66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_3117 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_3117  transcriptional regulator, MerR family  100 
 
 		 86 aa  177  4e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.484464  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1155  transcriptional regulator, MerR family  37.31 
 
 		 128 aa  49.3  0.00002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0258201  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3620  transcriptional regulator, MerR family  36.84 
 
 		 148 aa  48.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2494  transcriptional regulator, MerR family  36.84 
 
 		 148 aa  48.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.453842  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1150  transcriptional regulator, MerR family  38.57 
 
 		 135 aa  47.4  0.00006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00496019 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1816  MerR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 154 aa  47.4  0.00008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0245036  normal  0.855302 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10940  transcriptional regulator, MerR family  31.58 
 
 		 153 aa  47  0.00008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.07291  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1320  transcriptional regulator, MerR family  33.33 
 
 		 254 aa  46.2  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1199  MerR family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 138 aa  45.1  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.00877844  normal  0.661473 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1494  redox-sensitive transcriptional activator SoxR  35.29 
 
 		 165 aa  45.1  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.163233 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4421  MerR family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 139 aa  45.1  0.0003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0298638  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1777  MerR family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 145 aa  45.1  0.0003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0593  MerR family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 137 aa  45.1  0.0004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.429444  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3299  MerR family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 149 aa  44.3  0.0005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0169089  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4509  transcriptional regulator, MerR family  37.31 
 
 		 129 aa  44.3  0.0006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0125189 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4119  MerR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 137 aa  43.9  0.0007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1646  MerR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 133 aa  43.9  0.0007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2931  MerR family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 138 aa  43.9  0.0008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.68732 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2284  transcriptional regulator, MerR family  33.33 
 
 		 215 aa  43.1  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3456  MerR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 149 aa  43.5  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0408  redox-sensitive transcriptional activator SoxR  33.82 
 
 		 153 aa  43.5  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.381542  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1373  MerR family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 159 aa  43.1  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.175288 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4947  regulatory protein, MerR  34.33 
 
 		 129 aa  42  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.459947  decreased coverage  0.00286067 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2125  redox-sensitive transcriptional activator SoxR  33.33 
 
 		 150 aa  42.4  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0226644  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2195  transcriptional regulator, MerR family  33.8 
 
 		 214 aa  42.7  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1755  MerR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 342 aa  42.4  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.581641  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2233  MerR family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 138 aa  42.4  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.366472 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1662  MerR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 215 aa  42.4  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.727696  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3207  putative transcriptional regulator, MerR family  32.35 
 
 		 143 aa  42  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.789074  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2489  putative transcriptional regulator, MerR family  33.33 
 
 		 162 aa  42  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00633728 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4838  regulatory protein, MerR  32.84 
 
 		 148 aa  41.6  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1517  MerR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 342 aa  42  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.242009 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2443  MerR family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 140 aa  42  0.003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6337  MerR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 342 aa  42  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1663  MerR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 343 aa  42  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.350781  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1742  MerR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 342 aa  42  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4090  putative MerR/CueR family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 137 aa  41.2  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.849727  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5038  MerR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 342 aa  41.6  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.99192 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06140  predicted transcriptional regulator  35.82 
 
 		 129 aa  41.6  0.004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25610  predicted transcriptional regulator  35.82 
 
 		 129 aa  41.6  0.004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2699  MerR family transcriptional regulator  27.14 
 
 		 171 aa  41.6  0.004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5280  transcriptional regulator CadR  31.34 
 
 		 148 aa  41.2  0.005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0738  transcriptional regulator, MerR family  32.35 
 
 		 160 aa  41.2  0.005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.282121  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0159  transcriptional regulator, MerR family  29.41 
 
 		 135 aa  41.2  0.005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0745  aldo/keto reductase  35.38 
 
 		 449 aa  41.2  0.005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4070  transcriptional regulator, MerR family  30.88 
 
 		 132 aa  41.2  0.005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.336663 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1609  MerR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 272 aa  41.2  0.005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.822901  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0164  transcriptional regulator, MerR family  29.41 
 
 		 135 aa  40.8  0.006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.768188  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3253  transcriptional regulator, MerR family  27.78 
 
 		 249 aa  40.8  0.006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000117096  decreased coverage  0.00000535061 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2818  transcriptional regulator, MerR family  29.58 
 
 		 171 aa  40.8  0.006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000370461  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0980  MerR family transcriptional regulator  36.23 
 
 		 648 aa  40.8  0.006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000675  redox-sensitive transcriptional activator soxR  28.57 
 
 		 143 aa  40.8  0.007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.27209  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0115  Hg(II)-responsive transcriptional regulator  30.43 
 
 		 132 aa  40.4  0.008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.889131  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3788  MerR family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 144 aa  40.4  0.008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.318416  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2009  transcriptional regulator, MerR family  29.41 
 
 		 152 aa  40.4  0.008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1547  MerR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 143 aa  40.4  0.008  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0148728  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1701  transcriptional regulator, MerR family  29.41 
 
 		 152 aa  40.4  0.009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.201474  normal  0.917872 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2558  MerR family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 139 aa  40.4  0.009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4072  transcriptional regulator, MerR family  30.43 
 
 		 140 aa  40  0.009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.44146 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3141  redox-sensitive transcriptional activator SoxR  32.35 
 
 		 159 aa  40.4  0.009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.814433  normal  0.503062 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5097  transcriptional regulator, MerR family  28.99 
 
 		 303 aa  40.4  0.009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0313452 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6360  transcriptional regulator, MerR family  28.99 
 
 		 152 aa  40.4  0.009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.241077  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0010  hypothetical protein  33.82 
 
 		 270 aa  40.4  0.009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1129  MerR family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 131 aa  40.4  0.009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.560457  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5322  transcriptional regulator, MerR family  31.34 
 
 		 320 aa  40  0.01  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4431  transcriptional regulator, MerR family  34.62 
 
 		 160 aa  40  0.01  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.290243  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>