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1032  transcriptional regulator, MerR family  39.68 
 
 		 144 aa  50.1  0.00004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.920994  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3676  transcriptional regulator, MerR family  43.1 
 
 		 143 aa  49.7  0.00004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.511555  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35820  predicted transcriptional regulator  35.38 
 
 		 134 aa  49.3  0.00005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3026  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  39.68 
 
 		 139 aa  49.7  0.00005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0987  MerR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 160 aa  49.3  0.00006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.758767  hitchhiker  0.000750648 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4350  transcriptional regulator, MerR family  43.64 
 
 		 131 aa  49.3  0.00006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0495  MerR family transcriptional regulator  43.64 
 
 		 139 aa  47.8  0.0001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.292362  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0668  transcriptional regulator, MerR family  31.87 
 
 		 272 aa  47.8  0.0001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000812117  hitchhiker  0.0000325432 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14720  predicted transcriptional regulator  48.78 
 
 		 148 aa  48.5  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.590627  normal  0.772199 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3210  MerR family transcriptional regulator  40 
 
 		 136 aa  47.8  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.303617  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1534  transcriptional regulator, MerR family  34.38 
 
 		 249 aa  48.1  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0334786  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1697  MerR family transcriptional regulator  22.88 
 
 		 157 aa  48.1  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.115653  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1614  transcriptional regulator, MerR family  27.27 
 
 		 295 aa  47.4  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.256957  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0297  zinc-responsive transcriptional regulator  31.34 
 
 		 159 aa  47.4  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4509  transcriptional regulator, MerR family  39.68 
 
 		 129 aa  47.4  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0125189 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0440  transcriptional regulator, MerR family  32.99 
 
 		 129 aa  47.4  0.0002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.394631  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3411  zinc-responsive transcriptional regulator  33.7 
 
 		 158 aa  47.4  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1854  MerR family transcriptional regulator  32.17 
 
 		 166 aa  47.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.674161  normal  0.0887351 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1160  MerR family transcriptional regulator  41.07 
 
 		 133 aa  47.8  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.392851 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4214  putative transcriptional regulator, MerR family  36.51 
 
 		 319 aa  47.8  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.290445  hitchhiker  0.000447036 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0585  MerR family transcriptional regulator  39.68 
 
 		 136 aa  47  0.0003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.853287  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3731  transcriptional regulator, MerR family  29.75 
 
 		 160 aa  47  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2325  MerR family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 135 aa  46.6  0.0003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3133  MerR family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 139 aa  47  0.0003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.845727  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1103  MerR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 135 aa  46.6  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.394367  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1117  MerR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 135 aa  46.6  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2902  MerR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 135 aa  46.6  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1604  MerR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 135 aa  46.6  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2912  MerR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 135 aa  46.6  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0392  MerR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 135 aa  46.6  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0882  MerR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 135 aa  46.6  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.656142 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0052  transcriptional regulator, MerR family  39.06 
 
 		 157 aa  47  0.0003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4808  transcriptional regulator, MerR family  29.75 
 
 		 160 aa  47  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.820733 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0895  MerR family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 125 aa  47  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0901  MerR family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 125 aa  47  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0327374 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1645  regulatory protein, MerR  41.07 
 
 		 154 aa  46.6  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0841182  normal  0.942746 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0029  transcriptional regulator, MerR family  41.54 
 
 		 134 aa  47  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3477  MerR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 120 aa  47  0.0003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.137212  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4947  regulatory protein, MerR  38.1 
 
 		 129 aa  46.6  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.459947  decreased coverage  0.00286067 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0912  MerR family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 125 aa  47  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1402  MerR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 133 aa  46.6  0.0003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.87391  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>