More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_0245 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008527  LACR_0245  transcriptional regulator  100 
 
 		 123 aa  249  1e-65  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000476333  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0323  transcriptional regulator  39.09 
 
 		 117 aa  94.7  3e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0420386  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0702  transcriptional regulator  31.19 
 
 		 119 aa  72.8  0.000000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.271355  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10880  predicted transcriptional regulator  31.45 
 
 		 145 aa  67.4  0.00000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25610  predicted transcriptional regulator  35.42 
 
 		 129 aa  60.5  0.000000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06140  predicted transcriptional regulator  35.42 
 
 		 129 aa  60.5  0.000000007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2806  redox-sensitive transcriptional activator SoxR  36.11 
 
 		 158 aa  60.5  0.000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.37472  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3662  transcriptional regulator, MerR family  35.05 
 
 		 146 aa  58.9  0.00000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0745  aldo/keto reductase  31.3 
 
 		 449 aa  58.9  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0543  transcriptional regulator, MerR family  35.71 
 
 		 158 aa  57.8  0.00000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.166066  hitchhiker  0.000000593111 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0373  transcriptional regulator, MerR family  35.71 
 
 		 158 aa  57.8  0.00000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4945  regulatory protein, MerR  32.26 
 
 		 147 aa  57.4  0.00000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0828053  hitchhiker  0.00815362 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0486  MerR family transcriptional regulator  36.63 
 
 		 113 aa  57  0.00000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.277411  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2152  putative transcriptional regulator, MerR family  32.08 
 
 		 121 aa  57  0.00000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00240  predicted transcriptional regulator  29.73 
 
 		 114 aa  56.6  0.0000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1003  transcriptional regulator, MerR family  30.89 
 
 		 125 aa  55.8  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3623  MerR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 142 aa  55.8  0.0000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1319  transcriptional regulator, MerR family  33.33 
 
 		 127 aa  55.5  0.0000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.505264  normal  0.026746 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1777  MerR family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 145 aa  55.8  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3961  MerR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 142 aa  55.8  0.0000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.146237  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3209  MerR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 138 aa  55.8  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0636  transcriptional regulator, MerR family  28.23 
 
 		 160 aa  55.1  0.0000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2008  transcriptional regulator, MerR family  33.33 
 
 		 148 aa  55.1  0.0000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.505788  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4290  transcriptional regulator, MerR family  30.09 
 
 		 130 aa  54.7  0.0000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.66586 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1885  MerR family transcriptional regulator  35.64 
 
 		 113 aa  54.7  0.0000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.375979 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4947  regulatory protein, MerR  31.25 
 
 		 129 aa  54.3  0.0000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.459947  decreased coverage  0.00286067 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4100  MerR family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 127 aa  53.9  0.0000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.686135  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13367  MerR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 146 aa  53.9  0.0000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.272142  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04780  transcriptional regulator, MerR family  31.19 
 
 		 118 aa  53.9  0.0000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000795596  normal  0.576293 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4570  regulatory protein MerR  29.13 
 
 		 149 aa  53.9  0.0000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.922627  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0409  TipAS antibiotic-recognition domain protein  33.33 
 
 		 259 aa  53.9  0.0000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4137  MerR family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 138 aa  53.5  0.0000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0427  MerR family transcriptional regulator  28.07 
 
 		 129 aa  53.1  0.000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6606  MerR family transcriptional regulator  31.09 
 
 		 142 aa  53.5  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3410  hypothetical protein  31.67 
 
 		 142 aa  53.1  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009008  RSP_7395  MerR family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 138 aa  53.1  0.000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00890  predicted transcriptional regulator  26.36 
 
 		 129 aa  53.5  0.000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0056  soxR protein  36.99 
 
 		 148 aa  52.8  0.000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0560475  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3507  transcriptional regulator, MerR family  30.25 
 
 		 158 aa  52.8  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.278393 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23560  transcriptional regulator, MerR family  39.73 
 
 		 138 aa  52.4  0.000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.346447  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1161  transcriptional regulator, MerR family  30.09 
 
 		 142 aa  52.4  0.000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0215718 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0088  aldo/keto reductase  30.17 
 
 		 491 aa  52.4  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02350  transcriptional regulator, MerR family  29.6 
 
 		 156 aa  52.4  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0160379  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1155  transcriptional regulator, MerR family  32.32 
 
 		 128 aa  52.4  0.000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0258201  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0438  transcriptional regulator, MerR family  33.04 
 
 		 137 aa  51.6  0.000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0085  MerR family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 117 aa  52  0.000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4834  transcriptional regulator, MerR family  29.09 
 
