More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_01412 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011138  MADE_01412  Transcriptional regulator MerR  100 
 
 
150 aa  309  1e-83  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.536111  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4315  MerR family transcriptional regulator  72.22 
 
 
130 aa  194  3e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02950  Hg(II)-responsive transcriptional regulator  73.64 
 
 
131 aa  189  1e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0289893  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3492  transcriptional regulator, MerR family protein  70.08 
 
 
135 aa  185  2e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02955  Hg(II)-responsive transcriptional regulator  69.05 
 
 
128 aa  182  2.0000000000000003e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0202543  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02041  Hg(II)-responsive transcriptional regulator  67.24 
 
 
116 aa  166  1e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0171  MerR family transcriptional regulator  58.46 
 
 
134 aa  158  2e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5990  mercury resistance regulatory protein MerR  48.39 
 
 
132 aa  134  4e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.479863 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1943  transcriptional regulator of MerR family protein  50.41 
 
 
135 aa  134  5e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.555422  normal  0.0105773 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0115  Hg(II)-responsive transcriptional regulator  47.58 
 
 
132 aa  131  3e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.889131  n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6344  Hg(II) resistance regulatory protein MerR  43.24 
 
 
162 aa  117  6e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000851109  unclonable  0.0000000537327 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2323  putative transcriptional regulator MerR  45.11 
 
 
144 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0083  putative transcriptional regulator MerR  45.04 
 
 
144 aa  114  3.9999999999999997e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.68539 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2269  MerR family transcriptional regulator  45.6 
 
 
135 aa  114  5e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.220473  normal 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6498  putative transcriptional regulator MerR  45.04 
 
 
144 aa  113  7.999999999999999e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0239269  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2341  putative transcriptional regulator MerR  45.04 
 
 
144 aa  113  7.999999999999999e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6171  putative transcriptional regulator MerR  45.04 
 
 
144 aa  113  7.999999999999999e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000597544  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0101  putative transcriptional regulator MerR  45.04 
 
 
144 aa  113  7.999999999999999e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.656805  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15480  putative transcriptional regulator MerR  45.04 
 
 
144 aa  113  7.999999999999999e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000744936  unclonable  4.377399999999999e-22 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1339  mercuric resistance operon regulatory protein  43.2 
 
 
135 aa  112  1.0000000000000001e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2129  putative transcriptional regulator MerR  45.04 
 
 
144 aa  112  1.0000000000000001e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4341  putative transcriptional regulator MerR  45.38 
 
 
151 aa  112  1.0000000000000001e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1338  MerR family transcriptional regulator  43.08 
 
 
135 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.683374  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1217  putative transcriptional regulator MerR  44.36 
 
 
144 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0168  putative transcriptional regulator MerR  44.62 
 
 
144 aa  112  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1783  putative transcriptional regulator MerR  44.7 
 
 
144 aa  111  3e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.45958  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0094  Hg(II)-responsive transcriptional regulator  44.19 
 
 
136 aa  111  3e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2836  transcriptional regulator, MerR family  42.86 
 
 
135 aa  110  4.0000000000000004e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.906455  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1474  MerR family transcriptional regulator  44.8 
 
 
135 aa  110  6e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.70041  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2232  putative transcriptional regulator MerR  45.6 
 
 
144 aa  110  7.000000000000001e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.620327  normal  0.3464 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4014  MerR family transcriptional regulator  42.19 
 
 
144 aa  109  1.0000000000000001e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1213  transcriptional regulator, MerR family  44.8 
 
 
144 aa  109  2.0000000000000002e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.276419  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0237  MerR family transcriptional regulator  45.95 
 
 
132 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0747  MerR family transcriptional regulator  42.86 
 
 
141 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0238  MerR family transcriptional regulator  41.94 
 
 
141 aa  108  2.0000000000000002e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4798  MerR family transcriptional regulator  44 
 
 
136 aa  107  4.0000000000000004e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2760  Hg(II)-responsive transcriptional regulator  44 
 
 
135 aa  107  6e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1301  MerR family transcriptional regulator  43.2 
 
 
135 aa  106  1e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.440008 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2312  MerR family transcriptional regulator  43.2 
 
 
135 aa  106  1e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  unclonable  0.000000000000678056  hitchhiker  0.000026005 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0164  transcriptional regulator, MerR family  41.6 
 
 
135 aa  106  1e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.768188  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1661  MerR family transcriptional regulator  37.9 
 
 
137 aa  104  4e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.282422  normal  0.34807 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0159  transcriptional regulator, MerR family  40.8 
 
 
135 aa  104  4e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0486  MerR family transcriptional regulator  41.6 
 
 
135 aa  102  1e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4537  Hg(II)-responsive transcriptional regulator  43.75 
 
 
132 aa  102  1e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4834  transcriptional regulator, MerR family  41.22 
 
 
144 aa  100  5e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.300455  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2198  MerR family transcriptional regulator  38.52 
 
 
135 aa  98.2  4e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3237  MerR family transcriptional regulator  38.28 
 
 
137 aa  97.4  6e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2686  MerR family transcriptional regulator  40.98 
 
 
172 aa  97.1  7e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1097  transcriptional regulator, MerR family  41.41 
 
