141 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_1241 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013216  Dtox_1241  Resolvase domain protein  100 
 
 
222 aa  451  1.0000000000000001e-126  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0456632  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2781  Resolvase domain protein  97.3 
 
 
222 aa  441  1e-123  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.912906 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0851  regulatory protein MerR  96.85 
 
 
222 aa  438  9.999999999999999e-123  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0751  Resolvase domain protein  97.57 
 
 
209 aa  406  1.0000000000000001e-112  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0272  Resolvase domain protein  40.83 
 
 
229 aa  163  2.0000000000000002e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000593088  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1118  Resolvase domain protein  39.91 
 
 
229 aa  160  1e-38  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000220769  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2000  DNA binding domain protein, excisionase family  43.75 
 
 
212 aa  156  2e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.27976  normal  0.357405 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0744  Resolvase domain protein  40.37 
 
 
229 aa  156  2e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.000000124642  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1913  Resolvase domain protein  38.39 
 
 
208 aa  155  4e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2194  Resolvase domain protein  38.39 
 
 
208 aa  154  1e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.72008  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0785  Resolvase domain protein  43.98 
 
 
202 aa  149  2e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00525149  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1070  resolvase domain-containing protein  43.98 
 
 
197 aa  148  7e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.709621  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0236  Resolvase domain protein  43.98 
 
 
195 aa  146  3e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000223632  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0947  Resolvase domain protein  43.98 
 
 
195 aa  144  9e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000000151254  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1000  Resolvase domain protein  39.41 
 
 
206 aa  141  8e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0589477 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2935  Resolvase domain protein  39.41 
 
 
206 aa  141  8e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1449  Resolvase domain protein  42.86 
 
 
207 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0392946  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1710  resolvase domain-containing protein  35.48 
 
 
222 aa  132  3.9999999999999996e-30  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1513  DNA binding domain protein, excisionase family  40.31 
 
 
213 aa  127  1.0000000000000001e-28  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2716  DNA binding domain protein, excisionase family  40.31 
 
 
213 aa  127  1.0000000000000001e-28  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  decreased coverage  0.00788025  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1808  DNA binding domain protein, excisionase family  36.32 
 
 
219 aa  126  2.0000000000000002e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1174  DNA binding domain protein, excisionase family  34.21 
 
 
219 aa  124  9e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.122691  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0658  hypothetical protein  34.76 
 
 
215 aa  122  4e-27  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1564  hypothetical protein  34.76 
 
 
215 aa  122  4e-27  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.20655  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0941  resolvase domain-containing protein  35.26 
 
 
208 aa  122  6e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0143335  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0464  regulatory protein MerR  62.62 
 
 
100 aa  122  6e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.169334 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1911  DNA binding domain-containing protein  37.26 
 
 
216 aa  121  7e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1111  DNA binding domain-containing protein  39.38 
 
 
215 aa  120  9.999999999999999e-27  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.385151  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0754  Resolvase domain protein  33.17 
 
 
207 aa  115  3.9999999999999997e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0122  DNA binding domain protein, excisionase family  37.44 
 
 
216 aa  115  5e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0131  DNA binding domain protein, excisionase family  37.44 
 
 
216 aa  115  5e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000948008  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1190  DNA binding domain protein, excisionase family  37.44 
 
 
216 aa  114  7.999999999999999e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2513  Resolvase domain protein  38.14 
 
 
195 aa  114  8.999999999999998e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0390  DNA binding domain protein, excisionase family  34.56 
 
 
216 aa  113  2.0000000000000002e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0112175  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0484  DNA binding domain protein, excisionase family  37.13 
 
 
216 aa  113  2.0000000000000002e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.114276  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1304  transposon resolvase  33.16 
 
 
209 aa  113  3e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0311544  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0522  DNA binding domain protein, excisionase family  34.65 
 
 
244 aa  107  1e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0170413  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1033  transposon resolvase  41.45 
 
 
204 aa  107  1e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.412274  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0818  DNA binding domain protein, excisionase family  33.8 
 
 
216 aa  107  2e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1717  regulatory protein MerR  34.52 
 
 
201 aa  105  5e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.212526  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0465  resolvase-like protein  33.64 
 
 
219 aa  105  6e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.123984  normal 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3324  resolvase domain-containing protein  35.45 
 
 
197 aa  104  9e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.296266  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2574  DNA binding domain protein, excisionase family  36.41 
 
 
194 aa  102  5e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.235149  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2645  DNA binding domain protein, excisionase family  36.08 
 
 
192 aa  102  5e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0895  DNA binding domain protein, excisionase family  36.36 
 
 
192 aa  101  7e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3670  DNA binding domain-containing protein  36.08 
 
 
201 aa  101  8e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.635315  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2443  DNA binding domain protein, excisionase family  36.36 
 
 
193 aa  101  1e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.453884  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1219  DNA binding domain protein, excisionase family  32.46 
 
 
201 aa  99.8  3e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0911  DNA binding domain protein, excisionase family  37.16 
 
