141 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC8801_3893 on replicon NC_011726
Organism: Cyanothece sp. PCC 8801



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011726  PCC8801_3893  DNA binding domain protein, excisionase family  100 
 
 
203 aa  409  1e-113  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3943  DNA binding domain protein, excisionase family  100 
 
 
203 aa  409  1e-113  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000130893  normal  0.0337021 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1219  DNA binding domain protein, excisionase family  67.68 
 
 
201 aa  292  3e-78  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1220  DNA binding domain protein, excisionase family  61.11 
 
 
201 aa  257  8e-68  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3670  DNA binding domain-containing protein  51.01 
 
 
201 aa  199  1.9999999999999998e-50  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.635315  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1218  resolvase domain protein  41.58 
 
 
205 aa  186  3e-46  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1191  Resolvase domain protein  41.58 
 
 
205 aa  183  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0658  hypothetical protein  46.11 
 
 
215 aa  175  5e-43  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1564  hypothetical protein  46.11 
 
 
215 aa  175  5e-43  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.20655  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3324  resolvase domain-containing protein  44.02 
 
 
197 aa  164  1.0000000000000001e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.296266  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0465  resolvase-like protein  43.22 
 
 
219 aa  162  3e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.123984  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0948  site-specific integrase/resolvase  45.71 
 
 
209 aa  160  1e-38  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.531266  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1118  Resolvase domain protein  34 
 
 
229 aa  125  5e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000220769  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0272  Resolvase domain protein  33.5 
 
 
229 aa  124  1e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000593088  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0744  Resolvase domain protein  33.5 
 
 
229 aa  122  5e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.000000124642  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0947  Resolvase domain protein  33.16 
 
 
195 aa  119  3e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000000151254  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0390  DNA binding domain protein, excisionase family  35.29 
 
 
216 aa  119  3e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0112175  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2002  regulatory protein, MerR  40.41 
 
 
148 aa  116  1.9999999999999998e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0236  Resolvase domain protein  32.12 
 
 
195 aa  115  3e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000223632  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1449  Resolvase domain protein  32.29 
 
 
207 aa  116  3e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0392946  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1710  resolvase domain-containing protein  33 
 
 
222 aa  116  3e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0484  DNA binding domain protein, excisionase family  34.63 
 
 
216 aa  115  6e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.114276  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0131  DNA binding domain protein, excisionase family  35.29 
 
 
216 aa  115  6e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000948008  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0818  DNA binding domain protein, excisionase family  35.61 
 
 
216 aa  115  6e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0122  DNA binding domain protein, excisionase family  35.29 
 
 
216 aa  115  6e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1304  transposon resolvase  32.65 
 
 
209 aa  114  6.9999999999999995e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0311544  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1190  DNA binding domain protein, excisionase family  35.29 
 
 
216 aa  114  1.0000000000000001e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2574  DNA binding domain protein, excisionase family  31.47 
 
 
194 aa  112  3e-24  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.235149  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0522  DNA binding domain protein, excisionase family  34.15 
 
 
244 aa  112  4.0000000000000004e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0170413  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1911  DNA binding domain-containing protein  33.49 
 
 
216 aa  112  4.0000000000000004e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2645  DNA binding domain protein, excisionase family  32.99 
 
 
192 aa  111  7.000000000000001e-24  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1070  resolvase domain-containing protein  32.8 
 
 
197 aa  111  9e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.709621  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1111  DNA binding domain-containing protein  33.33 
 
 
215 aa  110  1.0000000000000001e-23  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.385151  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1717  regulatory protein MerR  31.03 
 
 
201 aa  110  1.0000000000000001e-23  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.212526  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1174  DNA binding domain protein, excisionase family  32.68 
 
 
219 aa  108  4.0000000000000004e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.122691  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1513  DNA binding domain protein, excisionase family  31.47 
 
 
213 aa  108  5e-23  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2716  DNA binding domain protein, excisionase family  31.47 
 
 
213 aa  108  5e-23  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  decreased coverage  0.00788025  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1808  DNA binding domain protein, excisionase family  32.68 
 
 
219 aa  108  5e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2443  DNA binding domain protein, excisionase family  32.8 
 
 
193 aa  107  8.000000000000001e-23  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.453884  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0895  DNA binding domain protein, excisionase family  33.87 
 
 
192 aa  107  1e-22  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0785  Resolvase domain protein  30.16 
 
 
202 aa  106  3e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00525149  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2048  Resolvase domain protein  32.26 
 
 
193 aa  102  4e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0322526  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2150  DNA binding domain protein, excisionase family  32.61 
 
 
195 aa  101  7e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0911  DNA binding domain protein, excisionase family  32.07 
 
 
192 aa  100  1e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  unclonable  0.00000302589  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1270  Resolvase domain protein  28.8 
 
 
195 aa  100  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0941  resolvase domain-containing protein  29.19 
 
 
208 aa  99.4  3e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0143335  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1913  Resolvase domain protein  29.69 
 
 
208 aa  97.4  1e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2194  Resolvase domain protein  29.53 
 
 
208 aa  97.4  1e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.72008  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1241  Resolvase domain protein  31.5 
 
