More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_4002 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_4002  MerR family transcriptional regulator  100 
 
 		 152 aa  306  5.9999999999999995e-83  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3479  MerR family transcriptional regulator  62.09 
 
 		 156 aa  172  9.999999999999999e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2916  MerR family transcriptional regulator  64.57 
 
 		 154 aa  166  9e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.221684  normal  0.314176 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2593  MerR family transcriptional regulator  54.42 
 
 		 152 aa  150  4e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0365897  normal  0.180328 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1215  transcriptional regulator, MerR family  53.74 
 
 		 152 aa  149  8.999999999999999e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.460716  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1816  MerR family transcriptional regulator  55.13 
 
 		 154 aa  144  3e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0245036  normal  0.855302 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5280  transcriptional regulator CadR  45.16 
 
 		 148 aa  110  5e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4838  regulatory protein, MerR  45.16 
 
 		 148 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46190  cadmium responsive transcriptional regulator, merR family  38.62 
 
 		 152 aa  108  2.0000000000000002e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.719382  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4438  MerR family transcriptional regulator  41.79 
 
 		 143 aa  106  1e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0028  transcriptional regulator, MerR family  42.54 
 
 		 143 aa  105  2e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.234521  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3291  Cd(II)/Pb(II)-responsive transcriptional regulator  43.2 
 
 		 143 aa  105  2e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3334  MerR family transcriptional regulator  43.2 
 
 		 143 aa  105  3e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2975  MerR family transcriptional regulator  43.2 
 
 		 143 aa  105  3e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.501139  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0151  Cd(II)/Pb(II)-responsive transcriptional regulator  43.2 
 
 		 143 aa  105  3e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.636208  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3947  Cd(II)/Pb(II)-responsive transcriptional regulator  43.2 
 
 		 143 aa  105  3e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1564  MerR family transcriptional regulator  43.2 
 
 		 143 aa  105  3e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4020  transcriptional regulator CadR  43.2 
 
 		 143 aa  105  3e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3037  MerR family transcriptional regulator  43.2 
 
 		 143 aa  105  3e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5140  MerR family transcriptional regulator  41.41 
 
 		 147 aa  104  4e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5193  MerR family transcriptional regulator  41.41 
 
 		 147 aa  104  4e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5013  MerR family transcriptional regulator  41.41 
 
 		 147 aa  104  5e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0325  MerR family transcriptional regulator  39.31 
 
 		 147 aa  102  1e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.634832 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2809  putative transcriptional regulator, MerR family  41.98 
 
 		 186 aa  103  1e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16670  putative transcriptional regulator CadR  41.1 
 
 		 156 aa  102  2e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3108  MerR family transcriptional regulator  41.01 
 
 		 154 aa  102  3e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.798682  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4091  MerR family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 138 aa  101  3e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.903901  normal  0.433272 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0123  MerR family transcriptional regulator  44 
 
 		 143 aa  101  4e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.329923  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0113  MerR family transcriptional regulator  44 
 
 		 143 aa  101  4e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1657  putative transcriptional regulator  40.8 
 
 		 159 aa  100  5e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00996367  normal  0.370586 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2633  Cd(II)/Pb(II)-responsive transcriptional regulator  43.64 
 
 		 162 aa  100  7e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.673518 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2391  Cd(II)/Pb(II)-responsive transcriptional regulator  41.6 
 
 		 151 aa  100  8e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0284263  normal  0.3053 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2104  transcriptional regulator, MerR family  41.6 
 
 		 151 aa  100  8e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3303  MerR family transcriptional regulator  43.2 
 
 		 143 aa  100  9e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0122  MerR family transcriptional regulator  44 
 
 		 143 aa  99.8  1e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0137  MerR family transcriptional regulator  43.2 
 
 		 143 aa  99.8  1e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2932  MerR family transcriptional regulator  43.2 
 
 		 143 aa  99.8  1e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.327003  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0123  MerR family transcriptional regulator  43.2 
 
 		 143 aa  99.8  1e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.169164  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05447  transcription regulator protein  41.73 
 
 		 170 aa  99  2e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.015587 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1449  Cd(II)/Pb(II)-responsive transcriptional regulator  41.35 
 
 		 156 aa  99  2e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1336  MerR family transcriptional regulator  42.07 
 
 		 146 aa  99  2e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.200551  normal  0.195494 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2325  MerR family transcriptional regulator  45.95 
 
 		 135 aa  99.4  2e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0032  MerR family transcriptional regulator  44.35 
 
 		 134 aa  99  2e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02024  Cd(II)/Pb(II)-responsive transcriptional regulator  37.8 
 
 		 138 aa  99  2e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.675487  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2149  transcriptional regulator, MerR family  39.2 
 
 		 132 aa  98.2  4e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.705718  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0034  MerR family transcriptional regulator  43.55 
 
 		 144 aa  97.1  8e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5946  MerR family transcriptional regulator PbrR  40.16 
 
 		 145 aa  97.1  8e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.543608 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5359  transcriptional regulator, MerR family  39.16 
 