 
192 aa  98.6  6e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  unclonable  0.00000302589  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0948  site-specific integrase/resolvase  31.75 
 
 
209 aa  98.2  9e-20  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.531266  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10939  resolvase  39.39 
 
 
193 aa  97.1  2e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2048  Resolvase domain protein  35.83 
 
 
193 aa  95.9  4e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0322526  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3893  DNA binding domain protein, excisionase family  31.5 
 
 
203 aa  95.1  7e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3943  DNA binding domain protein, excisionase family  31.5 
 
 
203 aa  95.1  7e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000130893  normal  0.0337021 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1105  transposon resolvase  36.15 
 
 
196 aa  94.4  1e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.600674  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2150  DNA binding domain protein, excisionase family  35.71 
 
 
195 aa  94  2e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12805  resolvase  35.66 
 
 
193 aa  92  6e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00189559  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1270  Resolvase domain protein  32.11 
 
 
195 aa  90.5  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3431  resolvase-like protein  33.14 
 
 
197 aa  89.4  4e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2683  resolvase-like protein  31.64 
 
 
190 aa  88.6  6e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.300522  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12994  resolvase  31.85 
 
 
194 aa  88.6  7e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000478883  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10616  resolvase  33.33 
 
 
202 aa  86.3  4e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000496522  normal  0.221326 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0684  resolvase domain-containing protein  34.11 
 
 
190 aa  85.9  4e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.245344 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5676  resolvase domain-containing protein  34.11 
 
 
190 aa  85.9  4e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2002  regulatory protein, MerR  38.57 
 
 
148 aa  85.1  8e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2393  DNA binding domain protein, excisionase family  35.16 
 
 
191 aa  82  0.000000000000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0842  resolvase domain-containing protein  30.66 
 
 
196 aa  81.3  0.00000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.419  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1614  resolvase domain-containing protein  29.31 
 
 
182 aa  80.9  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00182311  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1224  putative site-specific integrase-resolvase  30.73 
 
 
197 aa  80.9  0.00000000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.997311  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5986  resolvase domain-containing protein  32.26 
 
 
162 aa  77.8  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00224994  normal  0.0280728 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1220  DNA binding domain protein, excisionase family  26.29 
 
 
201 aa  77.4  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13862  resolvase  32.31 
 
 
203 aa  73.2  0.000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11450  Resolvase domain protein  29.71 
 
 
219 aa  63.2  0.000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000780792  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2776  putative resolvase  31 
 
 
116 aa  61.6  0.00000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.481265  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1218  resolvase domain protein  28.95 
 
 
205 aa  53.5  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1074  resolvase, N- domain protein  50.91 
 
 
58 aa  53.5  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3805  resolvase-like protein  38.02 
 
 
526 aa  52.8  0.000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.296715  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1191  Resolvase domain protein  28.42 
 
 
205 aa  52.8  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5613  transcriptional regulator, MerR family  51.22 
 
 
283 aa  52.4  0.000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.395167  normal  0.0913658 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2336  recombinase  40.23 
 
 
532 aa  51.2  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.430525  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4027  transcriptional regulator, MerR family  37.74 
 
 
269 aa  49.7  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7693  transcriptional regulator MerR family  44.9 
 
 
271 aa  49.7  0.00004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.56372  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4678  MerR family transcriptional regulator  52.78 
 
 
276 aa  49.3  0.00005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.825044  normal  0.111013 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4357  transcriptional regulator, MerR family  37.74 
 
 
269 aa  48.5  0.00008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00580847 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2084  regulatory protein MerR  42.25 
 
 
94 aa  48.1  0.0001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2278  MerR family transcriptional regulator  38 
 
 
273 aa  47.8  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.408305  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0233  resolvase  27.85 
 
 
183 aa  47.8  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0463  Resolvase domain protein  36.59 
 
 
475 aa  47.8  0.0001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0983248  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0202  resolvase  27.85 
 
 
183 aa  47.8  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0740  MerR family transcriptional regulator  44.23 
 
 
299 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1384  regulatory protein, MerR  40.38 
 
 
132 aa  47.4  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3567  transcriptional regulator, MerR family  34.21 
 
 
389 aa  47  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.728715  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0486  Resolvase domain protein  37.18 
 
 
515 aa  47  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.325495  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0768  MerR family transcriptional regulator  44.23 
 
 
299 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.819465  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5133  Resolvase domain  26.53 
 
 
539 aa  47.4  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.880179 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1960  site-specific integrase-resolvase-like  30.56 
 
 
147 aa  46.6  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.4652  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1425  putative resolvase  36.84 
 
 
126 aa  47  0.0003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007411  Ava_A0025  resolvase  41.56 
 
 
511 aa  46.2  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.712822  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5553  resolvase domain protein  35.9 
 
 
515 aa  45.4  0.0006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.919369999999999e-21 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0781  MerR family transcriptional regulator  42.31 
 
 
299 aa  45.4  0.0007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.818873  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>