More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_1336 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_1336  MerR family transcriptional regulator  100 
 
 		 134 aa  270  6e-72  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1329  transcriptional regulator, MerR family  70.68 
 
 		 142 aa  199  9.999999999999999e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000000199488  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2954  transcriptional regulator, MerR family  69.92 
 
 		 142 aa  197  3e-50  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2844  transcriptional regulator, MerR family  72.09 
 
 		 134 aa  194  2.0000000000000003e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00099405  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1369  transcriptional regulator, MerR family  71.32 
 
 		 134 aa  191  2e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000004274 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1724  MerR family transcriptional regulator  68.85 
 
 		 134 aa  184  5e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.232228 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1400  MerR family transcriptional regulator  54.48 
 
 		 161 aa  149  1e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1599  MerR family transcriptional regulator  43.41 
 
 		 131 aa  117  4.9999999999999996e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2464  transcriptional regulator, MerR family  32.17 
 
 		 137 aa  80.5  0.000000000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5221  MerR family transcriptional regulator  32.82 
 
 		 135 aa  70.9  0.000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5053  MerR family transcriptional regulator  32.82 
 
 		 135 aa  70.9  0.000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5069  MerR family transcriptional regulator  32.82 
 
 		 135 aa  70.9  0.000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.587051  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5621  MerR family transcriptional regulator  32.82 
 
 		 135 aa  70.9  0.000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5464  transcriptional regulator, MerR family  32.82 
 
 		 135 aa  70.9  0.000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3676  transcriptional regulator, MerR family  31.58 
 
 		 143 aa  70.5  0.000000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.511555  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5166  MerR family transcriptional regulator  32.82 
 
 		 135 aa  70.5  0.000000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5502  MerR family transcriptional regulator  32.82 
 
 		 135 aa  70.1  0.000000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5550  transcriptional regulator, MerR family  32.82 
 
 		 135 aa  70.1  0.000000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2284  transcriptional regulator, MerR family  30.25 
 
 		 215 aa  70.1  0.000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2195  transcriptional regulator, MerR family  32.5 
 
 		 214 aa  70.1  0.000000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1256  transcriptional regulator, MerR family  33.33 
 
 		 142 aa  69.7  0.00000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1662  MerR family transcriptional regulator  30.25 
 
 		 215 aa  70.1  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.727696  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5456  transcriptional regulator, MerR family  32.06 
 
 		 135 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25610  predicted transcriptional regulator  32.76 
 
 		 129 aa  68.9  0.00000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5494  transcriptional regulator, MerR family  32.06 
 
 		 135 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1402  MerR family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 133 aa  69.3  0.00000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.87391  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1137  transcriptional regulator, MerR family  31.53 
 
 		 159 aa  68.6  0.00000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0198  MerR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 137 aa  68.6  0.00000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1639  MerR family transcriptional regulator  32 
 
 		 159 aa  67.8  0.00000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.270848  normal  0.040207 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0407  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  30 
 
 		 154 aa  67.8  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000267625 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06140  predicted transcriptional regulator  29.57 
 
 		 129 aa  67.8  0.00000000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0448  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  30 
 
 		 154 aa  67.8  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.17179e-17 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0393  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  30 
 
 		 154 aa  67.8  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.493726  hitchhiker  2.73635e-17 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0388  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  30 
 
 		 154 aa  67.8  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0385  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  30 
 
 		 154 aa  67.4  0.00000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000075209 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0035  transcriptional regulator, MerR family  28.97 
 
 		 167 aa  67.4  0.00000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.987448  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3303  MerR family transcriptional regulator  31.93 
 
 		 143 aa  67.4  0.00000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4066  MerR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 132 aa  67.4  0.00000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3790  MerR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 132 aa  67.4  0.00000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0361759  normal  0.548118 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4947  regulatory protein, MerR  29.57 
 
 		 129 aa  67  0.00000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.459947  decreased coverage  0.00286067 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0017  MerR family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 167 aa  67  0.00000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.801756 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2572  MerR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 141 aa  67  0.00000000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.957862  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0943  MerR family transcriptional regulator  35.43 
 
 		 138 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.608211  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0137  MerR family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 143 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2208  MerR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 190 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.194329  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3291  Cd(II)/Pb(II)-responsive transcriptional regulator  31.86 
 
 		 143 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0123  MerR family transcriptional regulator  31.09 
 
 		 143 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.329923  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3793  transcriptional regulator, MerR family  30.25 
 