 		 142 aa  96.3  1e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3731  transcriptional regulator, MerR family  41.09 
 
 		 160 aa  96.7  1e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4808  transcriptional regulator, MerR family  41.09 
 
 		 160 aa  96.7  1e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.820733 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3389  MerR family transcriptional regulator  39.2 
 
 		 132 aa  95.5  2e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.462896  normal  0.11439 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0853  MerR family transcriptional regulator  39.2 
 
 		 146 aa  95.9  2e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4323  MerR family transcriptional regulator  40.46 
 
 		 146 aa  95.5  2e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1346  MerR family transcriptional regulator  40.46 
 
 		 136 aa  95.5  2e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.24451 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2302  MerR family transcriptional regulator  39.2 
 
 		 132 aa  95.5  2e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000169784  hitchhiker  0.000117286 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3461  transcriptional regulator, MerR family protein  40.46 
 
 		 146 aa  95.5  2e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5372  MerR family transcriptional regulator  42.06 
 
 		 149 aa  95.1  3e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1678  MerR family transcriptional regulator  40.8 
 
 		 132 aa  95.1  3e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3563  transcriptional regulator, MerR family  41.6 
 
 		 157 aa  94.7  4e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4049  MerR family transcriptional regulator  41.13 
 
 		 149 aa  94.7  4e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2256  MerR family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 144 aa  94.4  5e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3444  transcriptional regulator, MerR family  40 
 
 		 144 aa  94.4  5e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0545873  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4226  MerR family transcriptional regulator  39.68 
 
 		 150 aa  94  6e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.795335  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0035  transcriptional regulator, MerR family  41.13 
 
 		 167 aa  94  6e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.987448  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1103  MerR family transcriptional regulator  45.95 
 
 		 135 aa  94  7e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.394367  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1117  MerR family transcriptional regulator  45.95 
 
 		 135 aa  94  7e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2902  MerR family transcriptional regulator  45.95 
 
 		 135 aa  94  7e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1604  MerR family transcriptional regulator  45.95 
 
 		 135 aa  94  7e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2912  MerR family transcriptional regulator  45.95 
 
 		 135 aa  94  7e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0392  MerR family transcriptional regulator  45.95 
 
 		 135 aa  94  7e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0882  MerR family transcriptional regulator  45.95 
 
 		 135 aa  94  7e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.656142 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0017  MerR family transcriptional regulator  41.13 
 
 		 167 aa  93.6  8e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.801756 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2538  transcriptional regulator, MerR family  39.44 
 
 		 147 aa  92.8  1e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.329159  normal  0.129188 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1771  transcriptional regulator, MerR family  38.93 
 
 		 151 aa  92.8  1e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.13408  normal  0.537849 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3216  transcriptional regulator, MerR family  40.32 
 
 		 155 aa  92.4  2e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3542  transcriptional regulator, MerR family  40.32 
 
 		 152 aa  92.4  2e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.387014 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1851  MerR family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 162 aa  92  2e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.138506  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0194  MerR family transcriptional regulator  45.05 
 
 		 135 aa  92.8  2e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4002  MerR family transcriptional regulator  45.05 
 
 		 135 aa  92  2e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0470  putative transcriptional regulator, MerR family  45.05 
 
 		 133 aa  92.8  2e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0220  MerR family transcriptional regulator  45.05 
 
 		 135 aa  92.8  2e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2691  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  38.36 
 
 		 154 aa  92  3e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.455022  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0894  MerR family transcriptional regulator  44.14 
 
 		 135 aa  91.7  3e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0596  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  42.06 
 
 		 134 aa  91.3  4e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3347  transcription regulator protein  41.94 
 
 		 159 aa  91.3  4e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.445877  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0499  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  42.06 
 
 		 144 aa  91.7  4e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1913  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  42.06 
 
 		 134 aa  91.3  4e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0400556  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1407  MerR family transcriptional regulator  39.37 
 
 		 134 aa  90.9  5e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0693  MerR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 153 aa  90.9  5e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3523  MerR family transcriptional regulator  42.74 
 
 		 139 aa  91.3  5e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0812  MerR family transcriptional regulator  42.06 
 
 		 143 aa  91.3  5e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0448  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  41.13 
 
 		 154 aa  90.9  6e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.17179e-17 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0029  transcriptional regulator, MerR family  38.71 
 
 		 134 aa  90.9  6e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0385  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  41.13 
 
 		 154 aa  90.9  6e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000075209 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0388  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  41.13 
 
 		 154 aa  90.9  6e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0393  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  41.13 
 
 		 154 aa  90.9  6e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.493726  hitchhiker  2.73635e-17 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2814  transcriptional regulator, MerR family  41.13 
 
 		 138 aa  90.9  6e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0407  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  41.13 
 
 		 154 aa  90.9  6e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000267625 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0802  transcriptional regulator, MerR family  40.31 
 
 		 142 aa  90.5  7e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1805  transcriptional regulator, MerR family  39.16 
 
 		 142 aa  90.5  7e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.665763 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>