More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_2769 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_2769  transcriptional regulator, MerR family  100 
 
 		 230 aa  471  1e-132  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.545239  normal  0.552398 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2513  transcriptional regulator, MerR family  95.65 
 
 		 230 aa  451  1.0000000000000001e-126  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.106172  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2795  transcriptional regulator  51.81 
 
 		 230 aa  193  2e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.131484  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2106  MerR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 156 aa  63.9  0.000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.63412  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0091  MerR family transcriptional regulator  31.93 
 
 		 138 aa  63.5  0.000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.266234  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1538  MerR family transcriptional regulator  39.56 
 
 		 153 aa  63.2  0.000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.129222  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4538  transcriptional activator for superoxide response; Fe-S center for redox-sensing (MerR family)  33.08 
 
 		 169 aa  61.2  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.485722  normal  0.455986 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2996  transcriptional regulator, MerR family  30.25 
 
 		 152 aa  60.8  0.00000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3791  MerR family transcriptional regulator  35 
 
 		 149 aa  60.5  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.23211 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1053  MerR family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 173 aa  59.3  0.00000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.582501 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0820  MerR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 131 aa  58.9  0.00000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.575513  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0770  MerR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 151 aa  58.5  0.00000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.744449  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3653  transcriptional regulator, MerR family  35 
 
 		 234 aa  57.8  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.885436  normal  0.0353896 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1311  MerR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 132 aa  57.4  0.0000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3063  MerR family transcriptional regulator  42.03 
 
 		 142 aa  57.4  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.858131  normal  0.492052 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2244  regulatory protein, MerR  35.37 
 
 		 135 aa  57.4  0.0000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0024  MerR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 156 aa  57  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1994  MerR family transcriptional regulator  38.75 
 
 		 135 aa  56.2  0.0000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0132  MerR family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 160 aa  56.2  0.0000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.159933  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1459  MerR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 132 aa  55.5  0.0000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.425414 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0636  transcriptional regulator, MerR family  44.93 
 
 		 160 aa  55.5  0.0000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2972  MerR family transcriptional regulator  32.93 
 
 		 135 aa  55.5  0.0000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.54764  normal  0.504684 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2845  MerR family transcriptional regulator  32.93 
 
 		 135 aa  55.5  0.0000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0537  MerR family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 160 aa  55.1  0.0000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.400616  normal  0.698337 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0339  MerR family transcriptional regulator  34 
 
 		 253 aa  55.1  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.841288 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2569  MerR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 133 aa  55.1  0.000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2726  transcriptional regulator, MerR family protein  31.33 
 
 		 136 aa  54.7  0.000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.505695  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2827  MerR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 135 aa  54.3  0.000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1531  transcriptional regulator, MerR family  31.71 
 
 		 135 aa  54.3  0.000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.152534  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1415  transcriptional regulator, MerR family  32.03 
 
 		 143 aa  54.7  0.000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.0000000599633  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1898  transcriptional regulator, putative  31.71 
 
 		 134 aa  53.9  0.000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3016  MerR family transcriptional regulator  28.08 
 
 		 277 aa  53.9  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0684201  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2364  MerR family transcriptional regulator  27.91 
 
 		 188 aa  53.9  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0143687  normal  0.157085 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3972  MerR family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 149 aa  54.3  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2321  MerR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 134 aa  53.9  0.000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2393  MerR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 134 aa  53.9  0.000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.790409 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0461  MerR family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 174 aa  53.5  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0313707  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0266  transcriptional regulator, MerR family  31.62 
 
 		 161 aa  53.9  0.000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00988584 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1673  MerR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 134 aa  53.9  0.000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1189  MerR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 156 aa  53.5  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001544  predicted transcriptional regulator LiuR of leucine degradation pathway MerR family  40.62 
 
 		 124 aa  54.3  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0102  regulatory protein, MerR  34.38 
 
 		 130 aa  53.1  0.000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2820  MerR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 176 aa  53.1  0.000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.218132  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05481  hypothetical protein  39.06 
 
 		 127 aa  53.1  0.000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5291  transcriptional regulator, MerR family  39.68 
 
 		 145 aa  52.8  0.000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0253946  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0576  MerR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 134 aa  52.8  0.000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0456359  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1823  transcriptional regulator, MerR family  39.06 
 
 		 183 aa  52.4  0.000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.8156  normal  0.10618 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1546  MerR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 161 aa  52.4  0.000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.548833  normal  0.109608 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3609  transcriptional regulator, MerR family  30.97 
 
 		 288 aa  52  0.000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.279155  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06555  Zn(II)-responsive regulator of ZntA  32.38 
 
 		 145 aa  52  0.000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0004  MerR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 169 aa  52  0.000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3099  MerR family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 143 aa  52  0.000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00609185  decreased coverage  0.00847969 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2489  putative transcriptional regulator, MerR family  37.68 
 