 
133 aa  97.1  7e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3680  transcriptional regulator, MerR family  38.28 
 
 
133 aa  96.3  1e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.446637  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3184  transcriptional regulator, MerR family  44 
 
 
142 aa  96.3  1e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2453  transcriptional regulator, MerR family  38.58 
 
 
155 aa  95.5  2e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00000100878  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2699  MerR family transcriptional regulator  39.52 
 
 
171 aa  95.9  2e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4116  transcriptional regulator, MerR family  40.62 
 
 
133 aa  95.5  2e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2435  MerR family transcriptional regulator  40.77 
 
 
135 aa  94.7  3e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2024  mercuric resistance operon regulatory protein MerR  42.4 
 
 
130 aa  94.7  4e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2509  MerR family transcriptional regulator  35.61 
 
 
151 aa  94.4  5e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.591979 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1255  mercuric resistance operon regulatory protein MerR  41.6 
 
 
130 aa  94  6e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3726  MerR family transcriptional regulator  37.21 
 
 
140 aa  94  6e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2900  MerR family transcriptional regulator  38.52 
 
 
140 aa  94  7e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1395  MerR family transcriptional regulator  39.69 
 
 
146 aa  94  7e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.686505  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2122  MerR family transcriptional regulator  40.46 
 
 
131 aa  92  2e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.392854  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3133  MerR family transcriptional regulator  36.72 
 
 
139 aa  91.3  4e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.845727  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3373  MerR family transcriptional regulator  36.51 
 
 
136 aa  91.7  4e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0297855  normal  0.469131 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2155  transcriptional regulator, MerR family  34.68 
 
 
167 aa  91.3  4e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.000155365  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0800  MerR family transcriptional regulator  38.52 
 
 
142 aa  90.5  7e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.876996 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3156  MerR family transcriptional regulator  37.7 
 
 
146 aa  90.5  7e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.215145  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2325  MerR family transcriptional regulator  36.89 
 
 
147 aa  90.5  7e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0993  MerR family transcriptional regulator  36.8 
 
 
137 aa  89.7  1e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.335093  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2352  MerR family transcriptional regulator  36.51 
 
 
152 aa  88.2  4e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00208  zinc-responsive transcriptional regulator  36.43 
 
 
132 aa  88.2  4e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2322  MerR family transcriptional regulator  36.72 
 
 
139 aa  87.8  5e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0477  MerR family transcriptional regulator  34.68 
 
 
173 aa  87  8e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3209  MerR family transcriptional regulator  37.01 
 
 
138 aa  86.3  1e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2152  MerR family transcriptional regulator  34.4 
 
 
137 aa  85.9  2e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.845816  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5384  transcriptional regulator, MerR family  42.73 
 
 
149 aa  85.5  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4217  MerR family transcriptional regulator  36.51 
 
 
137 aa  85.5  2e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2399  transcriptional regulator, MerR family  32.8 
 
 
132 aa  85.5  2e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000424023  normal  0.796089 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2572  MerR family transcriptional regulator  30.47 
 
 
141 aa  85.1  3e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.957862  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1646  MerR family transcriptional regulator  40.19 
 
 
133 aa  84.7  4e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0373  transcriptional regulator, MerR family  35.71 
 
 
158 aa  84.3  5e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0543  transcriptional regulator, MerR family  35.71 
 
 
158 aa  84.3  5e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.166066  hitchhiker  0.000000593111 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2633  Cd(II)/Pb(II)-responsive transcriptional regulator  37.6 
 
 
162 aa  84  7e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.673518 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0495  MerR family transcriptional regulator  34.92 
 
 
139 aa  83.6  8e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.292362  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4673  transcriptional regulator, MerR family  35.38 
 
 
145 aa  83.2  0.000000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.156077  normal  0.0201833 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0211  MerR family transcriptional regulator  36 
 
 
140 aa  83.2  0.000000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2343  MerR family transcriptional regulator  36.8 
 
 
146 aa  83.2  0.000000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.264422  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1678  MerR family transcriptional regulator  36 
 
 
132 aa  82.8  0.000000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3410  hypothetical protein  33.86 
 
 
142 aa  83.2  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0303  transcriptional regulator, MerR family  33.08 
 
 
154 aa  82  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00540997  normal  0.988288 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4421  MerR family transcriptional regulator  36.72 
 
 
139 aa  82.4  0.000000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0298638  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4360  MerR family transcriptional regulator  33.08 
 
 
134 aa  81.6  0.000000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1218  MerR family transcriptional regulator  33.08 
 
 
134 aa  81.6  0.000000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4384  MerR family transcriptional regulator  33.08 
 
 
134 aa  81.6  0.000000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13367  MerR family transcriptional regulator  34.11 
 
 
146 aa  81.6  0.000000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.272142  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2981  MerR family transcriptional regulator  33.08 
 
 
134 aa  81.6  0.000000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1851  MerR family transcriptional regulator  34.4 
 
 
162 aa  82  0.000000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.138506  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1123  MerR family transcriptional regulator  35.46 
 
 
144 aa  82  0.000000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1339  transcriptional regulator of MerR family protein  34.92 
 
 
130 aa  82  0.000000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4954  regulatory protein, MerR  39.02 
 
 
143 aa  81.3  0.000000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00750643 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>