More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_0238 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008740  Maqu_0238  MerR family transcriptional regulator  100 
 
 
141 aa  290  4e-78  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0094  Hg(II)-responsive transcriptional regulator  62.12 
 
 
136 aa  174  3e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1338  MerR family transcriptional regulator  60.32 
 
 
135 aa  165  2e-40  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.683374  normal 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0168  putative transcriptional regulator MerR  57.58 
 
 
144 aa  159  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4014  MerR family transcriptional regulator  57.04 
 
 
144 aa  159  1e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2760  Hg(II)-responsive transcriptional regulator  54.07 
 
 
135 aa  158  2e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1474  MerR family transcriptional regulator  56.06 
 
 
135 aa  159  2e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.70041  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1217  putative transcriptional regulator MerR  56.82 
 
 
144 aa  157  3e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2269  MerR family transcriptional regulator  59.2 
 
 
135 aa  157  6e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.220473  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1783  putative transcriptional regulator MerR  59.52 
 
 
144 aa  157  6e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.45958  normal 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6498  putative transcriptional regulator MerR  55.56 
 
 
144 aa  156  7e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0239269  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2341  putative transcriptional regulator MerR  55.56 
 
 
144 aa  156  7e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6171  putative transcriptional regulator MerR  55.56 
 
 
144 aa  156  7e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000597544  normal 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6344  Hg(II) resistance regulatory protein MerR  55.56 
 
 
162 aa  156  7e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000851109  unclonable  0.0000000537327 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0101  putative transcriptional regulator MerR  55.56 
 
 
144 aa  156  7e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.656805  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15480  putative transcriptional regulator MerR  55.56 
 
 
144 aa  156  7e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000744936  unclonable  4.377399999999999e-22 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2323  putative transcriptional regulator MerR  56.06 
 
 
144 aa  156  9e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2129  putative transcriptional regulator MerR  56.06 
 
 
144 aa  155  1e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0083  putative transcriptional regulator MerR  56.06 
 
 
144 aa  155  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.68539 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4341  putative transcriptional regulator MerR  56.49 
 
 
151 aa  155  2e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2232  putative transcriptional regulator MerR  56.3 
 
 
144 aa  154  3e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.620327  normal  0.3464 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1213  transcriptional regulator, MerR family  54.07 
 
 
144 aa  152  2e-36  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.276419  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1395  MerR family transcriptional regulator  55.56 
 
 
146 aa  149  1e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.686505  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1301  MerR family transcriptional regulator  50.38 
 
 
135 aa  149  2e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.440008 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2312  MerR family transcriptional regulator  50.38 
 
 
135 aa  149  2e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  unclonable  0.000000000000678056  hitchhiker  0.000026005 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1339  mercuric resistance operon regulatory protein  51.13 
 
 
135 aa  147  6e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0486  MerR family transcriptional regulator  51.13 
 
 
135 aa  142  1e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4798  MerR family transcriptional regulator  52.8 
 
 
136 aa  141  3e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0164  transcriptional regulator, MerR family  52.8 
 
 
135 aa  138  1.9999999999999998e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.768188  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0159  transcriptional regulator, MerR family  52.8 
 
 
135 aa  137  4.999999999999999e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1661  MerR family transcriptional regulator  51.18 
 
 
137 aa  130  3.9999999999999996e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.282422  normal  0.34807 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1943  transcriptional regulator of MerR family protein  42.11 
 
 
135 aa  119  9.999999999999999e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.555422  normal  0.0105773 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0115  Hg(II)-responsive transcriptional regulator  48.03 
 
 
132 aa  118  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.889131  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02955  Hg(II)-responsive transcriptional regulator  44.35 
 
 
128 aa  116  9.999999999999999e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0202543  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4315  MerR family transcriptional regulator  44.35 
 
 
130 aa  116  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0237  MerR family transcriptional regulator  49.15 
 
 
132 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5990  mercury resistance regulatory protein MerR  43.31 
 
 
132 aa  115  1.9999999999999998e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.479863 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1620  MerR family transcriptional regulator  58.7 
 
 
110 aa  114  3.9999999999999997e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.230477  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0171  MerR family transcriptional regulator  49.19 
 
 
134 aa  114  6e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02950  Hg(II)-responsive transcriptional regulator  46.46 
 
 
131 aa  112  2.0000000000000002e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0289893  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3492  transcriptional regulator, MerR family protein  42.74 
 
 
135 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2699  MerR family transcriptional regulator  45.24 
 
 
171 aa  100  5e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01412  Transcriptional regulator MerR  41.94 
 
 
150 aa  99.8  1e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.536111  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2836  transcriptional regulator, MerR family  41.41 
 
 
135 aa  98.2  3e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.906455  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2155  transcriptional regulator, MerR family  38.1 
 
 
167 aa  96.7  1e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.000155365  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4834  transcriptional regulator, MerR family  39.69 
 
 
144 aa  95.1  3e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.300455  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2435  MerR family transcriptional regulator  40.15 
 
 
135 aa  93.6  8e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0608  zinc-responsive transcriptional regulator  37.5 
 
 
144 aa  92.8  1e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000357731  normal  0.723537 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0477  MerR family transcriptional regulator  37.3 
 
 
173 aa  93.2  1e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0310  zinc-responsive transcriptional regulator  37.5 
 