 		 144 aa  52  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.300455  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4464  MerR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 130 aa  52  0.000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4295  MerR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 130 aa  52  0.000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4195  MerR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 130 aa  52  0.000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3373  MerR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 136 aa  51.6  0.000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0297855  normal  0.469131 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1394  MerR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 188 aa  52  0.000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0440  transcriptional regulator, MerR family  29.91 
 
 		 129 aa  51.6  0.000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.394631  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3788  MerR family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 144 aa  51.6  0.000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.318416  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24080  transcriptional regulator, MerR family  32.35 
 
 		 140 aa  51.2  0.000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4421  MerR family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 139 aa  51.2  0.000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0298638  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2655  zinc-responsive transcriptional regulator  41.18 
 
 		 133 aa  51.2  0.000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2848  MerR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 142 aa  51.6  0.000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0082  MerR family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 117 aa  51.6  0.000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0086  MerR family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 117 aa  51.6  0.000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2458  transcriptional regulator, MerR family  28.57 
 
 		 119 aa  51.2  0.000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4237  MerR family transcriptional regulator  28.85 
 
 		 136 aa  51.2  0.000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.428618  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3453  MerR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 163 aa  50.8  0.000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0445527  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5683  MerR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 149 aa  50.8  0.000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6047  MerR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 149 aa  50.8  0.000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.790418 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0531  transcriptional regulator, MerR family  36.76 
 
 		 155 aa  50.8  0.000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0052  transcriptional regulator, MerR family  40.28 
 
 		 157 aa  50.8  0.000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1480  redox-sensitive transcriptional activator SoxR  38.36 
 
 		 148 aa  50.8  0.000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.00810919  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1699  MerR family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 149 aa  50.8  0.000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00675025  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2202  MerR family transcriptional regulator  26.15 
 
 		 158 aa  50.8  0.000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2454  transcriptional regulator, MerR family  31.68 
 
 		 159 aa  50.8  0.000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.589296  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0593  MerR family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 137 aa  50.4  0.000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.429444  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4070  transcriptional regulator, MerR family  32.35 
 
 		 132 aa  50.4  0.000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.336663 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6360  transcriptional regulator, MerR family  41.79 
 
 		 152 aa  50.4  0.000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.241077  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5312  transcriptional regulator, MerR family  30.61 
 
 		 117 aa  50.4  0.000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3653  transcriptional regulator, MerR family  43.08 
 
 		 234 aa  50.4  0.000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.885436  normal  0.0353896 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1943  transcriptional regulator of MerR family protein  29.57 
 
 		 135 aa  50.4  0.000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.555422  normal  0.0105773 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3828  MerR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 122 aa  50.1  0.000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1915  MerR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 136 aa  50.1  0.00001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5322  transcriptional regulator, MerR family  36.23 
 
 		 320 aa  49.7  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1070  transcriptional regulator, MerR family  33.01 
 
 		 256 aa  49.7  0.00001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.01274  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0271  MerR family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 156 aa  49.7  0.00001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1151  MerR family transcriptional regulator  29.59 
 
 		 133 aa  49.7  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.100669  hitchhiker  0.000000311334 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2081  MerR family transcriptional regulator  36 
 
 		 117 aa  50.1  0.00001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.665595  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06131  Zn(II)-responsive regulator of ZntA  32.67 
 
 		 128 aa  50.1  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06555  Zn(II)-responsive regulator of ZntA  32.88 
 
 		 145 aa  49.7  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2841  transcriptional regulator, MerR family  39.06 
 
 		 125 aa  49.7  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.429169  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4283  MerR family transcriptional regulator  32 
 
 		 113 aa  49.7  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.85164  normal  0.1781 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1287  MerR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 155 aa  50.1  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.422706  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0626  transcriptional regulator  27.1 
 
 		 115 aa  50.1  0.00001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01184  Transcriptional regulator, MerR family protein  37.63 
 
 		 137 aa  49.7  0.00001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1034  SoxR family transcriptional regulator  26.13 
 
 		 142 aa  49.7  0.00001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4827  MerR family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 137 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1255  mercuric resistance operon regulatory protein MerR  27.88 
 
 		 130 aa  49.3  0.00002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1032  transcriptional regulator, MerR family  27.55 
 
 		 144 aa  48.9  0.00002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.920994  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3223  transcriptional regulator, MerR family  30.17 
 
 		 134 aa  48.9  0.00002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0351444  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01780  transcriptional regulator, MerR family  33.03 
 
 		 158 aa  49.3  0.00002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.95899 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2435  MerR family transcriptional regulator  28.83 
 
 		 135 aa  49.7  0.00002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2620  MerR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 159 aa  48.9  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2664  MerR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 159 aa  48.9  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.674524 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>