 		 139 aa  66.2  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2371  MerR family transcriptional regulator  36.04 
 
 		 168 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00484931  normal  0.175809 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4049  MerR family transcriptional regulator  32 
 
 		 149 aa  66.2  0.0000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3886  MerR family transcriptional regulator  35.04 
 
 		 135 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.648362  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2932  MerR family transcriptional regulator  31.93 
 
 		 143 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.327003  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0113  MerR family transcriptional regulator  31.09 
 
 		 143 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0123  MerR family transcriptional regulator  31.93 
 
 		 143 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.169164  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4020  transcriptional regulator CadR  31.86 
 
 		 143 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2975  MerR family transcriptional regulator  31.86 
 
 		 143 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.501139  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2256  MerR family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 144 aa  66.2  0.0000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1564  MerR family transcriptional regulator  31.86 
 
 		 143 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2189  transcriptional regulator, MerR family  29.91 
 
 		 213 aa  65.9  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0218623 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0151  Cd(II)/Pb(II)-responsive transcriptional regulator  31.86 
 
 		 143 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.636208  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2325  MerR family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 135 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3947  Cd(II)/Pb(II)-responsive transcriptional regulator  31.86 
 
 		 143 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1407  MerR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 134 aa  66.2  0.0000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3334  MerR family transcriptional regulator  31.86 
 
 		 143 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3037  MerR family transcriptional regulator  31.86 
 
 		 143 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1771  transcriptional regulator, MerR family  28 
 
 		 151 aa  65.1  0.0000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.13408  normal  0.537849 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1026  MerR family transcriptional regulator  32.71 
 
 		 140 aa  64.7  0.0000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.120689  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0993  MerR family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 137 aa  64.7  0.0000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.335093  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2836  transcriptional regulator, MerR family  44.62 
 
 		 135 aa  64.3  0.0000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.906455  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0303  transcriptional regulator, MerR family  30.58 
 
 		 154 aa  64.3  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00540997  normal  0.988288 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1103  MerR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 135 aa  64.3  0.0000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.394367  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1117  MerR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 135 aa  64.3  0.0000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2902  MerR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 135 aa  64.3  0.0000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1604  MerR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 135 aa  64.3  0.0000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2912  MerR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 135 aa  64.3  0.0000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0392  MerR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 135 aa  64.3  0.0000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0882  MerR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 135 aa  64.3  0.0000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.656142 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4579  MerR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 134 aa  63.9  0.0000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.923905  decreased coverage  0.00324593 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0194  MerR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 135 aa  63.9  0.0000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1511  regulatory protein, MerR  34.74 
 
 		 178 aa  63.9  0.0000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.31333  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0220  MerR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 135 aa  63.9  0.0000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1961  MerR family transcriptional regulator  30.25 
 
 		 134 aa  63.9  0.0000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.778807  normal  0.944936 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0894  MerR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 135 aa  63.9  0.0000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0470  putative transcriptional regulator, MerR family  31.82 
 
 		 133 aa  63.9  0.0000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1816  transcriptional regulator, MerR family  44.62 
 
 		 164 aa  63.9  0.0000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.29408 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0593  MerR family transcriptional regulator  30.84 
 
 		 137 aa  63.5  0.0000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.429444  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4935  MerR family transcriptional regulator  33.06 
 
 		 139 aa  63.5  0.0000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.327998  normal  0.0174485 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3844  transcriptional regulator, MerR family  29.66 
 
 		 139 aa  63.5  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.603426 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4039  MerR family transcriptional regulator  29.57 
 
 		 130 aa  63.5  0.0000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.576602  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0749  transcriptional regulator, heavy metal-dependent  29.57 
 
 		 133 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5280  transcriptional regulator CadR  29.2 
 
 		 148 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1373  MerR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 159 aa  63.2  0.000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.366441  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0122  MerR family transcriptional regulator  29.51 
 
 		 143 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0052  transcriptional regulator, MerR family  32.8 
 
 		 157 aa  63.5  0.000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3680  transcriptional regulator, MerR family  29.57 
 
 		 133 aa  63.2  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.446637  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4002  MerR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 135 aa  63.5  0.000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1374  MerR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 164 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.43042  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2220  MerR family transcriptional regulator  35.58 
 
 		 164 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2386  MerR family transcriptional regulator  35.58 
 
 		 255 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0802  MerR family transcriptional regulator  48.48 
 
 		 165 aa  62  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0285806 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>