More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_2435 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_2435  MerR family transcriptional regulator  100 
 
 		 135 aa  266  5.9999999999999995e-71  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2122  MerR family transcriptional regulator  59.23 
 
 		 131 aa  139  9.999999999999999e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.392854  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1623  MerR family transcriptional regulator  60 
 
 		 133 aa  133  7.000000000000001e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.473197 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1123  MerR family transcriptional regulator  58.62 
 
 		 144 aa  122  2e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0060  hypothetical protein  45.52 
 
 		 134 aa  117  3.9999999999999996e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0059  hypothetical protein  44.78 
 
 		 134 aa  117  7e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5990  mercury resistance regulatory protein MerR  47.66 
 
 		 132 aa  107  6e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.479863 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0115  Hg(II)-responsive transcriptional regulator  50.38 
 
 		 132 aa  106  1e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.889131  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4798  MerR family transcriptional regulator  43.94 
 
 		 136 aa  103  1e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0094  Hg(II)-responsive transcriptional regulator  42.75 
 
 		 136 aa  102  2e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2129  putative transcriptional regulator MerR  41.79 
 
 		 144 aa  101  3e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0168  putative transcriptional regulator MerR  41.79 
 
 		 144 aa  101  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1338  MerR family transcriptional regulator  43.18 
 
 		 135 aa  100  6e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.683374  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1301  MerR family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 135 aa  100  6e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.440008 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2312  MerR family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 135 aa  100  6e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  unclonable  0.000000000000678056  hitchhiker  0.000026005 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2232  putative transcriptional regulator MerR  42.42 
 
 		 144 aa  100  7e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.620327  normal  0.3464 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1943  transcriptional regulator of MerR family protein  39.85 
 
 		 135 aa  100  7e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.555422  normal  0.0105773 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1213  transcriptional regulator, MerR family  41.79 
 
 		 144 aa  100  7e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.276419  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0171  MerR family transcriptional regulator  45.38 
 
 		 134 aa  100  9e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0237  MerR family transcriptional regulator  47.15 
 
 		 132 aa  99.4  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4341  putative transcriptional regulator MerR  41.79 
 
 		 151 aa  99.4  1e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2323  putative transcriptional regulator MerR  41.04 
 
 		 144 aa  99  2e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2269  MerR family transcriptional regulator  44.7 
 
 		 135 aa  98.6  2e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.220473  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1474  MerR family transcriptional regulator  43.94 
 
 		 135 aa  97.8  4e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.70041  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1217  putative transcriptional regulator MerR  40.3 
 
 		 144 aa  97.8  4e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4315  MerR family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 130 aa  97.8  4e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4014  MerR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 144 aa  97.4  6e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1661  MerR family transcriptional regulator  43.94 
 
 		 137 aa  97.1  7e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.282422  normal  0.34807 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0083  putative transcriptional regulator MerR  41.04 
 
 		 144 aa  97.1  7e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.68539 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2699  MerR family transcriptional regulator  40.77 
 
 		 171 aa  96.3  1e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6498  putative transcriptional regulator MerR  41.04 
 
 		 144 aa  95.5  2e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0239269  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2341  putative transcriptional regulator MerR  41.04 
 
 		 144 aa  95.5  2e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6171  putative transcriptional regulator MerR  41.04 
 
 		 144 aa  95.5  2e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000597544  normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6344  Hg(II) resistance regulatory protein MerR  41.04 
 
 		 162 aa  95.9  2e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000851109  unclonable  0.0000000537327 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0101  putative transcriptional regulator MerR  41.04 
 
 		 144 aa  95.5  2e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.656805  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2399  transcriptional regulator, MerR family  45.45 
 
 		 132 aa  95.5  2e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000424023  normal  0.796089 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15480  putative transcriptional regulator MerR  41.04 
 
 		 144 aa  95.5  2e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000744936  unclonable  4.377399999999999e-22 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0486  MerR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 135 aa  95.9  2e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1783  putative transcriptional regulator MerR  41.04 
 
 		 144 aa  94.7  3e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.45958  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0477  MerR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 173 aa  95.1  3e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2155  transcriptional regulator, MerR family  43.85 
 
 		 167 aa  94  7e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.000155365  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0238  MerR family transcriptional regulator  40.15 
 
 		 141 aa  93.6  8e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1339  mercuric resistance operon regulatory protein  40.15 
 
 		 135 aa  93.2  1e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2836  transcriptional regulator, MerR family  41.61 
 
 		 135 aa  93.2  1e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.906455  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0159  transcriptional regulator, MerR family  38.24 
 
 		 135 aa  92  2e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0164  transcriptional regulator, MerR family  38.24 
 
 		 135 aa  92.8  2e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.768188  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2760  Hg(II)-responsive transcriptional regulator  37.88 
 
 		 135 aa  91.7  3e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1395  MerR family transcriptional regulator  38.64 
 
 		 146 aa  90.9  5e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.686505  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01412  Transcriptional regulator MerR  40.77 
 
 		 150 aa  90.9  5e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.536111  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02955  Hg(II)-responsive transcriptional regulator  38.46 
 
 		 128 aa  89.4  1e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0202543  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3492  transcriptional regulator, MerR family protein  39.39 
 