 
141 aa  92.8  1e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.44406  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3888  zinc-responsive transcriptional regulator  37.5 
 
 
141 aa  92.8  1e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00039361  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2900  MerR family transcriptional regulator  43.2 
 
 
140 aa  92.8  2e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4537  Hg(II)-responsive transcriptional regulator  39.37 
 
 
132 aa  92.4  2e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2198  MerR family transcriptional regulator  40.94 
 
 
135 aa  92.4  2e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02041  Hg(II)-responsive transcriptional regulator  38.6 
 
 
116 aa  91.3  4e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3563  transcriptional regulator, MerR family  40.94 
 
 
157 aa  91.3  4e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2322  MerR family transcriptional regulator  40.46 
 
 
139 aa  90.1  8e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4384  MerR family transcriptional regulator  39.84 
 
 
134 aa  89.4  1e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2981  MerR family transcriptional regulator  39.84 
 
 
134 aa  89.4  1e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4360  MerR family transcriptional regulator  39.84 
 
 
134 aa  89.4  1e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1218  MerR family transcriptional regulator  39.84 
 
 
134 aa  89.4  1e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3184  transcriptional regulator, MerR family  38.4 
 
 
142 aa  89  2e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0543  transcriptional regulator, MerR family  42.97 
 
 
158 aa  88.6  3e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.166066  hitchhiker  0.000000593111 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0373  transcriptional regulator, MerR family  42.97 
 
 
158 aa  88.6  3e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2122  MerR family transcriptional regulator  38.93 
 
 
131 aa  88.2  3e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.392854  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2300  MerR family transcriptional regulator  40.62 
 
 
134 aa  88.2  4e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.639917  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1123  MerR family transcriptional regulator  42.31 
 
 
144 aa  87.8  5e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3156  MerR family transcriptional regulator  42.74 
 
 
146 aa  87.4  6e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.215145  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2325  MerR family transcriptional regulator  36.96 
 
 
147 aa  87.4  7e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1623  MerR family transcriptional regulator  41.98 
 
 
133 aa  87  8e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.473197 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3608  zinc-responsive transcriptional regulator  36.92 
 
 
141 aa  86.3  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.260442 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3778  zinc-responsive transcriptional regulator  36.92 
 
 
141 aa  86.3  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.508161  normal 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4117  MerR family transcriptional regulator  37.3 
 
 
140 aa  86.3  1e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3715  zinc-responsive transcriptional regulator  36.92 
 
 
141 aa  86.3  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.325937 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2331  MerR family transcriptional regulator  40.98 
 
 
153 aa  85.5  2e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.324696 
 
 
-
 
NC_009008  RSP_4277  MerR family transcriptional regulator  37.3 
 
 
140 aa  85.9  2e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0593  MerR family transcriptional regulator  39.68 
 
 
137 aa  85.5  2e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.429444  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3680  transcriptional regulator, MerR family  39.84 
 
 
133 aa  85.1  3e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.446637  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3133  MerR family transcriptional regulator  38.28 
 
 
139 aa  85.1  3e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.845727  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3389  MerR family transcriptional regulator  38.58 
 
 
132 aa  85.1  3e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.462896  normal  0.11439 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2302  MerR family transcriptional regulator  38.58 
 
 
132 aa  85.1  3e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000169784  hitchhiker  0.000117286 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3237  MerR family transcriptional regulator  38.06 
 
 
137 aa  85.1  3e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03143  zinc-responsive transcriptional regulator  36.92 
 
 
141 aa  84.7  4e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0421  transcriptional regulator, MerR family  36.92 
 
 
141 aa  84.7  4e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3486  zinc-responsive transcriptional regulator  36.92 
 
 
141 aa  84.7  4e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0751902  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0421  zinc-responsive transcriptional regulator  36.92 
 
 
141 aa  84.7  4e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0879681  hitchhiker  0.0000172555 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2453  transcriptional regulator, MerR family  39.84 
 
 
155 aa  84.7  4e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00000100878  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3678  zinc-responsive transcriptional regulator  36.92 
 
 
141 aa  84.7  4e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3961  MerR family transcriptional regulator  41.96 
 
 
142 aa  84.7  4e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.146237  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2149  transcriptional regulator, MerR family  37.01 
 
 
132 aa  84.7  4e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.705718  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3726  MerR family transcriptional regulator  39.06 
 
 
140 aa  84.7  4e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03094  hypothetical protein  36.92 
 
 
141 aa  84.7  4e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3797  transcriptional regulator, MerR family  38.6 
 
 
140 aa  84.7  4e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.360833  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4614  zinc-responsive transcriptional regulator  36.92 
 
 
141 aa  84.7  4e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000341039  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1678  MerR family transcriptional regulator  38.58 
 
 
132 aa  84.7  4e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3775  zinc-responsive transcriptional regulator  36.92 
 
 
141 aa  84.7  4e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.02383  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3623  MerR family transcriptional regulator  41.96 
 
 
142 aa  84.7  4e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3587  zinc-responsive transcriptional regulator  36.92 
 
 
141 aa  84.7  4e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.205456  normal  0.141164 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3680  zinc-responsive transcriptional regulator  36.15 
 
 
141 aa  84.3  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2399  transcriptional regulator, MerR family  37.01 
 
 
132 aa  84.3  5e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000424023  normal  0.796089 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>