 
222 aa  95.1  6e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0456632  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0754  Resolvase domain protein  33.9 
 
 
207 aa  94.4  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1000  Resolvase domain protein  29.15 
 
 
206 aa  94  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0589477 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2935  Resolvase domain protein  29.15 
 
 
206 aa  94  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2000  DNA binding domain protein, excisionase family  33 
 
 
212 aa  93.6  2e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.27976  normal  0.357405 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2781  Resolvase domain protein  31.22 
 
 
222 aa  92.4  4e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.912906 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0751  Resolvase domain protein  31.22 
 
 
209 aa  91.7  6e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0851  regulatory protein MerR  31 
 
 
222 aa  90.1  2e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2393  DNA binding domain protein, excisionase family  29.89 
 
 
191 aa  87  2e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2513  Resolvase domain protein  28.57 
 
 
195 aa  76.3  0.0000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1105  transposon resolvase  28.78 
 
 
196 aa  72.4  0.000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.600674  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2683  resolvase-like protein  28.34 
 
 
190 aa  72  0.000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.300522  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12805  resolvase  29.05 
 
 
193 aa  71.2  0.00000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00189559  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1891  transposase OrfA  54.84 
 
 
74 aa  70.5  0.00000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10616  resolvase  27.84 
 
 
202 aa  68.9  0.00000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000496522  normal  0.221326 
 
 
-
 
NC_010579  XfasM23_2258  resolvase domain-containing protein  53.23 
 
 
74 aa  67.8  0.00000000009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.216039  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3431  resolvase-like protein  27.47 
 
 
197 aa  67.4  0.0000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12994  resolvase  26.97 
 
 
194 aa  66.6  0.0000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000478883  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0684  resolvase domain-containing protein  26.82 
 
 
190 aa  67  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.245344 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5676  resolvase domain-containing protein  26.82 
 
 
190 aa  67  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10939  resolvase  26.09 
 
 
193 aa  65.5  0.0000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1033  transposon resolvase  28.28 
 
 
204 aa  63.9  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.412274  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0842  resolvase domain-containing protein  26.47 
 
 
196 aa  62.4  0.000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.419  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1224  putative site-specific integrase-resolvase  29.55 
 
 
197 aa  62.4  0.000000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.997311  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2084  regulatory protein MerR  48.39 
 
 
94 aa  57.4  0.0000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4926  merR family DNA-binding response regulator  43.1 
 
 
192 aa  57.4  0.0000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1602  DNA binding domain protein, excisionase family  36.89 
 
 
295 aa  57.4  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.200885  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3461  regulatory protein, MerR  38.37 
 
 
128 aa  56.2  0.0000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13862  resolvase  26.52 
 
 
203 aa  55.8  0.0000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1614  resolvase domain-containing protein  26.79 
 
 
182 aa  55.5  0.0000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00182311  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5986  resolvase domain-containing protein  25.76 
 
 
162 aa  55.5  0.0000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00224994  normal  0.0280728 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2025  DNA binding domain-containing protein  44.07 
 
 
206 aa  54.7  0.0000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.870655  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0258  DNA binding domain-containing protein  51.06 
 
 
74 aa  53.5  0.000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.453374  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4676  DNA binding domain protein, excisionase family  42.22 
 
 
80 aa  53.5  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.272297  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1938  excisionase family DNA-binding response regulator  52.08 
 
 
190 aa  53.1  0.000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.440271  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4091  DNA binding domain-containing protein  52.17 
 
 
90 aa  52.8  0.000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.446784 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4511  DNA binding domain-containing protein  52.17 
 
 
88 aa  53.1  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.812065  hitchhiker  0.00570166 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6401  DNA binding domain protein, excisionase family  45.28 
 
 
279 aa  52  0.000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.566174  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1745  DNA binding domain-containing protein  47.06 
 
 
205 aa  51.6  0.000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2159  DNA binding domain protein, excisionase family  52.27 
 
 
72 aa  51.6  0.000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0276  excisionase family DNA binding domain-containing protein  50 
 
 
73 aa  50.8  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.42155  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0579  hypothetical protein  50 
 
 
79 aa  50.8  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4424  DNA binding domain protein, excisionase family  50 
 
 
68 aa  50.4  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0161  DNA binding domain-containing protein  46.81 
 
 
69 aa  50.4  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.177228  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5979  DNA binding domain-containing protein, excisionase family  46.81 
 
 
75 aa  50.4  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.553184 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0170  DNA binding domain-containing protein  46.81 
 
 
69 aa  50.4  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.996607  hitchhiker  0.0018108 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6709  DNA binding domain protein, excisionase family  50 
 
 
72 aa  50.4  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34060  DNA-binding protein, excisionase family  44.9 
 
 
76 aa  50.1  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.910239  normal  0.267084 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03000  DNA-binding protein, excisionase family  52.27 
 
 
69 aa  50.4  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.17033  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2905  DNA binding domain protein, excisionase family  47.83 
 
 
71 aa  50.4  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.616527  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1619  DNA-binding response regulator  43.64 
 
 
185 aa  49.7  0.00003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.208637  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2776  putative resolvase  29.7 
 
 
116 aa  49.7  0.00003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.481265  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>