 		 135 aa  87.8  5e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02950  Hg(II)-responsive transcriptional regulator  40.6 
 
 		 131 aa  87.4  6e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0289893  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2453  transcriptional regulator, MerR family  43.61 
 
 		 155 aa  87  7e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00000100878  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3375  MerR family transcriptional regulator  39.85 
 
 		 149 aa  87  8e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4091  MerR family transcriptional regulator  37.4 
 
 		 138 aa  86.3  1e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.903901  normal  0.433272 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4537  Hg(II)-responsive transcriptional regulator  37.4 
 
 		 132 aa  85.1  3e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3411  zinc-responsive transcriptional regulator  39.85 
 
 		 158 aa  85.1  3e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2633  Cd(II)/Pb(II)-responsive transcriptional regulator  41.04 
 
 		 162 aa  84  6e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.673518 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2848  MerR family transcriptional regulator  39.1 
 
 		 142 aa  84  6e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2900  MerR family transcriptional regulator  39.42 
 
 		 140 aa  84  7e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4838  regulatory protein, MerR  38.64 
 
 		 148 aa  83.6  8e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3237  MerR family transcriptional regulator  40.6 
 
 		 137 aa  83.6  9e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3523  MerR family transcriptional regulator  40.46 
 
 		 139 aa  83.6  9e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3888  zinc-responsive transcriptional regulator  36.76 
 
 		 141 aa  82.8  0.000000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00039361  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0993  MerR family transcriptional regulator  38.17 
 
 		 137 aa  83.2  0.000000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.335093  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0310  zinc-responsive transcriptional regulator  36.76 
 
 		 141 aa  82.8  0.000000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.44406  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3184  transcriptional regulator, MerR family  39.1 
 
 		 142 aa  82.4  0.000000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5280  transcriptional regulator CadR  37.88 
 
 		 148 aa  82.4  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0608  zinc-responsive transcriptional regulator  36.76 
 
 		 144 aa  82.8  0.000000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000357731  normal  0.723537 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4517  zinc-responsive transcriptional regulator  36.76 
 
 		 143 aa  81.6  0.000000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00152846  hitchhiker  0.0000330659 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4950  regulatory protein, MerR  41.61 
 
 		 146 aa  81.6  0.000000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0034872 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0433  zinc-responsive transcriptional regulator  41.35 
 
 		 173 aa  82  0.000000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1678  MerR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 132 aa  81.6  0.000000000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4954  regulatory protein, MerR  39.71 
 
 		 143 aa  81.3  0.000000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00750643 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0812  MerR family transcriptional regulator  37.59 
 
 		 143 aa  80.9  0.000000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2543  MerR family transcriptional regulator  36.09 
 
 		 128 aa  80.5  0.000000000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.212021  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1339  transcriptional regulator of MerR family protein  33.59 
 
 		 130 aa  80.5  0.000000000000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4360  MerR family transcriptional regulator  39.69 
 
 		 134 aa  79.7  0.00000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1218  MerR family transcriptional regulator  39.69 
 
 		 134 aa  79.7  0.00000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1961  MerR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 134 aa  80.1  0.00000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.778807  normal  0.944936 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3680  transcriptional regulator, MerR family  39.1 
 
 		 133 aa  80.1  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.446637  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2981  MerR family transcriptional regulator  39.69 
 
 		 134 aa  79.7  0.00000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4384  MerR family transcriptional regulator  39.69 
 
 		 134 aa  79.7  0.00000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2331  MerR family transcriptional regulator  42.54 
 
 		 153 aa  80.1  0.00000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.324696 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16670  putative transcriptional regulator CadR  40.3 
 
 		 156 aa  79.7  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0445  zinc-responsive transcriptional regulator  39.1 
 
 		 159 aa  78.6  0.00000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.261357 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3347  transcription regulator protein  40.77 
 
 		 159 aa  79.3  0.00000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.445877  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2256  MerR family transcriptional regulator  37.12 
 
 		 144 aa  78.6  0.00000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3216  transcriptional regulator, MerR family  37.5 
 
 		 155 aa  79.3  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02041  Hg(II)-responsive transcriptional regulator  39.5 
 
 		 116 aa  78.6  0.00000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3961  MerR family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 142 aa  79.3  0.00000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.146237  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3623  MerR family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 142 aa  79.3  0.00000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2509  MerR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 151 aa  79  0.00000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.591979 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7842  transcriptional regulator, MerR family  36.09 
 
 		 149 aa  79.3  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1449  Cd(II)/Pb(II)-responsive transcriptional regulator  39.55 
 
 		 156 aa  78.6  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1129  MerR family transcriptional regulator  39.1 
 
 		 131 aa  78.6  0.00000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.560457  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3542  transcriptional regulator, MerR family  37.5 
 
 		 152 aa  78.6  0.00000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.387014 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4035  zinc-responsive transcriptional regulator  39.85 
 
 		 176 aa  78.2  0.00000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3156  MerR family transcriptional regulator  38.58 
 
 		 146 aa  78.2  0.00000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.215145  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2302  MerR family transcriptional regulator  39.26 
 
 		 132 aa  77.8  0.00000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000169784  hitchhiker  0.000117286 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>