 		 162 aa  51.2  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00633728 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1720  MerR family transcriptional regulator  32.47 
 
 		 134 aa  51.2  0.00001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4036  MerR family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 155 aa  51.2  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.614609  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5131  MerR family transcriptional regulator  36 
 
 		 166 aa  51.2  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.533425  normal  0.589756 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2818  transcriptional regulator, MerR family  32.04 
 
 		 171 aa  51.2  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000370461  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2867  MerR family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 169 aa  51.2  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.374801 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2276  MerR family transcriptional regulator  30.07 
 
 		 184 aa  51.6  0.00001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.101998  hitchhiker  0.00000024461 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4442  MerR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 145 aa  50.8  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0160175 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1604  MerR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 132 aa  50.8  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.408044  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1854  MerR family transcriptional regulator  36 
 
 		 166 aa  50.4  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.674161  normal  0.0887351 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6235  MerR family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 153 aa  50.4  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.204034  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6249  MerR family transcriptional regulator  36 
 
 		 166 aa  50.8  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.256623  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1768  MerR family transcriptional regulator  36 
 
 		 166 aa  50.4  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1830  MerR family transcriptional regulator  36 
 
 		 166 aa  50.8  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00524998  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1844  MerR family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 153 aa  50.4  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.051898  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4525  redox-sensitive transcriptional activator SoxR  35.05 
 
 		 154 aa  50.4  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2806  redox-sensitive transcriptional activator SoxR  31.43 
 
 		 158 aa  50.1  0.00003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.37472  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9086  putative transcriptional regulator, MerR family  32.41 
 
 		 162 aa  50.1  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1868  MerR family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 153 aa  50.1  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.158881  hitchhiker  0.000791021 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2496  transcriptional regulator, MerR family  32.08 
 
 		 259 aa  50.1  0.00003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1782  MerR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 153 aa  49.7  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000376  predicted transcriptional regulator LiuR of leucine degradation pathway MerR family  34.12 
 
 		 128 aa  50.1  0.00003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000675  redox-sensitive transcriptional activator soxR  32 
 
 		 143 aa  50.1  0.00003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.27209  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1754  MerR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 153 aa  49.7  0.00004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.164418 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2969  MerR family transcriptional regulator  32.48 
 
 		 130 aa  49.7  0.00004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0979935  normal  0.0797223 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3207  putative transcriptional regulator, MerR family  34 
 
 		 143 aa  49.7  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.789074  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3222  MerR family transcriptional regulator  31.17 
 
 		 132 aa  49.7  0.00004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.012049 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2851  transcriptional regulator, MerR family  32.48 
 
 		 135 aa  49.3  0.00005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1595  putative heavy metal regulator HmrR  26.67 
 
 		 137 aa  49.3  0.00005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1332  transcriptional regulator, MerR family  31.09 
 
 		 128 aa  49.3  0.00005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0224558 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1363  MerR family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 134 aa  49.3  0.00005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.381305 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3642  transcriptional regulator, MerR family  31.96 
 
 		 158 aa  49.3  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0408  redox-sensitive transcriptional activator SoxR  34.04 
 
 		 153 aa  48.9  0.00006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.381542  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02411  Transcriptional regulator, MerR family protein  37.1 
 
 		 151 aa  48.9  0.00006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2796  MerR family transcriptional regulator  28.92 
 
 		 132 aa  48.9  0.00006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0245  transcriptional regulator  30.65 
 
 		 123 aa  48.9  0.00007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000476333  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4811  MerR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 144 aa  48.9  0.00007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.229804  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3929  transcriptional regulator, MerR family  34.02 
 
 		 154 aa  48.5  0.00008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2060  transcriptional regulator SoxR  28.12 
 
 		 151 aa  48.5  0.00008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2950  MerR family transcriptional regulator  29.37 
 
 		 161 aa  48.5  0.00008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4581  redox-sensitive transcriptional activator SoxR  34.02 
 
 		 154 aa  48.5  0.00008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2558  transcriptional regulator, MerR family  31.09 
 
 		 128 aa  48.5  0.00008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.327244 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3964  MerR family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 154 aa  48.5  0.00008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0321214 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03895  hypothetical protein  34.02 
 
 		 154 aa  48.5  0.00008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0184757  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4616  redox-sensitive transcriptional activator SoxR  34.02 
 
 		 154 aa  48.5  0.00008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4305  redox-sensitive transcriptional activator SoxR  34.02 
 
 		 154 aa  48.5  0.00008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3273  regulatory protein GnyR  35.71 
 
 		 134 aa  48.5  0.00008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5566  redox-sensitive transcriptional activator SoxR  34.02 
 
 		 154 aa  48.5  0.00008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.953635  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>